MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017459	TAT	2	6	211757	211762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_017459	CGC	2	6	211834	211839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802544
4503	NC_017459	CAG	2	6	211845	211850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802544
4504	NC_017459	TGA	2	6	211858	211863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802544
4505	NC_017459	CTG	2	6	211866	211871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802544
4506	NC_017459	AGT	2	6	211970	211975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802544
4507	NC_017459	ATG	2	6	212025	212030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802544
4508	NC_017459	ATG	2	6	212076	212081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802544
4509	NC_017459	AG	3	6	212133	212138	50 %	0 %	50 %	0 %	385802544
4510	NC_017459	CA	3	6	212234	212239	50 %	0 %	0 %	50 %	385802544
4511	NC_017459	AC	3	6	212285	212290	50 %	0 %	0 %	50 %	385802544
4512	NC_017459	CGC	2	6	212311	212316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802544
4513	NC_017459	AGT	2	6	212389	212394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802544
4514	NC_017459	CTC	2	6	212397	212402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802544
4515	NC_017459	CTCA	2	8	212501	212508	25 %	25 %	0 %	50 %	385802544
4516	NC_017459	GAT	2	6	212522	212527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802544
4517	NC_017459	ACT	2	6	212545	212550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_017459	GAAA	2	8	212604	212611	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_017459	GTT	2	6	212759	212764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802545
4520	NC_017459	GAT	2	6	212831	212836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802545
4521	NC_017459	CA	3	6	212855	212860	50 %	0 %	0 %	50 %	385802545
4522	NC_017459	GTGG	2	8	212868	212875	0 %	25 %	75 %	0 %	385802545
4523	NC_017459	GCC	2	6	212904	212909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802545
4524	NC_017459	ACG	2	6	212991	212996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802545
4525	NC_017459	AGGA	2	8	212997	213004	50 %	0 %	50 %	0 %	385802545
4526	NC_017459	CGT	2	6	213067	213072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802545
4527	NC_017459	ACGT	2	8	213104	213111	25 %	25 %	25 %	25 %	385802545
4528	NC_017459	ACG	2	6	213117	213122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802545
4529	NC_017459	TGC	2	6	213189	213194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802545
4530	NC_017459	TTC	2	6	213209	213214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802545
4531	NC_017459	TCG	2	6	213229	213234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802545
4532	NC_017459	AAAG	2	8	213271	213278	75 %	0 %	25 %	0 %	385802545
4533	NC_017459	GAC	2	6	213322	213327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802545
4534	NC_017459	AGCG	2	8	213347	213354	25 %	0 %	50 %	25 %	385802545
4535	NC_017459	AACA	2	8	213407	213414	75 %	0 %	0 %	25 %	385802545
4536	NC_017459	GCG	2	6	213444	213449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802545
4537	NC_017459	GAC	2	6	213508	213513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802545
4538	NC_017459	GGCA	2	8	213528	213535	25 %	0 %	50 %	25 %	385802545
4539	NC_017459	CGT	2	6	213562	213567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802545
4540	NC_017459	GCT	2	6	213590	213595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802545
4541	NC_017459	TGGT	2	8	213611	213618	0 %	50 %	50 %	0 %	385802545
4542	NC_017459	CGT	2	6	213631	213636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802545
4543	NC_017459	CGCC	2	8	213637	213644	0 %	0 %	25 %	75 %	385802545
4544	NC_017459	GCGGG	2	10	213649	213658	0 %	0 %	80 %	20 %	385802545
4545	NC_017459	GGAG	2	8	213708	213715	25 %	0 %	75 %	0 %	385802545
4546	NC_017459	GGA	2	6	213718	213723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802545
4547	NC_017459	CT	3	6	213842	213847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_017459	AGT	2	6	213854	213859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_017459	TAT	2	6	214022	214027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_017459	GA	3	6	214039	214044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_017459	GGA	2	6	214137	214142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017459	TCT	2	6	214157	214162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_017459	TCG	2	6	214259	214264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_017459	TAA	2	6	214322	214327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017459	GAGT	2	8	214355	214362	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017459	AGGG	2	8	214376	214383	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_017459	CCG	2	6	214388	214393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4558	NC_017459	ATC	2	6	214397	214402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_017459	TCA	2	6	214455	214460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_017459	GACT	2	8	214461	214468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4561	NC_017459	ACCA	2	8	214480	214487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4562	NC_017459	CACGG	2	10	214562	214571	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4563	NC_017459	TCAC	2	8	214799	214806	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_017459	ATA	2	6	214809	214814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_017459	TGATAC	2	12	214900	214911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4566	NC_017459	ATG	2	6	214946	214951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802546
4567	NC_017459	TTC	2	6	214954	214959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802546
4568	NC_017459	CTG	2	6	215034	215039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802546
4569	NC_017459	GTA	2	6	215082	215087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802546
4570	NC_017459	TCA	3	9	215102	215110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802546
4571	NC_017459	GAC	2	6	215194	215199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802546
4572	NC_017459	CAC	2	6	215211	215216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802546
4573	NC_017459	CCA	2	6	215243	215248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802546
4574	NC_017459	TGC	2	6	215387	215392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802546
4575	NC_017459	GC	3	6	215435	215440	0 %	0 %	50 %	50 %	385802546
4576	NC_017459	TTCAAG	2	12	215464	215475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385802546
4577	NC_017459	CAAG	2	8	215541	215548	50 %	0 %	25 %	25 %	385802546
4578	NC_017459	GTC	2	6	215624	215629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802546
4579	NC_017459	ATG	2	6	215700	215705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802546
4580	NC_017459	AT	3	6	215759	215764	50 %	50 %	0 %	0 %	385802546
4581	NC_017459	TTA	2	6	215786	215791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802546
4582	NC_017459	AG	3	6	215827	215832	50 %	0 %	50 %	0 %	385802546
4583	NC_017459	ATC	2	6	215845	215850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802546
4584	NC_017459	CTTT	2	8	215867	215874	0 %	75 %	0 %	25 %	385802546
4585	NC_017459	AAC	2	6	215881	215886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802546
4586	NC_017459	CTG	2	6	215940	215945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802546
4587	NC_017459	TGC	2	6	215956	215961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802546
4588	NC_017459	CA	3	6	216016	216021	50 %	0 %	0 %	50 %	385802546
4589	NC_017459	ACG	2	6	216052	216057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802546
4590	NC_017459	ACG	2	6	216106	216111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802546
4591	NC_017459	GC	3	6	216155	216160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4592	NC_017459	CT	3	6	216174	216179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_017459	AATC	2	8	216197	216204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4594	NC_017459	ACA	2	6	216248	216253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_017459	CA	3	6	216264	216269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4596	NC_017459	ACTG	2	8	216359	216366	25 %	25 %	25 %	25 %	385802547
4597	NC_017459	TG	3	6	216513	216518	0 %	50 %	50 %	0 %	385802547
4598	NC_017459	CA	3	6	216523	216528	50 %	0 %	0 %	50 %	385802547
4599	NC_017459	CT	3	6	216618	216623	0 %	50 %	0 %	50 %	385802547
4600	NC_017459	CCT	2	6	216694	216699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802547
4601	NC_017459	ATGAA	2	10	216758	216767	60 %	20 %	20 %	0 %	385802547
4602	NC_017459	GTCG	2	8	216810	216817	0 %	25 %	50 %	25 %	385802547
4603	NC_017459	CGT	2	6	216824	216829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802547
4604	NC_017459	TG	3	6	216918	216923	0 %	50 %	50 %	0 %	385802547
4605	NC_017459	GCTCCT	2	12	217083	217094	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385802547
4606	NC_017459	CGG	2	6	217124	217129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_017459	CAA	2	6	217246	217251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_017459	GTT	3	9	217370	217378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802548
4609	NC_017459	GAT	2	6	217432	217437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802548
4610	NC_017459	CAC	2	6	217446	217451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802548
4611	NC_017459	CAT	2	6	217560	217565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802548
4612	NC_017459	GTCG	2	8	217638	217645	0 %	25 %	50 %	25 %	385802548
4613	NC_017459	TCG	2	6	217650	217655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802548
4614	NC_017459	AATA	2	8	217666	217673	75 %	25 %	0 %	0 %	385802548
4615	NC_017459	AAC	2	6	217741	217746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802548
4616	NC_017459	CTC	2	6	217798	217803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802548
4617	NC_017459	A	6	6	217891	217896	100 %	0 %	0 %	0 %	385802548
4618	NC_017459	TTG	2	6	217947	217952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802548
4619	NC_017459	CTG	2	6	218061	218066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802548
4620	NC_017459	GTTCTT	2	12	218130	218141	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4621	NC_017459	TCC	2	6	218167	218172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802549
4622	NC_017459	ATTA	2	8	218266	218273	50 %	50 %	0 %	0 %	385802549
4623	NC_017459	TTC	2	6	218302	218307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802549
4624	NC_017459	GCA	2	6	218378	218383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802549
4625	NC_017459	TCA	3	9	218393	218401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802549
4626	NC_017459	AGA	2	6	218476	218481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802549
4627	NC_017459	ATG	2	6	218571	218576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802549
4628	NC_017459	ATC	2	6	218659	218664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802549
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4630	NC_017459	GTC	2	6	218757	218762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802549
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4633	NC_017459	TG	3	6	218846	218851	0 %	50 %	50 %	0 %	385802549
4634	NC_017459	TTG	2	6	218862	218867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802549
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4638	NC_017459	TAA	2	6	219109	219114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802549
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4641	NC_017459	CAC	2	6	219147	219152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802549
4642	NC_017459	GTTGGT	2	12	219224	219235	0 %	50 %	50 %	0 %	385802549
4643	NC_017459	ACC	2	6	219238	219243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802549
4644	NC_017459	ATG	2	6	219407	219412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802549
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4646	NC_017459	TGTCTG	2	12	219440	219451	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385802550
4647	NC_017459	TTTG	2	8	219475	219482	0 %	75 %	25 %	0 %	385802550
4648	NC_017459	ATA	2	6	219496	219501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802550
4649	NC_017459	CGCA	2	8	219534	219541	25 %	0 %	25 %	50 %	385802550
4650	NC_017459	TTG	2	6	219543	219548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802550
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4654	NC_017459	AAT	2	6	219675	219680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802550
4655	NC_017459	TCA	2	6	219712	219717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802550
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4657	NC_017459	GCT	2	6	219773	219778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802550
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4660	NC_017459	GCTCTG	2	12	219944	219955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802550
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4666	NC_017459	ATTG	2	8	220177	220184	25 %	50 %	25 %	0 %	385802550
4667	NC_017459	TTC	2	6	220203	220208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802550
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4669	NC_017459	TGA	3	9	220431	220439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802551
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4677	NC_017459	T	6	6	220881	220886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4678	NC_017459	GTA	2	6	220974	220979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802552
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4682	NC_017459	GTT	2	6	221163	221168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802552
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4693	NC_017459	AT	3	6	221832	221837	50 %	50 %	0 %	0 %	385802553
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4700	NC_017459	GTT	2	6	222143	222148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802553
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4702	NC_017459	AG	3	6	222200	222205	50 %	0 %	50 %	0 %	385802553
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4709	NC_017459	AAGAAA	2	12	222492	222503	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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4721	NC_017459	CTG	2	6	222894	222899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802554
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4737	NC_017459	TGCCGT	2	12	223903	223914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802554
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4740	NC_017459	CG	3	6	223959	223964	0 %	0 %	50 %	50 %	385802554
4741	NC_017459	CAG	2	6	223995	224000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802554
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4745	NC_017459	ATT	2	6	224170	224175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802554
4746	NC_017459	CAT	2	6	224178	224183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802554
4747	NC_017459	CTC	2	6	224215	224220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802554
4748	NC_017459	GAA	2	6	224226	224231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802554
4749	NC_017459	ATC	3	9	224282	224290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802554
4750	NC_017459	GTC	2	6	224295	224300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802554
4751	NC_017459	GCT	2	6	224301	224306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802554
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4753	NC_017459	GAC	2	6	224320	224325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802554
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4755	NC_017459	CCG	2	6	224408	224413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802554
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4759	NC_017459	ATC	2	6	224599	224604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802554
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4762	NC_017459	CAT	2	6	224685	224690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802554
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4765	NC_017459	CAA	2	6	224931	224936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4766	NC_017459	CAT	2	6	224989	224994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802555
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4775	NC_017459	ACA	2	6	225455	225460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802555
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4777	NC_017459	GAT	2	6	225575	225580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802555
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4797	NC_017459	GAG	2	6	226639	226644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4798	NC_017459	AG	3	6	226643	226648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4799	NC_017459	GA	3	6	226666	226671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4800	NC_017459	GAT	2	6	226684	226689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4802	NC_017459	GTCG	2	8	226888	226895	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4803	NC_017459	CAC	2	6	226924	226929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4804	NC_017459	TCAG	2	8	226976	226983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4805	NC_017459	CGT	2	6	227181	227186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802557
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4848	NC_017459	ATTT	2	8	229069	229076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4850	NC_017459	CTG	2	6	229236	229241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4857	NC_017459	AC	3	6	229514	229519	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4858	NC_017459	TAC	2	6	229525	229530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802558
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4992	NC_017459	GATG	2	8	236597	236604	25 %	25 %	50 %	0 %	385802564
4993	NC_017459	TG	3	6	236607	236612	0 %	50 %	50 %	0 %	385802564
4994	NC_017459	GTGTA	2	10	236622	236631	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4995	NC_017459	GTG	2	6	236662	236667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4996	NC_017459	TATGA	2	10	236745	236754	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4997	NC_017459	AT	3	6	236770	236775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_017459	ATA	2	6	236797	236802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4999	NC_017459	CAT	2	6	236811	236816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5000	NC_017459	TC	3	6	236868	236873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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