MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 35504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017161	GAG	2	6	167262	167267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128251
3502	NC_017161	GA	3	6	167298	167303	50 %	0 %	50 %	0 %	384128252
3503	NC_017161	TCC	2	6	167387	167392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128252
3504	NC_017161	CTC	2	6	167479	167484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128252
3505	NC_017161	TCC	2	6	167522	167527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128252
3506	NC_017161	CCA	2	6	167547	167552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128252
3507	NC_017161	CA	3	6	167648	167653	50 %	0 %	0 %	50 %	384128252
3508	NC_017161	CACC	2	8	167658	167665	25 %	0 %	0 %	75 %	384128252
3509	NC_017161	A	6	6	167697	167702	100 %	0 %	0 %	0 %	384128252
3510	NC_017161	GAA	2	6	167703	167708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128252
3511	NC_017161	GGAA	2	8	167855	167862	50 %	0 %	50 %	0 %	384128253
3512	NC_017161	GTT	2	6	167882	167887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128253
3513	NC_017161	AGA	2	6	168055	168060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128253
3514	NC_017161	TGT	2	6	168176	168181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128253
3515	NC_017161	CCG	2	6	168199	168204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384128253
3516	NC_017161	TCC	2	6	168269	168274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128253
3517	NC_017161	AGTA	2	8	168287	168294	50 %	25 %	25 %	0 %	384128253
3518	NC_017161	TAA	2	6	168303	168308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128253
3519	NC_017161	CCT	2	6	168355	168360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128254
3520	NC_017161	GTA	2	6	168387	168392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128254
3521	NC_017161	CA	3	6	168511	168516	50 %	0 %	0 %	50 %	384128254
3522	NC_017161	TAT	2	6	168656	168661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128254
3523	NC_017161	ATT	2	6	168802	168807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128254
3524	NC_017161	TGG	2	6	168848	168853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128254
3525	NC_017161	AAG	2	6	168861	168866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128254
3526	NC_017161	TCT	2	6	168875	168880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128254
3527	NC_017161	AGG	2	6	168967	168972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128254
3528	NC_017161	CAC	2	6	168998	169003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128254
3529	NC_017161	ATC	2	6	169009	169014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128254
3530	NC_017161	AGT	2	6	169028	169033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128254
3531	NC_017161	GGTG	2	8	169035	169042	0 %	25 %	75 %	0 %	384128254
3532	NC_017161	GAG	2	6	169090	169095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128254
3533	NC_017161	TG	3	6	169137	169142	0 %	50 %	50 %	0 %	384128254
3534	NC_017161	CCT	2	6	169217	169222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128254
3535	NC_017161	CCA	2	6	169297	169302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128254
3536	NC_017161	ATG	2	6	169306	169311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128254
3537	NC_017161	G	6	6	169343	169348	0 %	0 %	100 %	0 %	384128254
3538	NC_017161	TCT	2	6	169442	169447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128254
3539	NC_017161	CAT	2	6	169448	169453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128254
3540	NC_017161	GTA	2	6	169464	169469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128254
3541	NC_017161	CTC	2	6	169509	169514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128254
3542	NC_017161	CCG	2	6	169532	169537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384128254
3543	NC_017161	AAG	2	6	169575	169580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128254
3544	NC_017161	GAA	2	6	169611	169616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128254
3545	NC_017161	CATC	2	8	169694	169701	25 %	25 %	0 %	50 %	384128254
3546	NC_017161	CAG	2	6	169859	169864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128254
3547	NC_017161	ATT	2	6	169879	169884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128254
3548	NC_017161	TGT	2	6	169887	169892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128254
3549	NC_017161	TTG	2	6	169933	169938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128254
3550	NC_017161	GT	3	6	170057	170062	0 %	50 %	50 %	0 %	384128254
3551	NC_017161	GA	3	6	170087	170092	50 %	0 %	50 %	0 %	384128254
3552	NC_017161	TGA	2	6	170099	170104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128254
3553	NC_017161	GGA	2	6	170197	170202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128254
3554	NC_017161	CCT	2	6	170305	170310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128254
3555	NC_017161	CTT	3	9	170319	170327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128254
3556	NC_017161	CCT	2	6	170344	170349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_017161	CTT	2	6	170380	170385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128255
3558	NC_017161	CTC	2	6	170577	170582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128255
3559	NC_017161	CCT	3	9	170702	170710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128255
3560	NC_017161	TGG	2	6	170721	170726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128255
3561	NC_017161	CGG	2	6	170742	170747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384128255
3562	NC_017161	CCT	2	6	170817	170822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_017161	T	8	8	170863	170870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017161	ACCC	2	8	170901	170908	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3565	NC_017161	TCT	2	6	170938	170943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_017161	TC	3	6	170962	170967	0 %	50 %	0 %	50 %	384128256
3567	NC_017161	TCA	2	6	171009	171014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128256
3568	NC_017161	GTG	2	6	171038	171043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128256
3569	NC_017161	CAA	3	9	171048	171056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128256
3570	NC_017161	GA	5	10	171072	171081	50 %	0 %	50 %	0 %	384128256
3571	NC_017161	GAG	2	6	171110	171115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128256
3572	NC_017161	TAC	2	6	171173	171178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128256
3573	NC_017161	A	6	6	171199	171204	100 %	0 %	0 %	0 %	384128256
3574	NC_017161	AGG	2	6	171213	171218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128256
3575	NC_017161	TCA	2	6	171336	171341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128256
3576	NC_017161	GGA	2	6	171355	171360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128256
3577	NC_017161	GAA	2	6	171379	171384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128256
3578	NC_017161	AC	3	6	171490	171495	50 %	0 %	0 %	50 %	384128256
3579	NC_017161	GAT	2	6	171536	171541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128256
3580	NC_017161	AGAGG	2	10	171586	171595	40 %	0 %	60 %	0 %	384128256
3581	NC_017161	CCA	2	6	171656	171661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128257
3582	NC_017161	TGG	2	6	171677	171682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128257
3583	NC_017161	CCA	2	6	171689	171694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128257
3584	NC_017161	A	6	6	171754	171759	100 %	0 %	0 %	0 %	384128257
3585	NC_017161	TCT	2	6	171770	171775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128257
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3587	NC_017161	AGGA	2	8	171872	171879	50 %	0 %	50 %	0 %	384128257
3588	NC_017161	TTA	2	6	171945	171950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128257
3589	NC_017161	AGG	2	6	172007	172012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128257
3590	NC_017161	CTT	2	6	172087	172092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128257
3591	NC_017161	AGA	2	6	172110	172115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128257
3592	NC_017161	GAAG	2	8	172164	172171	50 %	0 %	50 %	0 %	384128257
3593	NC_017161	CTT	2	6	172249	172254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128257
3594	NC_017161	AG	4	8	172307	172314	50 %	0 %	50 %	0 %	384128257
3595	NC_017161	GCA	2	6	172326	172331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128257
3596	NC_017161	AGG	2	6	172346	172351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128257
3597	NC_017161	TGA	2	6	172365	172370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128257
3598	NC_017161	GA	3	6	172369	172374	50 %	0 %	50 %	0 %	384128257
3599	NC_017161	AG	3	6	172396	172401	50 %	0 %	50 %	0 %	384128257
3600	NC_017161	CT	3	6	172405	172410	0 %	50 %	0 %	50 %	384128257
3601	NC_017161	TCCA	2	8	172475	172482	25 %	25 %	0 %	50 %	384128257
3602	NC_017161	A	7	7	172546	172552	100 %	0 %	0 %	0 %	384128257
3603	NC_017161	AGGCA	2	10	172577	172586	40 %	0 %	40 %	20 %	384128257
3604	NC_017161	AAT	2	6	172632	172637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128257
3605	NC_017161	AAG	2	6	172672	172677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128257
3606	NC_017161	TTG	2	6	172700	172705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128257
3607	NC_017161	GGAA	2	8	172759	172766	50 %	0 %	50 %	0 %	384128257
3608	NC_017161	TC	3	6	172778	172783	0 %	50 %	0 %	50 %	384128257
3609	NC_017161	GGT	2	6	172786	172791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128257
3610	NC_017161	AGA	2	6	172822	172827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128257
3611	NC_017161	TGCCA	2	10	172839	172848	20 %	20 %	20 %	40 %	384128257
3612	NC_017161	ATA	2	6	172855	172860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128257
3613	NC_017161	GAA	2	6	172884	172889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128257
3614	NC_017161	GAT	2	6	173194	173199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128257
3615	NC_017161	CT	3	6	173207	173212	0 %	50 %	0 %	50 %	384128257
3616	NC_017161	GAT	2	6	173215	173220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128257
3617	NC_017161	TCA	2	6	173234	173239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128257
3618	NC_017161	AG	3	6	173251	173256	50 %	0 %	50 %	0 %	384128257
3619	NC_017161	AAG	2	6	173314	173319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128257
3620	NC_017161	CCCT	2	8	173334	173341	0 %	25 %	0 %	75 %	384128257
3621	NC_017161	GAA	2	6	173404	173409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128257
3622	NC_017161	TGG	2	6	173417	173422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128257
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3624	NC_017161	TCTT	2	8	173559	173566	0 %	75 %	0 %	25 %	384128257
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3998	NC_017161	CAC	2	6	191872	191877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128278
3999	NC_017161	CCA	2	6	191889	191894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384128278
4000	NC_017161	GCCT	2	8	191929	191936	0 %	25 %	25 %	50 %	384128278

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