MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica7 plasmid unnamed

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017373	A	6	6	262	267	100 %	0 %	0 %	0 %	385221475
2	NC_017373	A	6	6	570	575	100 %	0 %	0 %	0 %	385221475
3	NC_017373	A	6	6	1015	1020	100 %	0 %	0 %	0 %	385221475
4	NC_017373	A	6	6	1402	1407	100 %	0 %	0 %	0 %	385221475
5	NC_017373	C	6	6	1432	1437	0 %	0 %	0 %	100 %	385221475
6	NC_017373	A	6	6	2164	2169	100 %	0 %	0 %	0 %	385221476
7	NC_017373	A	7	7	2236	2242	100 %	0 %	0 %	0 %	385221476
8	NC_017373	T	7	7	2273	2279	0 %	100 %	0 %	0 %	385221476
9	NC_017373	T	7	7	2390	2396	0 %	100 %	0 %	0 %	385221477
10	NC_017373	A	6	6	2487	2492	100 %	0 %	0 %	0 %	385221477
11	NC_017373	C	6	6	2774	2779	0 %	0 %	0 %	100 %	385221477
12	NC_017373	A	6	6	3016	3021	100 %	0 %	0 %	0 %	385221477
13	NC_017373	A	7	7	3068	3074	100 %	0 %	0 %	0 %	385221477
14	NC_017373	A	6	6	3214	3219	100 %	0 %	0 %	0 %	385221477
15	NC_017373	A	6	6	3795	3800	100 %	0 %	0 %	0 %	385221478
16	NC_017373	A	6	6	4140	4145	100 %	0 %	0 %	0 %	385221478
17	NC_017373	A	7	7	4148	4154	100 %	0 %	0 %	0 %	385221478
18	NC_017373	A	6	6	4263	4268	100 %	0 %	0 %	0 %	385221478
19	NC_017373	A	6	6	4275	4280	100 %	0 %	0 %	0 %	385221478
20	NC_017373	A	7	7	4306	4312	100 %	0 %	0 %	0 %	385221479
21	NC_017373	A	6	6	4480	4485	100 %	0 %	0 %	0 %	385221479
22	NC_017373	A	7	7	4535	4541	100 %	0 %	0 %	0 %	385221479
23	NC_017373	A	6	6	5011	5016	100 %	0 %	0 %	0 %	385221480
24	NC_017373	A	6	6	5108	5113	100 %	0 %	0 %	0 %	385221480
25	NC_017373	A	6	6	5115	5120	100 %	0 %	0 %	0 %	385221480
26	NC_017373	A	6	6	5324	5329	100 %	0 %	0 %	0 %	385221480
27	NC_017373	A	6	6	5398	5403	100 %	0 %	0 %	0 %	385221480
28	NC_017373	A	6	6	5496	5501	100 %	0 %	0 %	0 %	385221481
29	NC_017373	A	7	7	5630	5636	100 %	0 %	0 %	0 %	385221481
30	NC_017373	A	6	6	5797	5802	100 %	0 %	0 %	0 %	385221481
31	NC_017373	T	6	6	6171	6176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33	NC_017373	T	6	6	6231	6236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017373	A	6	6	6370	6375	100 %	0 %	0 %	0 %	385221482
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41	NC_017373	T	6	6	8278	8283	0 %	100 %	0 %	0 %	385221483
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70	NC_017373	A	6	6	13294	13299	100 %	0 %	0 %	0 %	385221489
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121	NC_017373	A	6	6	22972	22977	100 %	0 %	0 %	0 %	385221499
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132	NC_017373	T	6	6	25097	25102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017373	A	6	6	25136	25141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017373	A	6	6	25147	25152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017373	A	8	8	25175	25182	100 %	0 %	0 %	0 %	385221503

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.