MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori F30

Total Repeats: 32709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017365	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	384898368
2	NC_017365	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	384898368
3	NC_017365	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384898368
4	NC_017365	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	384898368
5	NC_017365	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384898368
6	NC_017365	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	384898368
7	NC_017365	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	384898368
8	NC_017365	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384898368
9	NC_017365	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384898368
10	NC_017365	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384898368
11	NC_017365	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	384898368
12	NC_017365	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384898369
13	NC_017365	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	384898369
14	NC_017365	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384898369
15	NC_017365	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384898369
16	NC_017365	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	384898369
17	NC_017365	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384898369
18	NC_017365	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	384898369
19	NC_017365	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384898369
20	NC_017365	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	384898370
21	NC_017365	CCGCAG	2	12	1043	1054	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384898370
22	NC_017365	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384898370
23	NC_017365	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384898370
24	NC_017365	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	384898370
25	NC_017365	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	384898370
26	NC_017365	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	384898370
27	NC_017365	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	384898370
28	NC_017365	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384898370
29	NC_017365	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	384898370
30	NC_017365	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	384898370
31	NC_017365	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	384898370
32	NC_017365	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384898370
33	NC_017365	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384898370
34	NC_017365	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384898370
35	NC_017365	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384898371
36	NC_017365	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	384898371
37	NC_017365	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	384898371
38	NC_017365	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	384898371
39	NC_017365	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384898371
40	NC_017365	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	384898371
41	NC_017365	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	384898371
42	NC_017365	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384898371
43	NC_017365	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	384898371
44	NC_017365	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384898371
45	NC_017365	CAT	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384898371
46	NC_017365	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384898371
47	NC_017365	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384898371
48	NC_017365	G	6	6	2189	2194	0 %	0 %	100 %	0 %	384898371
49	NC_017365	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	384898371
50	NC_017365	TTTGT	2	10	2423	2432	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017365	TTC	2	6	2459	2464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017365	A	8	8	2541	2548	100 %	0 %	0 %	0 %	384898372
53	NC_017365	T	7	7	2637	2643	0 %	100 %	0 %	0 %	384898372
54	NC_017365	T	7	7	2679	2685	0 %	100 %	0 %	0 %	384898372
55	NC_017365	AGC	2	6	2777	2782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384898372
56	NC_017365	A	6	6	2828	2833	100 %	0 %	0 %	0 %	384898372
57	NC_017365	ATTAA	2	10	2924	2933	60 %	40 %	0 %	0 %	384898372
58	NC_017365	AG	3	6	2947	2952	50 %	0 %	50 %	0 %	384898372
59	NC_017365	GTG	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384898372
60	NC_017365	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384898372
61	NC_017365	CAAA	2	8	3100	3107	75 %	0 %	0 %	25 %	384898372
62	NC_017365	GTA	2	6	3125	3130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384898372
63	NC_017365	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384898372
64	NC_017365	TGC	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384898373
65	NC_017365	GAAA	2	8	3247	3254	75 %	0 %	25 %	0 %	384898373
66	NC_017365	GAAA	2	8	3322	3329	75 %	0 %	25 %	0 %	384898373
67	NC_017365	AGTG	2	8	3343	3350	25 %	25 %	50 %	0 %	384898373
68	NC_017365	TG	3	6	3429	3434	0 %	50 %	50 %	0 %	384898373
69	NC_017365	GTT	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384898373
70	NC_017365	TTC	2	6	3599	3604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384898373
71	NC_017365	A	6	6	3866	3871	100 %	0 %	0 %	0 %	384898373
72	NC_017365	ATT	2	6	3906	3911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384898373
73	NC_017365	GGC	2	6	3979	3984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384898373
74	NC_017365	GGT	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017365	TAT	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017365	TGG	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017365	ATGC	2	8	4274	4281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017365	TGG	2	6	4290	4295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017365	GTG	2	6	4406	4411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017365	ACC	2	6	4438	4443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017365	GGT	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017365	A	7	7	4572	4578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017365	T	8	8	4592	4599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017365	AAT	2	6	4613	4618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017365	TGT	2	6	4742	4747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017365	A	6	6	4773	4778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017365	T	7	7	4825	4831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017365	A	6	6	4836	4841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017365	A	6	6	4852	4857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017365	TGT	2	6	4891	4896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017365	TTTTA	2	10	4910	4919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017365	TC	3	6	4955	4960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017365	A	9	9	4987	4995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017365	A	8	8	5004	5011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017365	A	6	6	5022	5027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017365	GCTT	2	8	5212	5219	0 %	50 %	25 %	25 %	384898374
97	NC_017365	T	6	6	5218	5223	0 %	100 %	0 %	0 %	384898374
98	NC_017365	CATT	2	8	5283	5290	25 %	50 %	0 %	25 %	384898374
99	NC_017365	ATT	2	6	5305	5310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384898374
100	NC_017365	TGG	2	6	5403	5408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384898374
101	NC_017365	A	6	6	5515	5520	100 %	0 %	0 %	0 %	384898374
102	NC_017365	C	6	6	5535	5540	0 %	0 %	0 %	100 %	384898374
103	NC_017365	A	6	6	5557	5562	100 %	0 %	0 %	0 %	384898374
104	NC_017365	GTT	2	6	5605	5610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384898374
105	NC_017365	TAA	2	6	5674	5679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384898374
106	NC_017365	GTTGA	2	10	5698	5707	20 %	40 %	40 %	0 %	384898374
107	NC_017365	TTA	2	6	5732	5737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384898374
108	NC_017365	GTG	2	6	5801	5806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384898374
109	NC_017365	GTT	2	6	5821	5826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384898374
110	NC_017365	GTGC	2	8	5861	5868	0 %	25 %	50 %	25 %	384898374
111	NC_017365	TCT	2	6	5945	5950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384898374
112	NC_017365	ATG	2	6	6021	6026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384898374
113	NC_017365	TTTGA	2	10	6073	6082	20 %	60 %	20 %	0 %	384898374
114	NC_017365	GCTTGC	2	12	6104	6115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384898374
115	NC_017365	AGA	2	6	6151	6156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384898374
116	NC_017365	TTG	2	6	6277	6282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384898374
117	NC_017365	GCC	2	6	6328	6333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384898374
118	NC_017365	ATG	2	6	6395	6400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384898374
119	NC_017365	TGG	2	6	6435	6440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384898374
120	NC_017365	TAT	2	6	6462	6467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384898374
121	NC_017365	GTG	2	6	6479	6484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384898374
122	NC_017365	CGTGGT	2	12	6502	6513	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384898374
123	NC_017365	ATTACC	2	12	6520	6531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384898374
124	NC_017365	CTA	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384898374
125	NC_017365	CTA	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384898374
126	NC_017365	CGT	2	6	6579	6584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384898374
127	NC_017365	CTT	2	6	6669	6674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384898374
128	NC_017365	TTG	2	6	6682	6687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384898374
129	NC_017365	GAT	2	6	6688	6693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384898374
130	NC_017365	TCA	2	6	6722	6727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384898374
131	NC_017365	GTT	2	6	6782	6787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384898374
132	NC_017365	TGGT	2	8	6796	6803	0 %	50 %	50 %	0 %	384898374
133	NC_017365	CT	3	6	6830	6835	0 %	50 %	0 %	50 %	384898374
134	NC_017365	CA	3	6	6852	6857	50 %	0 %	0 %	50 %	384898374
135	NC_017365	T	6	6	6939	6944	0 %	100 %	0 %	0 %	384898374
136	NC_017365	ATCG	2	8	6979	6986	25 %	25 %	25 %	25 %	384898374
137	NC_017365	CGTT	2	8	7014	7021	0 %	50 %	25 %	25 %	384898374
138	NC_017365	A	6	6	7153	7158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017365	GA	9	18	7192	7209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017365	T	7	7	7219	7225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017365	TGT	2	6	7346	7351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017365	A	10	10	7355	7364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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