MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Hydrogenobacter thermophilus TK-6 chromosome

Total Repeats: 35504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017161	C	6	6	268453	268458	0 %	0 %	0 %	100 %	384128348
5502	NC_017161	TCCTT	2	10	268465	268474	0 %	60 %	0 %	40 %	384128348
5503	NC_017161	TCA	2	6	268482	268487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128348
5504	NC_017161	TCT	2	6	268573	268578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128348
5505	NC_017161	T	6	6	268614	268619	0 %	100 %	0 %	0 %	384128348
5506	NC_017161	TGA	2	6	268636	268641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128348
5507	NC_017161	G	6	6	268677	268682	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017161	TA	3	6	268774	268779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017161	TTA	2	6	268863	268868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017161	TC	3	6	268894	268899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_017161	GTT	2	6	269005	269010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_017161	ATA	2	6	269040	269045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_017161	ATA	2	6	269085	269090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017161	TCA	2	6	269093	269098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_017161	T	7	7	269128	269134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_017161	TTC	2	6	269173	269178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_017161	TCTAC	2	10	269218	269227	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5518	NC_017161	TGGAAT	2	12	269238	269249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_017161	ATT	2	6	269250	269255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_017161	CT	3	6	269256	269261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5521	NC_017161	TTTA	2	8	269311	269318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_017161	TCC	2	6	269324	269329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5523	NC_017161	AGAT	2	8	269361	269368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_017161	AAT	2	6	269397	269402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128349
5525	NC_017161	GGT	2	6	269469	269474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128349
5526	NC_017161	GGT	2	6	269508	269513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128349
5527	NC_017161	T	7	7	269556	269562	0 %	100 %	0 %	0 %	384128349
5528	NC_017161	CTT	2	6	269647	269652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128349
5529	NC_017161	GAA	2	6	269653	269658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128349
5530	NC_017161	CAA	2	6	269727	269732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384128349
5531	NC_017161	TCT	2	6	269834	269839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128349
5532	NC_017161	ATGCA	2	10	269927	269936	40 %	20 %	20 %	20 %	384128349
5533	NC_017161	AG	3	6	269959	269964	50 %	0 %	50 %	0 %	384128349
5534	NC_017161	A	7	7	269998	270004	100 %	0 %	0 %	0 %	384128349
5535	NC_017161	TCA	2	6	270029	270034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128349
5536	NC_017161	AGG	2	6	270043	270048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128349
5537	NC_017161	T	7	7	270122	270128	0 %	100 %	0 %	0 %	384128349
5538	NC_017161	GGTC	2	8	270131	270138	0 %	25 %	50 %	25 %	384128349
5539	NC_017161	GGT	2	6	270162	270167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128349
5540	NC_017161	GATG	2	8	270168	270175	25 %	25 %	50 %	0 %	384128349
5541	NC_017161	TCA	2	6	270263	270268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128349
5542	NC_017161	AGG	2	6	270287	270292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128349
5543	NC_017161	GCGT	2	8	270295	270302	0 %	25 %	50 %	25 %	384128349
5544	NC_017161	A	7	7	270306	270312	100 %	0 %	0 %	0 %	384128349
5545	NC_017161	TTA	2	6	270320	270325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128349
5546	NC_017161	GTA	2	6	270352	270357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128349
5547	NC_017161	TAG	2	6	270377	270382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128349
5548	NC_017161	ATA	2	6	270400	270405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384128349
5549	NC_017161	TGA	2	6	270414	270419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128349
5550	NC_017161	AG	4	8	270547	270554	50 %	0 %	50 %	0 %	384128349
5551	NC_017161	GGA	2	6	270561	270566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128349
5552	NC_017161	CA	3	6	270675	270680	50 %	0 %	0 %	50 %	384128350
5553	NC_017161	TGACT	2	10	270736	270745	20 %	40 %	20 %	20 %	384128350
5554	NC_017161	A	6	6	270775	270780	100 %	0 %	0 %	0 %	384128350
5555	NC_017161	CCG	2	6	270858	270863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384128350
5556	NC_017161	AGA	2	6	270930	270935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128350
5557	NC_017161	CAT	2	6	270994	270999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128350
5558	NC_017161	TAC	2	6	271016	271021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128350
5559	NC_017161	T	6	6	271052	271057	0 %	100 %	0 %	0 %	384128350
5560	NC_017161	CAGG	2	8	271322	271329	25 %	0 %	50 %	25 %	384128350
5561	NC_017161	ATT	2	6	271403	271408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384128351
5562	NC_017161	T	6	6	271437	271442	0 %	100 %	0 %	0 %	384128351
5563	NC_017161	CTG	2	6	271461	271466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128351
5564	NC_017161	AAG	2	6	271513	271518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128351
5565	NC_017161	TTAC	2	8	271603	271610	25 %	50 %	0 %	25 %	384128351
5566	NC_017161	TCT	2	6	271640	271645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128351
5567	NC_017161	CAG	2	6	271646	271651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128351
5568	NC_017161	TCC	2	6	271716	271721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384128351
5569	NC_017161	CAG	2	6	271791	271796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128351
5570	NC_017161	TTC	2	6	271822	271827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128351
5571	NC_017161	T	6	6	271880	271885	0 %	100 %	0 %	0 %	384128351
5572	NC_017161	T	6	6	271943	271948	0 %	100 %	0 %	0 %	384128351
5573	NC_017161	TACA	2	8	271971	271978	50 %	25 %	0 %	25 %	384128351
5574	NC_017161	TGCC	2	8	271981	271988	0 %	25 %	25 %	50 %	384128351
5575	NC_017161	TTG	2	6	271996	272001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128351
5576	NC_017161	TGT	2	6	272027	272032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128351
5577	NC_017161	AG	3	6	272084	272089	50 %	0 %	50 %	0 %	384128351
5578	NC_017161	CTA	2	6	272090	272095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128351
5579	NC_017161	AGT	2	6	272113	272118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128352
5580	NC_017161	TGG	2	6	272316	272321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128352
5581	NC_017161	GGA	2	6	272398	272403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128352
5582	NC_017161	GTGAT	2	10	272505	272514	20 %	40 %	40 %	0 %	384128352
5583	NC_017161	ATG	2	6	272523	272528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384128352
5584	NC_017161	CTAC	2	8	272533	272540	25 %	25 %	0 %	50 %	384128352
5585	NC_017161	GA	3	6	272663	272668	50 %	0 %	50 %	0 %	384128352
5586	NC_017161	GGA	2	6	272672	272677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128352
5587	NC_017161	CAG	2	6	272690	272695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128352
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5589	NC_017161	GGA	2	6	272729	272734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128352
5590	NC_017161	GAA	2	6	272876	272881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128352
5591	NC_017161	AGA	2	6	272918	272923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128352
5592	NC_017161	GCT	2	6	273016	273021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128352
5593	NC_017161	CTG	2	6	273053	273058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384128352
5594	NC_017161	TCT	2	6	273084	273089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128352
5595	NC_017161	CTT	2	6	273125	273130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128352
5596	NC_017161	T	6	6	273135	273140	0 %	100 %	0 %	0 %	384128352
5597	NC_017161	CTT	2	6	273169	273174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128352
5598	NC_017161	AG	3	6	273209	273214	50 %	0 %	50 %	0 %	384128352
5599	NC_017161	AT	3	6	273263	273268	50 %	50 %	0 %	0 %	384128352
5600	NC_017161	TTG	2	6	273282	273287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384128352
5601	NC_017161	AG	3	6	273347	273352	50 %	0 %	50 %	0 %	384128352
5602	NC_017161	CTA	2	6	273402	273407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128353
5603	NC_017161	A	6	6	273441	273446	100 %	0 %	0 %	0 %	384128353
5604	NC_017161	ACT	2	6	273493	273498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384128353
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5606	NC_017161	TGGG	2	8	273612	273619	0 %	25 %	75 %	0 %	384128353
5607	NC_017161	CTT	2	6	273639	273644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384128353
5608	NC_017161	GAA	2	6	273648	273653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384128353
5609	NC_017161	A	6	6	273711	273716	100 %	0 %	0 %	0 %	384128353
5610	NC_017161	GGT	2	6	273719	273724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128353
5611	NC_017161	GGA	2	6	273749	273754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128353
5612	NC_017161	GCA	2	6	273897	273902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384128353
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5615	NC_017161	AAGGT	2	10	274183	274192	40 %	20 %	40 %	0 %	384128353
5616	NC_017161	TGG	2	6	274201	274206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384128353
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5619	NC_017161	T	6	6	274330	274335	0 %	100 %	0 %	0 %	384128354
5620	NC_017161	TACC	2	8	274420	274427	25 %	25 %	0 %	50 %	384128354
5621	NC_017161	GAG	3	9	274454	274462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384128354
5622	NC_017161	CT	3	6	274539	274544	0 %	50 %	0 %	50 %	384128354
5623	NC_017161	TACA	2	8	274568	274575	50 %	25 %	0 %	25 %	384128354
5624	NC_017161	A	6	6	274651	274656	100 %	0 %	0 %	0 %	384128354
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5626	NC_017161	ACAG	2	8	274769	274776	50 %	0 %	25 %	25 %	384128354
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