MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori v225d chromosome

Total Repeats: 1267

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017355	TAAAA	2	10	1591	1600	80 %	20 %	0 %	0 %	384888660
2	NC_017355	GATTA	2	10	2238	2247	40 %	40 %	20 %	0 %	384888661
3	NC_017355	TTTTA	2	10	4913	4922	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017355	CACTT	2	10	7854	7863	20 %	40 %	0 %	40 %	384888666
5	NC_017355	TTGAA	2	10	11653	11662	40 %	40 %	20 %	0 %	384888669
6	NC_017355	TTTTG	2	10	11669	11678	0 %	80 %	20 %	0 %	384888669
7	NC_017355	TGGTG	2	10	12507	12516	0 %	40 %	60 %	0 %	384888671
8	NC_017355	GCTTT	2	10	13334	13343	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017355	CAAAA	2	10	18385	18394	80 %	0 %	0 %	20 %	384888676
10	NC_017355	TGAAA	2	10	20729	20738	60 %	20 %	20 %	0 %	384888678
11	NC_017355	CCATG	2	10	22917	22926	20 %	20 %	20 %	40 %	384888682
12	NC_017355	CTCTT	2	10	22947	22956	0 %	60 %	0 %	40 %	384888682
13	NC_017355	ATACC	2	10	24937	24946	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017355	ATAGA	2	10	26241	26250	60 %	20 %	20 %	0 %	384888684
15	NC_017355	CAAGC	2	10	27556	27565	40 %	0 %	20 %	40 %	384888685
16	NC_017355	TTTTA	2	10	28487	28496	20 %	80 %	0 %	0 %	384888686
17	NC_017355	GATAA	2	10	30550	30559	60 %	20 %	20 %	0 %	384888690
18	NC_017355	GTGGG	2	10	32009	32018	0 %	20 %	80 %	0 %	384888691
19	NC_017355	TGGGG	2	10	33260	33269	0 %	20 %	80 %	0 %	384888693
20	NC_017355	CGAAA	2	10	33883	33892	60 %	0 %	20 %	20 %	384888694
21	NC_017355	AAGCC	2	10	39026	39035	40 %	0 %	20 %	40 %	384888700
22	NC_017355	AGAAA	2	10	40322	40331	80 %	0 %	20 %	0 %	384888701
23	NC_017355	AAAGT	2	10	40519	40528	60 %	20 %	20 %	0 %	384888701
24	NC_017355	TACTC	2	10	41175	41184	20 %	40 %	0 %	40 %	384888702
25	NC_017355	CTATT	2	10	42212	42221	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017355	TAAAA	2	10	43010	43019	80 %	20 %	0 %	0 %	384888703
27	NC_017355	TCCCA	2	10	44022	44031	20 %	20 %	0 %	60 %	384888704
28	NC_017355	GCTCC	2	10	44343	44352	0 %	20 %	20 %	60 %	384888704
29	NC_017355	TCGCA	2	10	44880	44889	20 %	20 %	20 %	40 %	384888704
30	NC_017355	TGCCT	2	10	47135	47144	0 %	40 %	20 %	40 %	384888706
31	NC_017355	TGAAA	2	10	48535	48544	60 %	20 %	20 %	0 %	384888708
32	NC_017355	TCAAA	2	10	48789	48798	60 %	20 %	0 %	20 %	384888708
33	NC_017355	CAGCA	2	10	49736	49745	40 %	0 %	20 %	40 %	384888709
34	NC_017355	TCGCC	2	10	51532	51541	0 %	20 %	20 %	60 %	384888709
35	NC_017355	TCAAA	2	10	52544	52553	60 %	20 %	0 %	20 %	384888709
36	NC_017355	AACGA	2	10	53552	53561	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017355	TTAAA	2	10	53564	53573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017355	ACAAA	2	10	53593	53602	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017355	TAAGA	2	10	53912	53921	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017355	AAAGA	2	10	54192	54201	80 %	0 %	20 %	0 %	384888711
41	NC_017355	AATAA	2	10	56208	56217	80 %	20 %	0 %	0 %	384888714
42	NC_017355	TATCC	2	10	57102	57111	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_017355	ATTGG	2	10	59664	59673	20 %	40 %	40 %	0 %	384888717
44	NC_017355	CAATA	2	10	59887	59896	60 %	20 %	0 %	20 %	384888717
45	NC_017355	GGTGG	2	10	62432	62441	0 %	20 %	80 %	0 %	384888720
46	NC_017355	GCGTT	2	10	64771	64780	0 %	40 %	40 %	20 %	384888722
47	NC_017355	TCAAT	2	10	65625	65634	40 %	40 %	0 %	20 %	384888723
48	NC_017355	CTTCT	2	10	66467	66476	0 %	60 %	0 %	40 %	384888724
49	NC_017355	TGCCT	2	10	66544	66553	0 %	40 %	20 %	40 %	384888724
50	NC_017355	TCCAA	2	10	66956	66965	40 %	20 %	0 %	40 %	384888725
51	NC_017355	TTTTG	2	10	70249	70258	0 %	80 %	20 %	0 %	384888729
52	NC_017355	ACGCC	2	10	70555	70564	20 %	0 %	20 %	60 %	384888729
53	NC_017355	AAAGC	2	10	71321	71330	60 %	0 %	20 %	20 %	384888730
54	NC_017355	ATCTT	2	10	78364	78373	20 %	60 %	0 %	20 %	384888737
55	NC_017355	TGGCT	2	10	78905	78914	0 %	40 %	40 %	20 %	384888737
56	NC_017355	ATGCC	2	10	79337	79346	20 %	20 %	20 %	40 %	384888738
57	NC_017355	TTGAT	2	10	80369	80378	20 %	60 %	20 %	0 %	384888741
58	NC_017355	GGCGT	2	10	82183	82192	0 %	20 %	60 %	20 %	384888743
59	NC_017355	ATTTT	2	10	85218	85227	20 %	80 %	0 %	0 %	384888744
60	NC_017355	TAAAA	2	10	85436	85445	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017355	CTTTC	2	10	85719	85728	0 %	60 %	0 %	40 %	384888745
62	NC_017355	TTTGC	2	10	86427	86436	0 %	60 %	20 %	20 %	384888746
63	NC_017355	GAAAT	2	10	87668	87677	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017355	TTTGA	2	10	88509	88518	20 %	60 %	20 %	0 %	384888747
65	NC_017355	TCTTT	2	10	88720	88729	0 %	80 %	0 %	20 %	384888747
66	NC_017355	GGCTT	2	10	89829	89838	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017355	CGGCA	2	10	92493	92502	20 %	0 %	40 %	40 %	384888751
68	NC_017355	CTTCT	2	10	93370	93379	0 %	60 %	0 %	40 %	384888752
69	NC_017355	AATTT	2	10	94526	94535	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017355	ACGAT	2	10	94975	94984	40 %	20 %	20 %	20 %	384888753
71	NC_017355	TTTTC	2	10	95170	95179	0 %	80 %	0 %	20 %	384888753
72	NC_017355	AATTG	2	10	96826	96835	40 %	40 %	20 %	0 %	384888754
73	NC_017355	TCGTT	2	10	98628	98637	0 %	60 %	20 %	20 %	384888755
74	NC_017355	TCTTT	2	10	101935	101944	0 %	80 %	0 %	20 %	384888758
75	NC_017355	TTTAT	2	10	103701	103710	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017355	GAATG	2	10	105925	105934	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017355	TTTTG	2	10	106736	106745	0 %	80 %	20 %	0 %	384888764
78	NC_017355	CAAAT	2	10	107132	107141	60 %	20 %	0 %	20 %	384888764
79	NC_017355	ACCCT	2	10	108561	108570	20 %	20 %	0 %	60 %	384888765
80	NC_017355	ATGCC	2	10	108693	108702	20 %	20 %	20 %	40 %	384888765
81	NC_017355	TTAAT	2	10	110079	110088	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017355	TGATT	2	10	110697	110706	20 %	60 %	20 %	0 %	384888767
83	NC_017355	CTAAA	2	10	111168	111177	60 %	20 %	0 %	20 %	384888769
84	NC_017355	GAATT	2	10	111317	111326	40 %	40 %	20 %	0 %	384888769
85	NC_017355	GATCG	2	10	115194	115203	20 %	20 %	40 %	20 %	384888771
86	NC_017355	AGCTC	2	10	115213	115222	20 %	20 %	20 %	40 %	384888771
87	NC_017355	AAGCC	2	10	117101	117110	40 %	0 %	20 %	40 %	384888772
88	NC_017355	GTTTG	2	10	118447	118456	0 %	60 %	40 %	0 %	384888773
89	NC_017355	GTTTG	2	10	119766	119775	0 %	60 %	40 %	0 %	384888774
90	NC_017355	GTTTG	2	10	121139	121148	0 %	60 %	40 %	0 %	384888775
91	NC_017355	TGATC	2	10	121687	121696	20 %	40 %	20 %	20 %	384888775
92	NC_017355	CGCTG	2	10	122649	122658	0 %	20 %	40 %	40 %	384888776
93	NC_017355	TTTGA	2	10	122796	122805	20 %	60 %	20 %	0 %	384888776
94	NC_017355	GACTT	2	10	123330	123339	20 %	40 %	20 %	20 %	384888776
95	NC_017355	ATCTC	2	10	124081	124090	20 %	40 %	0 %	40 %	384888776
96	NC_017355	CGCTT	2	10	124239	124248	0 %	40 %	20 %	40 %	384888776
97	NC_017355	TTTGT	2	10	124595	124604	0 %	80 %	20 %	0 %	384888777
98	NC_017355	TGCGT	2	10	126627	126636	0 %	40 %	40 %	20 %	384888779
99	NC_017355	GAAAA	2	10	126788	126797	80 %	0 %	20 %	0 %	384888779
100	NC_017355	GAAAA	2	10	127106	127115	80 %	0 %	20 %	0 %	384888779
101	NC_017355	ATTTT	2	10	130073	130082	20 %	80 %	0 %	0 %	384888785
102	NC_017355	ATGTT	2	10	130155	130164	20 %	60 %	20 %	0 %	384888785
103	NC_017355	AAAAG	2	10	130567	130576	80 %	0 %	20 %	0 %	384888785
104	NC_017355	AAATC	2	10	132833	132842	60 %	20 %	0 %	20 %	384888789
105	NC_017355	AAAAT	2	10	134305	134314	80 %	20 %	0 %	0 %	384888790
106	NC_017355	CAAAT	2	10	134357	134366	60 %	20 %	0 %	20 %	384888790
107	NC_017355	TTTTC	2	10	136662	136671	0 %	80 %	0 %	20 %	384888794
108	NC_017355	GTAAA	2	10	137214	137223	60 %	20 %	20 %	0 %	384888795
109	NC_017355	TTCTT	2	10	138618	138627	0 %	80 %	0 %	20 %	384888796
110	NC_017355	TCTTT	2	10	139112	139121	0 %	80 %	0 %	20 %	384888797
111	NC_017355	ATGAT	2	10	139730	139739	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017355	TTTTG	2	10	140275	140284	0 %	80 %	20 %	0 %	384888798
113	NC_017355	AATTC	2	10	140909	140918	40 %	40 %	0 %	20 %	384888798
114	NC_017355	GCGAT	2	10	141068	141077	20 %	20 %	40 %	20 %	384888798
115	NC_017355	GCTTG	2	10	141324	141333	0 %	40 %	40 %	20 %	384888798
116	NC_017355	TTTTG	2	10	141976	141985	0 %	80 %	20 %	0 %	384888799
117	NC_017355	CCAAA	2	10	143816	143825	60 %	0 %	0 %	40 %	384888800
118	NC_017355	TTATT	2	10	149234	149243	20 %	80 %	0 %	0 %	384888806
119	NC_017355	GCGTT	2	10	149592	149601	0 %	40 %	40 %	20 %	384888808
120	NC_017355	ATTTG	2	10	150567	150576	20 %	60 %	20 %	0 %	384888809
121	NC_017355	CAAAT	2	10	152459	152468	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017355	AAAAC	2	10	153183	153192	80 %	0 %	0 %	20 %	384888812
123	NC_017355	AAGCC	2	10	156419	156428	40 %	0 %	20 %	40 %	384888817
124	NC_017355	TAAAA	2	10	157422	157431	80 %	20 %	0 %	0 %	384888818
125	NC_017355	ATTTT	2	10	158590	158599	20 %	80 %	0 %	0 %	384888819
126	NC_017355	GGGTG	2	10	158946	158955	0 %	20 %	80 %	0 %	384888819
127	NC_017355	CAAAA	2	10	159849	159858	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017355	ATTCA	2	10	160339	160348	40 %	40 %	0 %	20 %	384888822
129	NC_017355	CACTT	2	10	160543	160552	20 %	40 %	0 %	40 %	384888822
130	NC_017355	AAAAC	2	10	162676	162685	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017355	ATCTT	2	10	163741	163750	20 %	60 %	0 %	20 %	384888825
132	NC_017355	CGCAC	2	10	171406	171415	20 %	0 %	20 %	60 %	384888834
133	NC_017355	TATCA	2	10	171883	171892	40 %	40 %	0 %	20 %	384888834
134	NC_017355	ATTTG	2	10	172889	172898	20 %	60 %	20 %	0 %	384888835
135	NC_017355	AATTG	2	10	173045	173054	40 %	40 %	20 %	0 %	384888836
136	NC_017355	TTTCT	2	10	173701	173710	0 %	80 %	0 %	20 %	384888837
137	NC_017355	AAATG	2	10	174038	174047	60 %	20 %	20 %	0 %	384888837
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