MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori India7 chromosome

Total Repeats: 35087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017372	TAAC	2	8	169941	169948	50 %	25 %	0 %	25 %	385220039
3502	NC_017372	AATA	2	8	169952	169959	75 %	25 %	0 %	0 %	385220039
3503	NC_017372	AATA	2	8	169961	169968	75 %	25 %	0 %	0 %	385220039
3504	NC_017372	TTA	2	6	169969	169974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385220039
3505	NC_017372	AC	3	6	170133	170138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_017372	GAAA	2	8	170142	170149	75 %	0 %	25 %	0 %	385220040
3507	NC_017372	A	7	7	170242	170248	100 %	0 %	0 %	0 %	385220040
3508	NC_017372	TTC	2	6	170256	170261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385220040
3509	NC_017372	ATTTTG	2	12	170339	170350	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385220040
3510	NC_017372	AGAA	2	8	170363	170370	75 %	0 %	25 %	0 %	385220040
3511	NC_017372	TTGA	2	8	170380	170387	25 %	50 %	25 %	0 %	385220040
3512	NC_017372	GAT	2	6	170463	170468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385220040
3513	NC_017372	A	6	6	170479	170484	100 %	0 %	0 %	0 %	385220040
3514	NC_017372	A	6	6	170509	170514	100 %	0 %	0 %	0 %	385220040
3515	NC_017372	GAA	2	6	170521	170526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385220040
3516	NC_017372	A	6	6	170530	170535	100 %	0 %	0 %	0 %	385220040
3517	NC_017372	ACG	2	6	170570	170575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385220040
3518	NC_017372	TAA	2	6	170577	170582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385220040
3519	NC_017372	CAAG	2	8	170598	170605	50 %	0 %	25 %	25 %	385220040
3520	NC_017372	ATT	2	6	170656	170661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385220040
3521	NC_017372	A	6	6	170689	170694	100 %	0 %	0 %	0 %	385220040
3522	NC_017372	A	7	7	170783	170789	100 %	0 %	0 %	0 %	385220040
3523	NC_017372	CGCTTT	2	12	170817	170828	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385220040
3524	NC_017372	ACTTAT	2	12	170914	170925	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385220040
3525	NC_017372	GAG	2	6	170998	171003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385220040
3526	NC_017372	CAA	2	6	171030	171035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385220040
3527	NC_017372	TGA	2	6	171041	171046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_017372	GTTA	2	8	171058	171065	25 %	50 %	25 %	0 %	385220041
3529	NC_017372	AAG	2	6	171096	171101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385220041
3530	NC_017372	TTCA	2	8	171188	171195	25 %	50 %	0 %	25 %	385220041
3531	NC_017372	TGA	2	6	171357	171362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385220041
3532	NC_017372	TCA	2	6	171373	171378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385220041
3533	NC_017372	GAA	2	6	171386	171391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385220041
3534	NC_017372	AAG	2	6	171528	171533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385220041
3535	NC_017372	GTTTAA	2	12	171601	171612	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385220041
3536	NC_017372	AAG	2	6	171645	171650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385220041
3537	NC_017372	GAGC	2	8	171687	171694	25 %	0 %	50 %	25 %	385220041
3538	NC_017372	GAT	2	6	171704	171709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385220041
3539	NC_017372	AGGG	2	8	171792	171799	25 %	0 %	75 %	0 %	385220041
3540	NC_017372	ATTTG	2	10	171883	171892	20 %	60 %	20 %	0 %	385220041
3541	NC_017372	T	7	7	171899	171905	0 %	100 %	0 %	0 %	385220041
3542	NC_017372	TAA	2	6	171967	171972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385220041
3543	NC_017372	CAA	2	6	171981	171986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_017372	GAGC	2	8	172015	172022	25 %	0 %	50 %	25 %	385220042
3545	NC_017372	AATTG	2	10	172039	172048	40 %	40 %	20 %	0 %	385220042
3546	NC_017372	GC	3	6	172114	172119	0 %	0 %	50 %	50 %	385220042
3547	NC_017372	AAATC	2	10	172122	172131	60 %	20 %	0 %	20 %	385220042
3548	NC_017372	A	6	6	172203	172208	100 %	0 %	0 %	0 %	385220042
3549	NC_017372	ATG	2	6	172227	172232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385220042
3550	NC_017372	ATAC	2	8	172236	172243	50 %	25 %	0 %	25 %	385220042
3551	NC_017372	AG	3	6	172258	172263	50 %	0 %	50 %	0 %	385220042
3552	NC_017372	TTG	2	6	172343	172348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385220042
3553	NC_017372	A	6	6	172448	172453	100 %	0 %	0 %	0 %	385220042
3554	NC_017372	AGA	2	6	172537	172542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385220042
3555	NC_017372	ATT	2	6	172566	172571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_017372	T	6	6	172570	172575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_017372	T	6	6	172602	172607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_017372	TTA	2	6	172621	172626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_017372	TTTG	2	8	172656	172663	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017372	GCGT	2	8	172666	172673	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3561	NC_017372	ATT	2	6	172691	172696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017372	ATTG	2	8	172701	172708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017372	T	6	6	172711	172716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017372	TTGA	2	8	172772	172779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_017372	AAT	2	6	172788	172793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017372	GA	3	6	172835	172840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017372	AAG	2	6	172877	172882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_017372	A	7	7	172915	172921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_017372	T	6	6	172943	172948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_017372	AGA	2	6	172970	172975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_017372	TGG	2	6	172980	172985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_017372	AAAT	2	8	173001	173008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_017372	TGAA	2	8	173051	173058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_017372	ATTT	2	8	173077	173084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_017372	TAC	2	6	173171	173176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385220043
3576	NC_017372	A	8	8	173225	173232	100 %	0 %	0 %	0 %	385220043
3577	NC_017372	A	6	6	173254	173259	100 %	0 %	0 %	0 %	385220043
3578	NC_017372	TGA	2	6	173261	173266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385220043
3579	NC_017372	AAT	2	6	173286	173291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385220043
3580	NC_017372	ATG	2	6	173308	173313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385220043
3581	NC_017372	CTAA	2	8	173341	173348	50 %	25 %	0 %	25 %	385220043
3582	NC_017372	ATG	2	6	173350	173355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_017372	CTT	3	9	173393	173401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385220044
3584	NC_017372	T	6	6	173430	173435	0 %	100 %	0 %	0 %	385220044
3585	NC_017372	T	6	6	173473	173478	0 %	100 %	0 %	0 %	385220044
3586	NC_017372	GTTT	2	8	173498	173505	0 %	75 %	25 %	0 %	385220044
3587	NC_017372	A	6	6	173555	173560	100 %	0 %	0 %	0 %	385220044
3588	NC_017372	T	7	7	173573	173579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_017372	CAC	2	6	173588	173593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_017372	AAC	2	6	173653	173658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_017372	CT	3	6	173669	173674	0 %	50 %	0 %	50 %	385220045
3592	NC_017372	TCA	2	6	173735	173740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385220045
3593	NC_017372	ATA	2	6	173741	173746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385220045
3594	NC_017372	TTA	2	6	173768	173773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385220045
3595	NC_017372	TTCT	2	8	173812	173819	0 %	75 %	0 %	25 %	385220045
3596	NC_017372	CTTAA	2	10	173886	173895	40 %	40 %	0 %	20 %	385220046
3597	NC_017372	TCGC	2	8	173903	173910	0 %	25 %	25 %	50 %	385220046
3598	NC_017372	TAT	3	9	173920	173928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385220046
3599	NC_017372	TCC	2	6	173940	173945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385220046
3600	NC_017372	TCA	2	6	173999	174004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385220046
3601	NC_017372	ATG	2	6	174029	174034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385220046
3602	NC_017372	TCA	2	6	174038	174043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385220046
3603	NC_017372	T	6	6	174135	174140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017372	A	6	6	174143	174148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_017372	ATC	2	6	174180	174185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_017372	T	7	7	174186	174192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017372	T	6	6	174203	174208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_017372	TGT	2	6	174219	174224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_017372	TTA	2	6	174285	174290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_017372	TTA	2	6	174327	174332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385220047
3611	NC_017372	CTTT	2	8	174345	174352	0 %	75 %	0 %	25 %	385220047
3612	NC_017372	T	6	6	174391	174396	0 %	100 %	0 %	0 %	385220047
3613	NC_017372	ATG	2	6	174408	174413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385220047
3614	NC_017372	GCAT	2	8	174447	174454	25 %	25 %	25 %	25 %	385220047
3615	NC_017372	T	6	6	174600	174605	0 %	100 %	0 %	0 %	385220047
3616	NC_017372	T	6	6	174607	174612	0 %	100 %	0 %	0 %	385220047
3617	NC_017372	ATT	2	6	174684	174689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385220047
3618	NC_017372	T	6	6	174704	174709	0 %	100 %	0 %	0 %	385220047
3619	NC_017372	CAGG	2	8	174754	174761	25 %	0 %	50 %	25 %	385220047
3620	NC_017372	TC	4	8	174819	174826	0 %	50 %	0 %	50 %	385220047
3621	NC_017372	GTC	2	6	175084	175089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_017372	T	6	6	175132	175137	0 %	100 %	0 %	0 %	385220048
3623	NC_017372	TTTC	2	8	175167	175174	0 %	75 %	0 %	25 %	385220048
3624	NC_017372	CAA	2	6	175198	175203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385220048
3625	NC_017372	TTG	2	6	175218	175223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385220048
3626	NC_017372	TC	3	6	175230	175235	0 %	50 %	0 %	50 %	385220048
3627	NC_017372	TTG	2	6	175241	175246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385220048
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