MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter cetorum MIT 99-5656 chromosome

Total Repeats: 19664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017735	CTT	2	6	35	40	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747037
2	NC_017735	ATT	2	6	305	310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747037
3	NC_017735	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747037
4	NC_017735	AAT	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747037
5	NC_017735	TAG	2	6	456	461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747038
6	NC_017735	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747038
7	NC_017735	CAT	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747038
8	NC_017735	AAT	2	6	697	702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747038
9	NC_017735	AAT	2	6	744	749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747038
10	NC_017735	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747038
11	NC_017735	ATA	2	6	820	825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747038
12	NC_017735	TCA	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747039
13	NC_017735	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386747039
14	NC_017735	ATT	2	6	1165	1170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747039
15	NC_017735	TTA	2	6	1240	1245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747039
16	NC_017735	TAC	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747039
17	NC_017735	TGA	2	6	1358	1363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747039
18	NC_017735	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747039
19	NC_017735	TCA	2	6	1721	1726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747039
20	NC_017735	ATT	2	6	1841	1846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747040
21	NC_017735	TTC	2	6	1970	1975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747040
22	NC_017735	CAT	2	6	2038	2043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747040
23	NC_017735	ATG	2	6	2094	2099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747040
24	NC_017735	TGG	2	6	2180	2185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386747040
25	NC_017735	ACT	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747040
26	NC_017735	TTA	2	6	2411	2416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017735	AGA	2	6	2536	2541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747041
28	NC_017735	TGA	2	6	2659	2664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747041
29	NC_017735	AGT	2	6	2774	2779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747041
30	NC_017735	GTG	2	6	2963	2968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386747041
31	NC_017735	AGA	2	6	3061	3066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747041
32	NC_017735	TGG	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386747041
33	NC_017735	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747042
34	NC_017735	TGA	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747042
35	NC_017735	CTA	2	6	3624	3629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747042
36	NC_017735	ATT	2	6	3912	3917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747042
37	NC_017735	TAG	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747042
38	NC_017735	TTG	2	6	4051	4056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017735	GGT	2	6	4115	4120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017735	TGG	2	6	4205	4210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017735	AAT	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017735	TGG	2	6	4337	4342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017735	GTG	2	6	4457	4462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017735	ACC	2	6	4489	4494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017735	GGT	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017735	ATA	2	6	4678	4683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017735	TCA	2	6	4778	4783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017735	GAA	2	6	4822	4827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017735	TAA	2	6	4903	4908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017735	TGT	2	6	4956	4961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017735	ATT	2	6	5001	5006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017735	CAT	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747043
53	NC_017735	CTG	2	6	5258	5263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386747043
54	NC_017735	TCT	2	6	5275	5280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
55	NC_017735	CTT	2	6	5381	5386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
56	NC_017735	CGC	2	6	5465	5470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386747043
57	NC_017735	AGC	2	6	5487	5492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386747043
58	NC_017735	TAA	2	6	5525	5530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386747043
59	NC_017735	TCA	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747043
60	NC_017735	TGC	2	6	5595	5600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386747043
61	NC_017735	ACC	2	6	5601	5606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386747043
62	NC_017735	CTT	2	6	5621	5626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
63	NC_017735	AGC	2	6	5697	5702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386747043
64	NC_017735	TTG	2	6	5777	5782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747043
65	NC_017735	TCA	2	6	5827	5832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747043
66	NC_017735	GTG	2	6	5857	5862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386747043
67	NC_017735	TTC	2	6	5882	5887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
68	NC_017735	TTC	2	6	5937	5942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
69	NC_017735	ACC	2	6	5955	5960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386747043
70	NC_017735	GAT	2	6	6099	6104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747043
71	NC_017735	GAA	2	6	6146	6151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747043
72	NC_017735	CTT	2	6	6311	6316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
73	NC_017735	TCT	2	6	6421	6426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
74	NC_017735	CAG	2	6	6521	6526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386747043
75	NC_017735	CTT	2	6	6542	6547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
76	NC_017735	TGT	2	6	6576	6581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747043
77	NC_017735	CTG	2	6	6593	6598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386747043
78	NC_017735	CGG	2	6	6602	6607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386747043
79	NC_017735	CTT	2	6	6620	6625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747043
80	NC_017735	CAT	2	6	6773	6778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747043
81	NC_017735	TAA	3	9	6856	6864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017735	ATG	2	6	6925	6930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747044
83	NC_017735	ACA	2	6	6940	6945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386747044
84	NC_017735	TCT	2	6	6974	6979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747044
85	NC_017735	TTC	3	9	7171	7179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747044
86	NC_017735	CTA	2	6	7188	7193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747044
87	NC_017735	CCA	2	6	7283	7288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017735	ATT	2	6	7352	7357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017735	AGT	2	6	7572	7577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017735	AAT	2	6	7635	7640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017735	CAA	2	6	7671	7676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017735	ATA	2	6	7741	7746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017735	TAT	2	6	7929	7934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017735	ATA	2	6	8168	8173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017735	ATT	2	6	8262	8267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017735	TGG	2	6	8364	8369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017735	GGT	2	6	8381	8386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017735	AAG	2	6	8403	8408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017735	TGA	2	6	8534	8539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017735	AAT	2	6	8603	8608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017735	ATT	2	6	8788	8793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017735	CAA	2	6	8923	8928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386747045
103	NC_017735	CAA	2	6	8935	8940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386747045
104	NC_017735	ATG	2	6	9088	9093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747045
105	NC_017735	GAT	2	6	9094	9099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747045
106	NC_017735	GGA	2	6	9124	9129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386747045
107	NC_017735	TGG	2	6	9147	9152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386747045
108	NC_017735	TCA	2	6	9224	9229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747045
109	NC_017735	CTA	2	6	9233	9238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747045
110	NC_017735	CTG	2	6	9329	9334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386747045
111	NC_017735	GTT	2	6	9370	9375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386747045
112	NC_017735	ACA	2	6	9447	9452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386747045
113	NC_017735	ACT	2	6	9527	9532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747045
114	NC_017735	ACC	2	6	9544	9549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386747045
115	NC_017735	TAT	2	6	9577	9582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747045
116	NC_017735	CAA	2	6	9628	9633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386747045
117	NC_017735	AAG	2	6	9638	9643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386747045
118	NC_017735	TAT	2	6	9645	9650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747045
119	NC_017735	TGA	2	6	9845	9850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386747045
120	NC_017735	CAA	2	6	9893	9898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386747045
121	NC_017735	TAT	2	6	9916	9921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386747045
122	NC_017735	CTT	2	6	10008	10013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386747045
123	NC_017735	CTA	2	6	10292	10297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747045
124	NC_017735	CTA	2	6	10308	10313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386747045
125	NC_017735	CAA	2	6	10466	10471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017735	AAG	2	6	10484	10489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017735	ATT	2	6	10522	10527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017735	AAC	2	6	10712	10717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017735	ACT	2	6	10718	10723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017735	CAA	3	9	10850	10858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017735	CAA	3	9	10863	10871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017735	ATA	2	6	10880	10885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017735	CAA	2	6	10887	10892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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135	NC_017735	CAA	2	6	11073	11078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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