MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halanaerobium praevalens DSM 2228 chromosome

Total Repeats: 37257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017455	CAA	2	6	5	10	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017455	AGG	2	6	297	302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017455	GAA	2	6	344	349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798918
4	NC_017455	ACT	2	6	426	431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798918
5	NC_017455	AAT	2	6	462	467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798918
6	NC_017455	GAA	2	6	510	515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798918
7	NC_017455	TTA	2	6	555	560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798918
8	NC_017455	AGA	2	6	635	640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798918
9	NC_017455	TGT	2	6	716	721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385798918
10	NC_017455	GTT	2	6	885	890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385798918
11	NC_017455	TCT	2	6	897	902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385798918
12	NC_017455	TGA	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798918
13	NC_017455	AAG	2	6	1033	1038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798918
14	NC_017455	TTA	2	6	1084	1089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798918
15	NC_017455	CCT	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385798918
16	NC_017455	AGA	2	6	1127	1132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798918
17	NC_017455	AGT	2	6	1253	1258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798918
18	NC_017455	TAA	2	6	1271	1276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798918
19	NC_017455	TTC	2	6	1331	1336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385798918
20	NC_017455	TAA	3	9	1394	1402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798918
21	NC_017455	CTG	2	6	1453	1458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798918
22	NC_017455	GGA	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385798918
23	NC_017455	ATA	2	6	1624	1629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798918
24	NC_017455	CAA	2	6	1748	1753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017455	TAA	2	6	1783	1788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017455	AAC	2	6	1842	1847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017455	ACT	2	6	1874	1879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017455	CTA	6	18	1911	1928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017455	TAA	2	6	1973	1978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017455	ATA	3	9	2114	2122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798919
31	NC_017455	ATT	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798919
32	NC_017455	AGA	2	6	2367	2372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798919
33	NC_017455	AAG	2	6	2398	2403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798919
34	NC_017455	CTA	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798919
35	NC_017455	CAC	2	6	2546	2551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385798919
36	NC_017455	GTA	2	6	2594	2599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798919
37	NC_017455	AAT	2	6	2614	2619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798919
38	NC_017455	ATA	2	6	2657	2662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798919
39	NC_017455	TGA	2	6	2748	2753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798919
40	NC_017455	CAG	2	6	2771	2776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798919
41	NC_017455	CTT	2	6	2810	2815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385798919
42	NC_017455	AGA	2	6	2856	2861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798919
43	NC_017455	CTG	2	6	2882	2887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798919
44	NC_017455	GAA	2	6	2911	2916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798919
45	NC_017455	GAA	2	6	3001	3006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798919
46	NC_017455	TAG	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798919
47	NC_017455	TAA	2	6	3160	3165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017455	AAT	2	6	3174	3179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017455	AGG	2	6	3194	3199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017455	GTG	2	6	3281	3286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385798920
51	NC_017455	GAA	2	6	3353	3358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798920
52	NC_017455	ATA	2	6	3423	3428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798920
53	NC_017455	GCA	2	6	3587	3592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798921
54	NC_017455	GCA	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798921
55	NC_017455	TAA	2	6	3699	3704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798921
56	NC_017455	AAG	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798921
57	NC_017455	TTA	2	6	3861	3866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798921
58	NC_017455	ATC	2	6	3869	3874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798921
59	NC_017455	ATC	2	6	3890	3895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798921
60	NC_017455	AAC	2	6	3977	3982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385798921
61	NC_017455	CTA	2	6	3986	3991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798921
62	NC_017455	ATT	2	6	4003	4008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798921
63	NC_017455	CTT	2	6	4109	4114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385798921
64	NC_017455	GAT	2	6	4234	4239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798921
65	NC_017455	ATA	2	6	4240	4245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798921
66	NC_017455	CAG	2	6	4291	4296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798921
67	NC_017455	CTG	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798921
68	NC_017455	GAT	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798921
69	NC_017455	AAG	2	6	4407	4412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798921
70	NC_017455	AGT	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798922
71	NC_017455	TAC	2	6	4630	4635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798922
72	NC_017455	GAA	2	6	4652	4657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798922
73	NC_017455	GAA	2	6	4676	4681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798922
74	NC_017455	TTG	2	6	4689	4694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385798922
75	NC_017455	ATT	2	6	4695	4700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798922
76	NC_017455	AGA	2	6	4798	4803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798922
77	NC_017455	CAT	2	6	4936	4941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798923
78	NC_017455	ATA	2	6	4961	4966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798923
79	NC_017455	TGA	2	6	4971	4976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798923
80	NC_017455	GAT	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798923
81	NC_017455	TGG	2	6	5139	5144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385798923
82	NC_017455	GTA	2	6	5191	5196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798923
83	NC_017455	TAG	2	6	5447	5452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798923
84	NC_017455	ATA	2	6	5453	5458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798923
85	NC_017455	AGA	2	6	5463	5468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798923
86	NC_017455	AAG	2	6	5477	5482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798923
87	NC_017455	TTG	2	6	5513	5518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385798923
88	NC_017455	AGA	2	6	5580	5585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798923
89	NC_017455	TAT	2	6	5604	5609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798923
90	NC_017455	ATC	2	6	5612	5617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798923
91	NC_017455	TAA	2	6	5649	5654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798923
92	NC_017455	AAG	2	6	5666	5671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798923
93	NC_017455	CTA	2	6	5702	5707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798923
94	NC_017455	GAT	2	6	5758	5763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798923
95	NC_017455	TAT	2	6	5802	5807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798923
96	NC_017455	TTG	2	6	5882	5887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385798923
97	NC_017455	CTG	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798923
98	NC_017455	TTC	2	6	5898	5903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385798923
99	NC_017455	AGA	2	6	5922	5927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798923
100	NC_017455	ATT	2	6	5950	5955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798923
101	NC_017455	TGC	2	6	5970	5975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798923
102	NC_017455	AGC	2	6	5988	5993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798923
103	NC_017455	AGA	2	6	6016	6021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798923
104	NC_017455	TGA	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798923
105	NC_017455	TTG	2	6	6104	6109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385798923
106	NC_017455	CTG	2	6	6119	6124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798923
107	NC_017455	GAA	2	6	6143	6148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798923
108	NC_017455	ATG	2	6	6230	6235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798923
109	NC_017455	TAA	2	6	6248	6253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798923
110	NC_017455	GAA	2	6	6277	6282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798923
111	NC_017455	ACC	2	6	6429	6434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385798923
112	NC_017455	AGA	2	6	6457	6462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798923
113	NC_017455	GAA	2	6	6463	6468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798923
114	NC_017455	GAA	2	6	6505	6510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798923
115	NC_017455	TAC	2	6	6582	6587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798923
116	NC_017455	AGC	2	6	6785	6790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798924
117	NC_017455	ATT	2	6	6841	6846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798924
118	NC_017455	AGA	2	6	6909	6914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798924
119	NC_017455	GAT	2	6	6930	6935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798924
120	NC_017455	TAG	2	6	7078	7083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798924
121	NC_017455	GCA	2	6	7122	7127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798924
122	NC_017455	ATG	2	6	7173	7178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798924
123	NC_017455	TGA	2	6	7220	7225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798924
124	NC_017455	AGA	2	6	7232	7237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798924
125	NC_017455	TTA	2	6	7269	7274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798924
126	NC_017455	TCC	2	6	7319	7324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385798924
127	NC_017455	TTA	2	6	7354	7359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798924
128	NC_017455	TGG	2	6	7430	7435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385798924
129	NC_017455	GTA	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798924
130	NC_017455	ATT	2	6	7545	7550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798924
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132	NC_017455	TAG	2	6	7780	7785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798924
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