MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter cetorum MIT 99-5656 chromosome

Total Repeats: 1479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017735	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386747039
2	NC_017735	TCTTT	2	10	1743	1752	0 %	80 %	0 %	20 %	386747040
3	NC_017735	TTTGT	2	10	2420	2429	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017735	TTTCT	2	10	5987	5996	0 %	80 %	0 %	20 %	386747043
5	NC_017735	CTTCA	2	10	6498	6507	20 %	40 %	0 %	40 %	386747043
6	NC_017735	AATTT	2	10	6826	6835	40 %	60 %	0 %	0 %	386747043
7	NC_017735	TTGTT	2	10	7161	7170	0 %	80 %	20 %	0 %	386747044
8	NC_017735	CCTCT	2	10	7976	7985	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017735	ATGAG	2	10	8469	8478	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017735	ACGCA	2	10	8774	8783	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017735	AAAAC	2	10	11019	11028	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017735	GTGTG	2	10	13513	13522	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017735	TTACT	2	10	15094	15103	20 %	60 %	0 %	20 %	386747048
14	NC_017735	GTTTG	2	10	18079	18088	0 %	60 %	40 %	0 %	386747049
15	NC_017735	TGCCT	2	10	18295	18304	0 %	40 %	20 %	40 %	386747050
16	NC_017735	AAGTG	2	10	18445	18454	40 %	20 %	40 %	0 %	386747050
17	NC_017735	TTCAT	2	10	19966	19975	20 %	60 %	0 %	20 %	386747052
18	NC_017735	GCACA	2	10	20350	20359	40 %	0 %	20 %	40 %	386747053
19	NC_017735	GTTCT	2	10	20922	20931	0 %	60 %	20 %	20 %	386747053
20	NC_017735	ATCAC	2	10	22492	22501	40 %	20 %	0 %	40 %	386747056
21	NC_017735	CGCTA	2	10	23401	23410	20 %	20 %	20 %	40 %	386747057
22	NC_017735	CCCAC	2	10	23495	23504	20 %	0 %	0 %	80 %	386747057
23	NC_017735	GAATT	2	10	26696	26705	40 %	40 %	20 %	0 %	386747061
24	NC_017735	ACCCA	2	10	27164	27173	40 %	0 %	0 %	60 %	386747062
25	NC_017735	TACCA	2	10	27864	27873	40 %	20 %	0 %	40 %	386747062
26	NC_017735	ACCAC	2	10	30050	30059	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_017735	ATGGA	2	10	32275	32284	40 %	20 %	40 %	0 %	386747064
28	NC_017735	AGTAA	2	10	32986	32995	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017735	TATCT	2	10	33422	33431	20 %	60 %	0 %	20 %	386747065
30	NC_017735	TTTCA	2	10	34760	34769	20 %	60 %	0 %	20 %	386747066
31	NC_017735	ACACC	2	10	41921	41930	40 %	0 %	0 %	60 %	386747072
32	NC_017735	TTCAT	2	10	43155	43164	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017735	CAAAA	2	10	43929	43938	80 %	0 %	0 %	20 %	386747074
34	NC_017735	GCCAT	2	10	45300	45309	20 %	20 %	20 %	40 %	386747075
35	NC_017735	AAAAG	2	10	46435	46444	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017735	ATTTG	2	10	47841	47850	20 %	60 %	20 %	0 %	386747078
37	NC_017735	CTTAG	2	10	51755	51764	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017735	TAAAA	2	10	52257	52266	80 %	20 %	0 %	0 %	386747084
39	NC_017735	AAATA	2	10	52916	52925	80 %	20 %	0 %	0 %	386747085
40	NC_017735	GAAAA	2	10	56667	56676	80 %	0 %	20 %	0 %	386747090
41	NC_017735	AATAG	2	10	57723	57732	60 %	20 %	20 %	0 %	386747091
42	NC_017735	CGCAC	2	10	58087	58096	20 %	0 %	20 %	60 %	386747092
43	NC_017735	CAATA	2	10	58945	58954	60 %	20 %	0 %	20 %	386747093
44	NC_017735	ATTTT	2	10	59400	59409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017735	CCCCA	2	10	62202	62211	20 %	0 %	0 %	80 %	386747095
46	NC_017735	GATAG	2	10	62274	62283	40 %	20 %	40 %	0 %	386747095
47	NC_017735	TTATT	2	10	64184	64193	20 %	80 %	0 %	0 %	386747097
48	NC_017735	TTTGA	2	10	65070	65079	20 %	60 %	20 %	0 %	386747098
49	NC_017735	TGCTT	2	10	65132	65141	0 %	60 %	20 %	20 %	386747098
50	NC_017735	TTTTC	2	10	66587	66596	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017735	ATATA	2	10	67153	67162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017735	TGTTT	2	10	67715	67724	0 %	80 %	20 %	0 %	386747099
53	NC_017735	ATTGA	2	10	67833	67842	40 %	40 %	20 %	0 %	386747099
54	NC_017735	TGTTT	2	10	67965	67974	0 %	80 %	20 %	0 %	386747099
55	NC_017735	CATAG	2	10	68010	68019	40 %	20 %	20 %	20 %	386747099
56	NC_017735	TGATT	2	10	69188	69197	20 %	60 %	20 %	0 %	386747099
57	NC_017735	TTTAT	2	10	69912	69921	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017735	CAATG	2	10	71874	71883	40 %	20 %	20 %	20 %	386747103
59	NC_017735	GTGAA	2	10	72849	72858	40 %	20 %	40 %	0 %	386747104
60	NC_017735	TTTCT	2	10	72964	72973	0 %	80 %	0 %	20 %	386747104
61	NC_017735	AAAGG	2	10	73999	74008	60 %	0 %	40 %	0 %	386747104
62	NC_017735	TCAAA	2	10	74648	74657	60 %	20 %	0 %	20 %	386747105
63	NC_017735	AATCA	2	10	76586	76595	60 %	20 %	0 %	20 %	386747107
64	NC_017735	TTTAT	2	10	82633	82642	20 %	80 %	0 %	0 %	386747114
65	NC_017735	TTTTG	2	10	82925	82934	0 %	80 %	20 %	0 %	386747115
66	NC_017735	TATTT	2	10	83111	83120	20 %	80 %	0 %	0 %	386747115
67	NC_017735	CAAGA	2	10	85003	85012	60 %	0 %	20 %	20 %	386747118
68	NC_017735	CTTAG	2	10	86067	86076	20 %	40 %	20 %	20 %	386747120
69	NC_017735	TGTTT	2	10	86180	86189	0 %	80 %	20 %	0 %	386747120
70	NC_017735	TCAAA	2	10	86722	86731	60 %	20 %	0 %	20 %	386747120
71	NC_017735	GGGGC	2	10	87845	87854	0 %	0 %	80 %	20 %	386747121
72	NC_017735	TCACT	2	10	89098	89107	20 %	40 %	0 %	40 %	386747121
73	NC_017735	CTTTT	2	10	90276	90285	0 %	80 %	0 %	20 %	386747122
74	NC_017735	AGACC	2	10	90415	90424	40 %	0 %	20 %	40 %	386747122
75	NC_017735	CTTTT	2	10	93655	93664	0 %	80 %	0 %	20 %	386747126
76	NC_017735	TTCTC	2	10	94230	94239	0 %	60 %	0 %	40 %	386747127
77	NC_017735	GCTTT	2	10	99997	100006	0 %	60 %	20 %	20 %	386747130
78	NC_017735	ACAAA	2	10	100457	100466	80 %	0 %	0 %	20 %	386747130
79	NC_017735	TAAAA	2	10	102913	102922	80 %	20 %	0 %	0 %	386747134
80	NC_017735	AAAAG	2	10	105553	105562	80 %	0 %	20 %	0 %	386747137
81	NC_017735	ATTTT	2	10	105965	105974	20 %	80 %	0 %	0 %	386747138
82	NC_017735	AAAAT	2	10	107759	107768	80 %	20 %	0 %	0 %	386747139
83	NC_017735	ACTTT	2	10	108395	108404	20 %	60 %	0 %	20 %	386747140
84	NC_017735	ATTTG	2	10	110675	110684	20 %	60 %	20 %	0 %	386747142
85	NC_017735	AAGAA	2	10	112243	112252	80 %	0 %	20 %	0 %	386747144
86	NC_017735	AAGTG	2	10	113225	113234	40 %	20 %	40 %	0 %	386747145
87	NC_017735	AATTT	2	10	113868	113877	40 %	60 %	0 %	0 %	386747145
88	NC_017735	TGTGG	2	10	115647	115656	0 %	40 %	60 %	0 %	386747147
89	NC_017735	CTTTT	2	10	116342	116351	0 %	80 %	0 %	20 %	386747148
90	NC_017735	ATAAA	2	10	116894	116903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017735	ATTGC	2	10	117390	117399	20 %	40 %	20 %	20 %	386747149
92	NC_017735	CCAAG	2	10	120801	120810	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017735	CAATA	2	10	120823	120832	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017735	TTCAA	2	10	122314	122323	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017735	CTCAT	2	10	122544	122553	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017735	TCACT	2	10	124022	124031	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017735	TACTT	2	10	124322	124331	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017735	TAAAG	2	10	124954	124963	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017735	ATGGC	2	10	126509	126518	20 %	20 %	40 %	20 %	386747159
100	NC_017735	TTTGA	2	10	127737	127746	20 %	60 %	20 %	0 %	386747160
101	NC_017735	ACCCT	2	10	128937	128946	20 %	20 %	0 %	60 %	386747162
102	NC_017735	TCTTT	2	10	130668	130677	0 %	80 %	0 %	20 %	386747165
103	NC_017735	TTTGG	2	10	131570	131579	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017735	TTGGC	2	10	132382	132391	0 %	40 %	40 %	20 %	386747167
105	NC_017735	AAAAT	2	10	132574	132583	80 %	20 %	0 %	0 %	386747168
106	NC_017735	TTCAT	2	10	133408	133417	20 %	60 %	0 %	20 %	386747168
107	NC_017735	TTCCT	2	10	133758	133767	0 %	60 %	0 %	40 %	386747169
108	NC_017735	ATCTA	2	10	134870	134879	40 %	40 %	0 %	20 %	386747170
109	NC_017735	TCATT	2	10	136390	136399	20 %	60 %	0 %	20 %	386747172
110	NC_017735	CATTT	2	10	136717	136726	20 %	60 %	0 %	20 %	386747173
111	NC_017735	AAAGC	2	10	142219	142228	60 %	0 %	20 %	20 %	386747177
112	NC_017735	AGCCC	2	10	142946	142955	20 %	0 %	20 %	60 %	386747178
113	NC_017735	CCAAA	2	10	143365	143374	60 %	0 %	0 %	40 %	386747178
114	NC_017735	CTTTT	2	10	153142	153151	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017735	AGATG	2	10	153637	153646	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017735	CACGA	2	10	154202	154211	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_017735	TTACC	2	10	155000	155009	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017735	CACCC	2	10	159296	159305	20 %	0 %	0 %	80 %	386747190
119	NC_017735	TTGAA	2	10	159396	159405	40 %	40 %	20 %	0 %	386747191
120	NC_017735	ACCAC	2	10	161672	161681	40 %	0 %	0 %	60 %	386747196
121	NC_017735	GGGCT	2	10	162829	162838	0 %	20 %	60 %	20 %	386747197
122	NC_017735	CAAGC	2	10	168279	168288	40 %	0 %	20 %	40 %	386747201
123	NC_017735	CTGGG	2	10	172028	172037	0 %	20 %	60 %	20 %	386747203
124	NC_017735	CTCAT	2	10	172346	172355	20 %	40 %	0 %	40 %	386747203
125	NC_017735	CGCTT	2	10	172824	172833	0 %	40 %	20 %	40 %	386747203
126	NC_017735	GAAGG	2	10	174112	174121	40 %	0 %	60 %	0 %	386747205
127	NC_017735	AGATA	2	10	175296	175305	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017735	TGCCC	2	10	175403	175412	0 %	20 %	20 %	60 %	386747207
129	NC_017735	GTAGA	2	10	175443	175452	40 %	20 %	40 %	0 %	386747207
130	NC_017735	AGCGT	2	10	179164	179173	20 %	20 %	40 %	20 %	386747212
131	NC_017735	TAGTG	2	10	180971	180980	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017735	TAAAA	2	10	181313	181322	80 %	20 %	0 %	0 %	386747213
133	NC_017735	GTTTT	2	10	182396	182405	0 %	80 %	20 %	0 %	386747215
134	NC_017735	CTTTT	2	10	182484	182493	0 %	80 %	0 %	20 %	386747215
135	NC_017735	TAGAT	2	10	182718	182727	40 %	40 %	20 %	0 %	386747216
136	NC_017735	TTTAG	2	10	182908	182917	20 %	60 %	20 %	0 %	386747216
137	NC_017735	CGCCT	2	10	185388	185397	0 %	20 %	20 %	60 %	386747220
138	NC_017735	TTTTG	2	10	186544	186553	0 %	80 %	20 %	0 %	386747221
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