MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori 51 chromosome

Total Repeats: 1296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017382	TAAAA	2	10	1641	1650	80 %	20 %	0 %	0 %	387781701
2	NC_017382	TTTTA	2	10	4948	4957	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017382	CCATG	2	10	5199	5208	20 %	20 %	20 %	40 %	387781705
4	NC_017382	TTGCT	2	10	6206	6215	0 %	60 %	20 %	20 %	387781705
5	NC_017382	TTTCT	2	10	8266	8275	0 %	80 %	0 %	20 %	387781706
6	NC_017382	TTGAA	2	10	11767	11776	40 %	40 %	20 %	0 %	387781709
7	NC_017382	TTTTG	2	10	11783	11792	0 %	80 %	20 %	0 %	387781709
8	NC_017382	TGGTG	2	10	12618	12627	0 %	40 %	60 %	0 %	387781710
9	NC_017382	GCTTT	2	10	13445	13454	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017382	CAAAA	2	10	18500	18509	80 %	0 %	0 %	20 %	387781715
11	NC_017382	CATCA	2	10	19876	19885	40 %	20 %	0 %	40 %	387781716
12	NC_017382	TGAAA	2	10	20844	20853	60 %	20 %	20 %	0 %	387781717
13	NC_017382	GCTGT	2	10	20866	20875	0 %	40 %	40 %	20 %	387781717
14	NC_017382	GCATG	2	10	22678	22687	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017382	AAAAG	2	10	22810	22819	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017382	CCATG	2	10	22999	23008	20 %	20 %	20 %	40 %	387781719
17	NC_017382	CTCTT	2	10	23029	23038	0 %	60 %	0 %	40 %	387781719
18	NC_017382	AAATC	2	10	25669	25678	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017382	ATTTT	2	10	27252	27261	20 %	80 %	0 %	0 %	387781722
20	NC_017382	GATTT	2	10	28512	28521	20 %	60 %	20 %	0 %	387781722
21	NC_017382	ATTTG	2	10	29360	29369	20 %	60 %	20 %	0 %	387781723
22	NC_017382	AAATT	2	10	29868	29877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017382	AGTTT	2	10	30162	30171	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017382	TTTTA	2	10	32049	32058	20 %	80 %	0 %	0 %	387781726
25	NC_017382	GGCGT	2	10	32071	32080	0 %	20 %	60 %	20 %	387781726
26	NC_017382	GATTT	2	10	33248	33257	20 %	60 %	20 %	0 %	387781727
27	NC_017382	AGGGC	2	10	33598	33607	20 %	0 %	60 %	20 %	387781728
28	NC_017382	ATTGA	2	10	34262	34271	40 %	40 %	20 %	0 %	387781728
29	NC_017382	TGGTG	2	10	34384	34393	0 %	40 %	60 %	0 %	387781728
30	NC_017382	TTTTA	2	10	34568	34577	20 %	80 %	0 %	0 %	387781729
31	NC_017382	GCGCT	2	10	35020	35029	0 %	20 %	40 %	40 %	387781729
32	NC_017382	ACCTT	2	10	35491	35500	20 %	40 %	0 %	40 %	387781730
33	NC_017382	CTTTA	2	10	35769	35778	20 %	60 %	0 %	20 %	387781730
34	NC_017382	TAAAA	2	10	36231	36240	80 %	20 %	0 %	0 %	387781730
35	NC_017382	AAAAT	2	10	36665	36674	80 %	20 %	0 %	0 %	387781730
36	NC_017382	ATTTT	2	10	41963	41972	20 %	80 %	0 %	0 %	387781733
37	NC_017382	GATTT	2	10	42251	42260	20 %	60 %	20 %	0 %	387781733
38	NC_017382	AAAAT	2	10	42428	42437	80 %	20 %	0 %	0 %	387781734
39	NC_017382	ATTTC	2	10	45146	45155	20 %	60 %	0 %	20 %	387781736
40	NC_017382	AAGAT	2	10	45272	45281	60 %	20 %	20 %	0 %	387781736
41	NC_017382	ATTTA	2	10	45515	45524	40 %	60 %	0 %	0 %	387781737
42	NC_017382	TGAAA	2	10	45692	45701	60 %	20 %	20 %	0 %	387781737
43	NC_017382	GCGGG	2	10	46192	46201	0 %	0 %	80 %	20 %	387781737
44	NC_017382	TGGCT	2	10	47199	47208	0 %	40 %	40 %	20 %	387781738
45	NC_017382	TTTAG	2	10	47554	47563	20 %	60 %	20 %	0 %	387781738
46	NC_017382	TTTTC	2	10	48905	48914	0 %	80 %	0 %	20 %	387781739
47	NC_017382	ATCAA	2	10	49691	49700	60 %	20 %	0 %	20 %	387781740
48	NC_017382	TTTGT	2	10	50357	50366	0 %	80 %	20 %	0 %	387781740
49	NC_017382	AGATG	2	10	53302	53311	40 %	20 %	40 %	0 %	387781744
50	NC_017382	TTTAT	2	10	54043	54052	20 %	80 %	0 %	0 %	387781745
51	NC_017382	AATTG	2	10	54632	54641	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017382	GCCAA	2	10	57552	57561	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_017382	GCAAG	2	10	58477	58486	40 %	0 %	40 %	20 %	387781746
54	NC_017382	AAAAC	2	10	59129	59138	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017382	TGCCT	2	10	59994	60003	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_017382	AAATG	2	10	62684	62693	60 %	20 %	20 %	0 %	387781748
57	NC_017382	TTGGC	2	10	63522	63531	0 %	40 %	40 %	20 %	387781750
58	NC_017382	AAAGA	2	10	64349	64358	80 %	0 %	20 %	0 %	387781751
59	NC_017382	ATTCA	2	10	64578	64587	40 %	40 %	0 %	20 %	387781751
60	NC_017382	AAAAT	2	10	67280	67289	80 %	20 %	0 %	0 %	387781753
61	NC_017382	TCTTT	2	10	67907	67916	0 %	80 %	0 %	20 %	387781754
62	NC_017382	AGAAA	2	10	68187	68196	80 %	0 %	20 %	0 %	387781754
63	NC_017382	TGCCT	2	10	69078	69087	0 %	40 %	20 %	40 %	387781755
64	NC_017382	TAAAA	2	10	72557	72566	80 %	20 %	0 %	0 %	387781758
65	NC_017382	ATTTC	2	10	72632	72641	20 %	60 %	0 %	20 %	387781758
66	NC_017382	TGAAA	2	10	74682	74691	60 %	20 %	20 %	0 %	387781760
67	NC_017382	TCAAA	2	10	74936	74945	60 %	20 %	0 %	20 %	387781760
68	NC_017382	TCGCC	2	10	77679	77688	0 %	20 %	20 %	60 %	387781761
69	NC_017382	TAAAA	2	10	77975	77984	80 %	20 %	0 %	0 %	387781761
70	NC_017382	TCAAA	2	10	78691	78700	60 %	20 %	0 %	20 %	387781761
71	NC_017382	TTAAA	2	10	79713	79722	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017382	ACAAA	2	10	79730	79739	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017382	TATCC	2	10	82634	82643	20 %	40 %	0 %	40 %	387781765
74	NC_017382	TCAAT	2	10	84836	84845	40 %	40 %	0 %	20 %	387781768
75	NC_017382	CTTCT	2	10	85678	85687	0 %	60 %	0 %	40 %	387781769
76	NC_017382	TCCAA	2	10	86167	86176	40 %	20 %	0 %	40 %	387781770
77	NC_017382	CAAAA	2	10	86484	86493	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017382	TTTTG	2	10	89453	89462	0 %	80 %	20 %	0 %	387781773
79	NC_017382	ACGCC	2	10	89759	89768	20 %	0 %	20 %	60 %	387781773
80	NC_017382	AAAGC	2	10	90525	90534	60 %	0 %	20 %	20 %	387781774
81	NC_017382	TTACA	2	10	91307	91316	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017382	CAAGC	2	10	94706	94715	40 %	0 %	20 %	40 %	387781779
83	NC_017382	ATCTT	2	10	99082	99091	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017382	TGGCT	2	10	99623	99632	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017382	ATGCC	2	10	100044	100053	20 %	20 %	20 %	40 %	387781781
86	NC_017382	TTGAT	2	10	100962	100971	20 %	60 %	20 %	0 %	387781783
87	NC_017382	GGCGT	2	10	102776	102785	0 %	20 %	60 %	20 %	387781785
88	NC_017382	TAAGA	2	10	105966	105975	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017382	TAAAA	2	10	106037	106046	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017382	CTTTC	2	10	106321	106330	0 %	60 %	0 %	40 %	387781787
91	NC_017382	GAAAT	2	10	108269	108278	60 %	20 %	20 %	0 %	387781789
92	NC_017382	TCTTT	2	10	108639	108648	0 %	80 %	0 %	20 %	387781789
93	NC_017382	TTTGA	2	10	109110	109119	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017382	GGCTT	2	10	110431	110440	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017382	CGGCA	2	10	113114	113123	20 %	0 %	40 %	40 %	387781793
96	NC_017382	AATTT	2	10	115149	115158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017382	ACGAT	2	10	115597	115606	40 %	20 %	20 %	20 %	387781795
98	NC_017382	TTTTC	2	10	115792	115801	0 %	80 %	0 %	20 %	387781795
99	NC_017382	AATTG	2	10	117439	117448	40 %	40 %	20 %	0 %	387781796
100	NC_017382	TCGTT	2	10	119250	119259	0 %	60 %	20 %	20 %	387781797
101	NC_017382	CAAAA	2	10	121826	121835	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017382	TCTTT	2	10	122544	122553	0 %	80 %	0 %	20 %	387781800
103	NC_017382	AAAGC	2	10	125313	125322	60 %	0 %	20 %	20 %	387781802
104	NC_017382	TGTCT	2	10	126782	126791	0 %	60 %	20 %	20 %	387781804
105	NC_017382	CAAAT	2	10	127175	127184	60 %	20 %	0 %	20 %	387781804
106	NC_017382	ACCCT	2	10	128604	128613	20 %	20 %	0 %	60 %	387781805
107	NC_017382	ATGCC	2	10	128736	128745	20 %	20 %	20 %	40 %	387781805
108	NC_017382	TTAAT	2	10	130116	130125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017382	TGATT	2	10	130725	130734	20 %	60 %	20 %	0 %	387781807
110	NC_017382	GAATT	2	10	131358	131367	40 %	40 %	20 %	0 %	387781809
111	NC_017382	GGATC	2	10	135234	135243	20 %	20 %	40 %	20 %	387781811
112	NC_017382	AGCTC	2	10	135254	135263	20 %	20 %	20 %	40 %	387781811
113	NC_017382	AAGCC	2	10	137142	137151	40 %	0 %	20 %	40 %	387781812
114	NC_017382	GTTTG	2	10	138443	138452	0 %	60 %	40 %	0 %	387781813
115	NC_017382	TTGAT	2	10	138962	138971	20 %	60 %	20 %	0 %	387781813
116	NC_017382	CGCTG	2	10	140062	140071	0 %	20 %	40 %	40 %	387781814
117	NC_017382	TTTGA	2	10	140209	140218	20 %	60 %	20 %	0 %	387781814
118	NC_017382	GACTT	2	10	140743	140752	20 %	40 %	20 %	20 %	387781814
119	NC_017382	ATCTC	2	10	141494	141503	20 %	40 %	0 %	40 %	387781814
120	NC_017382	CGCTT	2	10	141652	141661	0 %	40 %	20 %	40 %	387781814
121	NC_017382	TTTGT	2	10	142006	142015	0 %	80 %	20 %	0 %	387781815
122	NC_017382	TGCGT	2	10	144039	144048	0 %	40 %	40 %	20 %	387781817
123	NC_017382	GAAAA	2	10	144200	144209	80 %	0 %	20 %	0 %	387781817
124	NC_017382	GAAAA	2	10	144518	144527	80 %	0 %	20 %	0 %	387781817
125	NC_017382	CACAA	2	10	145081	145090	60 %	0 %	0 %	40 %	387781819
126	NC_017382	ATTTT	2	10	147475	147484	20 %	80 %	0 %	0 %	387781823
127	NC_017382	ATGTT	2	10	147557	147566	20 %	60 %	20 %	0 %	387781823
128	NC_017382	AAAAG	2	10	147969	147978	80 %	0 %	20 %	0 %	387781823
129	NC_017382	CGCTG	2	10	149575	149584	0 %	20 %	40 %	40 %	387781824
130	NC_017382	AAATC	2	10	150204	150213	60 %	20 %	0 %	20 %	387781824
131	NC_017382	AAAAT	2	10	151676	151685	80 %	20 %	0 %	0 %	387781825
132	NC_017382	TTTTC	2	10	154026	154035	0 %	80 %	0 %	20 %	387781828
133	NC_017382	GTAAA	2	10	154578	154587	60 %	20 %	20 %	0 %	387781829
134	NC_017382	TTCTT	2	10	155982	155991	0 %	80 %	0 %	20 %	387781830
135	NC_017382	TCTTT	2	10	156476	156485	0 %	80 %	0 %	20 %	387781831
136	NC_017382	TTTTG	2	10	157639	157648	0 %	80 %	20 %	0 %	387781832
137	NC_017382	GCGAT	2	10	158432	158441	20 %	20 %	40 %	20 %	387781832
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139	NC_017382	TTTTG	2	10	159340	159349	0 %	80 %	20 %	0 %	387781833
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261	NC_017382	GCGTA	2	10	335873	335882	20 %	20 %	40 %	20 %	387782001
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266	NC_017382	AGTTC	2	10	341814	341823	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
267	NC_017382	AATCA	2	10	341924	341933	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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