MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori SNT49 chromosome

Total Repeats: 4503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017376	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	385226253
2	NC_017376	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	385226253
3	NC_017376	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	385226254
4	NC_017376	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	385226255
5	NC_017376	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	385226255
6	NC_017376	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	385226256
7	NC_017376	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	385226256
8	NC_017376	TTAT	2	8	1856	1863	25 %	75 %	0 %	0 %	385226256
9	NC_017376	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	385226256
10	NC_017376	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	385226256
11	NC_017376	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	385226256
12	NC_017376	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	385226257
13	NC_017376	CAAA	2	8	3101	3108	75 %	0 %	0 %	25 %	385226257
14	NC_017376	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	385226258
15	NC_017376	TAAA	2	8	4699	4706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017376	GCTT	2	8	5372	5379	0 %	50 %	25 %	25 %	385226259
17	NC_017376	CATT	2	8	5443	5450	25 %	50 %	0 %	25 %	385226259
18	NC_017376	CATT	2	8	5752	5759	25 %	50 %	0 %	25 %	385226259
19	NC_017376	TGCT	2	8	6562	6569	0 %	50 %	25 %	25 %	385226259
20	NC_017376	GTTT	2	8	6717	6724	0 %	75 %	25 %	0 %	385226259
21	NC_017376	TGGT	2	8	6917	6924	0 %	50 %	50 %	0 %	385226259
22	NC_017376	ATCG	2	8	7100	7107	25 %	25 %	25 %	25 %	385226259
23	NC_017376	ATTG	2	8	7112	7119	25 %	50 %	25 %	0 %	385226259
24	NC_017376	CGTT	2	8	7135	7142	0 %	50 %	25 %	25 %	385226259
25	NC_017376	TTTG	2	8	7485	7492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017376	AGCG	2	8	7582	7589	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017376	TTCA	2	8	7900	7907	25 %	50 %	0 %	25 %	385226260
28	NC_017376	TCTT	2	8	8194	8201	0 %	75 %	0 %	25 %	385226260
29	NC_017376	ATAA	2	8	9698	9705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017376	ATTC	2	8	9901	9908	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017376	TTTG	2	8	10916	10923	0 %	75 %	25 %	0 %	385226262
32	NC_017376	GTTT	2	8	11012	11019	0 %	75 %	25 %	0 %	385226262
33	NC_017376	GCTC	2	8	11539	11546	0 %	25 %	25 %	50 %	385226262
34	NC_017376	ATTG	2	8	11891	11898	25 %	50 %	25 %	0 %	385226263
35	NC_017376	TGCT	2	8	12287	12294	0 %	50 %	25 %	25 %	385226263
36	NC_017376	GCCA	2	8	12527	12534	25 %	0 %	25 %	50 %	385226263
37	NC_017376	GGCC	2	8	12550	12557	0 %	0 %	50 %	50 %	385226263
38	NC_017376	TGCA	2	8	12768	12775	25 %	25 %	25 %	25 %	385226264
39	NC_017376	AGCA	2	8	12823	12830	50 %	0 %	25 %	25 %	385226264
40	NC_017376	TCTT	2	8	13568	13575	0 %	75 %	0 %	25 %	385226264
41	NC_017376	TTAA	2	8	13716	13723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017376	AGCG	2	8	14039	14046	25 %	0 %	50 %	25 %	385226266
43	NC_017376	GATT	2	8	14147	14154	25 %	50 %	25 %	0 %	385226266
44	NC_017376	CAAA	2	8	14316	14323	75 %	0 %	0 %	25 %	385226267
45	NC_017376	ATGC	2	8	14731	14738	25 %	25 %	25 %	25 %	385226267
46	NC_017376	GAGC	2	8	15036	15043	25 %	0 %	50 %	25 %	385226267
47	NC_017376	TTTA	2	8	15318	15325	25 %	75 %	0 %	0 %	385226267
48	NC_017376	CAGG	2	8	16476	16483	25 %	0 %	50 %	25 %	385226267
49	NC_017376	TGAT	2	8	16520	16527	25 %	50 %	25 %	0 %	385226267
50	NC_017376	AACG	2	8	17343	17350	50 %	0 %	25 %	25 %	385226268
51	NC_017376	GCTT	2	8	17515	17522	0 %	50 %	25 %	25 %	385226268
52	NC_017376	ATCT	2	8	18072	18079	25 %	50 %	0 %	25 %	385226268
53	NC_017376	TTGA	2	8	18636	18643	25 %	50 %	25 %	0 %	385226269
54	NC_017376	AGCG	2	8	19184	19191	25 %	0 %	50 %	25 %	385226269
55	NC_017376	AGAA	2	8	19617	19624	75 %	0 %	25 %	0 %	385226270
56	NC_017376	TAAA	2	8	20690	20697	75 %	25 %	0 %	0 %	385226271
57	NC_017376	GCGA	2	8	20699	20706	25 %	0 %	50 %	25 %	385226271
58	NC_017376	GCGT	2	8	20999	21006	0 %	25 %	50 %	25 %	385226271
59	NC_017376	AGGC	2	8	21131	21138	25 %	0 %	50 %	25 %	385226271
60	NC_017376	CTTT	2	8	21556	21563	0 %	75 %	0 %	25 %	385226272
61	NC_017376	AAGT	2	8	21868	21875	50 %	25 %	25 %	0 %	385226272
62	NC_017376	GCTT	2	8	21995	22002	0 %	50 %	25 %	25 %	385226272
63	NC_017376	CACT	2	8	22151	22158	25 %	25 %	0 %	50 %	385226272
64	NC_017376	AACT	2	8	22613	22620	50 %	25 %	0 %	25 %	385226272
65	NC_017376	CTTT	2	8	22627	22634	0 %	75 %	0 %	25 %	385226272
66	NC_017376	ATCA	2	8	22766	22773	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017376	GTTG	2	8	22874	22881	0 %	50 %	50 %	0 %	385226273
68	NC_017376	GTTT	2	8	23610	23617	0 %	75 %	25 %	0 %	385226274
69	NC_017376	TTCC	2	8	24408	24415	0 %	50 %	0 %	50 %	385226274
70	NC_017376	TCCC	2	8	24753	24760	0 %	25 %	0 %	75 %	385226274
71	NC_017376	GATT	2	8	25237	25244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017376	TAAG	2	8	25275	25282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017376	ATTA	2	8	25333	25340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017376	TTGC	2	8	25642	25649	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017376	CGCT	2	8	25661	25668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017376	ATAA	2	8	26450	26457	75 %	25 %	0 %	0 %	385226275
77	NC_017376	GCTC	2	8	27977	27984	0 %	25 %	25 %	50 %	385226276
78	NC_017376	GATG	2	8	28424	28431	25 %	25 %	50 %	0 %	385226276
79	NC_017376	GAAT	2	8	28686	28693	50 %	25 %	25 %	0 %	385226277
80	NC_017376	TGGC	2	8	28909	28916	0 %	25 %	50 %	25 %	385226277
81	NC_017376	GCGT	2	8	29043	29050	0 %	25 %	50 %	25 %	385226277
82	NC_017376	TCTG	2	8	29051	29058	0 %	50 %	25 %	25 %	385226277
83	NC_017376	TTTA	2	8	29062	29069	25 %	75 %	0 %	0 %	385226277
84	NC_017376	TGGT	2	8	29580	29587	0 %	50 %	50 %	0 %	385226278
85	NC_017376	GAGT	2	8	29894	29901	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017376	TGCT	2	8	29948	29955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017376	CAAT	2	8	30067	30074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017376	TAAA	2	8	30568	30575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017376	GGTT	2	8	31459	31466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017376	TTTA	2	8	31593	31600	25 %	75 %	0 %	0 %	385226279
91	NC_017376	CAGA	2	8	31629	31636	50 %	0 %	25 %	25 %	385226279
92	NC_017376	TGAT	2	8	31738	31745	25 %	50 %	25 %	0 %	385226279
93	NC_017376	GCGA	2	8	31791	31798	25 %	0 %	50 %	25 %	385226279
94	NC_017376	CATC	2	8	32049	32056	25 %	25 %	0 %	50 %	385226280
95	NC_017376	TCAA	2	8	32191	32198	50 %	25 %	0 %	25 %	385226281
96	NC_017376	TGCC	2	8	32413	32420	0 %	25 %	25 %	50 %	385226281
97	NC_017376	CATG	2	8	33314	33321	25 %	25 %	25 %	25 %	385226281
98	NC_017376	GAAA	2	8	33422	33429	75 %	0 %	25 %	0 %	385226281
99	NC_017376	CGCT	2	8	33430	33437	0 %	25 %	25 %	50 %	385226281
100	NC_017376	GCTT	2	8	34329	34336	0 %	50 %	25 %	25 %	385226281
101	NC_017376	GAAA	2	8	34388	34395	75 %	0 %	25 %	0 %	385226281
102	NC_017376	ATGA	2	8	34669	34676	50 %	25 %	25 %	0 %	385226282
103	NC_017376	CGAG	2	8	35283	35290	25 %	0 %	50 %	25 %	385226284
104	NC_017376	TGCA	2	8	36151	36158	25 %	25 %	25 %	25 %	385226285
105	NC_017376	TTGT	2	8	36264	36271	0 %	75 %	25 %	0 %	385226285
106	NC_017376	CTTT	2	8	36411	36418	0 %	75 %	0 %	25 %	385226285
107	NC_017376	AATA	2	8	37088	37095	75 %	25 %	0 %	0 %	385226285
108	NC_017376	TAAA	2	8	37110	37117	75 %	25 %	0 %	0 %	385226285
109	NC_017376	ATGA	2	8	37817	37824	50 %	25 %	25 %	0 %	385226287
110	NC_017376	TTTG	2	8	37870	37877	0 %	75 %	25 %	0 %	385226287
111	NC_017376	TGAT	2	8	37975	37982	25 %	50 %	25 %	0 %	385226287
112	NC_017376	CATG	2	8	38094	38101	25 %	25 %	25 %	25 %	385226288
113	NC_017376	TGAT	2	8	38360	38367	25 %	50 %	25 %	0 %	385226288
114	NC_017376	CAAA	2	8	39331	39338	75 %	0 %	0 %	25 %	385226289
115	NC_017376	ATTG	2	8	39745	39752	25 %	50 %	25 %	0 %	385226289
116	NC_017376	ATTG	2	8	39811	39818	25 %	50 %	25 %	0 %	385226289
117	NC_017376	ATCA	2	8	39920	39927	50 %	25 %	0 %	25 %	385226289
118	NC_017376	TCAA	2	8	39933	39940	50 %	25 %	0 %	25 %	385226289
119	NC_017376	GGTT	2	8	40525	40532	0 %	50 %	50 %	0 %	385226290
120	NC_017376	TGTT	2	8	40707	40714	0 %	75 %	25 %	0 %	385226290
121	NC_017376	CTTT	2	8	41300	41307	0 %	75 %	0 %	25 %	385226290
122	NC_017376	GAAA	2	8	41589	41596	75 %	0 %	25 %	0 %	385226291
123	NC_017376	GATC	2	8	41718	41725	25 %	25 %	25 %	25 %	385226291
124	NC_017376	TTTG	2	8	42120	42127	0 %	75 %	25 %	0 %	385226291
125	NC_017376	TTGT	2	8	42234	42241	0 %	75 %	25 %	0 %	385226291
126	NC_017376	ATGA	2	8	42725	42732	50 %	25 %	25 %	0 %	385226291
127	NC_017376	TATT	2	8	42842	42849	25 %	75 %	0 %	0 %	385226292
128	NC_017376	ATGA	2	8	42941	42948	50 %	25 %	25 %	0 %	385226292
129	NC_017376	AAAG	2	8	43082	43089	75 %	0 %	25 %	0 %	385226292
130	NC_017376	CAAA	2	8	43564	43571	75 %	0 %	0 %	25 %	385226292
131	NC_017376	CAAA	2	8	43732	43739	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017376	ATCT	2	8	43945	43952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017376	CTGT	2	8	44006	44013	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017376	AAAC	2	8	44409	44416	75 %	0 %	0 %	25 %	385226293
135	NC_017376	CATT	2	8	44537	44544	25 %	50 %	0 %	25 %	385226293
136	NC_017376	CGCT	2	8	44550	44557	0 %	25 %	25 %	50 %	385226293
137	NC_017376	TCAA	2	8	45161	45168	50 %	25 %	0 %	25 %	385226293
138	NC_017376	GTTT	2	8	45172	45179	0 %	75 %	25 %	0 %	385226293
139	NC_017376	CAAA	2	8	45677	45684	75 %	0 %	0 %	25 %	385226294
140	NC_017376	AGGG	2	8	46503	46510	25 %	0 %	75 %	0 %	385226294
141	NC_017376	GATA	2	8	46997	47004	50 %	25 %	25 %	0 %	385226294
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