MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori 35A chromosome

Total Repeats: 4430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017360	TGAA	2	8	131	138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017360	AATA	2	8	1091	1098	75 %	25 %	0 %	0 %	384895180
3	NC_017360	AATA	2	8	1538	1545	75 %	25 %	0 %	0 %	384895182
4	NC_017360	ACTT	2	8	1557	1564	25 %	50 %	0 %	25 %	384895182
5	NC_017360	CTTT	2	8	1973	1980	0 %	75 %	0 %	25 %	384895183
6	NC_017360	ATCC	2	8	2613	2620	25 %	25 %	0 %	50 %	384895184
7	NC_017360	CCAC	2	8	2665	2672	25 %	0 %	0 %	75 %	384895184
8	NC_017360	AAAG	2	8	2883	2890	75 %	0 %	25 %	0 %	384895184
9	NC_017360	TTTA	2	8	2896	2903	25 %	75 %	0 %	0 %	384895184
10	NC_017360	CTTT	2	8	3601	3608	0 %	75 %	0 %	25 %	384895185
11	NC_017360	CATC	2	8	3693	3700	25 %	25 %	0 %	50 %	384895185
12	NC_017360	TATT	2	8	3864	3871	25 %	75 %	0 %	0 %	384895185
13	NC_017360	CAAC	2	8	3894	3901	50 %	0 %	0 %	50 %	384895185
14	NC_017360	TTAA	2	8	4221	4228	50 %	50 %	0 %	0 %	384895186
15	NC_017360	ATGC	2	8	4610	4617	25 %	25 %	25 %	25 %	384895186
16	NC_017360	TGTA	2	8	4660	4667	25 %	50 %	25 %	0 %	384895186
17	NC_017360	TGAT	2	8	5356	5363	25 %	50 %	25 %	0 %	384895187
18	NC_017360	AACA	2	8	5751	5758	75 %	0 %	0 %	25 %	384895187
19	NC_017360	AATT	2	8	5798	5805	50 %	50 %	0 %	0 %	384895187
20	NC_017360	TGCT	2	8	5819	5826	0 %	50 %	25 %	25 %	384895187
21	NC_017360	GATT	2	8	5980	5987	25 %	50 %	25 %	0 %	384895187
22	NC_017360	GCCT	2	8	6194	6201	0 %	25 %	25 %	50 %	384895188
23	NC_017360	CATT	2	8	6452	6459	25 %	50 %	0 %	25 %	384895188
24	NC_017360	TAAC	2	8	6461	6468	50 %	25 %	0 %	25 %	384895188
25	NC_017360	ACCC	2	8	7861	7868	25 %	0 %	0 %	75 %	384895190
26	NC_017360	CCCT	2	8	8064	8071	0 %	25 %	0 %	75 %	384895190
27	NC_017360	CTTG	2	8	8703	8710	0 %	50 %	25 %	25 %	384895191
28	NC_017360	TAAA	2	8	9856	9863	75 %	25 %	0 %	0 %	384895192
29	NC_017360	TGAA	2	8	10784	10791	50 %	25 %	25 %	0 %	384895192
30	NC_017360	ATAG	2	8	11293	11300	50 %	25 %	25 %	0 %	384895192
31	NC_017360	CGCA	2	8	11484	11491	25 %	0 %	25 %	50 %	384895192
32	NC_017360	ATTC	2	8	11637	11644	25 %	50 %	0 %	25 %	384895192
33	NC_017360	TTTA	2	8	11845	11852	25 %	75 %	0 %	0 %	384895192
34	NC_017360	ATTG	2	8	12059	12066	25 %	50 %	25 %	0 %	384895192
35	NC_017360	TTTG	2	8	12447	12454	0 %	75 %	25 %	0 %	384895194
36	NC_017360	CTTG	2	8	12498	12505	0 %	50 %	25 %	25 %	384895194
37	NC_017360	TTGA	2	8	13272	13279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017360	TAAT	2	8	13679	13686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017360	GGAA	2	8	13694	13701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017360	TTCA	2	8	14121	14128	25 %	50 %	0 %	25 %	384895196
41	NC_017360	TCGC	2	8	14446	14453	0 %	25 %	25 %	50 %	384895196
42	NC_017360	GCCC	2	8	15277	15284	0 %	0 %	25 %	75 %	384895197
43	NC_017360	CATG	2	8	15601	15608	25 %	25 %	25 %	25 %	384895197
44	NC_017360	TTGT	2	8	16083	16090	0 %	75 %	25 %	0 %	384895198
45	NC_017360	CGCT	2	8	16496	16503	0 %	25 %	25 %	50 %	384895198
46	NC_017360	ATCA	2	8	17412	17419	50 %	25 %	0 %	25 %	384895198
47	NC_017360	CGCT	2	8	17498	17505	0 %	25 %	25 %	50 %	384895198
48	NC_017360	TTTC	2	8	18227	18234	0 %	75 %	0 %	25 %	384895199
49	NC_017360	CAAA	2	8	18308	18315	75 %	0 %	0 %	25 %	384895199
50	NC_017360	CTAT	2	8	18601	18608	25 %	50 %	0 %	25 %	384895199
51	NC_017360	AATT	2	8	18678	18685	50 %	50 %	0 %	0 %	384895199
52	NC_017360	ATTG	2	8	19241	19248	25 %	50 %	25 %	0 %	384895200
53	NC_017360	CTTT	2	8	19294	19301	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017360	AAAG	2	8	19575	19582	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017360	TTGG	2	8	19597	19604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017360	GTTT	2	8	19703	19710	0 %	75 %	25 %	0 %	384895202
57	NC_017360	GCTT	2	8	19843	19850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017360	GTTT	2	8	20165	20172	0 %	75 %	25 %	0 %	384895203
59	NC_017360	TCTT	2	8	20256	20263	0 %	75 %	0 %	25 %	384895203
60	NC_017360	GTTG	2	8	20727	20734	0 %	50 %	50 %	0 %	384895203
61	NC_017360	CTGT	2	8	21553	21560	0 %	50 %	25 %	25 %	384895203
62	NC_017360	TTCA	2	8	22503	22510	25 %	50 %	0 %	25 %	384895204
63	NC_017360	TCAA	2	8	22948	22955	50 %	25 %	0 %	25 %	384895204
64	NC_017360	TGCT	2	8	23354	23361	0 %	50 %	25 %	25 %	384895205
65	NC_017360	TCGC	2	8	23694	23701	0 %	25 %	25 %	50 %	384895205
66	NC_017360	TCAA	2	8	23832	23839	50 %	25 %	0 %	25 %	384895205
67	NC_017360	CTTT	2	8	23964	23971	0 %	75 %	0 %	25 %	384895205
68	NC_017360	CAAT	2	8	23992	23999	50 %	25 %	0 %	25 %	384895205
69	NC_017360	TTTG	2	8	24474	24481	0 %	75 %	25 %	0 %	384895207
70	NC_017360	ATTG	2	8	24781	24788	25 %	50 %	25 %	0 %	384895208
71	NC_017360	CAAG	2	8	25038	25045	50 %	0 %	25 %	25 %	384895208
72	NC_017360	CAGA	2	8	25853	25860	50 %	0 %	25 %	25 %	384895210
73	NC_017360	AAAG	2	8	25864	25871	75 %	0 %	25 %	0 %	384895210
74	NC_017360	CGCT	2	8	25964	25971	0 %	25 %	25 %	50 %	384895210
75	NC_017360	CGTT	2	8	26206	26213	0 %	50 %	25 %	25 %	384895210
76	NC_017360	TTTG	2	8	26243	26250	0 %	75 %	25 %	0 %	384895210
77	NC_017360	TCAA	2	8	26314	26321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017360	AAAT	2	8	26660	26667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017360	AAGT	2	8	26957	26964	50 %	25 %	25 %	0 %	384895211
80	NC_017360	TAAA	2	8	27089	27096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017360	AAGA	2	8	27097	27104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017360	CATC	2	8	27917	27924	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017360	ACCT	2	8	28071	28078	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017360	CTGA	2	8	28142	28149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017360	AGAA	2	8	28842	28849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017360	ATCA	2	8	28908	28915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017360	CAAT	2	8	28923	28930	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017360	CCTC	2	8	29340	29347	0 %	25 %	0 %	75 %	384895212
89	NC_017360	GAAA	2	8	29386	29393	75 %	0 %	25 %	0 %	384895212
90	NC_017360	CTGT	2	8	29432	29439	0 %	50 %	25 %	25 %	384895212
91	NC_017360	AGCT	2	8	29657	29664	25 %	25 %	25 %	25 %	384895212
92	NC_017360	GCTC	2	8	30391	30398	0 %	25 %	25 %	50 %	384895213
93	NC_017360	ATAG	2	8	30674	30681	50 %	25 %	25 %	0 %	384895214
94	NC_017360	ATGC	2	8	30832	30839	25 %	25 %	25 %	25 %	384895214
95	NC_017360	GAAA	2	8	32095	32102	75 %	0 %	25 %	0 %	384895217
96	NC_017360	ACAG	2	8	32210	32217	50 %	0 %	25 %	25 %	384895217
97	NC_017360	GACT	2	8	32247	32254	25 %	25 %	25 %	25 %	384895217
98	NC_017360	ACCA	2	8	33042	33049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017360	TTTA	2	8	33337	33344	25 %	75 %	0 %	0 %	384895219
100	NC_017360	GCTT	2	8	33449	33456	0 %	50 %	25 %	25 %	384895219
101	NC_017360	TCTT	2	8	34005	34012	0 %	75 %	0 %	25 %	384895221
102	NC_017360	CAAA	2	8	34259	34266	75 %	0 %	0 %	25 %	384895221
103	NC_017360	CTTT	2	8	34945	34952	0 %	75 %	0 %	25 %	384895221
104	NC_017360	GTTT	2	8	34964	34971	0 %	75 %	25 %	0 %	384895221
105	NC_017360	GCAA	2	8	35414	35421	50 %	0 %	25 %	25 %	384895221
106	NC_017360	AAAG	2	8	35762	35769	75 %	0 %	25 %	0 %	384895222
107	NC_017360	GAAA	2	8	35812	35819	75 %	0 %	25 %	0 %	384895222
108	NC_017360	ATTG	2	8	36034	36041	25 %	50 %	25 %	0 %	384895222
109	NC_017360	AATG	2	8	36380	36387	50 %	25 %	25 %	0 %	384895222
110	NC_017360	ATTT	2	8	36567	36574	25 %	75 %	0 %	0 %	384895223
111	NC_017360	GCTT	2	8	36660	36667	0 %	50 %	25 %	25 %	384895223
112	NC_017360	AGCG	2	8	36752	36759	25 %	0 %	50 %	25 %	384895223
113	NC_017360	TGAT	2	8	36889	36896	25 %	50 %	25 %	0 %	384895223
114	NC_017360	TTGA	2	8	37173	37180	25 %	50 %	25 %	0 %	384895223
115	NC_017360	TTTG	2	8	37964	37971	0 %	75 %	25 %	0 %	384895224
116	NC_017360	TGTA	2	8	38261	38268	25 %	50 %	25 %	0 %	384895224
117	NC_017360	TGGG	2	8	40158	40165	0 %	25 %	75 %	0 %	384895224
118	NC_017360	GTTT	2	8	40370	40377	0 %	75 %	25 %	0 %	384895225
119	NC_017360	AGAC	2	8	40428	40435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017360	CAAA	2	8	40785	40792	75 %	0 %	0 %	25 %	384895226
121	NC_017360	CAAG	2	8	40825	40832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017360	TCGC	2	8	40991	40998	0 %	25 %	25 %	50 %	384895227
123	NC_017360	CTGT	2	8	41036	41043	0 %	50 %	25 %	25 %	384895227
124	NC_017360	GATT	2	8	41442	41449	25 %	50 %	25 %	0 %	384895227
125	NC_017360	GTTT	2	8	41662	41669	0 %	75 %	25 %	0 %	384895227
126	NC_017360	AGCA	2	8	42082	42089	50 %	0 %	25 %	25 %	384895228
127	NC_017360	CTCC	2	8	42944	42951	0 %	25 %	0 %	75 %	384895230
128	NC_017360	TCAA	2	8	43073	43080	50 %	25 %	0 %	25 %	384895230
129	NC_017360	ACCC	2	8	43234	43241	25 %	0 %	0 %	75 %	384895230
130	NC_017360	TTAA	2	8	43490	43497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017360	AACA	2	8	43510	43517	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017360	AAAG	2	8	43556	43563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017360	AACG	2	8	44144	44151	50 %	0 %	25 %	25 %	384895232
134	NC_017360	GCAT	2	8	44428	44435	25 %	25 %	25 %	25 %	384895232
135	NC_017360	TGAT	2	8	44710	44717	25 %	50 %	25 %	0 %	384895232
136	NC_017360	ATCA	2	8	45506	45513	50 %	25 %	0 %	25 %	384895233
137	NC_017360	CCAT	2	8	45543	45550	25 %	25 %	0 %	50 %	384895233
138	NC_017360	AATC	2	8	47572	47579	50 %	25 %	0 %	25 %	384895233
139	NC_017360	TAAA	2	8	47885	47892	75 %	25 %	0 %	0 %	384895233
140	NC_017360	AATC	2	8	48274	48281	50 %	25 %	0 %	25 %	384895233
141	NC_017360	TACC	2	8	48467	48474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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