MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica7 chromosome

Total Repeats: 1374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017361	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	385221507
2	NC_017361	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	385221508
3	NC_017361	GTTTT	2	10	4793	4802	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017361	GATTT	2	10	4888	4897	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017361	TTTGT	2	10	5113	5122	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017361	CCATG	2	10	5401	5410	20 %	20 %	20 %	40 %	385221511
7	NC_017361	TTGAT	2	10	5913	5922	20 %	60 %	20 %	0 %	385221511
8	NC_017361	TTTGA	2	10	6290	6299	20 %	60 %	20 %	0 %	385221511
9	NC_017361	TTGCT	2	10	6408	6417	0 %	60 %	20 %	20 %	385221511
10	NC_017361	AAATT	2	10	7406	7415	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017361	TTTCT	2	10	8542	8551	0 %	80 %	0 %	20 %	385221513
12	NC_017361	AATTT	2	10	9381	9390	40 %	60 %	0 %	0 %	385221513
13	NC_017361	TGCCA	2	10	12018	12027	20 %	20 %	20 %	40 %	385221516
14	NC_017361	TTTTG	2	10	12074	12083	0 %	80 %	20 %	0 %	385221516
15	NC_017361	AAAGA	2	10	12118	12127	80 %	0 %	20 %	0 %	385221516
16	NC_017361	TGGTG	2	10	12912	12921	0 %	40 %	60 %	0 %	385221517
17	NC_017361	GCTTT	2	10	13739	13748	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017361	GGCTA	2	10	17685	17694	20 %	20 %	40 %	20 %	385221521
19	NC_017361	CAAAA	2	10	18768	18777	80 %	0 %	0 %	20 %	385221522
20	NC_017361	CGGAT	2	10	18883	18892	20 %	20 %	40 %	20 %	385221522
21	NC_017361	TGAAA	2	10	21144	21153	60 %	20 %	20 %	0 %	385221524
22	NC_017361	GAAAA	2	10	23056	23065	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017361	GATTT	2	10	23523	23532	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017361	TTTGT	2	10	23759	23768	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017361	CCATG	2	10	24167	24176	20 %	20 %	20 %	40 %	385221527
26	NC_017361	TTGAT	2	10	24868	24877	20 %	60 %	20 %	0 %	385221527
27	NC_017361	ATTTT	2	10	26432	26441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017361	CAAGC	2	10	28800	28809	40 %	0 %	20 %	40 %	385221529
29	NC_017361	AATGT	2	10	31407	31416	40 %	40 %	20 %	0 %	385221532
30	NC_017361	TGATT	2	10	32731	32740	20 %	60 %	20 %	0 %	385221533
31	NC_017361	GATAA	2	10	33149	33158	60 %	20 %	20 %	0 %	385221534
32	NC_017361	GTGGG	2	10	34608	34617	0 %	20 %	80 %	0 %	385221535
33	NC_017361	TGGGG	2	10	35859	35868	0 %	20 %	80 %	0 %	385221537
34	NC_017361	TTTTA	2	10	37312	37321	20 %	80 %	0 %	0 %	385221539
35	NC_017361	ATGAA	2	10	38163	38172	60 %	20 %	20 %	0 %	385221540
36	NC_017361	CAAAC	2	10	42277	42286	60 %	0 %	0 %	40 %	385221544
37	NC_017361	AGTAA	2	10	43140	43149	60 %	20 %	20 %	0 %	385221545
38	NC_017361	TATGA	2	10	44699	44708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017361	GGTTT	2	10	44745	44754	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017361	ATTGT	2	10	44947	44956	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017361	TAAAA	2	10	46305	46314	80 %	20 %	0 %	0 %	385221550
42	NC_017361	CTAAA	2	10	47023	47032	60 %	20 %	0 %	20 %	385221551
43	NC_017361	TCCCA	2	10	47326	47335	20 %	20 %	0 %	60 %	385221551
44	NC_017361	GCTCC	2	10	47647	47656	0 %	20 %	20 %	60 %	385221551
45	NC_017361	AAAAT	2	10	47826	47835	80 %	20 %	0 %	0 %	385221551
46	NC_017361	TCGCA	2	10	48184	48193	20 %	20 %	20 %	40 %	385221551
47	NC_017361	CAAAG	2	10	48197	48206	60 %	0 %	20 %	20 %	385221551
48	NC_017361	ATTGG	2	10	51010	51019	20 %	40 %	40 %	0 %	385221554
49	NC_017361	TTTGA	2	10	52804	52813	20 %	60 %	20 %	0 %	385221555
50	NC_017361	AATAA	2	10	52886	52895	80 %	20 %	0 %	0 %	385221555
51	NC_017361	TGAAA	2	10	53414	53423	60 %	20 %	20 %	0 %	385221556
52	NC_017361	AAATT	2	10	53670	53679	60 %	40 %	0 %	0 %	385221556
53	NC_017361	TAAAA	2	10	56704	56713	80 %	20 %	0 %	0 %	385221557
54	NC_017361	GCTTG	2	10	58882	58891	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017361	TTAGA	2	10	58926	58935	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017361	TTTTA	2	10	58945	58954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017361	AAGAA	2	10	59303	59312	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017361	TGTTT	2	10	60035	60044	0 %	80 %	20 %	0 %	385221560
59	NC_017361	TATCC	2	10	62494	62503	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017361	GGAAG	2	10	63561	63570	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017361	GATAC	2	10	63663	63672	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017361	TGGAT	2	10	65436	65445	20 %	40 %	40 %	0 %	385221564
63	NC_017361	GCATT	2	10	65835	65844	20 %	40 %	20 %	20 %	385221564
64	NC_017361	GGTGG	2	10	68144	68153	0 %	20 %	80 %	0 %	385221568
65	NC_017361	AATGC	2	10	68979	68988	40 %	20 %	20 %	20 %	385221568
66	NC_017361	CGAAG	2	10	69287	69296	40 %	0 %	40 %	20 %	385221568
67	NC_017361	CAATC	2	10	69823	69832	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017361	TATTT	2	10	72122	72131	20 %	80 %	0 %	0 %	385221572
69	NC_017361	CTTCT	2	10	72435	72444	0 %	60 %	0 %	40 %	385221572
70	NC_017361	TCCAA	2	10	72924	72933	40 %	20 %	0 %	40 %	385221573
71	NC_017361	TTTTG	2	10	76201	76210	0 %	80 %	20 %	0 %	385221576
72	NC_017361	AAATC	2	10	76293	76302	60 %	20 %	0 %	20 %	385221576
73	NC_017361	ACGCC	2	10	76507	76516	20 %	0 %	20 %	60 %	385221576
74	NC_017361	AAAGC	2	10	77273	77282	60 %	0 %	20 %	20 %	385221577
75	NC_017361	TTACA	2	10	78055	78064	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017361	TAAAA	2	10	79904	79913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017361	ATTGT	2	10	79992	80001	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017361	TTTTG	2	10	82291	82300	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017361	GATTT	2	10	82302	82311	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017361	ATAAA	2	10	84487	84496	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017361	ATCTT	2	10	85875	85884	20 %	60 %	0 %	20 %	385221583
82	NC_017361	ATGCC	2	10	86830	86839	20 %	20 %	20 %	40 %	385221584
83	NC_017361	ATTTT	2	10	87616	87625	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017361	TTGAT	2	10	87898	87907	20 %	60 %	20 %	0 %	385221586
85	NC_017361	GGCGT	2	10	89712	89721	0 %	20 %	60 %	20 %	385221588
86	NC_017361	AATAA	2	10	90797	90806	80 %	20 %	0 %	0 %	385221588
87	NC_017361	ATAAA	2	10	92892	92901	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017361	TAAGA	2	10	92928	92937	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017361	TATTT	2	10	93037	93046	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017361	AAAAT	2	10	93202	93211	80 %	20 %	0 %	0 %	385221590
91	NC_017361	CTTTC	2	10	93488	93497	0 %	60 %	0 %	40 %	385221591
92	NC_017361	AAATT	2	10	94244	94253	60 %	40 %	0 %	0 %	385221592
93	NC_017361	TTTTG	2	10	95730	95739	0 %	80 %	20 %	0 %	385221593
94	NC_017361	TGATT	2	10	96286	96295	20 %	60 %	20 %	0 %	385221594
95	NC_017361	TTTCC	2	10	102807	102816	0 %	60 %	0 %	40 %	385221601
96	NC_017361	GAATG	2	10	112315	112324	40 %	20 %	40 %	0 %	385221609
97	NC_017361	CAAAT	2	10	113571	113580	60 %	20 %	0 %	20 %	385221610
98	NC_017361	ATGCC	2	10	115129	115138	20 %	20 %	20 %	40 %	385221611
99	NC_017361	AACAA	2	10	115974	115983	80 %	0 %	0 %	20 %	385221612
100	NC_017361	TGATT	2	10	117103	117112	20 %	60 %	20 %	0 %	385221613
101	NC_017361	CTAAA	2	10	117572	117581	60 %	20 %	0 %	20 %	385221615
102	NC_017361	AACTT	2	10	120905	120914	40 %	40 %	0 %	20 %	385221616
103	NC_017361	GATCG	2	10	121595	121604	20 %	20 %	40 %	20 %	385221617
104	NC_017361	TTGAT	2	10	125360	125369	20 %	60 %	20 %	0 %	385221619
105	NC_017361	TTTGA	2	10	126604	126613	20 %	60 %	20 %	0 %	385221620
106	NC_017361	ATCTC	2	10	127889	127898	20 %	40 %	0 %	40 %	385221620
107	NC_017361	TGCGT	2	10	130434	130443	0 %	40 %	40 %	20 %	385221623
108	NC_017361	GAAAA	2	10	130595	130604	80 %	0 %	20 %	0 %	385221623
109	NC_017361	ATTTT	2	10	133713	133722	20 %	80 %	0 %	0 %	385221628
110	NC_017361	TTTTA	2	10	135230	135239	20 %	80 %	0 %	0 %	385221629
111	NC_017361	AAATC	2	10	136658	136667	60 %	20 %	0 %	20 %	385221631
112	NC_017361	AAAAT	2	10	138130	138139	80 %	20 %	0 %	0 %	385221632
113	NC_017361	ATAAA	2	10	139906	139915	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017361	AGAGC	2	10	140368	140377	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017361	TTTTC	2	10	140683	140692	0 %	80 %	0 %	20 %	385221635
116	NC_017361	TTCTT	2	10	142639	142648	0 %	80 %	0 %	20 %	385221637
117	NC_017361	TCTTT	2	10	143133	143142	0 %	80 %	0 %	20 %	385221638
118	NC_017361	GTTTT	2	10	144295	144304	0 %	80 %	20 %	0 %	385221639
119	NC_017361	AATTC	2	10	144930	144939	40 %	40 %	0 %	20 %	385221639
120	NC_017361	GCGAT	2	10	145089	145098	20 %	20 %	40 %	20 %	385221639
121	NC_017361	GTCCA	2	10	145949	145958	20 %	20 %	20 %	40 %	385221640
122	NC_017361	TTTTG	2	10	145997	146006	0 %	80 %	20 %	0 %	385221640
123	NC_017361	CCAAA	2	10	147837	147846	60 %	0 %	0 %	40 %	385221641
124	NC_017361	ACGCC	2	10	151359	151368	20 %	0 %	20 %	60 %	385221643
125	NC_017361	TGACA	2	10	153679	153688	40 %	20 %	20 %	20 %	385221649
126	NC_017361	CAAAT	2	10	156765	156774	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017361	AAAAC	2	10	157490	157499	80 %	0 %	0 %	20 %	385221653
128	NC_017361	AAGCC	2	10	160726	160735	40 %	0 %	20 %	40 %	385221658
129	NC_017361	GGCAT	2	10	162529	162538	20 %	20 %	40 %	20 %	385221659
130	NC_017361	ATTTT	2	10	162767	162776	20 %	80 %	0 %	0 %	385221660
131	NC_017361	GTTTA	2	10	164059	164068	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017361	ATTCA	2	10	164937	164946	40 %	40 %	0 %	20 %	385221663
133	NC_017361	ATCTT	2	10	168337	168346	20 %	60 %	0 %	20 %	385221666
134	NC_017361	TTTGT	2	10	169026	169035	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017361	AAAGC	2	10	170760	170769	60 %	0 %	20 %	20 %	385221669
136	NC_017361	TATCA	2	10	177099	177108	40 %	40 %	0 %	20 %	385221676
137	NC_017361	ATTTG	2	10	178106	178115	20 %	60 %	20 %	0 %	385221677
138	NC_017361	GGTGA	2	10	178731	178740	20 %	20 %	60 %	0 %	385221678
139	NC_017361	AAATG	2	10	179517	179526	60 %	20 %	20 %	0 %	385221679
140	NC_017361	TGTAA	2	10	180306	180315	40 %	40 %	20 %	0 %	385221680
141	NC_017361	AATAA	2	10	181801	181810	80 %	20 %	0 %	0 %	385221681
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257	NC_017361	TTTGT	2	10	326717	326726	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
258	NC_017361	TTGAT	2	10	328677	328686	20 %	60 %	20 %	0 %	385221817
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