MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017459	TC	3	6	189640	189645	0 %	50 %	0 %	50 %	385802520
4002	NC_017459	ACGA	2	8	189646	189653	50 %	0 %	25 %	25 %	385802520
4003	NC_017459	CACTGA	2	12	189811	189822	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385802520
4004	NC_017459	GTATCA	2	12	189839	189850	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385802520
4005	NC_017459	CAT	2	6	189881	189886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802520
4006	NC_017459	TTG	2	6	189907	189912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802520
4007	NC_017459	CAG	3	9	189928	189936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802520
4008	NC_017459	GTG	2	6	189982	189987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802520
4009	NC_017459	GTT	2	6	189993	189998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802520
4010	NC_017459	TTCAC	2	10	190048	190057	20 %	40 %	0 %	40 %	385802520
4011	NC_017459	CAG	2	6	190105	190110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802520
4012	NC_017459	CAG	2	6	190150	190155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802520
4013	NC_017459	AGG	2	6	190192	190197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802520
4014	NC_017459	GAC	2	6	190248	190253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802520
4015	NC_017459	CGA	2	6	190273	190278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802521
4016	NC_017459	CA	3	6	190303	190308	50 %	0 %	0 %	50 %	385802521
4017	NC_017459	GAT	3	9	190346	190354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802521
4018	NC_017459	AGC	2	6	190358	190363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802521
4019	NC_017459	AGG	2	6	190365	190370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802521
4020	NC_017459	GCA	3	9	190388	190396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802521
4021	NC_017459	TGA	2	6	190453	190458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802521
4022	NC_017459	ATG	2	6	190464	190469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802521
4023	NC_017459	AAT	2	6	190483	190488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802521
4024	NC_017459	TGA	2	6	190504	190509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802521
4025	NC_017459	AGA	2	6	190510	190515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802521
4026	NC_017459	GCA	2	6	190586	190591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802521
4027	NC_017459	GAC	2	6	190619	190624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802521
4028	NC_017459	TGA	2	6	190675	190680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802521
4029	NC_017459	GAT	2	6	190687	190692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802521
4030	NC_017459	ATC	2	6	190717	190722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802521
4031	NC_017459	TGA	2	6	190867	190872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802521
4032	NC_017459	ATT	2	6	190945	190950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802521
4033	NC_017459	TCA	2	6	191004	191009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802521
4034	NC_017459	GAC	3	9	191028	191036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802521
4035	NC_017459	AT	3	6	191085	191090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017459	TCA	2	6	191128	191133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_017459	GCG	2	6	191204	191209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802522
4038	NC_017459	CCG	2	6	191223	191228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802522
4039	NC_017459	TGA	2	6	191334	191339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802522
4040	NC_017459	CAG	2	6	191348	191353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802522
4041	NC_017459	ACTCA	2	10	191441	191450	40 %	20 %	0 %	40 %	385802522
4042	NC_017459	ATT	2	6	191576	191581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802522
4043	NC_017459	AAT	2	6	191614	191619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802522
4044	NC_017459	ACA	2	6	191653	191658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802522
4045	NC_017459	CGGC	2	8	191791	191798	0 %	0 %	50 %	50 %	385802522
4046	NC_017459	ACA	2	6	191812	191817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802522
4047	NC_017459	TCAT	2	8	191819	191826	25 %	50 %	0 %	25 %	385802522
4048	NC_017459	CGACT	2	10	191849	191858	20 %	20 %	20 %	40 %	385802522
4049	NC_017459	CTC	2	6	191876	191881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802522
4050	NC_017459	ATG	2	6	191891	191896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802522
4051	NC_017459	CTG	2	6	191897	191902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802522
4052	NC_017459	ATA	2	6	191923	191928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802522
4053	NC_017459	TGA	2	6	191946	191951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802522
4054	NC_017459	TTTC	2	8	191956	191963	0 %	75 %	0 %	25 %	385802522
4055	NC_017459	TGA	2	6	192002	192007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802522
4056	NC_017459	TGA	2	6	192018	192023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802522
4057	NC_017459	ATT	2	6	192079	192084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802522
4058	NC_017459	ACCA	2	8	192145	192152	50 %	0 %	0 %	50 %	385802522
4059	NC_017459	CAG	2	6	192170	192175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802522
4060	NC_017459	TCT	2	6	192186	192191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802522
4061	NC_017459	TCC	2	6	192236	192241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802522
4062	NC_017459	TG	3	6	192280	192285	0 %	50 %	50 %	0 %	385802522
4063	NC_017459	CAAT	2	8	192307	192314	50 %	25 %	0 %	25 %	385802522
4064	NC_017459	C	6	6	192363	192368	0 %	0 %	0 %	100 %	385802522
4065	NC_017459	GCA	2	6	192427	192432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802522
4066	NC_017459	GTC	2	6	192436	192441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802522
4067	NC_017459	GTT	2	6	192514	192519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802522
4068	NC_017459	CAG	2	6	192569	192574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802522
4069	NC_017459	CGC	2	6	192616	192621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802522
4070	NC_017459	CA	3	6	192633	192638	50 %	0 %	0 %	50 %	385802522
4071	NC_017459	CAC	2	6	192647	192652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802522
4072	NC_017459	TC	3	6	192681	192686	0 %	50 %	0 %	50 %	385802522
4073	NC_017459	GTC	2	6	192695	192700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802522
4074	NC_017459	CAC	2	6	192770	192775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802522
4075	NC_017459	ACA	2	6	192813	192818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802522
4076	NC_017459	GTC	2	6	192839	192844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802522
4077	NC_017459	GAT	2	6	192919	192924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802522
4078	NC_017459	GAA	2	6	193026	193031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802522
4079	NC_017459	GGATG	2	10	193044	193053	20 %	20 %	60 %	0 %	385802522
4080	NC_017459	TGC	2	6	193077	193082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802522
4081	NC_017459	TGC	2	6	193146	193151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802522
4082	NC_017459	GGT	2	6	193185	193190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802522
4083	NC_017459	GAT	2	6	193216	193221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802522
4084	NC_017459	AATC	2	8	193234	193241	50 %	25 %	0 %	25 %	385802522
4085	NC_017459	ATCT	2	8	193263	193270	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4086	NC_017459	GGCA	2	8	193314	193321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4087	NC_017459	CAG	2	6	193397	193402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_017459	ATCT	2	8	193419	193426	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4089	NC_017459	CTT	2	6	193511	193516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_017459	GGA	2	6	193586	193591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017459	TTCG	2	8	193647	193654	0 %	50 %	25 %	25 %	532164361
4092	NC_017459	TGA	2	6	193728	193733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532164361
4093	NC_017459	TGA	2	6	193746	193751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532164361
4094	NC_017459	AGT	2	6	193844	193849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532164361
4095	NC_017459	TCC	2	6	193863	193868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532164361
4096	NC_017459	CA	3	6	193893	193898	50 %	0 %	0 %	50 %	532164361
4097	NC_017459	TCA	2	6	193916	193921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532164361
4098	NC_017459	TCG	2	6	193952	193957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_017459	TGC	3	9	194032	194040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802524
4100	NC_017459	AT	3	6	194093	194098	50 %	50 %	0 %	0 %	385802524
4101	NC_017459	TGA	2	6	194119	194124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802524
4102	NC_017459	GT	3	6	194132	194137	0 %	50 %	50 %	0 %	385802524
4103	NC_017459	CAG	2	6	194196	194201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802524
4104	NC_017459	AGT	2	6	194300	194305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802524
4105	NC_017459	GCC	2	6	194325	194330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802524
4106	NC_017459	CGAC	2	8	194360	194367	25 %	0 %	25 %	50 %	385802524
4107	NC_017459	CATCT	2	10	194418	194427	20 %	40 %	0 %	40 %	385802524
4108	NC_017459	ATT	2	6	194447	194452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802524
4109	NC_017459	GTTC	2	8	194542	194549	0 %	50 %	25 %	25 %	385802524
4110	NC_017459	ACC	2	6	194559	194564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802524
4111	NC_017459	CGA	2	6	194606	194611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802524
4112	NC_017459	GTT	2	6	194635	194640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802524
4113	NC_017459	TGAT	2	8	194641	194648	25 %	50 %	25 %	0 %	385802524
4114	NC_017459	T	6	6	194650	194655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017459	TA	3	6	194680	194685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017459	CAA	2	6	194748	194753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_017459	TATC	2	8	194762	194769	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4118	NC_017459	T	6	6	194790	194795	0 %	100 %	0 %	0 %	385802525
4119	NC_017459	AGT	2	6	194875	194880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802525
4120	NC_017459	ATAA	2	8	194906	194913	75 %	25 %	0 %	0 %	385802525
4121	NC_017459	TCAG	2	8	195021	195028	25 %	25 %	25 %	25 %	385802525
4122	NC_017459	ATA	2	6	195074	195079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802525
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4237	NC_017459	TA	3	6	200214	200219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4238	NC_017459	GGT	2	6	200297	200302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4243	NC_017459	ACG	2	6	200523	200528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802531
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4246	NC_017459	AC	3	6	200677	200682	50 %	0 %	0 %	50 %	385802531
4247	NC_017459	ATC	2	6	200699	200704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802531
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4250	NC_017459	CTG	2	6	200885	200890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4251	NC_017459	GATA	2	8	200912	200919	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_017459	TAG	2	6	200921	200926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4254	NC_017459	CTG	2	6	201005	201010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802532
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4273	NC_017459	GGA	2	6	201622	201627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4275	NC_017459	CTGG	2	8	201638	201645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4276	NC_017459	CAG	2	6	201728	201733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4278	NC_017459	ACCCG	3	15	201882	201896	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4279	NC_017459	TAC	2	6	201947	201952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4284	NC_017459	GAT	2	6	202123	202128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802533
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4342	NC_017459	ACCAGT	2	12	204778	204789	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4351	NC_017459	TTGGTG	2	12	205223	205234	0 %	50 %	50 %	0 %	385802536
4352	NC_017459	GGC	2	6	205311	205316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802536
4353	NC_017459	CAT	2	6	205328	205333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802536
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4355	NC_017459	CCA	2	6	205391	205396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802536
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4359	NC_017459	ATA	2	6	205493	205498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802536
4360	NC_017459	ATA	2	6	205614	205619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802536
4361	NC_017459	TCAAA	2	10	205641	205650	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4362	NC_017459	CA	3	6	205674	205679	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4363	NC_017459	TGG	2	6	205694	205699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4364	NC_017459	TAT	2	6	205788	205793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4365	NC_017459	GC	3	6	205834	205839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4366	NC_017459	TAT	3	9	205913	205921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802537
4367	NC_017459	GAC	2	6	205940	205945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802537
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4369	NC_017459	CTG	2	6	206000	206005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802537
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4493	NC_017459	GTC	2	6	211464	211469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4494	NC_017459	TC	3	6	211485	211490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4495	NC_017459	AATCCA	2	12	211556	211567	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4496	NC_017459	ATGAAT	3	18	211583	211600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4497	NC_017459	ATAAAT	2	12	211601	211612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4498	NC_017459	ATT	2	6	211628	211633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_017459	GAC	2	6	211642	211647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4500	NC_017459	AAT	3	9	211716	211724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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