MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori 2017 chromosome

Total Repeats: 1259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017374	GATTA	2	10	2292	2301	40 %	40 %	20 %	0 %	385223052
2	NC_017374	TCATT	2	10	4955	4964	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017374	TTTTA	2	10	5383	5392	20 %	80 %	0 %	0 %	385223058
4	NC_017374	TTTCT	2	10	6310	6319	0 %	80 %	0 %	20 %	385223059
5	NC_017374	AATTT	2	10	7149	7158	40 %	60 %	0 %	0 %	385223059
6	NC_017374	AAAGG	2	10	8784	8793	60 %	0 %	40 %	0 %	385223061
7	NC_017374	TTTTG	2	10	9840	9849	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017374	TGGTG	2	10	10678	10687	0 %	40 %	60 %	0 %	385223062
9	NC_017374	GCTTT	2	10	11505	11514	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017374	CTGTA	2	10	21185	21194	20 %	40 %	20 %	20 %	385223072
11	NC_017374	CCATG	2	10	21255	21264	20 %	20 %	20 %	40 %	385223072
12	NC_017374	CTCTT	2	10	21285	21294	0 %	60 %	0 %	40 %	385223072
13	NC_017374	TTGAT	2	10	22768	22777	20 %	60 %	20 %	0 %	385223072
14	NC_017374	CTTTA	2	10	23223	23232	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017374	AGCCT	2	10	23798	23807	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017374	CAAGC	2	10	25980	25989	40 %	0 %	20 %	40 %	385223075
17	NC_017374	TTTTA	2	10	26909	26918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017374	TAGCG	2	10	27570	27579	20 %	20 %	40 %	20 %	385223076
19	NC_017374	TGATT	2	10	29927	29936	20 %	60 %	20 %	0 %	385223078
20	NC_017374	GTGGG	2	10	31810	31819	0 %	20 %	80 %	0 %	385223080
21	NC_017374	ATCAA	2	10	33942	33951	60 %	20 %	0 %	20 %	385223083
22	NC_017374	TTTTG	2	10	36438	36447	0 %	80 %	20 %	0 %	385223087
23	NC_017374	TGAGT	2	10	38458	38467	20 %	40 %	40 %	0 %	385223089
24	NC_017374	CAAAA	2	10	38561	38570	80 %	0 %	0 %	20 %	385223089
25	NC_017374	AAGCC	2	10	38843	38852	40 %	0 %	20 %	40 %	385223089
26	NC_017374	CAAAC	2	10	39484	39493	60 %	0 %	0 %	40 %	385223089
27	NC_017374	AGAAA	2	10	40169	40178	80 %	0 %	20 %	0 %	385223090
28	NC_017374	TCGCT	2	10	41992	42001	0 %	40 %	20 %	40 %	385223092
29	NC_017374	TAAAA	2	10	43433	43442	80 %	20 %	0 %	0 %	385223095
30	NC_017374	GCGAT	2	10	43964	43973	20 %	20 %	40 %	20 %	385223096
31	NC_017374	GCTCC	2	10	44766	44775	0 %	20 %	20 %	60 %	385223096
32	NC_017374	ATGAA	2	10	44948	44957	60 %	20 %	20 %	0 %	385223096
33	NC_017374	TCGCA	2	10	45303	45312	20 %	20 %	20 %	40 %	385223096
34	NC_017374	CAATA	2	10	46871	46880	60 %	20 %	0 %	20 %	385223097
35	NC_017374	AGGCT	2	10	47183	47192	20 %	20 %	40 %	20 %	385223098
36	NC_017374	TGCCT	2	10	47558	47567	0 %	40 %	20 %	40 %	385223098
37	NC_017374	GATTG	2	10	48042	48051	20 %	40 %	40 %	0 %	385223099
38	NC_017374	GCTTT	2	10	48098	48107	0 %	60 %	20 %	20 %	385223099
39	NC_017374	GATAA	2	10	48350	48359	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017374	AAATA	2	10	49344	49353	80 %	20 %	0 %	0 %	385223100
41	NC_017374	ATATT	2	10	49510	49519	40 %	60 %	0 %	0 %	385223100
42	NC_017374	CCAAA	2	10	49677	49686	60 %	0 %	0 %	40 %	385223101
43	NC_017374	TAAAA	2	10	51728	51737	80 %	20 %	0 %	0 %	385223101
44	NC_017374	ATCAA	2	10	51759	51768	60 %	20 %	0 %	20 %	385223101
45	NC_017374	TGAAA	2	10	52490	52499	60 %	20 %	20 %	0 %	385223102
46	NC_017374	TCAAA	2	10	52744	52753	60 %	20 %	0 %	20 %	385223102
47	NC_017374	TCGTT	2	10	53554	53563	0 %	60 %	20 %	20 %	385223102
48	NC_017374	TAAAA	2	10	55783	55792	80 %	20 %	0 %	0 %	385223103
49	NC_017374	TCAAA	2	10	56499	56508	60 %	20 %	0 %	20 %	385223103
50	NC_017374	AACGA	2	10	57502	57511	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017374	TTAAA	2	10	57514	57523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017374	ACAAA	2	10	57542	57551	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017374	TGATA	2	10	57856	57865	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017374	AAGCC	2	10	58316	58325	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017374	GGTGG	2	10	65337	65346	0 %	20 %	80 %	0 %	385223116
56	NC_017374	CTTGG	2	10	69334	69343	0 %	40 %	40 %	20 %	385223120
57	NC_017374	TGCCT	2	10	69465	69474	0 %	40 %	20 %	40 %	385223120
58	NC_017374	TCCAA	2	10	69877	69886	40 %	20 %	0 %	40 %	385223121
59	NC_017374	CAAAA	2	10	70194	70203	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017374	TTTTG	2	10	73205	73214	0 %	80 %	20 %	0 %	385223124
61	NC_017374	ACGCC	2	10	73511	73520	20 %	0 %	20 %	60 %	385223124
62	NC_017374	AAAGC	2	10	74277	74286	60 %	0 %	20 %	20 %	385223125
63	NC_017374	TTACA	2	10	75059	75068	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017374	TAAAA	2	10	76742	76751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017374	TTTTG	2	10	79019	79028	0 %	80 %	20 %	0 %	385223132
66	NC_017374	GATTT	2	10	79030	79039	20 %	60 %	20 %	0 %	385223132
67	NC_017374	TTTTC	2	10	82496	82505	0 %	80 %	0 %	20 %	385223136
68	NC_017374	CCATA	2	10	82824	82833	40 %	20 %	0 %	40 %	385223136
69	NC_017374	TGGCT	2	10	83190	83199	0 %	40 %	40 %	20 %	385223136
70	NC_017374	ATGCC	2	10	83632	83641	20 %	20 %	20 %	40 %	385223137
71	NC_017374	TTGAT	2	10	84718	84727	20 %	60 %	20 %	0 %	385223139
72	NC_017374	GGCGT	2	10	86532	86541	0 %	20 %	60 %	20 %	385223141
73	NC_017374	TAAGA	2	10	89739	89748	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017374	ATTAT	2	10	89795	89804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017374	CTTTC	2	10	90124	90133	0 %	60 %	0 %	40 %	385223143
76	NC_017374	CGAGA	2	10	92144	92153	40 %	0 %	40 %	20 %	385223145
77	NC_017374	TGATT	2	10	93088	93097	20 %	60 %	20 %	0 %	385223146
78	NC_017374	GGCTT	2	10	94412	94421	0 %	40 %	40 %	20 %	385223148
79	NC_017374	ATAAA	2	10	96414	96423	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017374	ACGAT	2	10	99371	99380	40 %	20 %	20 %	20 %	385223154
81	NC_017374	TTTTC	2	10	99566	99575	0 %	80 %	0 %	20 %	385223154
82	NC_017374	AATTG	2	10	101099	101108	40 %	40 %	20 %	0 %	385223155
83	NC_017374	TCGTT	2	10	103001	103010	0 %	60 %	20 %	20 %	385223156
84	NC_017374	GTGGG	2	10	103323	103332	0 %	20 %	80 %	0 %	385223157
85	NC_017374	TTAGA	2	10	104014	104023	40 %	40 %	20 %	0 %	385223158
86	NC_017374	CAAGC	2	10	105118	105127	40 %	0 %	20 %	40 %	385223159
87	NC_017374	AAAGC	2	10	109098	109107	60 %	0 %	20 %	20 %	385223162
88	NC_017374	GAATG	2	10	110330	110339	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017374	CAAAT	2	10	111655	111664	60 %	20 %	0 %	20 %	385223165
90	NC_017374	CGTTT	2	10	112288	112297	0 %	60 %	20 %	20 %	385223165
91	NC_017374	ACCCT	2	10	113083	113092	20 %	20 %	0 %	60 %	385223166
92	NC_017374	ATGCC	2	10	113215	113224	20 %	20 %	20 %	40 %	385223166
93	NC_017374	GATTT	2	10	114598	114607	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017374	TGATT	2	10	115210	115219	20 %	60 %	20 %	0 %	385223168
95	NC_017374	GATCG	2	10	119725	119734	20 %	20 %	40 %	20 %	385223172
96	NC_017374	AGCTC	2	10	119744	119753	20 %	20 %	20 %	40 %	385223172
97	NC_017374	AAGCC	2	10	121632	121641	40 %	0 %	20 %	40 %	385223173
98	NC_017374	CCATA	2	10	122510	122519	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017374	TTGAT	2	10	122697	122706	20 %	60 %	20 %	0 %	385223174
100	NC_017374	TTTGA	2	10	123935	123944	20 %	60 %	20 %	0 %	385223175
101	NC_017374	ATCTC	2	10	125220	125229	20 %	40 %	0 %	40 %	385223175
102	NC_017374	TTTGT	2	10	125730	125739	0 %	80 %	20 %	0 %	385223176
103	NC_017374	TGCGT	2	10	127763	127772	0 %	40 %	40 %	20 %	385223179
104	NC_017374	ATTTT	2	10	130414	130423	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017374	ATTTT	2	10	131291	131300	20 %	80 %	0 %	0 %	385223185
106	NC_017374	ATGTT	2	10	131373	131382	20 %	60 %	20 %	0 %	385223186
107	NC_017374	AAAAG	2	10	131785	131794	80 %	0 %	20 %	0 %	385223186
108	NC_017374	AATAA	2	10	132640	132649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017374	AAATC	2	10	133800	133809	60 %	20 %	0 %	20 %	385223187
110	NC_017374	AAAAT	2	10	135272	135281	80 %	20 %	0 %	0 %	385223188
111	NC_017374	ATAAA	2	10	137050	137059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017374	AGAGC	2	10	137513	137522	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017374	TTTTC	2	10	137828	137837	0 %	80 %	0 %	20 %	385223191
114	NC_017374	TTCTT	2	10	139784	139793	0 %	80 %	0 %	20 %	385223193
115	NC_017374	TCTTT	2	10	140278	140287	0 %	80 %	0 %	20 %	385223194
116	NC_017374	GTTTT	2	10	141440	141449	0 %	80 %	20 %	0 %	385223195
117	NC_017374	AATTC	2	10	142012	142021	40 %	40 %	0 %	20 %	385223195
118	NC_017374	GCGAT	2	10	142171	142180	20 %	20 %	40 %	20 %	385223195
119	NC_017374	GCTTG	2	10	142427	142436	0 %	40 %	40 %	20 %	385223195
120	NC_017374	TTTTG	2	10	143079	143088	0 %	80 %	20 %	0 %	385223196
121	NC_017374	ACGCC	2	10	148378	148387	20 %	0 %	20 %	60 %	385223199
122	NC_017374	GCGTT	2	10	150641	150650	0 %	40 %	40 %	20 %	385223204
123	NC_017374	ATTTG	2	10	151618	151627	20 %	60 %	20 %	0 %	385223205
124	NC_017374	CAAAT	2	10	154037	154046	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017374	GGATT	2	10	154200	154209	20 %	40 %	40 %	0 %	385223208
126	NC_017374	AGATT	2	10	156659	156668	40 %	40 %	20 %	0 %	385223210
127	NC_017374	AAGCC	2	10	157996	158005	40 %	0 %	20 %	40 %	385223213
128	NC_017374	TGGCG	2	10	158670	158679	0 %	20 %	60 %	20 %	385223213
129	NC_017374	GTTTT	2	10	159752	159761	0 %	80 %	20 %	0 %	385223214
130	NC_017374	ATTTT	2	10	160037	160046	20 %	80 %	0 %	0 %	385223215
131	NC_017374	TTGAA	2	10	161308	161317	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017374	ATTCA	2	10	161669	161678	40 %	40 %	0 %	20 %	385223217
133	NC_017374	CACTT	2	10	161873	161882	20 %	40 %	0 %	40 %	385223217
134	NC_017374	ATCTT	2	10	165068	165077	20 %	60 %	0 %	20 %	385223220
135	NC_017374	TTTAA	2	10	169735	169744	40 %	60 %	0 %	0 %	385223226
136	NC_017374	AATAT	2	10	172394	172403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017374	TTTCC	2	10	172446	172455	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017374	GAATG	2	10	172532	172541	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_017374	GATTG	2	10	223045	223054	20 %	40 %	40 %	0 %	385223280
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251	NC_017374	ATCCA	2	10	330293	330302	40 %	20 %	0 %	40 %	385223386
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263	NC_017374	AATAA	2	10	339220	339229	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017374	GTTTT	2	10	340021	340030	0 %	80 %	20 %	0 %	385223400
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