MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL100

Total Repeats: 2095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017457	ATT	2	6	46665	46670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017457	CA	3	6	46721	46726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_017457	ACG	2	6	46775	46780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017457	ATA	2	6	46874	46879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017457	T	6	6	46893	46898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017457	TTA	2	6	46909	46914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017457	A	6	6	46914	46919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017457	ATT	3	9	46946	46954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017457	AGC	2	6	47012	47017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_017457	AAT	2	6	47045	47050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017457	ATG	2	6	47083	47088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017457	ATA	2	6	47121	47126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017457	AAT	2	6	47192	47197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017457	TAC	2	6	47238	47243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017457	A	6	6	47244	47249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017457	GAA	2	6	47267	47272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017457	ATT	2	6	47282	47287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017457	ATT	2	6	47353	47358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017457	TGA	2	6	47371	47376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017457	TGAG	2	8	47389	47396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017457	GTT	2	6	47409	47414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017457	TTA	2	6	47465	47470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017457	TCTGA	2	10	47511	47520	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1024	NC_017457	GAA	2	6	47553	47558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017457	AAT	2	6	47604	47609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017457	T	8	8	47611	47618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017457	TA	3	6	47625	47630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017457	CTA	8	24	47726	47749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017457	TAC	2	6	47750	47755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017457	TA	3	6	47760	47765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017457	ACT	2	6	47770	47775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_017457	TAC	3	9	47776	47784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017457	GTT	2	6	47792	47797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017457	AAT	2	6	47850	47855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017457	ATT	2	6	47872	47877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017457	GTA	2	6	47925	47930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017457	AG	3	6	47967	47972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017457	A	7	7	48000	48006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017457	TAT	2	6	48091	48096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017457	ATC	2	6	48097	48102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_017457	TTG	2	6	48123	48128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017457	ATT	2	6	48135	48140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017457	AAG	2	6	48272	48277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017457	AT	3	6	48388	48393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017457	AT	3	6	48509	48514	50 %	50 %	0 %	0 %	385802342
1046	NC_017457	GTT	2	6	48552	48557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802342
1047	NC_017457	TTG	2	6	48607	48612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802342
1048	NC_017457	AT	4	8	48619	48626	50 %	50 %	0 %	0 %	385802342
1049	NC_017457	TGA	2	6	48662	48667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802342
1050	NC_017457	A	8	8	48675	48682	100 %	0 %	0 %	0 %	385802342
1051	NC_017457	GAA	2	6	48693	48698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802342
1052	NC_017457	ATT	2	6	48751	48756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802342
1053	NC_017457	GAA	2	6	48764	48769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802342
1054	NC_017457	AT	3	6	48777	48782	50 %	50 %	0 %	0 %	385802342
1055	NC_017457	GAAG	2	8	48809	48816	50 %	0 %	50 %	0 %	385802342
1056	NC_017457	TCA	2	6	48860	48865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802342
1057	NC_017457	TCA	2	6	48922	48927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802342
1058	NC_017457	ATA	2	6	48949	48954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802342
1059	NC_017457	GTT	2	6	48980	48985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802342
1060	NC_017457	GAT	2	6	48996	49001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802342
1061	NC_017457	AG	3	6	49050	49055	50 %	0 %	50 %	0 %	385802342
1062	NC_017457	AGA	2	6	49070	49075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802342
1063	NC_017457	AAAG	2	8	49193	49200	75 %	0 %	25 %	0 %	385802342
1064	NC_017457	TA	3	6	49285	49290	50 %	50 %	0 %	0 %	385802342
1065	NC_017457	GAT	2	6	49401	49406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802342
1066	NC_017457	ATT	2	6	49510	49515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802342
1067	NC_017457	ATC	2	6	49563	49568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_017457	AT	3	6	49634	49639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017457	AT	3	6	49694	49699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017457	CTT	2	6	49714	49719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_017457	CACT	2	8	49759	49766	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_017457	GA	3	6	49775	49780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017457	A	6	6	49796	49801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017457	GAC	2	6	49805	49810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017457	GATA	2	8	49812	49819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017457	ATTT	2	8	49831	49838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017457	CAG	2	6	49904	49909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_017457	TA	3	6	49951	49956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017457	CGA	2	6	49982	49987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_017457	GAA	2	6	50119	50124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017457	GAGT	2	8	50244	50251	25 %	25 %	50 %	0 %	385802343
1082	NC_017457	TCT	2	6	50261	50266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802343
1083	NC_017457	TTC	2	6	50282	50287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802343
1084	NC_017457	ATG	2	6	50470	50475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802344
1085	NC_017457	TA	3	6	50585	50590	50 %	50 %	0 %	0 %	385802344
1086	NC_017457	TCT	2	6	50602	50607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802344
1087	NC_017457	TCA	2	6	50638	50643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802344
1088	NC_017457	AGG	2	6	50687	50692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802344
1089	NC_017457	TC	3	6	50699	50704	0 %	50 %	0 %	50 %	385802344
1090	NC_017457	AAAT	2	8	50771	50778	75 %	25 %	0 %	0 %	385802344
1091	NC_017457	CACT	2	8	50917	50924	25 %	25 %	0 %	50 %	385802344
1092	NC_017457	AACTG	2	10	50946	50955	40 %	20 %	20 %	20 %	385802344
1093	NC_017457	TCA	2	6	50964	50969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802344
1094	NC_017457	GA	3	6	50992	50997	50 %	0 %	50 %	0 %	385802344
1095	NC_017457	TCG	2	6	51001	51006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802344
1096	NC_017457	GAA	2	6	51012	51017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017457	T	6	6	51062	51067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017457	TC	3	6	51072	51077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_017457	GTA	2	6	51092	51097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017457	C	6	6	51117	51122	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1101	NC_017457	CAT	2	6	51152	51157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017457	TTCAG	2	10	51181	51190	20 %	40 %	20 %	20 %	385802345
1103	NC_017457	ACA	2	6	51229	51234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802345
1104	NC_017457	GAG	2	6	51254	51259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802345
1105	NC_017457	TG	3	6	51271	51276	0 %	50 %	50 %	0 %	385802345
1106	NC_017457	GTT	2	6	51302	51307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802345
1107	NC_017457	GTC	2	6	51335	51340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802345
1108	NC_017457	TCGG	2	8	51398	51405	0 %	25 %	50 %	25 %	385802345
1109	NC_017457	AAG	2	6	51444	51449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802345
1110	NC_017457	GAT	2	6	51559	51564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802345
1111	NC_017457	CGA	2	6	51665	51670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802345
1112	NC_017457	TGAG	2	8	51701	51708	25 %	25 %	50 %	0 %	385802345
1113	NC_017457	GTGG	2	8	51868	51875	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017457	ATGT	2	8	51998	52005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017457	AT	3	6	52044	52049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017457	ATA	2	6	52089	52094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017457	ATGTTG	2	12	52118	52129	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017457	A	6	6	52135	52140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017457	AGT	2	6	52143	52148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017457	ACC	2	6	52194	52199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_017457	TCT	2	6	52220	52225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_017457	TGG	2	6	52243	52248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017457	AT	3	6	52292	52297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017457	ATC	2	6	52307	52312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_017457	AGA	2	6	52335	52340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017457	AATTG	2	10	52405	52414	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017457	GAC	2	6	52645	52650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017457	CTAT	2	8	52745	52752	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_017457	AG	3	6	52836	52841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017457	AT	3	6	52936	52941	50 %	50 %	0 %	0 %	385802346
1131	NC_017457	CTT	2	6	52955	52960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802346
1132	NC_017457	GAA	2	6	53017	53022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802346
1133	NC_017457	TGA	2	6	53040	53045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802346
1134	NC_017457	TCC	2	6	53101	53106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802346
1135	NC_017457	GAA	2	6	53132	53137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802346
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1261	NC_017457	TAT	2	6	59420	59425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_017457	AT	4	8	59432	59439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_017457	TTA	2	6	59440	59445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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