MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 40949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017451	T	6	6	240616	240621	0 %	100 %	0 %	0 %	386263470
5002	NC_017451	T	7	7	240694	240700	0 %	100 %	0 %	0 %	386263470
5003	NC_017451	AAAAAG	2	12	240732	240743	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017451	A	6	6	240760	240765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017451	T	6	6	240769	240774	0 %	100 %	0 %	0 %	386263471
5006	NC_017451	CATTT	2	10	240829	240838	20 %	60 %	0 %	20 %	386263471
5007	NC_017451	ATT	2	6	240850	240855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263471
5008	NC_017451	CTTT	2	8	241065	241072	0 %	75 %	0 %	25 %	386263471
5009	NC_017451	T	6	6	241075	241080	0 %	100 %	0 %	0 %	386263471
5010	NC_017451	CAA	2	6	241101	241106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263471
5011	NC_017451	CTG	2	6	241119	241124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263471
5012	NC_017451	CTT	2	6	241185	241190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263471
5013	NC_017451	T	6	6	241189	241194	0 %	100 %	0 %	0 %	386263471
5014	NC_017451	T	6	6	241231	241236	0 %	100 %	0 %	0 %	386263471
5015	NC_017451	GTTG	2	8	241280	241287	0 %	50 %	50 %	0 %	386263471
5016	NC_017451	CATTT	2	10	241312	241321	20 %	60 %	0 %	20 %	386263471
5017	NC_017451	AAC	2	6	241342	241347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263471
5018	NC_017451	TTG	2	6	241351	241356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263471
5019	NC_017451	CTA	2	6	241371	241376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263471
5020	NC_017451	CGT	2	6	241390	241395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263471
5021	NC_017451	ATT	2	6	241396	241401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263471
5022	NC_017451	CGC	2	6	241402	241407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386263471
5023	NC_017451	AGG	2	6	241471	241476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386263471
5024	NC_017451	GAA	2	6	241597	241602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263471
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5026	NC_017451	AATAA	2	10	241610	241619	80 %	20 %	0 %	0 %	386263471
5027	NC_017451	ATAA	2	8	241637	241644	75 %	25 %	0 %	0 %	386263471
5028	NC_017451	TCA	2	6	241760	241765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263471
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5030	NC_017451	GAA	2	6	241790	241795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263471
5031	NC_017451	GAA	2	6	241800	241805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263471
5032	NC_017451	T	6	6	241819	241824	0 %	100 %	0 %	0 %	386263471
5033	NC_017451	TGA	2	6	241864	241869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263471
5034	NC_017451	AGTT	2	8	241902	241909	25 %	50 %	25 %	0 %	386263471
5035	NC_017451	T	8	8	241919	241926	0 %	100 %	0 %	0 %	386263471
5036	NC_017451	GAT	2	6	242030	242035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263471
5037	NC_017451	ATTA	2	8	242093	242100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017451	GCG	2	6	242127	242132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_017451	A	6	6	242283	242288	100 %	0 %	0 %	0 %	386263472
5040	NC_017451	TAA	2	6	242325	242330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263472
5041	NC_017451	CAT	3	9	242383	242391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263472
5042	NC_017451	GATT	2	8	242412	242419	25 %	50 %	25 %	0 %	386263472
5043	NC_017451	GAT	2	6	242488	242493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263472
5044	NC_017451	TG	3	6	242497	242502	0 %	50 %	50 %	0 %	386263472
5045	NC_017451	TAA	2	6	242534	242539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263472
5046	NC_017451	TCA	2	6	242550	242555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263472
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5050	NC_017451	T	7	7	242746	242752	0 %	100 %	0 %	0 %	386263472
5051	NC_017451	GAA	2	6	242857	242862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263472
5052	NC_017451	T	7	7	242883	242889	0 %	100 %	0 %	0 %	386263472
5053	NC_017451	A	6	6	243022	243027	100 %	0 %	0 %	0 %	386263472
5054	NC_017451	GCA	2	6	243036	243041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263472
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5056	NC_017451	AAT	2	6	243087	243092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263472
5057	NC_017451	T	6	6	243111	243116	0 %	100 %	0 %	0 %	386263472
5058	NC_017451	TTC	2	6	243137	243142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263472
5059	NC_017451	TC	3	6	243187	243192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_017451	TAC	2	6	243224	243229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263473
5061	NC_017451	ACTCGT	2	12	243327	243338	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386263473
5062	NC_017451	AATT	2	8	243346	243353	50 %	50 %	0 %	0 %	386263473
5063	NC_017451	CTTAA	2	10	243420	243429	40 %	40 %	0 %	20 %	386263473
5064	NC_017451	CTG	2	6	243493	243498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263473
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5071	NC_017451	AT	3	6	243815	243820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017451	GTA	2	6	243822	243827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5074	NC_017451	T	6	6	243888	243893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5076	NC_017451	ATT	2	6	243932	243937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_017451	TTA	2	6	243953	243958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017451	TAT	2	6	243966	243971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017451	GGA	2	6	243990	243995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5091	NC_017451	ATT	2	6	244316	244321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263474
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5094	NC_017451	ATTTT	2	10	244540	244549	20 %	80 %	0 %	0 %	386263474
5095	NC_017451	T	6	6	244636	244641	0 %	100 %	0 %	0 %	386263474
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5098	NC_017451	A	7	7	244721	244727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017451	TGC	2	6	244765	244770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263475
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5104	NC_017451	GCT	2	6	244922	244927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263475
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5110	NC_017451	GTG	2	6	245135	245140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263475
5111	NC_017451	AGC	2	6	245167	245172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263475
5112	NC_017451	TTG	2	6	245212	245217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263475
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5126	NC_017451	AAGT	2	8	245743	245750	50 %	25 %	25 %	0 %	386263475
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5254	NC_017451	ATG	2	6	251717	251722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263483
5255	NC_017451	AATC	2	8	251735	251742	50 %	25 %	0 %	25 %	386263483
5256	NC_017451	GAT	2	6	251801	251806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263483
5257	NC_017451	GTG	2	6	251844	251849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263483
5258	NC_017451	A	8	8	251857	251864	100 %	0 %	0 %	0 %	386263483
5259	NC_017451	GAA	2	6	251885	251890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263483
5260	NC_017451	TG	3	6	252021	252026	0 %	50 %	50 %	0 %	386263483
5261	NC_017451	TGAG	2	8	252054	252061	25 %	25 %	50 %	0 %	386263483
5262	NC_017451	AT	3	6	252142	252147	50 %	50 %	0 %	0 %	386263483
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5265	NC_017451	TGG	3	9	252288	252296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263484
5266	NC_017451	TGC	2	6	252324	252329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263484
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5270	NC_017451	GGT	2	6	252451	252456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263484
5271	NC_017451	TGG	2	6	252467	252472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263484
5272	NC_017451	TGG	2	6	252534	252539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263484
5273	NC_017451	TTAT	2	8	252567	252574	25 %	75 %	0 %	0 %	386263484
5274	NC_017451	A	6	6	252580	252585	100 %	0 %	0 %	0 %	386263484
5275	NC_017451	TTAATC	2	12	252589	252600	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386263484
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5282	NC_017451	TGA	2	6	252852	252857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263484
5283	NC_017451	TAA	2	6	252913	252918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263484
5284	NC_017451	TAATT	2	10	252932	252941	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5285	NC_017451	T	6	6	252947	252952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5286	NC_017451	ATT	2	6	252968	252973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263485
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5291	NC_017451	CTG	2	6	253308	253313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263485
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5293	NC_017451	A	6	6	253473	253478	100 %	0 %	0 %	0 %	386263485
5294	NC_017451	TTTTA	2	10	253551	253560	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5295	NC_017451	T	6	6	253575	253580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5300	NC_017451	TGGGG	2	10	253833	253842	0 %	20 %	80 %	0 %	386263486
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5303	NC_017451	A	7	7	253948	253954	100 %	0 %	0 %	0 %	386263486
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5312	NC_017451	ATG	2	6	254538	254543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263487
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5373	NC_017451	AGA	2	6	257412	257417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263490
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5493	NC_017451	CAA	2	6	262557	262562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5495	NC_017451	TGT	2	6	262587	262592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_017451	A	6	6	262593	262598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_017451	AAG	2	6	262674	262679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263498
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