MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori ELS37 plasmid pHPELS37

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017064	AAC	2	6	14	19	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017064	CAA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017064	TAG	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017064	CAA	2	6	214	219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017064	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017064	AAC	2	6	589	594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017064	AGG	2	6	801	806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017064	TCA	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017064	TAG	2	6	920	925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017064	CAA	2	6	1008	1013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017064	TTG	2	6	1116	1121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017064	GGT	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017064	GTT	2	6	1438	1443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750636
14	NC_017064	TGT	2	6	1653	1658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750637
15	NC_017064	ATG	2	6	1706	1711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750637
16	NC_017064	ATT	2	6	1723	1728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750637
17	NC_017064	ATG	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750637
18	NC_017064	TTG	2	6	1836	1841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750637
19	NC_017064	TTG	2	6	1902	1907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750637
20	NC_017064	ACC	2	6	1945	1950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383750637
21	NC_017064	TCA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750637
22	NC_017064	ATC	2	6	2080	2085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750637
23	NC_017064	GTA	2	6	2299	2304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383750638
24	NC_017064	TTC	2	6	2318	2323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750638
25	NC_017064	TTG	2	6	2444	2449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750638
26	NC_017064	CAA	2	6	2578	2583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383750638
27	NC_017064	AAG	2	6	3219	3224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383750638
28	NC_017064	TTG	2	6	3248	3253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750638
29	NC_017064	CAC	2	6	3414	3419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383750638
30	NC_017064	TGT	2	6	3423	3428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750638
31	NC_017064	AAT	2	6	3452	3457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750638
32	NC_017064	TTA	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383750638
33	NC_017064	GGT	2	6	3628	3633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383750638
34	NC_017064	GGT	2	6	3685	3690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383750638
35	NC_017064	TTG	2	6	3702	3707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750638
36	NC_017064	TTC	2	6	3868	3873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383750638
37	NC_017064	TAA	2	6	3874	3879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383750638
38	NC_017064	ATA	2	6	3974	3979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017064	TTA	2	6	4023	4028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017064	ACT	2	6	4079	4084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017064	CCT	2	6	4108	4113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017064	TTA	2	6	4218	4223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017064	TAA	2	6	4241	4246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017064	AAG	2	6	4263	4268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017064	AAG	2	6	4285	4290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017064	AAG	2	6	4307	4312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017064	AAG	2	6	4329	4334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017064	AAG	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017064	TAA	2	6	4491	4496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017064	AAC	2	6	4498	4503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017064	ATC	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750640
52	NC_017064	TTG	2	6	5120	5125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383750640
53	NC_017064	ATC	2	6	5203	5208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383750640

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.