MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017459	AAC	2	6	70929	70934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_017459	CGG	2	6	71033	71038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_017459	GTA	2	6	71066	71071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017459	GCA	2	6	71243	71248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_017459	TAGG	2	8	71249	71256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017459	TAC	2	6	71307	71312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_017459	GTGACT	2	12	71319	71330	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1508	NC_017459	GGA	2	6	71340	71345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017459	GC	3	6	71402	71407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_017459	TGA	2	6	71548	71553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017459	GTC	2	6	71581	71586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_017459	CCTG	2	8	71645	71652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_017459	GTT	2	6	71675	71680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017459	AGG	2	6	71691	71696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017459	CGT	2	6	71716	71721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_017459	GCT	2	6	71733	71738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_017459	AGC	2	6	71843	71848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_017459	CAC	2	6	71853	71858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_017459	CCTC	2	8	71891	71898	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1520	NC_017459	AAG	2	6	71902	71907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017459	AGA	2	6	71927	71932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017459	TAGA	2	8	71938	71945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017459	TAT	2	6	72024	72029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017459	TAC	2	6	72034	72039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_017459	TATCA	2	10	72049	72058	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1526	NC_017459	ACA	2	6	72088	72093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_017459	CA	3	6	72116	72121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_017459	GA	3	6	72127	72132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017459	GA	3	6	72154	72159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017459	TTGA	2	8	72168	72175	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017459	TAC	2	6	72187	72192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_017459	TA	3	6	72240	72245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017459	CATACA	2	12	72284	72295	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_017459	AG	3	6	72312	72317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017459	GT	3	6	72373	72378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017459	CAGAT	2	10	72391	72400	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1537	NC_017459	ATA	2	6	72440	72445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017459	CAATA	5	25	72446	72470	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1539	NC_017459	GGC	2	6	72499	72504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_017459	GA	3	6	72582	72587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017459	CGC	2	6	72607	72612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_017459	TCAT	2	8	72644	72651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1543	NC_017459	GAG	2	6	72652	72657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017459	ATA	2	6	72666	72671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017459	CTC	2	6	72672	72677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_017459	ACG	2	6	72684	72689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_017459	TAT	2	6	72721	72726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017459	ATC	2	6	72788	72793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_017459	TAG	2	6	72875	72880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017459	TCA	2	6	72903	72908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_017459	AT	3	6	72924	72929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017459	AT	3	6	72931	72936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017459	TTA	2	6	72938	72943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017459	ACT	2	6	72981	72986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802437
1555	NC_017459	CCA	2	6	73025	73030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802437
1556	NC_017459	CCA	2	6	73054	73059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802437
1557	NC_017459	ATC	2	6	73084	73089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802437
1558	NC_017459	CAA	2	6	73152	73157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802437
1559	NC_017459	CAA	2	6	73191	73196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802437
1560	NC_017459	CCG	2	6	73217	73222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802437
1561	NC_017459	ATC	2	6	73279	73284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802437
1562	NC_017459	GT	3	6	73291	73296	0 %	50 %	50 %	0 %	385802437
1563	NC_017459	GTT	2	6	73302	73307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802437
1564	NC_017459	CAT	2	6	73308	73313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802437
1565	NC_017459	CAAAT	2	10	73332	73341	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1566	NC_017459	AATT	2	8	73349	73356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017459	GAG	2	6	73458	73463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017459	TCCA	2	8	73505	73512	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_017459	AGA	2	6	73595	73600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017459	TCACCA	2	12	73628	73639	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_017459	TGTC	2	8	73698	73705	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_017459	TGG	2	6	73812	73817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017459	AAAG	2	8	73849	73856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017459	CGA	2	6	73864	73869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_017459	AC	4	8	73934	73941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_017459	AAC	2	6	73970	73975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_017459	GTG	2	6	74003	74008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017459	AAG	2	6	74015	74020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017459	GAC	2	6	74050	74055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_017459	TG	3	6	74183	74188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017459	GT	3	6	74231	74236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017459	GTG	2	6	74271	74276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017459	TG	3	6	74342	74347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017459	GTT	2	6	74365	74370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017459	GCGG	2	8	74440	74447	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1586	NC_017459	GAA	2	6	74520	74525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017459	GAG	2	6	74538	74543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017459	TCCA	2	8	74641	74648	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_017459	GGT	2	6	74734	74739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017459	G	6	6	74837	74842	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017459	CAT	2	6	74883	74888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_017459	GAGCT	2	10	74910	74919	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1593	NC_017459	CT	4	8	74918	74925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_017459	ATC	2	6	74977	74982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_017459	ATG	3	9	75059	75067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802438
1596	NC_017459	TTC	2	6	75113	75118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802438
1597	NC_017459	TTG	2	6	75266	75271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802438
1598	NC_017459	GCA	2	6	75274	75279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802438
1599	NC_017459	AGC	2	6	75285	75290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802438
1600	NC_017459	AAC	2	6	75320	75325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802438
1601	NC_017459	TTG	2	6	75341	75346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802438
1602	NC_017459	TTGT	2	8	75359	75366	0 %	75 %	25 %	0 %	385802438
1603	NC_017459	CAA	2	6	75461	75466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802438
1604	NC_017459	AGC	2	6	75491	75496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802438
1605	NC_017459	CTA	2	6	75557	75562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802438
1606	NC_017459	TGG	2	6	75606	75611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802438
1607	NC_017459	GAA	2	6	75619	75624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802438
1608	NC_017459	ATTGA	2	10	75640	75649	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017459	A	6	6	75668	75673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017459	GA	3	6	75707	75712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017459	AC	3	6	75721	75726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_017459	AGT	2	6	75727	75732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017459	CATTTA	2	12	75733	75744	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1614	NC_017459	CTA	3	9	75764	75772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_017459	AT	3	6	75821	75826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017459	ATTTTT	2	12	75876	75887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385802439
1617	NC_017459	TATT	2	8	75894	75901	25 %	75 %	0 %	0 %	385802439
1618	NC_017459	TCGA	2	8	75934	75941	25 %	25 %	25 %	25 %	385802439
1619	NC_017459	ATG	2	6	76051	76056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802439
1620	NC_017459	ACC	2	6	76057	76062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802439
1621	NC_017459	TCA	3	9	76121	76129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802439
1622	NC_017459	CAA	2	6	76134	76139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802439
1623	NC_017459	AT	3	6	76175	76180	50 %	50 %	0 %	0 %	385802439
1624	NC_017459	CCA	2	6	76181	76186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802439
1625	NC_017459	AAT	2	6	76306	76311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802439
1626	NC_017459	TGT	2	6	76339	76344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802439
1627	NC_017459	CGC	2	6	76384	76389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802439
1628	NC_017459	TCA	2	6	76400	76405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802439
1629	NC_017459	TCA	2	6	76409	76414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802439
1630	NC_017459	GTAT	2	8	76417	76424	25 %	50 %	25 %	0 %	385802439
1631	NC_017459	TCA	2	6	76463	76468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802439
1632	NC_017459	TCC	2	6	76534	76539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802439
1633	NC_017459	TTG	2	6	76629	76634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802439
1634	NC_017459	TGA	2	6	76669	76674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802439
1635	NC_017459	AGC	2	6	76678	76683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802439
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