MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266

Total Repeats: 87820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_017668	GTAT	2	8	73888	73895	25 %	50 %	25 %	0 %	386712411
1503	NC_017668	ATTGGA	2	12	73899	73910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712411
1504	NC_017668	GCT	2	6	73917	73922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712411
1505	NC_017668	CATA	2	8	74017	74024	50 %	25 %	0 %	25 %	386712411
1506	NC_017668	CTT	2	6	74212	74217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712411
1507	NC_017668	GAA	2	6	74264	74269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712411
1508	NC_017668	AAG	2	6	74275	74280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712411
1509	NC_017668	ATC	2	6	74319	74324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712411
1510	NC_017668	ATTA	2	8	74345	74352	50 %	50 %	0 %	0 %	386712411
1511	NC_017668	CCAT	2	8	74361	74368	25 %	25 %	0 %	50 %	386712411
1512	NC_017668	TTC	2	6	74379	74384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712411
1513	NC_017668	GTCA	2	8	74487	74494	25 %	25 %	25 %	25 %	386712411
1514	NC_017668	ATA	2	6	74592	74597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712411
1515	NC_017668	TGC	2	6	74690	74695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712411
1516	NC_017668	CAG	3	9	74800	74808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712411
1517	NC_017668	TAC	2	6	74827	74832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712411
1518	NC_017668	AT	3	6	74984	74989	50 %	50 %	0 %	0 %	386712412
1519	NC_017668	ATC	2	6	75036	75041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712412
1520	NC_017668	A	7	7	75058	75064	100 %	0 %	0 %	0 %	386712412
1521	NC_017668	GAA	2	6	75101	75106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712412
1522	NC_017668	TA	3	6	75126	75131	50 %	50 %	0 %	0 %	386712412
1523	NC_017668	AGC	2	6	75157	75162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712412
1524	NC_017668	TGCT	2	8	75204	75211	0 %	50 %	25 %	25 %	386712412
1525	NC_017668	A	6	6	75213	75218	100 %	0 %	0 %	0 %	386712412
1526	NC_017668	TGC	2	6	75295	75300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712412
1527	NC_017668	TCA	2	6	75305	75310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712412
1528	NC_017668	TGAAG	2	10	75430	75439	40 %	20 %	40 %	0 %	386712412
1529	NC_017668	GCT	2	6	75445	75450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712412
1530	NC_017668	CCT	2	6	75461	75466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386712412
1531	NC_017668	CAG	2	6	75489	75494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712412
1532	NC_017668	GCA	2	6	75498	75503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712412
1533	NC_017668	GA	3	6	75507	75512	50 %	0 %	50 %	0 %	386712412
1534	NC_017668	CAA	2	6	75559	75564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386712412
1535	NC_017668	TCC	2	6	75583	75588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386712412
1536	NC_017668	AAAAAC	2	12	75594	75605	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386712412
1537	NC_017668	ATC	2	6	75609	75614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712412
1538	NC_017668	ATT	2	6	75635	75640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712412
1539	NC_017668	AGA	2	6	75715	75720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712412
1540	NC_017668	CAGG	2	8	75748	75755	25 %	0 %	50 %	25 %	386712412
1541	NC_017668	ATG	2	6	75756	75761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712412
1542	NC_017668	GAA	2	6	75773	75778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712412
1543	NC_017668	TTC	2	6	75789	75794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712412
1544	NC_017668	A	6	6	75873	75878	100 %	0 %	0 %	0 %	386712412
1545	NC_017668	TCG	2	6	75883	75888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712412
1546	NC_017668	TGA	2	6	75904	75909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712412
1547	NC_017668	AAAG	2	8	76048	76055	75 %	0 %	25 %	0 %	386712412
1548	NC_017668	AGA	2	6	76111	76116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712412
1549	NC_017668	AGGC	2	8	76207	76214	25 %	0 %	50 %	25 %	386712412
1550	NC_017668	CTAAA	2	10	76362	76371	60 %	20 %	0 %	20 %	386712412
1551	NC_017668	AAT	2	6	76386	76391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712412
1552	NC_017668	TAAA	2	8	76592	76599	75 %	25 %	0 %	0 %	386712413
1553	NC_017668	GCG	2	6	76606	76611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386712413
1554	NC_017668	AAGA	2	8	76627	76634	75 %	0 %	25 %	0 %	386712413
1555	NC_017668	ATA	2	6	76647	76652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712413
1556	NC_017668	ACA	2	6	76655	76660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_017668	TGT	2	6	76687	76692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017668	T	6	6	76692	76697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017668	TTG	2	6	76714	76719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017668	CAA	2	6	76741	76746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_017668	TTG	2	6	76757	76762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017668	GAA	2	6	76790	76795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017668	CCT	2	6	76840	76845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386712414
1564	NC_017668	GGA	2	6	77035	77040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017668	TCT	2	6	77050	77055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_017668	GTG	2	6	77087	77092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1568	NC_017668	TAA	2	6	77209	77214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017668	AAG	2	6	77216	77221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1573	NC_017668	ATTT	2	8	77530	77537	25 %	75 %	0 %	0 %	386712415
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1582	NC_017668	ATG	2	6	78232	78237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712415
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1585	NC_017668	TCC	2	6	78578	78583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_017668	AGCTT	2	10	78638	78647	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1587	NC_017668	CGAG	2	8	78717	78724	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1588	NC_017668	CCA	2	6	78763	78768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_017668	TAA	2	6	78840	78845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1591	NC_017668	CTGA	2	8	78903	78910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1592	NC_017668	AGG	2	6	78959	78964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_017668	ATT	2	6	79254	79259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712416
1599	NC_017668	GAT	2	6	79310	79315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712417
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1601	NC_017668	AAG	2	6	79380	79385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712417
1602	NC_017668	ATC	2	6	79398	79403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712417
1603	NC_017668	CTTTT	2	10	79435	79444	0 %	80 %	0 %	20 %	386712417
1604	NC_017668	T	6	6	79441	79446	0 %	100 %	0 %	0 %	386712417
1605	NC_017668	TCAA	2	8	79535	79542	50 %	25 %	0 %	25 %	386712417
1606	NC_017668	GGT	2	6	79574	79579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712417
1607	NC_017668	TTC	2	6	79611	79616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712417
1608	NC_017668	TCT	2	6	79645	79650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712417
1609	NC_017668	TTA	2	6	79707	79712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712417
1610	NC_017668	GTT	2	6	79740	79745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386712417
1611	NC_017668	GATT	2	8	79750	79757	25 %	50 %	25 %	0 %	386712417
1612	NC_017668	ATT	2	6	79763	79768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712417
1613	NC_017668	A	6	6	79848	79853	100 %	0 %	0 %	0 %	386712417
1614	NC_017668	GTAA	2	8	79858	79865	50 %	25 %	25 %	0 %	386712417
1615	NC_017668	AGG	2	6	79866	79871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017668	TACA	2	8	79923	79930	50 %	25 %	0 %	25 %	386712418
1617	NC_017668	AGAAAA	2	12	79964	79975	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386712418
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1620	NC_017668	GAA	2	6	80092	80097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712418
1621	NC_017668	ATG	2	6	80165	80170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712418
1622	NC_017668	ATT	2	6	80201	80206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712418
1623	NC_017668	TA	4	8	80282	80289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017668	AAG	2	6	80296	80301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017668	AGG	2	6	80323	80328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017668	T	8	8	80333	80340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017668	GCA	2	6	80357	80362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712419
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