MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halanaerobium praevalens DSM 2228 chromosome

Total Repeats: 64406

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017455	ATTAAA	2	12	20044	20055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798928
502	NC_017455	A	6	6	20053	20058	100 %	0 %	0 %	0 %	385798929
503	NC_017455	GTA	2	6	20062	20067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798929
504	NC_017455	TGG	2	6	20073	20078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385798929
505	NC_017455	CTG	2	6	20084	20089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798929
506	NC_017455	AGCTGC	2	12	20094	20105	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385798929
507	NC_017455	TCA	2	6	20205	20210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798929
508	NC_017455	GAA	2	6	20218	20223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798929
509	NC_017455	ATG	2	6	20258	20263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798929
510	NC_017455	CAG	2	6	20315	20320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798929
511	NC_017455	A	6	6	20323	20328	100 %	0 %	0 %	0 %	385798929
512	NC_017455	A	6	6	20509	20514	100 %	0 %	0 %	0 %	385798929
513	NC_017455	GGT	2	6	20617	20622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385798929
514	NC_017455	AGA	2	6	20649	20654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798929
515	NC_017455	TTAAAG	2	12	20668	20679	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385798929
516	NC_017455	ATT	2	6	20695	20700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798929
517	NC_017455	TGA	2	6	20739	20744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798929
518	NC_017455	TTA	2	6	20794	20799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798929
519	NC_017455	A	6	6	20836	20841	100 %	0 %	0 %	0 %	385798929
520	NC_017455	GAT	2	6	20857	20862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798929
521	NC_017455	GGT	2	6	20869	20874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385798929
522	NC_017455	GAA	2	6	20968	20973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798929
523	NC_017455	GCA	2	6	20995	21000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798929
524	NC_017455	AT	3	6	21003	21008	50 %	50 %	0 %	0 %	385798929
525	NC_017455	AGA	2	6	21012	21017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798929
526	NC_017455	A	6	6	21035	21040	100 %	0 %	0 %	0 %	385798929
527	NC_017455	TA	3	6	21125	21130	50 %	50 %	0 %	0 %	385798929
528	NC_017455	A	6	6	21251	21256	100 %	0 %	0 %	0 %	385798929
529	NC_017455	TGA	2	6	21261	21266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798929
530	NC_017455	AGG	2	6	21308	21313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385798929
531	NC_017455	AAAC	2	8	21331	21338	75 %	0 %	0 %	25 %	385798930
532	NC_017455	ATG	2	6	21386	21391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798930
533	NC_017455	GAA	2	6	21394	21399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798930
534	NC_017455	ATA	2	6	21400	21405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798930
535	NC_017455	AGA	2	6	21450	21455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798930
536	NC_017455	CAA	2	6	21482	21487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385798930
537	NC_017455	ATT	2	6	21577	21582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798930
538	NC_017455	CTA	2	6	21665	21670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798930
539	NC_017455	A	7	7	21682	21688	100 %	0 %	0 %	0 %	385798930
540	NC_017455	A	6	6	21692	21697	100 %	0 %	0 %	0 %	385798930
541	NC_017455	AAT	2	6	21703	21708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017455	AGTAA	2	10	21740	21749	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017455	ATT	2	6	21773	21778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017455	TAATT	2	10	21824	21833	40 %	60 %	0 %	0 %	385798931
545	NC_017455	ATT	2	6	21849	21854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798931
546	NC_017455	TAT	2	6	21865	21870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798931
547	NC_017455	ATTA	2	8	21879	21886	50 %	50 %	0 %	0 %	385798931
548	NC_017455	A	7	7	21898	21904	100 %	0 %	0 %	0 %	385798931
549	NC_017455	GAA	2	6	21912	21917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798931
550	NC_017455	A	6	6	21946	21951	100 %	0 %	0 %	0 %	385798931
551	NC_017455	A	6	6	21960	21965	100 %	0 %	0 %	0 %	385798931
552	NC_017455	ATT	2	6	21980	21985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798931
553	NC_017455	TTAA	2	8	22032	22039	50 %	50 %	0 %	0 %	385798931
554	NC_017455	A	6	6	22050	22055	100 %	0 %	0 %	0 %	385798931
555	NC_017455	AT	3	6	22084	22089	50 %	50 %	0 %	0 %	385798931
556	NC_017455	AAT	2	6	22104	22109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798931
557	NC_017455	GCAGCT	2	12	22110	22121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385798931
558	NC_017455	GAA	2	6	22122	22127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798931
559	NC_017455	GAA	2	6	22143	22148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798931
560	NC_017455	TCT	4	12	22152	22163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385798931
561	NC_017455	ATT	2	6	22167	22172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798931
562	NC_017455	AGA	2	6	22175	22180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798931
563	NC_017455	A	7	7	22228	22234	100 %	0 %	0 %	0 %	385798931
564	NC_017455	A	6	6	22280	22285	100 %	0 %	0 %	0 %	385798931
565	NC_017455	A	6	6	22290	22295	100 %	0 %	0 %	0 %	385798931
566	NC_017455	ATT	2	6	22359	22364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798931
567	NC_017455	AAAT	2	8	22378	22385	75 %	25 %	0 %	0 %	385798931
568	NC_017455	TTA	2	6	22386	22391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798931
569	NC_017455	GCT	2	6	22413	22418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798931
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571	NC_017455	AGA	2	6	22509	22514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798931
572	NC_017455	AAT	2	6	22556	22561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798931
573	NC_017455	AGA	2	6	22592	22597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798931
574	NC_017455	AATG	2	8	22631	22638	50 %	25 %	25 %	0 %	385798931
575	NC_017455	AACA	2	8	22711	22718	75 %	0 %	0 %	25 %	385798931
576	NC_017455	ATT	2	6	22828	22833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798931
577	NC_017455	GAA	2	6	22944	22949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798931
578	NC_017455	ATT	2	6	22962	22967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798931
579	NC_017455	A	7	7	22980	22986	100 %	0 %	0 %	0 %	385798931
580	NC_017455	GAA	2	6	23025	23030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798931
581	NC_017455	TA	3	6	23040	23045	50 %	50 %	0 %	0 %	385798931
582	NC_017455	A	6	6	23045	23050	100 %	0 %	0 %	0 %	385798931
583	NC_017455	GGTT	2	8	23067	23074	0 %	50 %	50 %	0 %	385798931
584	NC_017455	ATA	2	6	23194	23199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798931
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586	NC_017455	AAG	2	6	23284	23289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798931
587	NC_017455	TTTAA	2	10	23427	23436	40 %	60 %	0 %	0 %	385798931
588	NC_017455	TAAA	2	8	23572	23579	75 %	25 %	0 %	0 %	385798931
589	NC_017455	TGA	2	6	23606	23611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798931
590	NC_017455	ATT	2	6	23625	23630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798931
591	NC_017455	AGC	2	6	23640	23645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798931
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593	NC_017455	TA	3	6	23668	23673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017455	ATAA	2	8	23678	23685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017455	ATCTA	2	10	23721	23730	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
596	NC_017455	AGG	2	6	23731	23736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017455	TTTA	2	8	23738	23745	25 %	75 %	0 %	0 %	385798932
598	NC_017455	GAA	2	6	23747	23752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798932
599	NC_017455	A	6	6	23751	23756	100 %	0 %	0 %	0 %	385798932
600	NC_017455	TTAA	2	8	23757	23764	50 %	50 %	0 %	0 %	385798932
601	NC_017455	GTA	2	6	23778	23783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798932
602	NC_017455	GAT	2	6	23789	23794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798932
603	NC_017455	A	6	6	23829	23834	100 %	0 %	0 %	0 %	385798932
604	NC_017455	GAT	2	6	23838	23843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798932
605	NC_017455	A	6	6	23868	23873	100 %	0 %	0 %	0 %	385798932
606	NC_017455	GTG	2	6	23896	23901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385798932
607	NC_017455	TGC	2	6	23957	23962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798932
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609	NC_017455	TGT	3	9	24134	24142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385798932
610	NC_017455	ATG	3	9	24145	24153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798932
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612	NC_017455	TAC	2	6	24176	24181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385798932
613	NC_017455	GCA	2	6	24240	24245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798932
614	NC_017455	GATA	2	8	24287	24294	50 %	25 %	25 %	0 %	385798932
615	NC_017455	TTTAG	2	10	24357	24366	20 %	60 %	20 %	0 %	385798932
616	NC_017455	GGAATT	2	12	24387	24398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798932
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618	NC_017455	AGA	2	6	24452	24457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385798932
619	NC_017455	ATT	2	6	24458	24463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798932
620	NC_017455	GGA	2	6	24531	24536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385798932
621	NC_017455	TGC	2	6	24583	24588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385798932
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623	NC_017455	AT	3	6	24629	24634	50 %	50 %	0 %	0 %	385798932
624	NC_017455	CTT	2	6	24637	24642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385798932
625	NC_017455	GCA	3	9	24705	24713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385798932
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627	NC_017455	GAG	2	6	24743	24748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017455	A	6	6	24764	24769	100 %	0 %	0 %	0 %	385798933
629	NC_017455	TAAA	2	8	24782	24789	75 %	25 %	0 %	0 %	385798933
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631	NC_017455	A	6	6	24814	24819	100 %	0 %	0 %	0 %	385798933
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