MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL100

Total Repeats: 2095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017457	CAA	2	6	95850	95855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802374
2002	NC_017457	CGT	2	6	95856	95861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2003	NC_017457	CT	3	6	95887	95892	0 %	50 %	0 %	50 %	385802374
2004	NC_017457	GAC	2	6	95893	95898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2005	NC_017457	GAC	2	6	95911	95916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2006	NC_017457	CTC	2	6	95989	95994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802374
2007	NC_017457	TGA	2	6	96078	96083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802374
2008	NC_017457	CAG	2	6	96103	96108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2009	NC_017457	GAC	2	6	96246	96251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2010	NC_017457	CTT	2	6	96300	96305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802374
2011	NC_017457	GTCTC	2	10	96320	96329	0 %	40 %	20 %	40 %	385802374
2012	NC_017457	GAG	2	6	96340	96345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802374
2013	NC_017457	GAC	2	6	96355	96360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2014	NC_017457	TAC	2	6	96472	96477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802374
2015	NC_017457	CA	3	6	96507	96512	50 %	0 %	0 %	50 %	385802374
2016	NC_017457	AGG	2	6	96554	96559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802374
2017	NC_017457	ACTC	2	8	96696	96703	25 %	25 %	0 %	50 %	385802374
2018	NC_017457	CAA	2	6	96840	96845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802374
2019	NC_017457	CAG	2	6	96928	96933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2020	NC_017457	GGC	2	6	96978	96983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802374
2021	NC_017457	GATTC	2	10	97008	97017	20 %	40 %	20 %	20 %	385802374
2022	NC_017457	CGCT	2	8	97021	97028	0 %	25 %	25 %	50 %	385802374
2023	NC_017457	CGA	2	6	97050	97055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2024	NC_017457	ACG	2	6	97066	97071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2025	NC_017457	CCT	2	6	97092	97097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802374
2026	NC_017457	TGA	2	6	97098	97103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802374
2027	NC_017457	GCCA	2	8	97119	97126	25 %	0 %	25 %	50 %	385802374
2028	NC_017457	CTG	2	6	97183	97188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2029	NC_017457	CAG	2	6	97231	97236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2030	NC_017457	GAG	2	6	97354	97359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802374
2031	NC_017457	CTT	2	6	97371	97376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802374
2032	NC_017457	CCG	2	6	97386	97391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802374
2033	NC_017457	CAC	2	6	97416	97421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802374
2034	NC_017457	TCA	2	6	97448	97453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802374
2035	NC_017457	CGA	2	6	97461	97466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2036	NC_017457	TTC	2	6	97492	97497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802374
2037	NC_017457	ATT	2	6	97633	97638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802374
2038	NC_017457	CGT	2	6	97644	97649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2039	NC_017457	TCA	2	6	97655	97660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802374
2040	NC_017457	CGA	3	9	97662	97670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2041	NC_017457	GCT	2	6	97680	97685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2042	NC_017457	TA	3	6	97718	97723	50 %	50 %	0 %	0 %	385802374
2043	NC_017457	CGA	2	6	97799	97804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2044	NC_017457	TGTC	2	8	97821	97828	0 %	50 %	25 %	25 %	385802374
2045	NC_017457	GTC	2	6	97875	97880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2046	NC_017457	TGA	2	6	97911	97916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802374
2047	NC_017457	ATC	2	6	97927	97932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802374
2048	NC_017457	AGGG	2	8	97993	98000	25 %	0 %	75 %	0 %	385802374
2049	NC_017457	CGA	2	6	98030	98035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2050	NC_017457	TC	3	6	98061	98066	0 %	50 %	0 %	50 %	385802374
2051	NC_017457	CCA	2	6	98089	98094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802374
2052	NC_017457	CGGG	2	8	98121	98128	0 %	0 %	75 %	25 %	385802374
2053	NC_017457	ATC	2	6	98227	98232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802374
2054	NC_017457	CAA	2	6	98265	98270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802374
2055	NC_017457	AGGA	2	8	98363	98370	50 %	0 %	50 %	0 %	385802374
2056	NC_017457	AAC	2	6	98425	98430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802374
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2058	NC_017457	GAC	2	6	98533	98538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2059	NC_017457	CGT	2	6	98575	98580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802374
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2063	NC_017457	ACG	2	6	98782	98787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802374
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2070	NC_017457	TGA	2	6	99264	99269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802374
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2073	NC_017457	TGCTA	2	10	99367	99376	20 %	40 %	20 %	20 %	385802374
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2083	NC_017457	CCAG	2	8	99777	99784	25 %	0 %	25 %	50 %	385802374
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2086	NC_017457	AAAC	2	8	99863	99870	75 %	0 %	0 %	25 %	385802374
2087	NC_017457	AG	3	6	99888	99893	50 %	0 %	50 %	0 %	385802374
2088	NC_017457	A	6	6	99989	99994	100 %	0 %	0 %	0 %	385802374
2089	NC_017457	ACG	2	6	100001	100006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802374
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2091	NC_017457	TCG	2	6	100070	100075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802374
2092	NC_017457	TCA	2	6	100086	100091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802374
2093	NC_017457	GAA	2	6	100137	100142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802374
2094	NC_017457	GAG	2	6	100186	100191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802374
2095	NC_017457	TA	3	6	100247	100252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.