MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori v225d chromosome

Total Repeats: 790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017355	AAAGCA	2	12	278	289	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384888658
2	NC_017355	ATTATA	2	12	1785	1796	50 %	50 %	0 %	0 %	384888661
3	NC_017355	GCGATA	2	12	3717	3728	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384888663
4	NC_017355	GCTTGC	2	12	6114	6125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384888665
5	NC_017355	GAAACC	2	12	7489	7500	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384888666
6	NC_017355	CAATAT	2	12	17143	17154	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384888675
7	NC_017355	AAACAC	2	12	18070	18081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017355	AGAAAA	2	12	18420	18431	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384888676
9	NC_017355	GATAAA	2	12	21976	21987	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384888679
10	NC_017355	TTTCTT	2	12	22678	22689	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017355	TTTTAG	2	12	28961	28972	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384888687
12	NC_017355	GCGTGG	2	12	30854	30865	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384888691
13	NC_017355	TTGGAT	2	12	30964	30975	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384888691
14	NC_017355	TTGAAT	2	12	32047	32058	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384888691
15	NC_017355	TAAGGA	2	12	32346	32357	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384888691
16	NC_017355	TAGGGG	2	12	33858	33869	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384888694
17	NC_017355	CAGCAC	2	12	34616	34627	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384888695
18	NC_017355	AAAGAA	2	12	35370	35381	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384888695
19	NC_017355	AAAGAA	2	12	36940	36951	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384888698
20	NC_017355	CAAAAT	2	12	39286	39297	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384888700
21	NC_017355	CAAAAT	2	12	39923	39934	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384888700
22	NC_017355	CGCAAA	2	12	43075	43086	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384888703
23	NC_017355	TAAAAA	2	12	49616	49627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384888708
24	NC_017355	AGATAA	2	12	54268	54279	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384888711
25	NC_017355	AGAAAA	2	12	54541	54552	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384888712
26	NC_017355	AAAGAA	2	12	54917	54928	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384888712
27	NC_017355	AATTTT	2	12	55070	55081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888712
28	NC_017355	GATGTG	2	12	56384	56395	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017355	CCAACA	2	12	58345	58356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017355	TTTTGT	2	12	58676	58687	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384888715
31	NC_017355	AAAGAG	2	12	58955	58966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888715
32	NC_017355	GCAAAC	2	12	58983	58994	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384888715
33	NC_017355	GAAAAA	2	12	60346	60357	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017355	GGACAA	2	12	61889	61900	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384888720
35	NC_017355	TAAGGG	2	12	73011	73022	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384888733
36	NC_017355	CGCCCA	2	12	73548	73559	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384888733
37	NC_017355	GGCATG	2	12	75559	75570	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384888736
38	NC_017355	GCAACG	2	12	76607	76618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384888736
39	NC_017355	AATATT	2	12	77208	77219	50 %	50 %	0 %	0 %	384888737
40	NC_017355	AACAGG	2	12	85139	85150	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384888744
41	NC_017355	TACAAA	2	12	87458	87469	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017355	GATTTT	2	12	90924	90935	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384888749
43	NC_017355	AAACTC	2	12	91041	91052	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384888749
44	NC_017355	TCAAAA	2	12	92527	92538	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384888751
45	NC_017355	GCGGTG	2	12	93227	93238	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384888752
46	NC_017355	AATATT	2	12	96444	96455	50 %	50 %	0 %	0 %	384888753
47	NC_017355	CATATT	2	12	102182	102193	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384888758
48	NC_017355	AGCGTT	2	12	103045	103056	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384888758
49	NC_017355	TTTTCT	2	12	108612	108623	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384888765
50	NC_017355	TGCAAG	2	12	109018	109029	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384888765
51	NC_017355	GGGAAG	2	12	115021	115032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384888771
52	NC_017355	AGGGAG	2	12	115299	115310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384888771
53	NC_017355	TAGGCA	2	12	116164	116175	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384888771
54	NC_017355	CTTCTA	2	12	118487	118498	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384888773
55	NC_017355	GTTCTA	2	12	118694	118705	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384888773
56	NC_017355	CTTCTA	2	12	119806	119817	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384888774
57	NC_017355	GTTCTA	2	12	120067	120078	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384888774
58	NC_017355	CTTCTA	2	12	121179	121190	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384888775
59	NC_017355	GTTCTA	2	12	121419	121430	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384888775
60	NC_017355	CTAAGG	2	12	122777	122788	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384888776
61	NC_017355	TGAATT	2	12	123311	123322	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384888776
62	NC_017355	TTTCAA	2	12	123470	123481	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384888776
63	NC_017355	TTAAAA	2	12	126333	126344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888778
64	NC_017355	CTAAAG	2	12	127080	127091	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384888779
65	NC_017355	GTTTTA	2	12	127827	127838	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017355	TCATGA	2	12	129605	129616	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017355	AAAAAT	2	12	136156	136167	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384888792
68	NC_017355	TTAAAA	2	12	136358	136369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888793
69	NC_017355	ATTCAA	2	12	137242	137253	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384888795
70	NC_017355	TAGCGA	2	12	138298	138309	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384888796
71	NC_017355	TTAGCG	2	12	141190	141201	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384888798
72	NC_017355	TATCGC	2	12	141402	141413	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384888798
73	NC_017355	ATCGCT	2	12	143110	143121	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384888799
74	NC_017355	TTCTAT	2	12	146493	146504	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384888802
75	NC_017355	TTGTTT	2	12	149481	149492	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384888807
76	NC_017355	CTTGGG	2	12	150142	150153	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384888809
77	NC_017355	GAATCT	2	12	151636	151647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384888811
78	NC_017355	TTGGGT	2	12	154913	154924	0 %	50 %	50 %	0 %	384888814
79	NC_017355	GATTTT	2	12	155425	155436	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384888815
80	NC_017355	CTTTCT	2	12	159022	159033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888819
81	NC_017355	CCGCTC	2	12	161031	161042	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384888823
82	NC_017355	GCTCTC	2	12	163458	163469	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384888825
83	NC_017355	TAAAAA	2	12	164116	164127	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017355	TTCTAA	2	12	165781	165792	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384888828
85	NC_017355	TCAATA	2	12	167463	167474	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384888830
86	NC_017355	ATCGTT	2	12	167885	167896	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384888830
87	NC_017355	AATTTC	2	12	168236	168247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384888831
88	NC_017355	TAAAAT	2	12	169760	169771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888832
89	NC_017355	TTCTTT	2	12	170170	170181	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384888832
90	NC_017355	ATTTTG	2	12	171347	171358	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384888834
91	NC_017355	CGCTTT	2	12	171825	171836	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384888834
92	NC_017355	GTTTAA	2	12	172607	172618	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384888835
93	NC_017355	CCGCTC	2	12	175252	175263	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384888838
94	NC_017355	GAAAAA	2	12	178894	178905	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384888841
95	NC_017355	AGGCAT	2	12	178983	178994	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384888841
96	NC_017355	GCATTT	2	12	180696	180707	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384888843
97	NC_017355	TCAAAC	2	12	181263	181274	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384888844
98	NC_017355	ATAAAG	2	12	181430	181441	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384888844
99	NC_017355	GGTATT	2	12	185321	185332	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384888847
100	NC_017355	TCTAAA	2	12	185551	185562	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384888847
101	NC_017355	TGGGCA	2	12	186620	186631	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384888848
102	NC_017355	TTCTAA	2	12	187099	187110	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384888849
103	NC_017355	ATTTTC	2	12	189044	189055	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384888849
104	NC_017355	TGGGGC	2	12	196453	196464	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384888859
105	NC_017355	AAATCC	2	12	197880	197891	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384888861
106	NC_017355	AACATC	2	12	197946	197957	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384888861
107	NC_017355	AATTTT	2	12	200659	200670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888863
108	NC_017355	AAAGAT	2	12	205837	205848	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384888868
109	NC_017355	TATAAT	2	12	207944	207955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017355	ATTCTA	2	12	208269	208280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384888871
111	NC_017355	CATAGC	2	12	210034	210045	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384888872
112	NC_017355	GTTTTG	2	12	210539	210550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888872
113	NC_017355	TTATTT	2	12	212171	212182	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384888873
114	NC_017355	GCTAAA	2	12	217631	217642	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384888880
115	NC_017355	AATGCC	2	12	222120	222131	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384888885
116	NC_017355	GGATTG	2	12	224410	224421	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384888886
117	NC_017355	GCTGTA	2	12	224687	224698	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384888886
118	NC_017355	GGACCA	2	12	224760	224771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384888886
119	NC_017355	GGTGAT	2	12	226374	226385	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384888887
120	NC_017355	TCAATA	2	12	226796	226807	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384888888
121	NC_017355	CACGCC	2	12	227276	227287	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384888888
122	NC_017355	GCTTTG	2	12	228518	228529	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384888889
123	NC_017355	GCTAGG	2	12	229899	229910	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384888890
124	NC_017355	TCTTTA	2	12	236247	236258	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384888897
125	NC_017355	GTTTTT	2	12	241883	241894	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384888904
126	NC_017355	ATTTTA	2	12	243343	243354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017355	TCCCGC	2	12	247226	247237	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384888909
128	NC_017355	TCCCGC	2	12	248039	248050	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384888909
129	NC_017355	CAAAGC	2	12	249508	249519	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384888911
130	NC_017355	TTTAGC	2	12	251242	251253	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384888913
131	NC_017355	TAATAC	2	12	251302	251313	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384888913
132	NC_017355	TGAGCG	2	12	255889	255900	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384888918
133	NC_017355	GGGGCT	2	12	259709	259720	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384888920
134	NC_017355	GATTTT	2	12	261001	261012	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384888920
135	NC_017355	TGAGCG	2	12	264263	264274	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384888923
136	NC_017355	AGCTTT	2	12	264411	264422	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384888923
137	NC_017355	GATTTT	2	12	268947	268958	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384888930
138	NC_017355	ATTAGA	2	12	269069	269080	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384888930
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142	NC_017355	AAATCA	2	12	271850	271861	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384888934
143	NC_017355	GCGTTA	2	12	273606	273617	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384888935
144	NC_017355	AGCGAG	2	12	282827	282838	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384888942
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149	NC_017355	GTAGCG	2	12	297840	297851	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384888950
150	NC_017355	TTATCG	2	12	300073	300084	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384888951
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152	NC_017355	GGCATG	2	12	302201	302212	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384888954
153	NC_017355	GAAAAA	2	12	304895	304906	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384888956
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155	NC_017355	GCTATG	2	12	305746	305757	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_017355	GTTTGC	2	12	308096	308107	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384888959
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161	NC_017355	CCAAAA	2	12	317420	317431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888970
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169	NC_017355	AAAAGC	2	12	329797	329808	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
170	NC_017355	TGGCTA	2	12	334883	334894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
171	NC_017355	AGAAAC	2	12	337008	337019	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384888997
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191	NC_017355	ATAGCG	2	12	373675	373686	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384889030
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235	NC_017355	TGCAAA	2	12	454060	454071	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384889111
236	NC_017355	ACTTTA	2	12	455698	455709	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384889112
237	NC_017355	TATATG	2	12	460500	460511	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384889118
238	NC_017355	TGGTAT	2	12	461387	461398	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384889118
239	NC_017355	TATTTT	2	12	461684	461695	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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349	NC_017355	AAAAAT	2	12	668076	668087	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_017355	ATTACC	2	12	901720	901731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384889528
465	NC_017355	GCGTTA	2	12	915941	915952	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384889542
466	NC_017355	ACCAAT	2	12	919218	919229	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384889544
467	NC_017355	AAAGTG	2	12	921380	921391	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384889546
468	NC_017355	TTGACT	2	12	922406	922417	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384889546
469	NC_017355	ATTATA	2	12	922657	922668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_017355	TAAAAT	2	12	922682	922693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_017355	CTCACT	2	12	925471	925482	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384889549
472	NC_017355	TAGAGC	2	12	925511	925522	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384889549
473	NC_017355	ATTTTC	2	12	927661	927672	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384889550
474	NC_017355	ATTGAA	2	12	930054	930065	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
475	NC_017355	TTAATT	2	12	931679	931690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384889553
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478	NC_017355	ATATTA	2	12	938243	938254	50 %	50 %	0 %	0 %	384889553
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489	NC_017355	TCAAAT	2	12	952501	952512	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
490	NC_017355	TTATTT	2	12	952966	952977	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_017355	CAAGCT	2	12	953296	953307	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384889571
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494	NC_017355	AAATTT	2	12	965824	965835	50 %	50 %	0 %	0 %	384889586
495	NC_017355	TATCCT	2	12	969336	969347	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384889591
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499	NC_017355	TTTTCT	2	12	976787	976798	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384889598
500	NC_017355	GCGCGA	2	12	978286	978297	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

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