MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori Puno120 plasmid pHPPN120

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017377	GAAC	2	8	1152	1159	50 %	0 %	25 %	25 %	385229300
2	NC_017377	CCAA	2	8	1334	1341	50 %	0 %	0 %	50 %	385229300
3	NC_017377	CAAG	2	8	1494	1501	50 %	0 %	25 %	25 %	385229300
4	NC_017377	TAAA	2	8	1919	1926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017377	TCCA	2	8	2197	2204	25 %	25 %	0 %	50 %	385229302
6	NC_017377	CTTG	2	8	2381	2388	0 %	50 %	25 %	25 %	385229302
7	NC_017377	TTGC	2	8	2780	2787	0 %	50 %	25 %	25 %	385229302
8	NC_017377	CTTT	2	8	2794	2801	0 %	75 %	0 %	25 %	385229302
9	NC_017377	TGAG	2	8	3995	4002	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017377	TTAG	2	8	4019	4026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017377	TGAT	2	8	4655	4662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017377	AAGA	2	8	4818	4825	75 %	0 %	25 %	0 %	385229304
13	NC_017377	GAAT	2	8	5265	5272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017377	TGAA	2	8	5306	5313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017377	ATCA	2	8	5471	5478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017377	AGCG	2	8	5499	5506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017377	TTAT	2	8	6220	6227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017377	ATCA	2	8	6308	6315	50 %	25 %	0 %	25 %	385229307
19	NC_017377	AAGA	2	8	7144	7151	75 %	0 %	25 %	0 %	385229307
20	NC_017377	CCTG	2	8	8168	8175	0 %	25 %	25 %	50 %	385229308
21	NC_017377	CATG	2	8	8474	8481	25 %	25 %	25 %	25 %	385229308
22	NC_017377	GAAA	2	8	8576	8583	75 %	0 %	25 %	0 %	385229308
23	NC_017377	GAAA	2	8	8708	8715	75 %	0 %	25 %	0 %	385229309
24	NC_017377	GAAG	2	8	8783	8790	50 %	0 %	50 %	0 %	385229309
25	NC_017377	ATCA	2	8	8888	8895	50 %	25 %	0 %	25 %	385229309
26	NC_017377	CTTG	2	8	8914	8921	0 %	50 %	25 %	25 %	385229309
27	NC_017377	CAAT	2	8	9503	9510	50 %	25 %	0 %	25 %	385229310
28	NC_017377	TTAG	2	8	9773	9780	25 %	50 %	25 %	0 %	385229310
29	NC_017377	TTTC	2	8	9970	9977	0 %	75 %	0 %	25 %	385229310
30	NC_017377	GATT	2	8	10202	10209	25 %	50 %	25 %	0 %	385229310
31	NC_017377	AAAT	2	8	10315	10322	75 %	25 %	0 %	0 %	385229310
32	NC_017377	GGTC	2	8	10381	10388	0 %	25 %	50 %	25 %	385229310
33	NC_017377	TTAT	2	8	10715	10722	25 %	75 %	0 %	0 %	385229310
34	NC_017377	TAAA	2	8	10933	10940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017377	TGAT	2	8	11763	11770	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017377	AAGA	2	8	11926	11933	75 %	0 %	25 %	0 %	385229313
37	NC_017377	GAAT	2	8	12373	12380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017377	TGAA	2	8	12414	12421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017377	ATCA	2	8	12579	12586	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017377	AGCG	2	8	12607	12614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.