MICAS: Microsatellite Analysis Server

Di-nucleotide Repeats of Haemophilus parainfluenzae T3T1

Total Repeats: 2268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015964	TA	3	6	1100	1105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015964	TG	3	6	2049	2054	0 %	50 %	50 %	0 %	345428592
3	NC_015964	AT	3	6	2671	2676	50 %	50 %	0 %	0 %	345428592
4	NC_015964	CT	3	6	2927	2932	0 %	50 %	0 %	50 %	345428592
5	NC_015964	AG	3	6	4899	4904	50 %	0 %	50 %	0 %	345428594
6	NC_015964	GA	4	8	5385	5392	50 %	0 %	50 %	0 %	345428594
7	NC_015964	CG	3	6	5678	5683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015964	TA	3	6	6394	6399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015964	TA	4	8	6580	6587	50 %	50 %	0 %	0 %	345428596
10	NC_015964	AT	3	6	6724	6729	50 %	50 %	0 %	0 %	345428596
11	NC_015964	AT	3	6	7065	7070	50 %	50 %	0 %	0 %	345428596
12	NC_015964	AT	3	6	7108	7113	50 %	50 %	0 %	0 %	345428596
13	NC_015964	CA	3	6	7754	7759	50 %	0 %	0 %	50 %	345428597
14	NC_015964	TC	3	6	8215	8220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015964	GC	3	6	8891	8896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015964	GT	3	6	14953	14958	0 %	50 %	50 %	0 %	345428602
17	NC_015964	AG	3	6	15437	15442	50 %	0 %	50 %	0 %	345428603
18	NC_015964	AG	3	6	15449	15454	50 %	0 %	50 %	0 %	345428603
19	NC_015964	AT	3	6	17866	17871	50 %	50 %	0 %	0 %	345428606
20	NC_015964	AT	3	6	18831	18836	50 %	50 %	0 %	0 %	345428608
21	NC_015964	TA	3	6	19072	19077	50 %	50 %	0 %	0 %	345428608
22	NC_015964	AT	3	6	19158	19163	50 %	50 %	0 %	0 %	345428608
23	NC_015964	CA	3	6	21439	21444	50 %	0 %	0 %	50 %	345428610
24	NC_015964	GT	3	6	22237	22242	0 %	50 %	50 %	0 %	345428611
25	NC_015964	CA	3	6	22570	22575	50 %	0 %	0 %	50 %	345428611
26	NC_015964	AT	3	6	22721	22726	50 %	50 %	0 %	0 %	345428611
27	NC_015964	AG	3	6	24165	24170	50 %	0 %	50 %	0 %	345428612
28	NC_015964	AT	3	6	24746	24751	50 %	50 %	0 %	0 %	345428614
29	NC_015964	AC	3	6	24954	24959	50 %	0 %	0 %	50 %	345428614
30	NC_015964	CA	3	6	25049	25054	50 %	0 %	0 %	50 %	345428614
31	NC_015964	GT	3	6	26660	26665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015964	AT	3	6	27490	27495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015964	TG	3	6	27623	27628	0 %	50 %	50 %	0 %	345428618
34	NC_015964	GC	3	6	29268	29273	0 %	0 %	50 %	50 %	345428620
35	NC_015964	CA	3	6	29668	29673	50 %	0 %	0 %	50 %	345428620
36	NC_015964	CA	3	6	30127	30132	50 %	0 %	0 %	50 %	345428621
37	NC_015964	CG	3	6	30668	30673	0 %	0 %	50 %	50 %	345428621
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39	NC_015964	AG	3	6	32056	32061	50 %	0 %	50 %	0 %	345428622
40	NC_015964	CG	3	6	32601	32606	0 %	0 %	50 %	50 %	345428623
41	NC_015964	TC	3	6	32727	32732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015964	CG	3	6	33598	33603	0 %	0 %	50 %	50 %	345428624
43	NC_015964	CA	3	6	34158	34163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015964	CA	3	6	34468	34473	50 %	0 %	0 %	50 %	345428625
45	NC_015964	CT	3	6	34720	34725	0 %	50 %	0 %	50 %	345428625
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47	NC_015964	CT	3	6	37184	37189	0 %	50 %	0 %	50 %	345428628
48	NC_015964	CT	3	6	37989	37994	0 %	50 %	0 %	50 %	345428629
49	NC_015964	CA	4	8	38255	38262	50 %	0 %	0 %	50 %	345428629
50	NC_015964	TA	3	6	38970	38975	50 %	50 %	0 %	0 %	345428630
51	NC_015964	TC	3	6	39492	39497	0 %	50 %	0 %	50 %	345428630
52	NC_015964	TA	3	6	40853	40858	50 %	50 %	0 %	0 %	345428630
53	NC_015964	AG	3	6	41335	41340	50 %	0 %	50 %	0 %	345428631
54	NC_015964	GA	3	6	41994	41999	50 %	0 %	50 %	0 %	345428631
55	NC_015964	TC	3	6	42438	42443	0 %	50 %	0 %	50 %	345428631
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59	NC_015964	TA	3	6	45844	45849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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61	NC_015964	AT	3	6	47096	47101	50 %	50 %	0 %	0 %	345428636
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64	NC_015964	CG	3	6	49049	49054	0 %	0 %	50 %	50 %	345428638
65	NC_015964	TA	3	6	50020	50025	50 %	50 %	0 %	0 %	345428639
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67	NC_015964	AT	3	6	50369	50374	50 %	50 %	0 %	0 %	345428639
68	NC_015964	AT	3	6	50434	50439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_015964	GC	3	6	51701	51706	0 %	0 %	50 %	50 %	345428640
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72	NC_015964	TC	3	6	53083	53088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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74	NC_015964	TG	3	6	56467	56472	0 %	50 %	50 %	0 %	345428646
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76	NC_015964	AT	3	6	57490	57495	50 %	50 %	0 %	0 %	345428647
77	NC_015964	AT	3	6	57841	57846	50 %	50 %	0 %	0 %	345428647
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84	NC_015964	TA	3	6	64238	64243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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95	NC_015964	AT	3	6	76924	76929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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105	NC_015964	CT	3	6	83514	83519	0 %	50 %	0 %	50 %	345428672
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111	NC_015964	AG	3	6	85839	85844	50 %	0 %	50 %	0 %	345428675
112	NC_015964	GA	3	6	87389	87394	50 %	0 %	50 %	0 %	345428676
113	NC_015964	TC	3	6	88158	88163	0 %	50 %	0 %	50 %	345428676
114	NC_015964	GT	3	6	88965	88970	0 %	50 %	50 %	0 %	345428677
115	NC_015964	CG	3	6	89141	89146	0 %	0 %	50 %	50 %	345428677
116	NC_015964	AT	3	6	90786	90791	50 %	50 %	0 %	0 %	345428678
117	NC_015964	GC	4	8	92308	92315	0 %	0 %	50 %	50 %	345428681
118	NC_015964	CG	3	6	92877	92882	0 %	0 %	50 %	50 %	345428681
119	NC_015964	GT	3	6	93707	93712	0 %	50 %	50 %	0 %	345428682
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121	NC_015964	CA	3	6	98368	98373	50 %	0 %	0 %	50 %	345428687
122	NC_015964	TG	4	8	99006	99013	0 %	50 %	50 %	0 %	345428688
123	NC_015964	AC	3	6	101437	101442	50 %	0 %	0 %	50 %	345428691
124	NC_015964	AC	3	6	104185	104190	50 %	0 %	0 %	50 %	345428694
125	NC_015964	GA	3	6	105771	105776	50 %	0 %	50 %	0 %	345428695
126	NC_015964	AT	3	6	106644	106649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015964	GA	3	6	107155	107160	50 %	0 %	50 %	0 %	345428697
128	NC_015964	CT	3	6	108508	108513	0 %	50 %	0 %	50 %	345428700
129	NC_015964	CT	3	6	108641	108646	0 %	50 %	0 %	50 %	345428700
130	NC_015964	AC	3	6	109273	109278	50 %	0 %	0 %	50 %	345428701
131	NC_015964	GA	3	6	110040	110045	50 %	0 %	50 %	0 %	345428702
132	NC_015964	GA	3	6	112329	112334	50 %	0 %	50 %	0 %	345428704
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139	NC_015964	AC	3	6	118610	118615	50 %	0 %	0 %	50 %	345428708
140	NC_015964	CA	3	6	119428	119433	50 %	0 %	0 %	50 %	345428709
141	NC_015964	GT	3	6	121945	121950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015964	GA	3	6	122325	122330	50 %	0 %	50 %	0 %	345428713
143	NC_015964	CA	3	6	122416	122421	50 %	0 %	0 %	50 %	345428713
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