MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL100

Total Repeats: 1325

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017457	GTA	2	6	132	137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017457	TTG	2	6	192	197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017457	AGC	2	6	209	214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017457	TCT	2	6	277	282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017457	TGA	2	6	313	318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017457	CTT	2	6	397	402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017457	TTC	2	6	491	496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017457	ATT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017457	ATT	2	6	618	623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017457	TTC	2	6	679	684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017457	ACT	2	6	725	730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017457	GAT	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017457	TCT	2	6	1063	1068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802305
14	NC_017457	CGA	2	6	1094	1099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802305
15	NC_017457	TAG	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802305
16	NC_017457	AGG	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802305
17	NC_017457	TTA	2	6	1182	1187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017457	GAT	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802306
19	NC_017457	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802306
20	NC_017457	GAT	3	9	1311	1319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802306
21	NC_017457	GCA	2	6	1386	1391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802306
22	NC_017457	CAC	2	6	1505	1510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017457	TTC	2	6	1736	1741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017457	CGA	2	6	1771	1776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802307
25	NC_017457	TCA	2	6	1819	1824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802307
26	NC_017457	TCA	2	6	1865	1870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802307
27	NC_017457	AAG	2	6	1937	1942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802307
28	NC_017457	GTG	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802307
29	NC_017457	ATC	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802307
30	NC_017457	GAA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802307
31	NC_017457	ACT	2	6	2129	2134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802307
32	NC_017457	GAT	2	6	2149	2154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017457	GAT	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017457	GAT	2	6	2204	2209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017457	CAT	2	6	2291	2296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017457	CAA	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802308
37	NC_017457	GGA	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802308
38	NC_017457	TGG	2	6	2651	2656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802308
39	NC_017457	CAT	2	6	2839	2844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802308
40	NC_017457	CGG	2	6	3217	3222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802309
41	NC_017457	TAA	2	6	3309	3314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802309
42	NC_017457	GTG	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802309
43	NC_017457	GTT	2	6	3451	3456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802309
44	NC_017457	CAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802309
45	NC_017457	GGT	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017457	ATT	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017457	GTC	2	6	3641	3646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017457	GTC	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802310
49	NC_017457	AGA	2	6	3763	3768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802310
50	NC_017457	ATT	2	6	3822	3827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802310
51	NC_017457	TCC	2	6	3907	3912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802310
52	NC_017457	AGC	2	6	3960	3965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802310
53	NC_017457	TGA	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802310
54	NC_017457	AAG	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802310
55	NC_017457	CCA	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802310
56	NC_017457	CGT	2	6	4051	4056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802310
57	NC_017457	TAC	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802310
58	NC_017457	TAT	3	9	4185	4193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017457	GGT	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017457	CTG	2	6	4310	4315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017457	TGA	2	6	4358	4363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802311
62	NC_017457	GAC	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802311
63	NC_017457	TGG	2	6	4527	4532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802311
64	NC_017457	CTG	2	6	4537	4542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802311
65	NC_017457	CAT	2	6	4656	4661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017457	ATC	2	6	4685	4690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017457	TCA	3	9	4715	4723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017457	TTA	2	6	4856	4861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802312
69	NC_017457	CTG	2	6	5085	5090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802312
70	NC_017457	GTT	2	6	5139	5144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802312
71	NC_017457	AGC	2	6	5254	5259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802312
72	NC_017457	AGA	2	6	5278	5283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802312
73	NC_017457	GAG	2	6	5324	5329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802312
74	NC_017457	CTT	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802312
75	NC_017457	AGG	2	6	5542	5547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017457	ATC	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017457	TCA	2	6	5702	5707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017457	GTT	2	6	5710	5715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017457	CAA	2	6	5721	5726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017457	CAA	2	6	5766	5771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017457	AAT	2	6	5979	5984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017457	TCC	2	6	6059	6064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017457	CAG	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017457	CAC	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017457	TAA	2	6	6466	6471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017457	ATG	2	6	6486	6491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017457	TAC	2	6	6523	6528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017457	GAC	2	6	6557	6562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
89	NC_017457	AGA	2	6	6563	6568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802313
90	NC_017457	TCC	2	6	6592	6597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802313
91	NC_017457	TGA	2	6	6602	6607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
92	NC_017457	GAC	2	6	6629	6634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
93	NC_017457	TAT	2	6	6731	6736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802313
94	NC_017457	GAG	2	6	6792	6797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802313
95	NC_017457	ATC	2	6	6893	6898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802313
96	NC_017457	CGA	2	6	6966	6971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
97	NC_017457	CAA	2	6	6975	6980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802313
98	NC_017457	TCG	2	6	7027	7032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802313
99	NC_017457	CGA	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
100	NC_017457	TGA	2	6	7163	7168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
101	NC_017457	GGT	2	6	7200	7205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802313
102	NC_017457	ATG	3	9	7279	7287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
103	NC_017457	TGG	2	6	7292	7297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802313
104	NC_017457	TGA	3	9	7475	7483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
105	NC_017457	TGA	2	6	7526	7531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
106	NC_017457	CTG	2	6	7609	7614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802313
107	NC_017457	CGT	2	6	7719	7724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802313
108	NC_017457	GTC	2	6	8019	8024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802313
109	NC_017457	TCA	2	6	8161	8166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802313
110	NC_017457	ACG	2	6	8254	8259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
111	NC_017457	TGA	2	6	8267	8272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
112	NC_017457	CTG	2	6	8329	8334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802313
113	NC_017457	AAC	2	6	8455	8460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802313
114	NC_017457	CTT	2	6	8553	8558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802313
115	NC_017457	GAC	2	6	8622	8627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
116	NC_017457	TCT	2	6	8639	8644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802313
117	NC_017457	ACG	2	6	8964	8969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
118	NC_017457	TGA	2	6	9130	9135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017457	GAG	2	6	9237	9242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017457	GTG	2	6	9310	9315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802314
121	NC_017457	ACA	2	6	9403	9408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802314
122	NC_017457	GTC	2	6	9409	9414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802314
123	NC_017457	TCG	2	6	9548	9553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802314
124	NC_017457	ACC	2	6	9555	9560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802314
125	NC_017457	CTT	2	6	9670	9675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802314
126	NC_017457	AGT	2	6	9729	9734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802314
127	NC_017457	GCT	2	6	9772	9777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802314
128	NC_017457	ATT	2	6	9814	9819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802314
129	NC_017457	CAG	2	6	9865	9870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802314
130	NC_017457	TCG	2	6	9923	9928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802314
131	NC_017457	TGT	2	6	9939	9944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802314
132	NC_017457	ATT	2	6	9964	9969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802314
133	NC_017457	CTT	2	6	10026	10031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802314
134	NC_017457	GTG	2	6	10034	10039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802314
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262	NC_017457	TTG	2	6	21343	21348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802320
263	NC_017457	TCA	2	6	21521	21526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_017457	TAA	2	6	22236	22241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017457	GAT	2	6	22312	22317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_017457	CAT	2	6	30864	30869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_017457	TCA	2	6	30894	30899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
384	NC_017457	ACC	2	6	31094	31099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802328
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