MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori 35A chromosome

Total Repeats: 32651

< Previous12...54555657585960616263646566Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_017360	T	6	6	1559027	1559032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32502	NC_017360	A	6	6	1559142	1559147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32503	NC_017360	TA	3	6	1559176	1559181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32504	NC_017360	AAT	2	6	1559193	1559198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32505	NC_017360	CTAA	2	8	1559246	1559253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32506	NC_017360	A	6	6	1559436	1559441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32507	NC_017360	TTATG	2	10	1559456	1559465	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32508	NC_017360	TTTTA	2	10	1559474	1559483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32509	NC_017360	ATTTT	2	10	1559493	1559502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32510	NC_017360	ATTTT	2	10	1559513	1559522	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32511	NC_017360	A	6	6	1559551	1559556	100 %	0 %	0 %	0 %	384896645
32512	NC_017360	CAA	2	6	1559569	1559574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896645
32513	NC_017360	AAC	2	6	1559575	1559580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896645
32514	NC_017360	ACC	2	6	1559594	1559599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384896645
32515	NC_017360	AAAC	2	8	1559600	1559607	75 %	0 %	0 %	25 %	384896645
32516	NC_017360	AAT	2	6	1559621	1559626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896645
32517	NC_017360	TAAA	2	8	1559632	1559639	75 %	25 %	0 %	0 %	384896645
32518	NC_017360	A	6	6	1559650	1559655	100 %	0 %	0 %	0 %	384896645
32519	NC_017360	CTT	2	6	1559756	1559761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896646
32520	NC_017360	ACC	2	6	1559774	1559779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384896646
32521	NC_017360	AAT	2	6	1559781	1559786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384896646
32522	NC_017360	ATCCA	2	10	1559911	1559920	40 %	20 %	0 %	40 %	384896646
32523	NC_017360	TCT	3	9	1559929	1559937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896646
32524	NC_017360	CCG	2	6	1559980	1559985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384896646
32525	NC_017360	GTT	2	6	1560008	1560013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896646
32526	NC_017360	A	6	6	1560058	1560063	100 %	0 %	0 %	0 %	384896646
32527	NC_017360	TTC	2	6	1560117	1560122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384896646
32528	NC_017360	CAT	2	6	1560137	1560142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896646
32529	NC_017360	CCT	2	6	1560236	1560241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32530	NC_017360	TTG	2	6	1560244	1560249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32531	NC_017360	A	6	6	1560316	1560321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32532	NC_017360	A	6	6	1560336	1560341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32533	NC_017360	AAT	2	6	1560356	1560361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32534	NC_017360	A	6	6	1560372	1560377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32535	NC_017360	A	7	7	1560386	1560392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32536	NC_017360	TAT	2	6	1560443	1560448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32537	NC_017360	AGA	2	6	1560588	1560593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32538	NC_017360	TTAA	2	8	1560607	1560614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32539	NC_017360	CT	3	6	1560682	1560687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32540	NC_017360	A	6	6	1560749	1560754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32541	NC_017360	TAG	3	9	1560772	1560780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32542	NC_017360	CAG	2	6	1560890	1560895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32543	NC_017360	GT	3	6	1560907	1560912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32544	NC_017360	AAC	2	6	1560938	1560943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32545	NC_017360	CTC	2	6	1560994	1560999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32546	NC_017360	ACG	2	6	1561041	1561046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32547	NC_017360	CA	3	6	1561228	1561233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32548	NC_017360	ACC	2	6	1561236	1561241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32549	NC_017360	GGCT	2	8	1561294	1561301	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32550	NC_017360	AGG	2	6	1561372	1561377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32551	NC_017360	CCA	2	6	1561399	1561404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32552	NC_017360	CCTG	2	8	1561413	1561420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32553	NC_017360	GGT	2	6	1561459	1561464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32554	NC_017360	GTA	2	6	1561556	1561561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32555	NC_017360	AGG	2	6	1561596	1561601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32556	NC_017360	GCC	2	6	1561729	1561734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32557	NC_017360	TTCAA	2	10	1561747	1561756	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32558	NC_017360	GGGA	2	8	1561868	1561875	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32559	NC_017360	TGC	2	6	1561895	1561900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32560	NC_017360	CTCAT	2	10	1561977	1561986	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32561	NC_017360	GAC	2	6	1562011	1562016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32562	NC_017360	ACG	2	6	1562046	1562051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32563	NC_017360	AGCT	2	8	1562166	1562173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32564	NC_017360	C	6	6	1562191	1562196	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32565	NC_017360	GAC	2	6	1562288	1562293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32566	NC_017360	CGG	2	6	1562319	1562324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32567	NC_017360	AT	3	6	1562336	1562341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32568	NC_017360	CTTT	2	8	1562523	1562530	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32569	NC_017360	GCT	2	6	1562539	1562544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32570	NC_017360	CCT	2	6	1562555	1562560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32571	NC_017360	GTT	2	6	1562562	1562567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32572	NC_017360	CA	3	6	1562576	1562581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32573	NC_017360	GTT	2	6	1562630	1562635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32574	NC_017360	GATT	2	8	1562647	1562654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32575	NC_017360	CACC	2	8	1562659	1562666	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32576	NC_017360	AGC	2	6	1562728	1562733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32577	NC_017360	TAT	2	6	1562763	1562768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32578	NC_017360	AT	3	6	1562788	1562793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32579	NC_017360	GTTT	2	8	1562819	1562826	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32580	NC_017360	TCC	2	6	1562884	1562889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32581	NC_017360	GCA	2	6	1562947	1562952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32582	NC_017360	AGT	2	6	1563182	1563187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32583	NC_017360	TCGC	2	8	1563397	1563404	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32584	NC_017360	ACT	2	6	1563406	1563411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32585	NC_017360	TCACT	2	10	1563456	1563465	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32586	NC_017360	CT	3	6	1563473	1563478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32587	NC_017360	CT	3	6	1563593	1563598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32588	NC_017360	TTC	2	6	1563701	1563706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32589	NC_017360	TACTT	2	10	1563754	1563763	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32590	NC_017360	AGA	2	6	1563853	1563858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32591	NC_017360	T	6	6	1563882	1563887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32592	NC_017360	TTG	2	6	1563922	1563927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32593	NC_017360	AACTTG	2	12	1563947	1563958	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32594	NC_017360	GTT	2	6	1563993	1563998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32595	NC_017360	GAAA	2	8	1564092	1564099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32596	NC_017360	AAAAT	2	10	1564194	1564203	80 %	20 %	0 %	0 %	384896647
32597	NC_017360	CAT	2	6	1564205	1564210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896647
32598	NC_017360	AAAT	2	8	1564212	1564219	75 %	25 %	0 %	0 %	384896647
32599	NC_017360	CAT	2	6	1564221	1564226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896647
32600	NC_017360	ACA	2	6	1564253	1564258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896647
32601	NC_017360	T	8	8	1564271	1564278	0 %	100 %	0 %	0 %	384896647
32602	NC_017360	ATC	2	6	1564323	1564328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32603	NC_017360	ATC	2	6	1564331	1564336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32604	NC_017360	TGT	2	6	1564356	1564361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32605	NC_017360	T	6	6	1564398	1564403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32606	NC_017360	ATT	2	6	1564404	1564409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32607	NC_017360	GA	3	6	1564514	1564519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32608	NC_017360	AGA	2	6	1564533	1564538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384896648
32609	NC_017360	TGT	3	9	1564565	1564573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384896648
32610	NC_017360	ACG	2	6	1564665	1564670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384896648
32611	NC_017360	CAT	2	6	1564722	1564727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384896648
32612	NC_017360	CAA	2	6	1564748	1564753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384896648
32613	NC_017360	TGA	2	6	1564818	1564823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384896648
32614	NC_017360	GAA	2	6	1564879	1564884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32615	NC_017360	ATTG	2	8	1564941	1564948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32616	NC_017360	A	7	7	1564952	1564958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32617	NC_017360	ATGGTT	2	12	1564962	1564973	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32618	NC_017360	T	6	6	1564972	1564977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32619	NC_017360	CAT	2	6	1564988	1564993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32620	NC_017360	GAA	2	6	1564995	1565000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32621	NC_017360	TTG	2	6	1565016	1565021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32622	NC_017360	A	6	6	1565089	1565094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32623	NC_017360	AG	3	6	1565178	1565183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32624	NC_017360	ACC	2	6	1565277	1565282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32625	NC_017360	TAT	2	6	1565340	1565345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32626	NC_017360	GAA	3	9	1565376	1565384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32627	NC_017360	CTT	2	6	1565407	1565412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32628	NC_017360	T	6	6	1565445	1565450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32629	NC_017360	A	6	6	1565455	1565460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32630	NC_017360	A	6	6	1565488	1565493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32631	NC_017360	GTG	2	6	1565529	1565534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32632	NC_017360	A	6	6	1565664	1565669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32633	NC_017360	CAA	2	6	1565682	1565687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32634	NC_017360	T	6	6	1565756	1565761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32635	NC_017360	TAC	2	6	1565781	1565786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32636	NC_017360	GTT	2	6	1565813	1565818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32637	NC_017360	ACA	2	6	1565854	1565859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32638	NC_017360	GAT	2	6	1565888	1565893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32639	NC_017360	TCTT	2	8	1565905	1565912	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32640	NC_017360	TTC	2	6	1565914	1565919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32641	NC_017360	TGA	2	6	1565947	1565952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32642	NC_017360	TTG	2	6	1565970	1565975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32643	NC_017360	GCG	2	6	1566037	1566042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32644	NC_017360	T	6	6	1566067	1566072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32645	NC_017360	CT	4	8	1566083	1566090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32646	NC_017360	GC	3	6	1566103	1566108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32647	NC_017360	ACC	2	6	1566137	1566142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32648	NC_017360	TTA	2	6	1566158	1566163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32649	NC_017360	T	6	6	1566319	1566324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32650	NC_017360	A	7	7	1566543	1566549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32651	NC_017360	TGA	2	6	1566640	1566645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...54555657585960616263646566Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.