MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori v225d plasmid pHPv225d

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017383	TAT	2	6	113	118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017383	ATC	2	6	160	165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017383	ATT	2	6	364	369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888494
4	NC_017383	GAA	2	6	447	452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888494
5	NC_017383	ATA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888494
6	NC_017383	TTA	2	6	533	538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888494
7	NC_017383	AAC	2	6	621	626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888494
8	NC_017383	AAT	2	6	628	633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888494
9	NC_017383	TCA	2	6	650	655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888494
10	NC_017383	TAG	2	6	834	839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888494
11	NC_017383	GAT	2	6	865	870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888494
12	NC_017383	GAA	2	6	892	897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888494
13	NC_017383	CAA	2	6	971	976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888494
14	NC_017383	TTG	2	6	1068	1073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888494
15	NC_017383	ATA	2	6	1085	1090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888494
16	NC_017383	GAT	2	6	1102	1107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888494
17	NC_017383	ACA	2	6	1280	1285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888494
18	NC_017383	ATT	2	6	1466	1471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888495
19	NC_017383	GTG	2	6	1555	1560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384888495
20	NC_017383	TAA	2	6	1573	1578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888495
21	NC_017383	AGA	2	6	1754	1759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888495
22	NC_017383	TAC	2	6	1863	1868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888495
23	NC_017383	ATT	2	6	1905	1910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888495
24	NC_017383	GAT	2	6	1923	1928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888495
25	NC_017383	TCT	2	6	1929	1934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888495
26	NC_017383	ACA	2	6	1973	1978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888495
27	NC_017383	ACT	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888495
28	NC_017383	TTA	2	6	2413	2418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888495
29	NC_017383	CAC	2	6	2547	2552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384888496
30	NC_017383	CTT	2	6	2662	2667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888496
31	NC_017383	CAT	2	6	2975	2980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888496
32	NC_017383	CCA	2	6	3026	3031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384888496
33	NC_017383	TCT	2	6	3183	3188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888496
34	NC_017383	AAT	2	6	3242	3247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888496
35	NC_017383	ATA	2	6	3431	3436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888496
36	NC_017383	ACA	2	6	3462	3467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888496
37	NC_017383	ATC	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888496
38	NC_017383	AAT	2	6	3895	3900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888496
39	NC_017383	GTC	2	6	4097	4102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017383	CAG	2	6	4400	4405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384888497
41	NC_017383	AAC	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888498
42	NC_017383	AGC	2	6	4456	4461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384888498
43	NC_017383	GTT	2	6	4470	4475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888498
44	NC_017383	CAA	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888498
45	NC_017383	TTG	2	6	4581	4586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888498
46	NC_017383	ACT	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888498
47	NC_017383	TCA	2	6	4606	4611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888498
48	NC_017383	TTA	2	6	4618	4623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888498
49	NC_017383	TTA	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888500
50	NC_017383	TAA	2	6	5375	5380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888500
51	NC_017383	AAC	2	6	5437	5442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888500
52	NC_017383	TGA	2	6	5654	5659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017383	CTA	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017383	ACA	3	9	5930	5938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017383	CAT	2	6	6041	6046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017383	TAC	2	6	6150	6155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017383	CAA	2	6	6402	6407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888501
58	NC_017383	CCA	2	6	6574	6579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017383	GTT	2	6	6786	6791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888502
60	NC_017383	ATT	2	6	6930	6935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888502
61	NC_017383	ACA	2	6	6993	6998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888502
62	NC_017383	ACA	2	6	7084	7089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888502
63	NC_017383	CTT	2	6	7196	7201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888502
64	NC_017383	ACA	2	6	7266	7271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888502

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.