MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017459	ATC	2	6	47074	47079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802425
1002	NC_017459	CGT	2	6	47120	47125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802425
1003	NC_017459	AATATT	2	12	47143	47154	50 %	50 %	0 %	0 %	385802425
1004	NC_017459	CG	3	6	47210	47215	0 %	0 %	50 %	50 %	385802425
1005	NC_017459	ACA	2	6	47345	47350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802425
1006	NC_017459	TGA	2	6	47536	47541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802425
1007	NC_017459	AGT	2	6	47555	47560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802425
1008	NC_017459	AT	3	6	47597	47602	50 %	50 %	0 %	0 %	385802425
1009	NC_017459	AC	3	6	47619	47624	50 %	0 %	0 %	50 %	385802425
1010	NC_017459	TCA	2	6	47655	47660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802425
1011	NC_017459	GCA	2	6	47678	47683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802425
1012	NC_017459	AAC	2	6	47755	47760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802425
1013	NC_017459	CTG	2	6	47853	47858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802425
1014	NC_017459	TCA	2	6	47873	47878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802425
1015	NC_017459	ACG	2	6	47879	47884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802425
1016	NC_017459	CCA	2	6	47912	47917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802425
1017	NC_017459	CTG	2	6	47952	47957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802425
1018	NC_017459	GC	3	6	47996	48001	0 %	0 %	50 %	50 %	385802425
1019	NC_017459	CAA	2	6	48021	48026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802425
1020	NC_017459	GCTCG	2	10	48042	48051	0 %	20 %	40 %	40 %	385802425
1021	NC_017459	AT	3	6	48062	48067	50 %	50 %	0 %	0 %	385802425
1022	NC_017459	CAA	2	6	48078	48083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802425
1023	NC_017459	ATCC	2	8	48085	48092	25 %	25 %	0 %	50 %	385802425
1024	NC_017459	CCT	2	6	48117	48122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802425
1025	NC_017459	CCCGA	2	10	48124	48133	20 %	0 %	20 %	60 %	385802425
1026	NC_017459	CTG	3	9	48273	48281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802425
1027	NC_017459	CAA	2	6	48309	48314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802425
1028	NC_017459	GCA	2	6	48332	48337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802425
1029	NC_017459	CAA	2	6	48375	48380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802425
1030	NC_017459	TTCA	2	8	48412	48419	25 %	50 %	0 %	25 %	385802425
1031	NC_017459	ACG	2	6	48437	48442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802425
1032	NC_017459	CGG	2	6	48516	48521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802425
1033	NC_017459	TCG	2	6	48545	48550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802425
1034	NC_017459	TTC	2	6	48612	48617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_017459	CTGT	2	8	48632	48639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_017459	TATG	2	8	48651	48658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017459	TG	3	6	48657	48662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017459	CT	3	6	48801	48806	0 %	50 %	0 %	50 %	385802426
1039	NC_017459	TTC	2	6	48825	48830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802426
1040	NC_017459	AATG	2	8	48883	48890	50 %	25 %	25 %	0 %	385802426
1041	NC_017459	TGC	2	6	48925	48930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802426
1042	NC_017459	TGA	2	6	48946	48951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802426
1043	NC_017459	TGG	2	6	49054	49059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802426
1044	NC_017459	A	6	6	49189	49194	100 %	0 %	0 %	0 %	385802426
1045	NC_017459	GTCC	2	8	49328	49335	0 %	25 %	25 %	50 %	385802426
1046	NC_017459	CGT	3	9	49345	49353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802426
1047	NC_017459	CATG	2	8	49372	49379	25 %	25 %	25 %	25 %	385802426
1048	NC_017459	GAG	2	6	49385	49390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802426
1049	NC_017459	ATT	2	6	49397	49402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802426
1050	NC_017459	CAA	2	6	49430	49435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017459	TAT	2	6	49478	49483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017459	ATT	2	6	49500	49505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017459	ATATTT	2	12	49515	49526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017459	AT	3	6	49536	49541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017459	ACA	2	6	49624	49629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017459	AAAT	2	8	49672	49679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017459	CAG	2	6	49681	49686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_017459	CA	3	6	49757	49762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_017459	TGG	2	6	49763	49768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017459	CGG	2	6	49881	49886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017459	GAG	2	6	49936	49941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017459	TGA	2	6	49970	49975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017459	CAA	3	9	50084	50092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802427
1064	NC_017459	CCG	2	6	50163	50168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802427
1065	NC_017459	AAT	2	6	50169	50174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802427
1066	NC_017459	TCA	3	9	50209	50217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802427
1067	NC_017459	TCA	2	6	50236	50241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802427
1068	NC_017459	CAC	2	6	50417	50422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802427
1069	NC_017459	AAT	2	6	50496	50501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802427
1070	NC_017459	CCCG	2	8	50518	50525	0 %	0 %	25 %	75 %	385802427
1071	NC_017459	ACCC	2	8	50540	50547	25 %	0 %	0 %	75 %	385802427
1072	NC_017459	TAA	2	6	50642	50647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802427
1073	NC_017459	TGT	3	9	50694	50702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802427
1074	NC_017459	CG	3	6	50773	50778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_017459	CCG	2	6	50895	50900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802428
1076	NC_017459	GTT	2	6	50966	50971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802428
1077	NC_017459	TAT	2	6	50973	50978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802428
1078	NC_017459	ATT	2	6	51010	51015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802428
1079	NC_017459	ACC	2	6	51046	51051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802428
1080	NC_017459	TCA	2	6	51101	51106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802428
1081	NC_017459	TCAG	2	8	51179	51186	25 %	25 %	25 %	25 %	385802428
1082	NC_017459	GC	3	6	51191	51196	0 %	0 %	50 %	50 %	385802428
1083	NC_017459	CCA	2	6	51245	51250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802428
1084	NC_017459	TGC	2	6	51337	51342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802428
1085	NC_017459	GCT	2	6	51362	51367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802428
1086	NC_017459	T	6	6	51506	51511	0 %	100 %	0 %	0 %	385802428
1087	NC_017459	CAAAT	2	10	51667	51676	60 %	20 %	0 %	20 %	385802428
1088	NC_017459	GTT	2	6	51728	51733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802428
1089	NC_017459	AG	3	6	51742	51747	50 %	0 %	50 %	0 %	385802428
1090	NC_017459	TCA	2	6	51749	51754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802428
1091	NC_017459	TAG	2	6	51860	51865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802428
1092	NC_017459	CGT	2	6	51868	51873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802428
1093	NC_017459	TCA	2	6	51893	51898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802428
1094	NC_017459	TTTCC	2	10	51972	51981	0 %	60 %	0 %	40 %	385802428
1095	NC_017459	CGA	2	6	51995	52000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802428
1096	NC_017459	ACC	2	6	52028	52033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802428
1097	NC_017459	CAT	3	9	52047	52055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802428
1098	NC_017459	GTC	2	6	52062	52067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802428
1099	NC_017459	GTG	2	6	52098	52103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802428
1100	NC_017459	ATG	2	6	52276	52281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802428
1101	NC_017459	GCT	2	6	52301	52306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802428
1102	NC_017459	CAT	2	6	52317	52322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802428
1103	NC_017459	CAG	2	6	52413	52418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802428
1104	NC_017459	CCA	2	6	52463	52468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802428
1105	NC_017459	GTC	2	6	52509	52514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802428
1106	NC_017459	GT	3	6	52565	52570	0 %	50 %	50 %	0 %	385802428
1107	NC_017459	TGT	2	6	52606	52611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802428
1108	NC_017459	CGA	2	6	52615	52620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802428
1109	NC_017459	CAT	2	6	52641	52646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802428
1110	NC_017459	CAA	2	6	52674	52679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802428
1111	NC_017459	CA	3	6	52689	52694	50 %	0 %	0 %	50 %	385802428
1112	NC_017459	CGA	2	6	52697	52702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802428
1113	NC_017459	ACC	2	6	52729	52734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802428
1114	NC_017459	TAA	2	6	52791	52796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802428
1115	NC_017459	GCTC	2	8	52868	52875	0 %	25 %	25 %	50 %	385802428
1116	NC_017459	TCG	2	6	52879	52884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802428
1117	NC_017459	GCA	2	6	53072	53077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802428
1118	NC_017459	ACA	3	9	53078	53086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802428
1119	NC_017459	TGC	2	6	53113	53118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802428
1120	NC_017459	TTG	2	6	53122	53127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802428
1121	NC_017459	TTGA	2	8	53131	53138	25 %	50 %	25 %	0 %	385802428
1122	NC_017459	ACA	2	6	53174	53179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802428
1123	NC_017459	TG	3	6	53230	53235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017459	ACG	2	6	53250	53255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_017459	TAT	2	6	53318	53323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017459	GCAC	2	8	53327	53334	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1128	NC_017459	GACT	2	8	53345	53352	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1254	NC_017459	TTC	2	6	58444	58449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802431
1255	NC_017459	ATTCA	2	10	58543	58552	40 %	40 %	0 %	20 %	385802431
1256	NC_017459	CAT	2	6	58580	58585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802431
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1262	NC_017459	TGA	2	6	59027	59032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802432
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1270	NC_017459	TGA	2	6	59471	59476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802432
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1293	NC_017459	TTCA	2	8	60548	60555	25 %	50 %	0 %	25 %	385802432
1294	NC_017459	GGAC	2	8	60561	60568	25 %	0 %	50 %	25 %	385802432
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1299	NC_017459	AAT	2	6	60748	60753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1375	NC_017459	AGTG	2	8	64325	64332	25 %	25 %	50 %	0 %	385802434
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1380	NC_017459	GTT	2	6	64580	64585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802434
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1399	NC_017459	TA	4	8	65359	65366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1401	NC_017459	ATTA	2	8	65533	65540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1402	NC_017459	CTG	2	6	65565	65570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1413	NC_017459	CATG	2	8	65936	65943	25 %	25 %	25 %	25 %	385802436
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1429	NC_017459	GAC	2	6	66496	66501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1432	NC_017459	CCG	2	6	66575	66580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1441	NC_017459	GGT	2	6	67310	67315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1450	NC_017459	TCA	2	6	67856	67861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1480	NC_017459	ATACT	2	10	69080	69089	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1481	NC_017459	TACTG	2	10	69093	69102	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1482	NC_017459	GGCTC	2	10	69113	69122	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1497	NC_017459	CGT	2	6	70610	70615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1498	NC_017459	AAAC	2	8	70749	70756	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1499	NC_017459	AC	3	6	70755	70760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1500	NC_017459	GAA	2	6	70865	70870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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