MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL100

Total Repeats: 2095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017457	TAA	2	6	24295	24300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802323
502	NC_017457	TGA	2	6	24490	24495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802323
503	NC_017457	ATT	3	9	24531	24539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802323
504	NC_017457	AAAT	2	8	24546	24553	75 %	25 %	0 %	0 %	385802323
505	NC_017457	TTA	2	6	24570	24575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802323
506	NC_017457	CAG	2	6	24584	24589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802323
507	NC_017457	AAT	2	6	24632	24637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802323
508	NC_017457	TCG	2	6	24658	24663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802323
509	NC_017457	ATA	2	6	24672	24677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802323
510	NC_017457	TAT	2	6	24694	24699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802323
511	NC_017457	GCA	2	6	24719	24724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802323
512	NC_017457	CTA	2	6	24755	24760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802323
513	NC_017457	AAG	2	6	24788	24793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802323
514	NC_017457	A	6	6	24860	24865	100 %	0 %	0 %	0 %	385802323
515	NC_017457	TGA	2	6	24880	24885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802323
516	NC_017457	AGAT	2	8	25047	25054	50 %	25 %	25 %	0 %	385802323
517	NC_017457	AAT	2	6	25058	25063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802323
518	NC_017457	ATT	2	6	25067	25072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802323
519	NC_017457	ATT	2	6	25097	25102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802323
520	NC_017457	TGA	2	6	25186	25191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802323
521	NC_017457	TGA	2	6	25207	25212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802323
522	NC_017457	ATG	2	6	25248	25253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802323
523	NC_017457	TTA	2	6	25310	25315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802323
524	NC_017457	GATAT	2	10	25332	25341	40 %	40 %	20 %	0 %	385802323
525	NC_017457	GA	3	6	25384	25389	50 %	0 %	50 %	0 %	385802323
526	NC_017457	GAT	2	6	25547	25552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802323
527	NC_017457	ACG	2	6	25648	25653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802323
528	NC_017457	TGA	2	6	25726	25731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802323
529	NC_017457	TAT	2	6	25858	25863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802324
530	NC_017457	CAA	2	6	25885	25890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802324
531	NC_017457	AGA	2	6	25933	25938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802324
532	NC_017457	AAAG	2	8	25979	25986	75 %	0 %	25 %	0 %	385802324
533	NC_017457	TAA	2	6	26080	26085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802324
534	NC_017457	TTC	2	6	26109	26114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802324
535	NC_017457	GA	3	6	26195	26200	50 %	0 %	50 %	0 %	385802324
536	NC_017457	A	6	6	26302	26307	100 %	0 %	0 %	0 %	385802324
537	NC_017457	GCT	2	6	26323	26328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802324
538	NC_017457	GAT	2	6	26392	26397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802324
539	NC_017457	GAG	2	6	26483	26488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802324
540	NC_017457	AGT	2	6	26500	26505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802324
541	NC_017457	TAC	2	6	26533	26538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802324
542	NC_017457	GGT	2	6	26595	26600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802324
543	NC_017457	GA	4	8	26609	26616	50 %	0 %	50 %	0 %	385802324
544	NC_017457	AGT	2	6	26702	26707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802324
545	NC_017457	AAAT	2	8	26727	26734	75 %	25 %	0 %	0 %	385802324
546	NC_017457	AG	3	6	26740	26745	50 %	0 %	50 %	0 %	385802324
547	NC_017457	CTG	2	6	26802	26807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802324
548	NC_017457	TTA	2	6	26826	26831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802324
549	NC_017457	GCG	2	6	26891	26896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802324
550	NC_017457	AATT	2	8	26998	27005	50 %	50 %	0 %	0 %	385802324
551	NC_017457	AT	3	6	27063	27068	50 %	50 %	0 %	0 %	385802324
552	NC_017457	TAA	2	6	27088	27093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802324
553	NC_017457	GAT	2	6	27098	27103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802324
554	NC_017457	A	7	7	27140	27146	100 %	0 %	0 %	0 %	385802324
555	NC_017457	GTA	2	6	27191	27196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802324
556	NC_017457	ATCA	2	8	27213	27220	50 %	25 %	0 %	25 %	385802324
557	NC_017457	GAT	2	6	27313	27318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802324
558	NC_017457	TG	3	6	27326	27331	0 %	50 %	50 %	0 %	385802324
559	NC_017457	ATGAT	2	10	27333	27342	40 %	40 %	20 %	0 %	385802324
560	NC_017457	AAC	2	6	27369	27374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802324
561	NC_017457	TGA	2	6	27406	27411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802324
562	NC_017457	GAA	2	6	27811	27816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802324
563	NC_017457	A	9	9	27834	27842	100 %	0 %	0 %	0 %	385802324
564	NC_017457	GAA	2	6	27866	27871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802324
565	NC_017457	A	6	6	27926	27931	100 %	0 %	0 %	0 %	385802324
566	NC_017457	AC	3	6	28020	28025	50 %	0 %	0 %	50 %	385802324
567	NC_017457	TCA	2	6	28028	28033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802324
568	NC_017457	GAT	2	6	28070	28075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802324
569	NC_017457	GTA	2	6	28079	28084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802324
570	NC_017457	CT	4	8	28157	28164	0 %	50 %	0 %	50 %	385802324
571	NC_017457	A	6	6	28196	28201	100 %	0 %	0 %	0 %	385802324
572	NC_017457	GA	3	6	28259	28264	50 %	0 %	50 %	0 %	385802325
573	NC_017457	CGA	2	6	28338	28343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802325
574	NC_017457	TC	3	6	28392	28397	0 %	50 %	0 %	50 %	385802325
575	NC_017457	CTT	2	6	28401	28406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802325
576	NC_017457	A	6	6	28453	28458	100 %	0 %	0 %	0 %	385802325
577	NC_017457	TGC	2	6	28522	28527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802325
578	NC_017457	TCA	2	6	28528	28533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802325
579	NC_017457	ATG	2	6	28606	28611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802325
580	NC_017457	ATTCAT	2	12	28638	28649	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
581	NC_017457	AT	3	6	28667	28672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017457	GGA	2	6	28707	28712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017457	GTT	2	6	28746	28751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017457	ATC	2	6	28790	28795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017457	A	6	6	28809	28814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017457	TGA	3	9	28851	28859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017457	AG	3	6	28899	28904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017457	TTG	2	6	28976	28981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017457	CAT	2	6	29024	29029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_017457	ATC	2	6	29053	29058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017457	ACCCC	2	10	29094	29103	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
592	NC_017457	C	6	6	29100	29105	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
593	NC_017457	AG	3	6	29127	29132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017457	GTA	2	6	29197	29202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017457	AGTT	2	8	29266	29273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017457	AGTG	2	8	29290	29297	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017457	CAA	2	6	29319	29324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_017457	CGCC	2	8	29337	29344	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
599	NC_017457	ATT	2	6	29549	29554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017457	AAG	2	6	29581	29586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017457	ACGGG	2	10	29594	29603	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
602	NC_017457	ACTC	2	8	29642	29649	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_017457	GTC	2	6	29751	29756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802326
604	NC_017457	GA	3	6	29782	29787	50 %	0 %	50 %	0 %	385802326
605	NC_017457	TAC	2	6	29799	29804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802326
606	NC_017457	AGG	2	6	29931	29936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017457	TAGT	2	8	29993	30000	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017457	GA	3	6	30039	30044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017457	AAAT	2	8	30050	30057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017457	CCT	2	6	30069	30074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_017457	AG	3	6	30107	30112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017457	CT	3	6	30132	30137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_017457	CTG	2	6	30143	30148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_017457	CGA	2	6	30178	30183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_017457	CTC	2	6	30196	30201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_017457	GCT	2	6	30206	30211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_017457	TGT	2	6	30231	30236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802327
618	NC_017457	TCG	2	6	30264	30269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802327
619	NC_017457	TCA	2	6	30327	30332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802327
620	NC_017457	TCA	2	6	30357	30362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802327
621	NC_017457	GTC	2	6	30443	30448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802327
622	NC_017457	GCTG	2	8	30452	30459	0 %	25 %	50 %	25 %	385802327
623	NC_017457	AC	3	6	30529	30534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_017457	CATA	2	8	30604	30611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
625	NC_017457	TAT	2	6	30619	30624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017457	AATAT	2	10	30627	30636	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017457	TAG	2	6	30650	30655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017457	TG	3	6	30699	30704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017457	CT	3	6	30711	30716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_017457	A	7	7	30731	30737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017457	AG	3	6	30768	30773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017457	CAT	2	6	30864	30869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_017457	TCA	2	6	30894	30899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_017457	C	6	6	30940	30945	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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