MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266

Total Repeats: 87820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017668	CATC	2	8	219510	219517	25 %	25 %	0 %	50 %	386712548
4502	NC_017668	TGC	2	6	219546	219551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712548
4503	NC_017668	TGC	2	6	219558	219563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712548
4504	NC_017668	A	7	7	219669	219675	100 %	0 %	0 %	0 %	386712548
4505	NC_017668	TGG	2	6	219681	219686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712548
4506	NC_017668	GCT	2	6	219695	219700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712548
4507	NC_017668	GTG	2	6	219716	219721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712548
4508	NC_017668	GTT	2	6	219722	219727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386712548
4509	NC_017668	A	8	8	219811	219818	100 %	0 %	0 %	0 %	386712548
4510	NC_017668	CAG	2	6	219833	219838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712548
4511	NC_017668	TTGG	2	8	219840	219847	0 %	50 %	50 %	0 %	386712548
4512	NC_017668	A	6	6	219857	219862	100 %	0 %	0 %	0 %	386712548
4513	NC_017668	AAT	2	6	219878	219883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712548
4514	NC_017668	TTA	2	6	219893	219898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712548
4515	NC_017668	T	6	6	219911	219916	0 %	100 %	0 %	0 %	386712548
4516	NC_017668	TGT	2	6	219999	220004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386712548
4517	NC_017668	A	6	6	220231	220236	100 %	0 %	0 %	0 %	386712548
4518	NC_017668	TCT	2	6	220335	220340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_017668	AAG	2	6	220343	220348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_017668	T	7	7	220353	220359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_017668	ATGA	2	8	220373	220380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_017668	TGC	2	6	220384	220389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_017668	AT	3	6	220419	220424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_017668	GAA	2	6	220444	220449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_017668	TTTA	2	8	220454	220461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_017668	A	6	6	220547	220552	100 %	0 %	0 %	0 %	386712549
4527	NC_017668	AAG	3	9	220557	220565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712549
4528	NC_017668	CATT	2	8	220624	220631	25 %	50 %	0 %	25 %	386712549
4529	NC_017668	AGTGG	2	10	220702	220711	20 %	20 %	60 %	0 %	386712549
4530	NC_017668	TTA	2	6	220874	220879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712549
4531	NC_017668	CAT	2	6	220895	220900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712549
4532	NC_017668	ATG	2	6	221022	221027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712549
4533	NC_017668	AAG	2	6	221070	221075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712549
4534	NC_017668	ATG	2	6	221084	221089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712549
4535	NC_017668	ATC	2	6	221097	221102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712549
4536	NC_017668	TCT	2	6	221204	221209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712549
4537	NC_017668	ACAG	2	8	221290	221297	50 %	0 %	25 %	25 %	386712549
4538	NC_017668	AGC	2	6	221298	221303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712549
4539	NC_017668	AGA	2	6	221359	221364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712549
4540	NC_017668	AG	3	6	221376	221381	50 %	0 %	50 %	0 %	386712549
4541	NC_017668	GAAAT	2	10	221440	221449	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_017668	AGG	2	6	221458	221463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_017668	AGA	2	6	221467	221472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712550
4544	NC_017668	TGAC	2	8	221473	221480	25 %	25 %	25 %	25 %	386712550
4545	NC_017668	GAA	2	6	221481	221486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712550
4546	NC_017668	GTA	2	6	221556	221561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712550
4547	NC_017668	AAG	2	6	221563	221568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712550
4548	NC_017668	TAT	2	6	221573	221578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712550
4549	NC_017668	AGA	2	6	221605	221610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712550
4550	NC_017668	GTGC	2	8	221650	221657	0 %	25 %	50 %	25 %	386712550
4551	NC_017668	TTGAA	2	10	221674	221683	40 %	40 %	20 %	0 %	386712550
4552	NC_017668	GCCCT	2	10	221711	221720	0 %	20 %	20 %	60 %	386712550
4553	NC_017668	TG	4	8	221722	221729	0 %	50 %	50 %	0 %	386712550
4554	NC_017668	CTAT	2	8	221734	221741	25 %	50 %	0 %	25 %	386712550
4555	NC_017668	GAT	2	6	221781	221786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712550
4556	NC_017668	TGA	2	6	221804	221809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712550
4557	NC_017668	AAG	2	6	221824	221829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712550
4558	NC_017668	GA	3	6	221847	221852	50 %	0 %	50 %	0 %	386712550
4559	NC_017668	AAG	2	6	221901	221906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712550
4560	NC_017668	AGA	2	6	221918	221923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712550
4561	NC_017668	TTTCC	2	10	221941	221950	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4562	NC_017668	GAA	2	6	222013	222018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712551
4563	NC_017668	AAG	2	6	222019	222024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712551
4564	NC_017668	GAAG	2	8	222036	222043	50 %	0 %	50 %	0 %	386712551
4565	NC_017668	ATA	2	6	222059	222064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712551
4566	NC_017668	ATA	2	6	222109	222114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712551
4567	NC_017668	AAT	2	6	222175	222180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712551
4568	NC_017668	AGT	3	9	222197	222205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712551
4569	NC_017668	TCGA	2	8	222265	222272	25 %	25 %	25 %	25 %	386712551
4570	NC_017668	A	6	6	222344	222349	100 %	0 %	0 %	0 %	386712551
4571	NC_017668	ATA	2	6	222360	222365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712551
4572	NC_017668	TAT	2	6	222376	222381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712551
4573	NC_017668	AGA	2	6	222401	222406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712551
4574	NC_017668	CTA	2	6	222420	222425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712551
4575	NC_017668	TCCT	2	8	222456	222463	0 %	50 %	0 %	50 %	386712551
4576	NC_017668	CTT	2	6	222464	222469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712551
4577	NC_017668	A	6	6	222473	222478	100 %	0 %	0 %	0 %	386712551
4578	NC_017668	T	6	6	222486	222491	0 %	100 %	0 %	0 %	386712551
4579	NC_017668	GCGT	2	8	222518	222525	0 %	25 %	50 %	25 %	386712551
4580	NC_017668	TC	3	6	222559	222564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4581	NC_017668	TG	3	6	222678	222683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_017668	ATT	2	6	222690	222695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_017668	GAA	2	6	222796	222801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712552
4584	NC_017668	TA	3	6	222830	222835	50 %	50 %	0 %	0 %	386712552
4585	NC_017668	TGC	2	6	222935	222940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712552
4586	NC_017668	GAA	2	6	222943	222948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712552
4587	NC_017668	AATTC	2	10	223095	223104	40 %	40 %	0 %	20 %	386712552
4588	NC_017668	TC	3	6	223103	223108	0 %	50 %	0 %	50 %	386712552
4589	NC_017668	AGC	2	6	223130	223135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712552
4590	NC_017668	AG	3	6	223195	223200	50 %	0 %	50 %	0 %	386712552
4591	NC_017668	TCT	2	6	223208	223213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712552
4592	NC_017668	CAG	2	6	223233	223238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712552
4593	NC_017668	CAG	2	6	223245	223250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712552
4594	NC_017668	AAG	2	6	223253	223258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712552
4595	NC_017668	AGCA	2	8	223304	223311	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4596	NC_017668	TGCT	2	8	223322	223329	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4597	NC_017668	T	7	7	223329	223335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_017668	AAT	2	6	223346	223351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_017668	CTT	2	6	223360	223365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712553
4600	NC_017668	CAT	2	6	223366	223371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712553
4601	NC_017668	CTT	2	6	223384	223389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712553
4602	NC_017668	TA	3	6	223408	223413	50 %	50 %	0 %	0 %	386712553
4603	NC_017668	ATC	2	6	223427	223432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712553
4604	NC_017668	AAT	2	6	223472	223477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712553
4605	NC_017668	TAG	2	6	223484	223489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712553
4606	NC_017668	CAG	2	6	223499	223504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712553
4607	NC_017668	CA	3	6	223521	223526	50 %	0 %	0 %	50 %	386712553
4608	NC_017668	CCG	2	6	223536	223541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712553
4609	NC_017668	TA	3	6	223603	223608	50 %	50 %	0 %	0 %	386712553
4610	NC_017668	GTC	2	6	223653	223658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712553
4611	NC_017668	AAT	2	6	223668	223673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712553
4612	NC_017668	GTCT	2	8	223874	223881	0 %	50 %	25 %	25 %	386712553
4613	NC_017668	GCA	2	6	223887	223892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712553
4614	NC_017668	TCC	2	6	223988	223993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386712553
4615	NC_017668	CAG	2	6	224164	224169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712553
4616	NC_017668	TG	3	6	224232	224237	0 %	50 %	50 %	0 %	386712553
4617	NC_017668	A	6	6	224288	224293	100 %	0 %	0 %	0 %	386712553
4618	NC_017668	T	7	7	224330	224336	0 %	100 %	0 %	0 %	386712553
4619	NC_017668	CAG	2	6	224399	224404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712553
4620	NC_017668	AAT	2	6	224441	224446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712553
4621	NC_017668	AAT	2	6	224457	224462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712553
4622	NC_017668	CCT	2	6	224472	224477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386712553
4623	NC_017668	CAA	2	6	224500	224505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386712553
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4996	NC_017668	TCA	2	6	243267	243272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712567
4997	NC_017668	CTT	2	6	243295	243300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712567
4998	NC_017668	TTC	2	6	243353	243358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712567
4999	NC_017668	GCT	2	6	243364	243369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712567
5000	NC_017668	T	7	7	243421	243427	0 %	100 %	0 %	0 %	386712567

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