MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 21013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017161	CAA	2	6	71	76	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128091
2	NC_017161	TGA	2	6	79	84	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128091
3	NC_017161	AGA	3	9	145	153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128091
4	NC_017161	AGA	2	6	238	243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128092
5	NC_017161	ACA	2	6	249	254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128092
6	NC_017161	AAG	2	6	349	354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128092
7	NC_017161	TGT	2	6	424	429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128092
8	NC_017161	GAT	2	6	622	627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128092
9	NC_017161	GAT	2	6	698	703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128092
10	NC_017161	GAT	2	6	884	889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128092
11	NC_017161	ATA	2	6	905	910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128092
12	NC_017161	GGT	2	6	1024	1029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128092
13	NC_017161	TGG	2	6	1080	1085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128092
14	NC_017161	AGA	2	6	1117	1122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128092
15	NC_017161	ATA	2	6	1151	1156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128092
16	NC_017161	GGA	2	6	1276	1281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128092
17	NC_017161	ATG	2	6	1313	1318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128092
18	NC_017161	TAA	2	6	1358	1363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128092
19	NC_017161	AGG	2	6	1368	1373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017161	TTA	2	6	1392	1397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128093
21	NC_017161	AGG	2	6	1557	1562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128093
22	NC_017161	GGT	2	6	1570	1575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128093
23	NC_017161	AGG	2	6	1641	1646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128093
24	NC_017161	CTT	2	6	1670	1675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128093
25	NC_017161	TGG	2	6	1719	1724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128093
26	NC_017161	AAC	2	6	1733	1738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128093
27	NC_017161	TGG	3	9	1815	1823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128093
28	NC_017161	AGG	2	6	1839	1844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128093
29	NC_017161	GCT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128093
30	NC_017161	TGG	2	6	2034	2039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128093
31	NC_017161	GAT	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128093
32	NC_017161	GTA	2	6	2066	2071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128093
33	NC_017161	GAG	2	6	2228	2233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128093
34	NC_017161	GGT	2	6	2281	2286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128093
35	NC_017161	ATC	2	6	2370	2375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128094
36	NC_017161	AGA	2	6	2468	2473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128094
37	NC_017161	CTT	2	6	2649	2654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128094
38	NC_017161	GCT	2	6	2928	2933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128094
39	NC_017161	AGA	2	6	3148	3153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128095
40	NC_017161	TGA	2	6	3228	3233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128095
41	NC_017161	TAT	2	6	3240	3245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128095
42	NC_017161	TCC	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128095
43	NC_017161	ATT	2	6	3381	3386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128095
44	NC_017161	CTT	2	6	3524	3529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128095
45	NC_017161	CTT	2	6	3560	3565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128095
46	NC_017161	TTA	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128095
47	NC_017161	TGA	2	6	3614	3619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128095
48	NC_017161	GCG	2	6	3679	3684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017161	AGG	2	6	3979	3984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128096
50	NC_017161	GAG	2	6	4010	4015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128096
51	NC_017161	ACA	2	6	4065	4070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128096
52	NC_017161	AGG	2	6	4071	4076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128096
53	NC_017161	GTG	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128096
54	NC_017161	TCT	2	6	4210	4215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128096
55	NC_017161	ATA	2	6	4286	4291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128096
56	NC_017161	TGG	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128096
57	NC_017161	AAG	2	6	4488	4493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128096
58	NC_017161	AAG	2	6	4545	4550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128096
59	NC_017161	TGG	2	6	4572	4577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128096
60	NC_017161	GAG	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128096
61	NC_017161	AGG	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128097
62	NC_017161	AGG	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128097
63	NC_017161	TAG	2	6	4919	4924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128097
64	NC_017161	TCC	2	6	5030	5035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128097
65	NC_017161	CAT	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128097
66	NC_017161	ACC	2	6	5201	5206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128097
67	NC_017161	ACC	2	6	5257	5262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128098
68	NC_017161	CAA	2	6	5268	5273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128098
69	NC_017161	CAA	2	6	5300	5305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128098
70	NC_017161	GGA	2	6	5391	5396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128098
71	NC_017161	CCA	2	6	5414	5419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128098
72	NC_017161	AGC	2	6	5457	5462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128098
73	NC_017161	AAG	2	6	5619	5624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128098
74	NC_017161	GAA	2	6	5741	5746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128098
75	NC_017161	ATA	2	6	5754	5759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128098
76	NC_017161	CTG	2	6	5886	5891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128098
77	NC_017161	TTA	2	6	5953	5958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128098
78	NC_017161	GGA	2	6	6038	6043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128098
79	NC_017161	CAA	2	6	6059	6064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128098
80	NC_017161	TCA	2	6	6065	6070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128098
81	NC_017161	ACC	2	6	6108	6113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128098
82	NC_017161	ACA	2	6	6133	6138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128098
83	NC_017161	GCG	2	6	6217	6222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384128098
84	NC_017161	ATA	2	6	6250	6255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128098
85	NC_017161	CAG	2	6	6312	6317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128098
86	NC_017161	CTA	2	6	6353	6358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128098
87	NC_017161	GCA	3	9	6475	6483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128098
88	NC_017161	CCA	2	6	6759	6764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128099
89	NC_017161	TCT	3	9	6886	6894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128099
90	NC_017161	CAT	2	6	7158	7163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128099
91	NC_017161	ATA	2	6	7193	7198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128099
92	NC_017161	TCC	2	6	7244	7249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128099
93	NC_017161	ATC	2	6	7327	7332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128099
94	NC_017161	TTC	2	6	7354	7359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128099
95	NC_017161	ACT	2	6	7370	7375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128099
96	NC_017161	GAA	2	6	7434	7439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128099
97	NC_017161	TCG	2	6	7445	7450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128099
98	NC_017161	ACT	2	6	7508	7513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128099
99	NC_017161	CTT	2	6	7641	7646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128099
100	NC_017161	CTA	2	6	7692	7697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128099
101	NC_017161	TCT	3	9	7822	7830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128100
102	NC_017161	AGG	2	6	7990	7995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128100
103	NC_017161	CTG	2	6	8039	8044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128100
104	NC_017161	CAC	2	6	8148	8153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128100
105	NC_017161	GTA	2	6	8166	8171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128100
106	NC_017161	TCA	2	6	8201	8206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128100
107	NC_017161	TTG	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128100
108	NC_017161	CAC	2	6	8294	8299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128100
109	NC_017161	CTC	2	6	8307	8312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128100
110	NC_017161	TCT	2	6	8455	8460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128100
111	NC_017161	TCC	2	6	8609	8614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017161	TTC	2	6	8720	8725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128101
113	NC_017161	CAC	2	6	8817	8822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128101
114	NC_017161	ACT	2	6	8842	8847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128101
115	NC_017161	CTC	2	6	9003	9008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128101
116	NC_017161	CTT	2	6	9110	9115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128101
117	NC_017161	GCA	2	6	9239	9244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128101
118	NC_017161	CAC	2	6	9257	9262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128101
119	NC_017161	TAT	2	6	9345	9350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128101
120	NC_017161	AAT	2	6	9372	9377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128101
121	NC_017161	CTT	2	6	9535	9540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128102
122	NC_017161	GGA	2	6	9542	9547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128102
123	NC_017161	AGG	2	6	9636	9641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128102
124	NC_017161	CAC	2	6	9665	9670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128102
125	NC_017161	CTT	2	6	9719	9724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128102
126	NC_017161	TCC	2	6	9799	9804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128102
127	NC_017161	CCT	2	6	9953	9958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128102
128	NC_017161	CCT	2	6	9965	9970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128102
129	NC_017161	CCT	2	6	10157	10162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128103
130	NC_017161	AGG	2	6	10348	10353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128103
131	NC_017161	GGT	2	6	10494	10499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128103
132	NC_017161	CCT	2	6	10570	10575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128104
133	NC_017161	TCC	2	6	10596	10601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128104
134	NC_017161	TCC	3	9	10779	10787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128104
135	NC_017161	GTA	2	6	10808	10813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128104
136	NC_017161	CTC	2	6	10838	10843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128104
137	NC_017161	CTC	2	6	10955	10960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128104
138	NC_017161	AGT	2	6	11072	11077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128104
139	NC_017161	AGA	2	6	11124	11129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128104
140	NC_017161	CGT	2	6	11212	11217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128104
141	NC_017161	CCT	2	6	11419	11424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128104
142	NC_017161	AGG	2	6	11618	11623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128104
143	NC_017161	ACC	2	6	11648	11653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128104
144	NC_017161	CCT	2	6	11755	11760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128104
145	NC_017161	CAA	2	6	11797	11802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128104
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147	NC_017161	TCC	2	6	11880	11885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128104
148	NC_017161	CCA	2	6	12314	12319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_017161	ATT	2	6	12346	12351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128105
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152	NC_017161	TGA	2	6	12651	12656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128105
153	NC_017161	GTG	2	6	12717	12722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128105
154	NC_017161	CTG	2	6	12727	12732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128105
155	NC_017161	CTA	2	6	12818	12823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128105
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157	NC_017161	ATT	2	6	12971	12976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128105
158	NC_017161	ATT	2	6	13064	13069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128106
159	NC_017161	TGA	2	6	13168	13173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128106
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162	NC_017161	TGG	2	6	13511	13516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128106
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171	NC_017161	CTT	2	6	13981	13986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128106
172	NC_017161	TCA	2	6	14286	14291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128106
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174	NC_017161	TAT	2	6	14498	14503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128106
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179	NC_017161	TCA	2	6	14853	14858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128106
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213	NC_017161	TTC	2	6	17150	17155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128109
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231	NC_017161	ATC	2	6	18392	18397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128110
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248	NC_017161	CAG	2	6	19728	19733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128110
249	NC_017161	AGC	2	6	19765	19770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128110
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251	NC_017161	CTT	2	6	19926	19931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128110
252	NC_017161	TTC	2	6	20065	20070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128110
253	NC_017161	AAT	2	6	20102	20107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128110
254	NC_017161	TCA	2	6	20120	20125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128110
255	NC_017161	CTG	2	6	20211	20216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128110
256	NC_017161	TCT	3	9	20253	20261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128110
257	NC_017161	TCT	2	6	20299	20304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128111
258	NC_017161	ATT	2	6	20338	20343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128111
259	NC_017161	TCT	2	6	20380	20385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128111
260	NC_017161	CAA	2	6	20513	20518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128111
261	NC_017161	CTG	2	6	20556	20561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128111
262	NC_017161	AGC	2	6	20830	20835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128111
263	NC_017161	TCA	2	6	20869	20874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128111
264	NC_017161	TCT	2	6	20921	20926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128111
265	NC_017161	CCA	2	6	21079	21084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128111
266	NC_017161	TTA	2	6	21110	21115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128111
267	NC_017161	TTG	2	6	21227	21232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128112
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269	NC_017161	CTT	2	6	21397	21402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128112
270	NC_017161	ATA	2	6	21415	21420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128112
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291	NC_017161	GTG	2	6	23468	23473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128114
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295	NC_017161	TTC	2	6	23745	23750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128114
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332	NC_017161	GTA	2	6	27534	27539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
333	NC_017161	AGG	2	6	27543	27548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_017161	ATT	2	6	39623	39628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_017161	AAC	2	6	39773	39778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128126
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