MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266 plasmid PL3

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017670	GAT	2	6	2	7	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017670	ATA	2	6	335	340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386118365
3	NC_017670	ATA	2	6	569	574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386118365
4	NC_017670	ATC	2	6	638	643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386118365
5	NC_017670	TAC	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386118365
6	NC_017670	ATT	2	6	752	757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386118365
7	NC_017670	GTA	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386118365
8	NC_017670	GAA	2	6	774	779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386118365
9	NC_017670	AGA	2	6	801	806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386118365
10	NC_017670	TCA	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386118365
11	NC_017670	TGC	2	6	954	959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386118365
12	NC_017670	TTA	2	6	1198	1203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017670	GAA	2	6	1210	1215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017670	TCT	2	6	1327	1332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386118366
15	NC_017670	ATT	2	6	1591	1596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386118366
16	NC_017670	GAA	2	6	1616	1621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386118366
17	NC_017670	TGA	2	6	1636	1641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386118366
18	NC_017670	AGC	2	6	1880	1885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017670	CTT	2	6	2037	2042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017670	TCT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017670	GAG	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017670	ATA	2	6	2440	2445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017670	TTG	2	6	2727	2732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017670	CAA	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017670	TAA	2	6	2862	2867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017670	GTT	2	6	2960	2965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386118368
27	NC_017670	AGA	3	9	3068	3076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386118368
28	NC_017670	GAT	2	6	3087	3092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386118368
29	NC_017670	TGG	2	6	3229	3234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017670	TGA	2	6	3316	3321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.