MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori 35A chromosome

Total Repeats: 32651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017360	T	6	6	23764	23769	0 %	100 %	0 %	0 %	384895205
502	NC_017360	T	6	6	23785	23790	0 %	100 %	0 %	0 %	384895205
503	NC_017360	CCA	2	6	23820	23825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895205
504	NC_017360	TCAA	2	8	23832	23839	50 %	25 %	0 %	25 %	384895205
505	NC_017360	CTT	2	6	23884	23889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895205
506	NC_017360	GGGCG	2	10	23945	23954	0 %	0 %	80 %	20 %	384895205
507	NC_017360	CTTT	2	8	23964	23971	0 %	75 %	0 %	25 %	384895205
508	NC_017360	A	6	6	23978	23983	100 %	0 %	0 %	0 %	384895205
509	NC_017360	CAAT	2	8	23992	23999	50 %	25 %	0 %	25 %	384895205
510	NC_017360	ATT	2	6	24048	24053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895205
511	NC_017360	T	6	6	24067	24072	0 %	100 %	0 %	0 %	384895205
512	NC_017360	TAT	2	6	24127	24132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017360	GCT	2	6	24216	24221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384895206
514	NC_017360	GAA	3	9	24333	24341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895206
515	NC_017360	T	6	6	24412	24417	0 %	100 %	0 %	0 %	384895206
516	NC_017360	TGT	2	6	24428	24433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384895207
517	NC_017360	TTTG	2	8	24474	24481	0 %	75 %	25 %	0 %	384895207
518	NC_017360	T	6	6	24491	24496	0 %	100 %	0 %	0 %	384895207
519	NC_017360	GAT	2	6	24500	24505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895207
520	NC_017360	A	7	7	24641	24647	100 %	0 %	0 %	0 %	384895208
521	NC_017360	TAG	2	6	24676	24681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895208
522	NC_017360	AAC	2	6	24722	24727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895208
523	NC_017360	ATTG	2	8	24781	24788	25 %	50 %	25 %	0 %	384895208
524	NC_017360	T	6	6	24848	24853	0 %	100 %	0 %	0 %	384895208
525	NC_017360	TCGCAT	2	12	24896	24907	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384895208
526	NC_017360	ATA	2	6	25032	25037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895208
527	NC_017360	CAAG	2	8	25038	25045	50 %	0 %	25 %	25 %	384895208
528	NC_017360	CAA	2	6	25129	25134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895208
529	NC_017360	CAC	2	6	25162	25167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895208
530	NC_017360	AAT	2	6	25188	25193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895208
531	NC_017360	AG	4	8	25214	25221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017360	ATG	2	6	25235	25240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017360	AT	3	6	25263	25268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017360	CAA	2	6	25316	25321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017360	ATT	2	6	25365	25370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895209
536	NC_017360	AAC	2	6	25453	25458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895209
537	NC_017360	TGT	2	6	25530	25535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384895209
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539	NC_017360	TTTTAA	2	12	25574	25585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895209
540	NC_017360	AAAGG	2	10	25653	25662	60 %	0 %	40 %	0 %	384895209
541	NC_017360	AAAAT	2	10	25676	25685	80 %	20 %	0 %	0 %	384895209
542	NC_017360	TGA	2	6	25709	25714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895209
543	NC_017360	A	6	6	25742	25747	100 %	0 %	0 %	0 %	384895209
544	NC_017360	ACA	2	6	25841	25846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895210
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547	NC_017360	CGCT	2	8	25964	25971	0 %	25 %	25 %	50 %	384895210
548	NC_017360	TC	3	6	26003	26008	0 %	50 %	0 %	50 %	384895210
549	NC_017360	TTA	2	6	26067	26072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895210
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551	NC_017360	A	6	6	26118	26123	100 %	0 %	0 %	0 %	384895210
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555	NC_017360	TTTG	2	8	26243	26250	0 %	75 %	25 %	0 %	384895210
556	NC_017360	TCAA	2	8	26314	26321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
557	NC_017360	TGA	2	6	26374	26379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017360	TTA	2	6	26382	26387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017360	AGT	2	6	26404	26409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017360	T	7	7	26409	26415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017360	TTA	2	6	26530	26535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017360	AG	3	6	26537	26542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017360	ATC	2	6	26647	26652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017360	AAAT	2	8	26660	26667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017360	TTTGAG	2	12	26673	26684	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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569	NC_017360	TAG	2	6	26916	26921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895211
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571	NC_017360	AAGT	2	8	26957	26964	50 %	25 %	25 %	0 %	384895211
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573	NC_017360	TAA	2	6	26991	26996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_017360	TG	4	8	27263	27270	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017360	GA	3	6	27439	27444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017360	GT	3	6	27506	27511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017360	ATG	2	6	27531	27536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017360	CGT	2	6	27543	27548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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588	NC_017360	GAC	2	6	27670	27675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_017360	GCA	2	6	27682	27687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_017360	CA	3	6	27738	27743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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592	NC_017360	GA	3	6	27891	27896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017360	CAA	2	6	27907	27912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017360	CATC	2	8	27917	27924	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_017360	CAG	2	6	28002	28007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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597	NC_017360	TAG	2	6	28095	28100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017360	CTGA	2	8	28142	28149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
599	NC_017360	GCT	2	6	28218	28223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_017360	TCT	2	6	28267	28272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017360	TCC	2	6	28307	28312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_017360	TGC	2	6	28322	28327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017360	CTG	2	6	28361	28366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_017360	GT	3	6	28402	28407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017360	TTACC	2	10	28455	28464	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
606	NC_017360	ATC	2	6	28535	28540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017360	CGC	2	6	28661	28666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_017360	CT	3	6	28721	28726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_017360	T	6	6	28729	28734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017360	TAA	2	6	28754	28759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017360	ACA	3	9	28829	28837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017360	AGAA	2	8	28842	28849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017360	ATCA	2	8	28908	28915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
614	NC_017360	CAAT	2	8	28923	28930	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_017360	AAAGA	2	10	28968	28977	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017360	AAT	2	6	29023	29028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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618	NC_017360	TCTTT	2	10	29249	29258	0 %	80 %	0 %	20 %	384895212
619	NC_017360	CTA	2	6	29296	29301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895212
620	NC_017360	CCTC	2	8	29340	29347	0 %	25 %	0 %	75 %	384895212
621	NC_017360	AAG	2	6	29372	29377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895212
622	NC_017360	GAAA	2	8	29386	29393	75 %	0 %	25 %	0 %	384895212
623	NC_017360	CTGT	2	8	29432	29439	0 %	50 %	25 %	25 %	384895212
624	NC_017360	GTA	2	6	29472	29477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895212
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626	NC_017360	ATA	2	6	29559	29564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895212
627	NC_017360	CT	3	6	29566	29571	0 %	50 %	0 %	50 %	384895212
628	NC_017360	AAT	2	6	29585	29590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895212
629	NC_017360	CGG	2	6	29603	29608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384895212
630	NC_017360	AGCT	2	8	29657	29664	25 %	25 %	25 %	25 %	384895212
631	NC_017360	GCT	2	6	29685	29690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384895212
632	NC_017360	AGA	2	6	29748	29753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895212
633	NC_017360	CTT	2	6	29792	29797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895212
634	NC_017360	ATT	2	6	29898	29903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895212
635	NC_017360	TCA	2	6	29909	29914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895212
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637	NC_017360	CAT	2	6	29970	29975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895212
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