MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori 35A chromosome

Total Repeats: 32651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017360	AATC	2	8	47572	47579	50 %	25 %	0 %	25 %	384895233
1002	NC_017360	TTC	2	6	47654	47659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895233
1003	NC_017360	CTT	2	6	47746	47751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895233
1004	NC_017360	TGG	2	6	47791	47796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384895233
1005	NC_017360	GAT	2	6	47798	47803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895233
1006	NC_017360	TCA	2	6	47841	47846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895233
1007	NC_017360	TAAA	2	8	47885	47892	75 %	25 %	0 %	0 %	384895233
1008	NC_017360	GTC	2	6	47894	47899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384895233
1009	NC_017360	T	7	7	47929	47935	0 %	100 %	0 %	0 %	384895233
1010	NC_017360	TCA	2	6	47940	47945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895233
1011	NC_017360	TC	3	6	47972	47977	0 %	50 %	0 %	50 %	384895233
1012	NC_017360	ATA	2	6	48083	48088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895233
1013	NC_017360	GTC	2	6	48203	48208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384895233
1014	NC_017360	GAT	2	6	48233	48238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895233
1015	NC_017360	CTT	2	6	48250	48255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895233
1016	NC_017360	T	6	6	48254	48259	0 %	100 %	0 %	0 %	384895233
1017	NC_017360	AATC	2	8	48274	48281	50 %	25 %	0 %	25 %	384895233
1018	NC_017360	TACC	2	8	48467	48474	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_017360	A	6	6	48482	48487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017360	ATT	2	6	48514	48519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017360	TGG	2	6	48526	48531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017360	TAA	2	6	48535	48540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017360	TAT	2	6	48550	48555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017360	TCA	2	6	48577	48582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895234
1025	NC_017360	A	6	6	48585	48590	100 %	0 %	0 %	0 %	384895234
1026	NC_017360	A	6	6	48657	48662	100 %	0 %	0 %	0 %	384895234
1027	NC_017360	GCCTAT	2	12	48683	48694	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384895234
1028	NC_017360	A	7	7	48723	48729	100 %	0 %	0 %	0 %	384895234
1029	NC_017360	GAA	2	6	48911	48916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895234
1030	NC_017360	ATG	2	6	48964	48969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895234
1031	NC_017360	TGGGA	2	10	48978	48987	20 %	20 %	60 %	0 %	384895234
1032	NC_017360	TCT	2	6	49029	49034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895234
1033	NC_017360	GTG	2	6	49059	49064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384895234
1034	NC_017360	A	6	6	49069	49074	100 %	0 %	0 %	0 %	384895234
1035	NC_017360	ATG	2	6	49201	49206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895234
1036	NC_017360	T	6	6	49208	49213	0 %	100 %	0 %	0 %	384895234
1037	NC_017360	AAG	2	6	49249	49254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895234
1038	NC_017360	TG	3	6	49281	49286	0 %	50 %	50 %	0 %	384895234
1039	NC_017360	GGT	2	6	49334	49339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384895234
1040	NC_017360	GAA	2	6	49521	49526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895234
1041	NC_017360	A	7	7	49530	49536	100 %	0 %	0 %	0 %	384895234
1042	NC_017360	A	6	6	49566	49571	100 %	0 %	0 %	0 %	384895234
1043	NC_017360	TAA	2	6	49600	49605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895234
1044	NC_017360	CAA	2	6	49703	49708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_017360	A	6	6	49710	49715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017360	AAAT	2	8	49829	49836	75 %	25 %	0 %	0 %	384895235
1047	NC_017360	T	6	6	49842	49847	0 %	100 %	0 %	0 %	384895235
1048	NC_017360	AC	3	6	49948	49953	50 %	0 %	0 %	50 %	384895235
1049	NC_017360	CATA	2	8	50003	50010	50 %	25 %	0 %	25 %	384895235
1050	NC_017360	CTT	2	6	50104	50109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895235
1051	NC_017360	T	6	6	50136	50141	0 %	100 %	0 %	0 %	384895235
1052	NC_017360	AG	3	6	50201	50206	50 %	0 %	50 %	0 %	384895235
1053	NC_017360	CTT	2	6	50217	50222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895235
1054	NC_017360	CT	3	6	50227	50232	0 %	50 %	0 %	50 %	384895235
1055	NC_017360	T	6	6	50320	50325	0 %	100 %	0 %	0 %	384895235
1056	NC_017360	A	9	9	50339	50347	100 %	0 %	0 %	0 %	384895235
1057	NC_017360	TCC	2	6	50409	50414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_017360	T	7	7	50425	50431	0 %	100 %	0 %	0 %	384895236
1059	NC_017360	T	6	6	50461	50466	0 %	100 %	0 %	0 %	384895236
1060	NC_017360	CTT	2	6	50481	50486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895236
1061	NC_017360	GTTTT	2	10	50570	50579	0 %	80 %	20 %	0 %	384895236
1062	NC_017360	TTTTCT	2	12	50681	50692	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384895236
1063	NC_017360	CTT	2	6	50787	50792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895236
1064	NC_017360	TAA	2	6	50922	50927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895236
1065	NC_017360	GCA	2	6	51006	51011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384895236
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1068	NC_017360	ATT	2	6	51101	51106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895237
1069	NC_017360	ATT	2	6	51288	51293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895237
1070	NC_017360	ATC	2	6	51372	51377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895237
1071	NC_017360	TCA	2	6	51415	51420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895237
1072	NC_017360	TCA	2	6	51452	51457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895237
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1074	NC_017360	CTT	2	6	51506	51511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895237
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1078	NC_017360	TGA	2	6	51710	51715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895237
1079	NC_017360	ATA	2	6	51801	51806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895237
1080	NC_017360	ATAAA	2	10	51839	51848	80 %	20 %	0 %	0 %	384895237
1081	NC_017360	AGA	2	6	51875	51880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895237
1082	NC_017360	CCG	2	6	51883	51888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384895237
1083	NC_017360	TC	3	6	51922	51927	0 %	50 %	0 %	50 %	384895238
1084	NC_017360	TTGAA	2	10	51934	51943	40 %	40 %	20 %	0 %	384895238
1085	NC_017360	T	6	6	51977	51982	0 %	100 %	0 %	0 %	384895238
1086	NC_017360	ATC	2	6	52080	52085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895238
1087	NC_017360	ACC	2	6	52086	52091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895238
1088	NC_017360	CT	3	6	52104	52109	0 %	50 %	0 %	50 %	384895238
1089	NC_017360	ATG	2	6	52119	52124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895238
1090	NC_017360	TCA	2	6	52128	52133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895238
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1092	NC_017360	C	6	6	52238	52243	0 %	0 %	0 %	100 %	384895238
1093	NC_017360	GGT	2	6	52264	52269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384895238
1094	NC_017360	CAA	2	6	52321	52326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895238
1095	NC_017360	T	7	7	52327	52333	0 %	100 %	0 %	0 %	384895238
1096	NC_017360	TGC	2	6	52443	52448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384895238
1097	NC_017360	TCTT	2	8	52451	52458	0 %	75 %	0 %	25 %	384895238
1098	NC_017360	AT	3	6	52468	52473	50 %	50 %	0 %	0 %	384895238
1099	NC_017360	AAT	2	6	52616	52621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895238
1100	NC_017360	CTTCA	2	10	52649	52658	20 %	40 %	0 %	40 %	384895238
1101	NC_017360	AGC	2	6	52676	52681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384895238
1102	NC_017360	TCA	2	6	52684	52689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895238
1103	NC_017360	ATA	2	6	52709	52714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895239
1104	NC_017360	A	6	6	52716	52721	100 %	0 %	0 %	0 %	384895239
1105	NC_017360	CAC	2	6	52756	52761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895239
1106	NC_017360	ATCGCA	2	12	52832	52843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384895239
1107	NC_017360	A	6	6	52877	52882	100 %	0 %	0 %	0 %	384895239
1108	NC_017360	TA	3	6	52915	52920	50 %	50 %	0 %	0 %	384895239
1109	NC_017360	TTC	2	6	53089	53094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895239
1110	NC_017360	TCA	2	6	53103	53108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895239
1111	NC_017360	CTC	2	6	53138	53143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384895239
1112	NC_017360	TAAAA	2	10	53161	53170	80 %	20 %	0 %	0 %	384895239
1113	NC_017360	TC	3	6	53178	53183	0 %	50 %	0 %	50 %	384895239
1114	NC_017360	TTGTAA	2	12	53236	53247	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384895239
1115	NC_017360	TGATA	2	10	53328	53337	40 %	40 %	20 %	0 %	384895239
1116	NC_017360	TAA	2	6	53382	53387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895239
1117	NC_017360	AATAA	3	15	53383	53397	80 %	20 %	0 %	0 %	384895239
1118	NC_017360	T	6	6	53485	53490	0 %	100 %	0 %	0 %	384895239
1119	NC_017360	T	6	6	53497	53502	0 %	100 %	0 %	0 %	384895239
1120	NC_017360	CTT	2	6	53517	53522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895239
1121	NC_017360	CTAA	2	8	53606	53613	50 %	25 %	0 %	25 %	384895239
1122	NC_017360	T	6	6	53646	53651	0 %	100 %	0 %	0 %	384895239
1123	NC_017360	TGA	2	6	53684	53689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895239
1124	NC_017360	TAA	2	6	53692	53697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895239
1125	NC_017360	T	9	9	53698	53706	0 %	100 %	0 %	0 %	384895239
1126	NC_017360	AATCCC	2	12	53739	53750	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384895239
1127	NC_017360	AT	3	6	53825	53830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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