MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 40949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017451	TTG	2	6	22966	22971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263256
502	NC_017451	AAG	2	6	23023	23028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263256
503	NC_017451	CATT	2	8	23110	23117	25 %	50 %	0 %	25 %	386263256
504	NC_017451	A	6	6	23259	23264	100 %	0 %	0 %	0 %	386263256
505	NC_017451	ATTT	2	8	23281	23288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017451	TCT	2	6	23301	23306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017451	CTTA	2	8	23333	23340	25 %	50 %	0 %	25 %	386263257
508	NC_017451	T	7	7	23351	23357	0 %	100 %	0 %	0 %	386263257
509	NC_017451	GTC	2	6	23377	23382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263257
510	NC_017451	GAT	2	6	23404	23409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263257
511	NC_017451	TCT	2	6	23460	23465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263257
512	NC_017451	CCA	2	6	23468	23473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386263257
513	NC_017451	AC	3	6	23516	23521	50 %	0 %	0 %	50 %	386263257
514	NC_017451	TCATT	2	10	23558	23567	20 %	60 %	0 %	20 %	386263257
515	NC_017451	TTATTT	2	12	23589	23600	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386263257
516	NC_017451	TTA	2	6	23602	23607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263257
517	NC_017451	TAA	2	6	23669	23674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263257
518	NC_017451	T	6	6	23690	23695	0 %	100 %	0 %	0 %	386263257
519	NC_017451	TGC	2	6	23720	23725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263257
520	NC_017451	AAT	2	6	23738	23743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263257
521	NC_017451	TTGAA	2	10	23844	23853	40 %	40 %	20 %	0 %	386263258
522	NC_017451	AGA	2	6	23854	23859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263258
523	NC_017451	GAA	2	6	23951	23956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263258
524	NC_017451	GAA	2	6	23975	23980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263258
525	NC_017451	TTGA	2	8	24005	24012	25 %	50 %	25 %	0 %	386263258
526	NC_017451	CA	3	6	24025	24030	50 %	0 %	0 %	50 %	386263258
527	NC_017451	TTA	2	6	24036	24041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263258
528	NC_017451	TTA	2	6	24133	24138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263258
529	NC_017451	A	6	6	24164	24169	100 %	0 %	0 %	0 %	386263258
530	NC_017451	A	7	7	24184	24190	100 %	0 %	0 %	0 %	386263258
531	NC_017451	TGT	2	6	24301	24306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263258
532	NC_017451	GGTT	2	8	24307	24314	0 %	50 %	50 %	0 %	386263258
533	NC_017451	TGG	2	6	24336	24341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263258
534	NC_017451	CTG	2	6	24396	24401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263258
535	NC_017451	TGG	2	6	24507	24512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263258
536	NC_017451	ATTG	2	8	24552	24559	25 %	50 %	25 %	0 %	386263258
537	NC_017451	T	7	7	24570	24576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017451	ATT	2	6	24591	24596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017451	AAT	2	6	24625	24630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017451	ATA	2	6	24642	24647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263259
541	NC_017451	A	6	6	24798	24803	100 %	0 %	0 %	0 %	386263259
542	NC_017451	GAA	2	6	24827	24832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263259
543	NC_017451	ACA	2	6	24833	24838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263259
544	NC_017451	TTA	2	6	24871	24876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263259
545	NC_017451	GAA	2	6	25046	25051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263259
546	NC_017451	TAT	2	6	25066	25071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263259
547	NC_017451	A	6	6	25098	25103	100 %	0 %	0 %	0 %	386263259
548	NC_017451	GAA	2	6	25142	25147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263259
549	NC_017451	TATCG	2	10	25157	25166	20 %	40 %	20 %	20 %	386263259
550	NC_017451	ATT	2	6	25170	25175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263259
551	NC_017451	TGGT	2	8	25222	25229	0 %	50 %	50 %	0 %	386263259
552	NC_017451	TAT	2	6	25313	25318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263259
553	NC_017451	TGG	2	6	25377	25382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263259
554	NC_017451	GCC	2	6	25390	25395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386263259
555	NC_017451	ATT	2	6	25400	25405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263259
556	NC_017451	TGA	2	6	25423	25428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263259
557	NC_017451	GGA	2	6	25468	25473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386263259
558	NC_017451	AGA	2	6	25546	25551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263259
559	NC_017451	ATTA	2	8	25744	25751	50 %	50 %	0 %	0 %	386263259
560	NC_017451	TGA	2	6	25765	25770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263259
561	NC_017451	GAA	2	6	25795	25800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263259
562	NC_017451	AAG	2	6	25824	25829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263259
563	NC_017451	GC	3	6	25863	25868	0 %	0 %	50 %	50 %	386263259
564	NC_017451	TTG	2	6	25895	25900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263259
565	NC_017451	TGG	2	6	25996	26001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263259
566	NC_017451	GAA	2	6	26101	26106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263259
567	NC_017451	A	6	6	26105	26110	100 %	0 %	0 %	0 %	386263259
568	NC_017451	TAAT	2	8	26114	26121	50 %	50 %	0 %	0 %	386263259
569	NC_017451	ATA	2	6	26165	26170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017451	TGG	2	6	26309	26314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263260
571	NC_017451	TTA	2	6	26328	26333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263260
572	NC_017451	TGG	2	6	26394	26399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263260
573	NC_017451	GAT	2	6	26403	26408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263260
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575	NC_017451	ATT	2	6	26592	26597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263260
576	NC_017451	TGA	3	9	26654	26662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263260
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580	NC_017451	TTA	2	6	26895	26900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263260
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582	NC_017451	CGCT	2	8	27115	27122	0 %	25 %	25 %	50 %	386263261
583	NC_017451	GAT	2	6	27173	27178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263261
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585	NC_017451	TAA	2	6	27283	27288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263261
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587	NC_017451	CAA	2	6	27326	27331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263261
588	NC_017451	AAG	2	6	27415	27420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017451	TG	3	6	27484	27489	0 %	50 %	50 %	0 %	386263262
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591	NC_017451	A	6	6	27542	27547	100 %	0 %	0 %	0 %	386263262
592	NC_017451	AAT	2	6	27608	27613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263262
593	NC_017451	TTA	2	6	27621	27626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263262
594	NC_017451	TGA	2	6	27668	27673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263262
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596	NC_017451	GA	3	6	27710	27715	50 %	0 %	50 %	0 %	386263262
597	NC_017451	GA	3	6	27730	27735	50 %	0 %	50 %	0 %	386263262
598	NC_017451	TAAA	2	8	27835	27842	75 %	25 %	0 %	0 %	386263262
599	NC_017451	A	6	6	27840	27845	100 %	0 %	0 %	0 %	386263262
600	NC_017451	AT	3	6	27916	27921	50 %	50 %	0 %	0 %	386263262
601	NC_017451	TG	3	6	27924	27929	0 %	50 %	50 %	0 %	386263262
602	NC_017451	A	6	6	27936	27941	100 %	0 %	0 %	0 %	386263262
603	NC_017451	ATAG	2	8	27957	27964	50 %	25 %	25 %	0 %	386263262
604	NC_017451	TTA	2	6	28005	28010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263262
605	NC_017451	ATC	2	6	28041	28046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263262
606	NC_017451	AGA	2	6	28086	28091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263262
607	NC_017451	GAT	2	6	28104	28109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263262
608	NC_017451	CAG	2	6	28117	28122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263262
609	NC_017451	A	6	6	28149	28154	100 %	0 %	0 %	0 %	386263262
610	NC_017451	CATC	2	8	28218	28225	25 %	25 %	0 %	50 %	386263262
611	NC_017451	TAG	2	6	28226	28231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263262
612	NC_017451	AG	3	6	28233	28238	50 %	0 %	50 %	0 %	386263262
613	NC_017451	AGA	2	6	28495	28500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263263
614	NC_017451	GTGC	2	8	28544	28551	0 %	25 %	50 %	25 %	386263263
615	NC_017451	GTA	2	6	28559	28564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263263
616	NC_017451	TAC	2	6	28584	28589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263263
617	NC_017451	AGA	2	6	28597	28602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263263
618	NC_017451	ATT	3	9	28610	28618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263263
619	NC_017451	TGG	2	6	28621	28626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263263
620	NC_017451	TGG	2	6	28708	28713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263263
621	NC_017451	GAA	2	6	28715	28720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263263
622	NC_017451	AAG	2	6	28761	28766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263263
623	NC_017451	TTG	2	6	28828	28833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263263
624	NC_017451	CGG	2	6	28843	28848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386263263
625	NC_017451	AAG	2	6	28938	28943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263263
626	NC_017451	GAA	2	6	28961	28966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263263
627	NC_017451	A	7	7	28991	28997	100 %	0 %	0 %	0 %	386263263
628	NC_017451	CAC	2	6	29026	29031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386263263
629	NC_017451	A	6	6	29076	29081	100 %	0 %	0 %	0 %	386263263
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631	NC_017451	A	6	6	29264	29269	100 %	0 %	0 %	0 %	386263263
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