MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori HUP-B14 plasmid pHPB14

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017734	GTTG	2	8	225	232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017734	TGGT	2	8	287	294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017734	GTTT	2	8	425	432	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017734	TTAG	2	8	927	934	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017734	CAAG	2	8	1485	1492	50 %	0 %	25 %	25 %	386745519
6	NC_017734	TGAT	2	8	1511	1518	25 %	50 %	25 %	0 %	386745519
7	NC_017734	CTTC	2	8	1616	1623	0 %	50 %	0 %	50 %	386745519
8	NC_017734	TTCT	2	8	1688	1695	0 %	75 %	0 %	25 %	386745519
9	NC_017734	GCAT	2	8	1728	1735	25 %	25 %	25 %	25 %	386745519
10	NC_017734	AACA	2	8	2050	2057	75 %	0 %	0 %	25 %	386745520
11	NC_017734	TTCT	2	8	2413	2420	0 %	75 %	0 %	25 %	386745520
12	NC_017734	GTTG	2	8	4347	4354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017734	TGGT	2	8	4409	4416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017734	GTTT	2	8	4547	4554	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017734	TTAG	2	8	5049	5056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017734	CAAG	2	8	5607	5614	50 %	0 %	25 %	25 %	386745523
17	NC_017734	TGAT	2	8	5633	5640	25 %	50 %	25 %	0 %	386745523
18	NC_017734	CTTC	2	8	5738	5745	0 %	50 %	0 %	50 %	386745523
19	NC_017734	TTCT	2	8	5810	5817	0 %	75 %	0 %	25 %	386745523
20	NC_017734	GCAT	2	8	5850	5857	25 %	25 %	25 %	25 %	386745523
21	NC_017734	AACA	2	8	6172	6179	75 %	0 %	0 %	25 %	386745524
22	NC_017734	TTCT	2	8	6535	6542	0 %	75 %	0 %	25 %	386745524

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.