MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 46881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017459	ATA	2	6	17	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017459	AAG	2	6	83	88	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017459	TCT	2	6	126	131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017459	ACA	2	6	150	155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017459	ACG	2	6	162	167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017459	ACT	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017459	AGA	2	6	325	330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017459	TGA	2	6	350	355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017459	CAT	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017459	TTG	2	6	494	499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017459	ATA	2	6	727	732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802383
12	NC_017459	AAC	2	6	744	749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802383
13	NC_017459	ATC	2	6	770	775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802383
14	NC_017459	TGA	2	6	836	841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
15	NC_017459	ACA	2	6	856	861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802383
16	NC_017459	GAT	2	6	918	923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
17	NC_017459	AGA	2	6	944	949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802383
18	NC_017459	CAT	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802383
19	NC_017459	ATG	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
20	NC_017459	TGA	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
21	NC_017459	TCA	2	6	1371	1376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802383
22	NC_017459	TGA	2	6	1406	1411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
23	NC_017459	TGA	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
24	NC_017459	TGA	2	6	1499	1504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
25	NC_017459	GAA	2	6	1533	1538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802383
26	NC_017459	TGA	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
27	NC_017459	TTG	2	6	1654	1659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802383
28	NC_017459	TGA	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
29	NC_017459	ATG	2	6	1825	1830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
30	NC_017459	TTC	2	6	1849	1854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802383
31	NC_017459	TGC	2	6	1916	1921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802383
32	NC_017459	GCT	2	6	1926	1931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802383
33	NC_017459	ATC	2	6	2118	2123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802383
34	NC_017459	TTG	2	6	2278	2283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802383
35	NC_017459	TGC	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802384
36	NC_017459	TCA	2	6	2675	2680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802384
37	NC_017459	AAT	2	6	2761	2766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802384
38	NC_017459	CCA	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802384
39	NC_017459	GAC	2	6	2860	2865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802384
40	NC_017459	GTT	2	6	2903	2908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802384
41	NC_017459	CAC	2	6	2928	2933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802384
42	NC_017459	GGC	2	6	2978	2983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802384
43	NC_017459	TCA	2	6	3248	3253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802384
44	NC_017459	TAA	2	6	3324	3329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017459	CGT	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017459	TAA	2	6	3373	3378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017459	GAG	2	6	3401	3406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017459	TCT	2	6	3477	3482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017459	GAT	2	6	3695	3700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
50	NC_017459	CTG	3	9	3714	3722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802385
51	NC_017459	ATA	2	6	3801	3806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802385
52	NC_017459	AAT	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802385
53	NC_017459	TCA	2	6	3896	3901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802385
54	NC_017459	TCA	2	6	4076	4081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802385
55	NC_017459	ATT	2	6	4154	4159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802385
56	NC_017459	TTG	2	6	4203	4208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802385
57	NC_017459	ACA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802385
58	NC_017459	TGT	2	6	4270	4275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802385
59	NC_017459	TGA	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
60	NC_017459	CTG	2	6	4395	4400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802385
61	NC_017459	GCG	2	6	4415	4420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802385
62	NC_017459	ATG	2	6	4461	4466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
63	NC_017459	TGC	2	6	4480	4485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802385
64	NC_017459	GAT	2	6	4574	4579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
65	NC_017459	TTG	2	6	4590	4595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802385
66	NC_017459	TTC	2	6	4659	4664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802385
67	NC_017459	ACG	2	6	4680	4685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802385
68	NC_017459	TGA	3	9	4717	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
69	NC_017459	ATG	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
70	NC_017459	TGA	2	6	4828	4833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
71	NC_017459	ATG	2	6	4869	4874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
72	NC_017459	CTC	2	6	4920	4925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802385
73	NC_017459	TAA	2	6	4971	4976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802385
74	NC_017459	ATG	2	6	5040	5045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
75	NC_017459	AAT	2	6	5246	5251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017459	GTG	2	6	5321	5326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017459	GTT	3	9	5355	5363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802386
78	NC_017459	GCA	3	9	5415	5423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802386
79	NC_017459	ACA	2	6	5448	5453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802386
80	NC_017459	CGC	2	6	5477	5482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802386
81	NC_017459	TTG	2	6	5518	5523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802386
82	NC_017459	TTC	2	6	5612	5617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802386
83	NC_017459	GTT	2	6	5661	5666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802386
84	NC_017459	TCA	2	6	5679	5684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802386
85	NC_017459	TGT	2	6	5711	5716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802386
86	NC_017459	TAT	3	9	5900	5908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017459	TAT	2	6	6160	6165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017459	TGG	2	6	6244	6249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802387
89	NC_017459	CGG	2	6	6300	6305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802387
90	NC_017459	TGT	2	6	6331	6336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802387
91	NC_017459	TGA	2	6	6373	6378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802387
92	NC_017459	CGC	2	6	6391	6396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802387
93	NC_017459	GTG	2	6	6474	6479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802387
94	NC_017459	TGA	2	6	6508	6513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802387
95	NC_017459	ATT	2	6	6521	6526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802387
96	NC_017459	GTG	2	6	6537	6542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802387
97	NC_017459	TGT	2	6	6601	6606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802387
98	NC_017459	ATG	2	6	6639	6644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802387
99	NC_017459	ACA	2	6	6647	6652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802387
100	NC_017459	CGG	2	6	6667	6672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802387
101	NC_017459	GTT	2	6	6722	6727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802387
102	NC_017459	TGA	2	6	6750	6755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802387
103	NC_017459	GTT	2	6	6770	6775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802387
104	NC_017459	TGA	2	6	6808	6813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802387
105	NC_017459	GTG	2	6	6834	6839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802387
106	NC_017459	GAC	2	6	6878	6883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802387
107	NC_017459	CGA	2	6	7063	7068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802387
108	NC_017459	TGA	2	6	7204	7209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802387
109	NC_017459	TCG	2	6	7347	7352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802387
110	NC_017459	GCA	2	6	7575	7580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017459	CTT	2	6	7627	7632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017459	AAT	2	6	7674	7679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017459	CGA	2	6	7907	7912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017459	GGC	2	6	7914	7919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017459	CAC	2	6	8019	8024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017459	CTG	2	6	8052	8057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017459	AGT	2	6	8139	8144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017459	AGT	2	6	8148	8153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017459	CAG	2	6	8156	8161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017459	CCA	2	6	8245	8250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017459	TCC	2	6	8265	8270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017459	GGA	3	9	8389	8397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017459	ACT	2	6	8408	8413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017459	CAA	2	6	8425	8430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017459	TGT	2	6	8510	8515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017459	AAT	2	6	8567	8572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017459	GCA	3	9	8716	8724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802388
128	NC_017459	TTC	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802388
129	NC_017459	TGT	2	6	8802	8807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802388
130	NC_017459	CAT	2	6	8813	8818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802388
131	NC_017459	TAA	3	9	8858	8866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802388
132	NC_017459	GAT	2	6	8880	8885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802388
133	NC_017459	GAG	2	6	8896	8901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802388
134	NC_017459	TAT	2	6	8930	8935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802388
135	NC_017459	ATC	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802388
136	NC_017459	TCT	2	6	9008	9013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802388
137	NC_017459	TCT	2	6	9053	9058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802388
138	NC_017459	ATT	2	6	9096	9101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802388
139	NC_017459	GCT	2	6	9109	9114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802388
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143	NC_017459	CGA	2	6	9249	9254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017459	GTA	2	6	9260	9265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017459	TGG	2	6	9414	9419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_017459	ATA	2	6	9464	9469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017459	ATT	2	6	9489	9494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017459	TCG	2	6	9498	9503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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259	NC_017459	AAG	2	6	16912	16917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802394
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299	NC_017459	CTT	2	6	19623	19628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_017459	ATC	2	6	19660	19665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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381	NC_017459	AGC	2	6	25162	25167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802402
382	NC_017459	AGA	2	6	25229	25234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802402
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