MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haemophilus parainfluenzae T3T1

Total Repeats: 1542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015964	TCGTA	2	10	43	52	20 %	40 %	20 %	20 %	345428591
2	NC_015964	AAACG	2	10	4702	4711	60 %	0 %	20 %	20 %	345428594
3	NC_015964	CAATG	2	10	5930	5939	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015964	TCCCC	2	10	8250	8259	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5	NC_015964	ATTAC	2	10	8286	8295	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015964	TTTAT	2	10	9231	9240	20 %	80 %	0 %	0 %	345428598
7	NC_015964	GCAAC	2	10	11707	11716	40 %	0 %	20 %	40 %	345428601
8	NC_015964	TGAAA	2	10	12438	12447	60 %	20 %	20 %	0 %	345428601
9	NC_015964	AACCA	2	10	17009	17018	60 %	0 %	0 %	40 %	345428605
10	NC_015964	AATTT	2	10	17020	17029	40 %	60 %	0 %	0 %	345428605
11	NC_015964	TCATA	2	10	18627	18636	40 %	40 %	0 %	20 %	345428607
12	NC_015964	GTTTC	2	10	18886	18895	0 %	60 %	20 %	20 %	345428608
13	NC_015964	GAAAA	2	10	19547	19556	80 %	0 %	20 %	0 %	345428609
14	NC_015964	ACTTC	2	10	20876	20885	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015964	GGCAA	2	10	22343	22352	40 %	0 %	40 %	20 %	345428611
16	NC_015964	ATAAA	2	10	24081	24090	80 %	20 %	0 %	0 %	345428612
17	NC_015964	TAAAA	2	10	24406	24415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015964	TAAGC	2	10	25037	25046	40 %	20 %	20 %	20 %	345428614
19	NC_015964	TGATT	2	10	28491	28500	20 %	60 %	20 %	0 %	345428619
20	NC_015964	TGCAA	2	10	28842	28851	40 %	20 %	20 %	20 %	345428620
21	NC_015964	GTGAA	2	10	33238	33247	40 %	20 %	40 %	0 %	345428624
22	NC_015964	TGCTG	2	10	33533	33542	0 %	40 %	40 %	20 %	345428624
23	NC_015964	GTATT	2	10	38059	38068	20 %	60 %	20 %	0 %	345428629
24	NC_015964	TTGGT	2	10	38212	38221	0 %	60 %	40 %	0 %	345428629
25	NC_015964	TAATA	2	10	39170	39179	60 %	40 %	0 %	0 %	345428630
26	NC_015964	TTTCT	2	10	39195	39204	0 %	80 %	0 %	20 %	345428630
27	NC_015964	ATCTC	2	10	39751	39760	20 %	40 %	0 %	40 %	345428630
28	NC_015964	TACGA	2	10	39783	39792	40 %	20 %	20 %	20 %	345428630
29	NC_015964	CAATA	2	10	41077	41086	60 %	20 %	0 %	20 %	345428631
30	NC_015964	TTTTG	2	10	47180	47189	0 %	80 %	20 %	0 %	345428636
31	NC_015964	TGCTT	2	10	47942	47951	0 %	60 %	20 %	20 %	345428637
32	NC_015964	CAGTA	2	10	50560	50569	40 %	20 %	20 %	20 %	345428640
33	NC_015964	TTTTG	2	10	51161	51170	0 %	80 %	20 %	0 %	345428640
34	NC_015964	CAACC	2	10	51353	51362	40 %	0 %	0 %	60 %	345428640
35	NC_015964	TCGTA	2	10	55287	55296	20 %	40 %	20 %	20 %	345428645
36	NC_015964	ATTTA	2	10	58599	58608	40 %	60 %	0 %	0 %	345428648
37	NC_015964	TAAAT	2	10	59834	59843	60 %	40 %	0 %	0 %	345428650
38	NC_015964	CTTGC	2	10	59893	59902	0 %	40 %	20 %	40 %	345428650
39	NC_015964	TTTTC	2	10	60540	60549	0 %	80 %	0 %	20 %	345428650
40	NC_015964	AAATG	2	10	63947	63956	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015964	GCATC	2	10	64128	64137	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015964	TGCGA	2	10	66135	66144	20 %	20 %	40 %	20 %	345428657
43	NC_015964	AGTTT	2	10	66340	66349	20 %	60 %	20 %	0 %	345428657
44	NC_015964	TATTT	2	10	66554	66563	20 %	80 %	0 %	0 %	345428658
45	NC_015964	AAAAC	2	10	70538	70547	80 %	0 %	0 %	20 %	345428663
46	NC_015964	GCACC	2	10	70829	70838	20 %	0 %	20 %	60 %	345428663
47	NC_015964	TTTAA	2	10	73374	73383	40 %	60 %	0 %	0 %	345428664
48	NC_015964	CAATT	2	10	75522	75531	40 %	40 %	0 %	20 %	345428665
49	NC_015964	CAAAG	2	10	76374	76383	60 %	0 %	20 %	20 %	345428665
50	NC_015964	ATTCC	2	10	78254	78263	20 %	40 %	0 %	40 %	345428667
51	NC_015964	ATTTT	2	10	79681	79690	20 %	80 %	0 %	0 %	345428669
52	NC_015964	TGCGA	2	10	80010	80019	20 %	20 %	40 %	20 %	345428669
53	NC_015964	TGGCG	2	10	80862	80871	0 %	20 %	60 %	20 %	345428669
54	NC_015964	AAAAT	2	10	82465	82474	80 %	20 %	0 %	0 %	345428671
55	NC_015964	AGATG	2	10	83693	83702	40 %	20 %	40 %	0 %	345428672
56	NC_015964	GCTTG	2	10	87884	87893	0 %	40 %	40 %	20 %	345428676
57	NC_015964	GGCAA	2	10	93279	93288	40 %	0 %	40 %	20 %	345428682
58	NC_015964	ATCAC	2	10	94372	94381	40 %	20 %	0 %	40 %	345428683
59	NC_015964	AATCA	2	10	95553	95562	60 %	20 %	0 %	20 %	345428684
60	NC_015964	CAACC	2	10	95870	95879	40 %	0 %	0 %	60 %	345428684
61	NC_015964	AAAAC	2	10	96762	96771	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015964	CAAGC	2	10	99217	99226	40 %	0 %	20 %	40 %	345428688
63	NC_015964	GGTTT	2	10	100713	100722	0 %	60 %	40 %	0 %	345428690
64	NC_015964	CACTT	2	10	101877	101886	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_015964	ACGAT	2	10	102300	102309	40 %	20 %	20 %	20 %	345428692
66	NC_015964	CATGC	2	10	102469	102478	20 %	20 %	20 %	40 %	345428692
67	NC_015964	ATTTA	2	10	102893	102902	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015964	AATTG	2	10	102947	102956	40 %	40 %	20 %	0 %	345428693
69	NC_015964	TTCAA	2	10	103930	103939	40 %	40 %	0 %	20 %	345428694
70	NC_015964	ATCAC	2	10	104683	104692	40 %	20 %	0 %	40 %	345428694
71	NC_015964	GCAAA	2	10	104744	104753	60 %	0 %	20 %	20 %	345428695
72	NC_015964	CCATT	2	10	104961	104970	20 %	40 %	0 %	40 %	345428695
73	NC_015964	AGCTG	2	10	105328	105337	20 %	20 %	40 %	20 %	345428695
74	NC_015964	GCTTA	2	10	106236	106245	20 %	40 %	20 %	20 %	345428696
75	NC_015964	GAGCT	2	10	106926	106935	20 %	20 %	40 %	20 %	345428697
76	NC_015964	ACAAG	2	10	107985	107994	60 %	0 %	20 %	20 %	345428700
77	NC_015964	AAATT	2	10	110850	110859	60 %	40 %	0 %	0 %	345428703
78	NC_015964	AAATT	2	10	115501	115510	60 %	40 %	0 %	0 %	345428705
79	NC_015964	GCGGA	2	10	116731	116740	20 %	0 %	60 %	20 %	345428708
80	NC_015964	AAAAG	2	10	118578	118587	80 %	0 %	20 %	0 %	345428708
81	NC_015964	ATTTT	2	10	119437	119446	20 %	80 %	0 %	0 %	345428709
82	NC_015964	GGTGC	2	10	120851	120860	0 %	20 %	60 %	20 %	345428711
83	NC_015964	CATTA	2	10	122768	122777	40 %	40 %	0 %	20 %	345428713
84	NC_015964	CACGG	2	10	123220	123229	20 %	0 %	40 %	40 %	345428714
85	NC_015964	CTTCT	2	10	124031	124040	0 %	60 %	0 %	40 %	345428715
86	NC_015964	TTTAT	2	10	126867	126876	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015964	AAGTG	2	10	127334	127343	40 %	20 %	40 %	0 %	345428717
88	NC_015964	ATTTG	2	10	129375	129384	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015964	ATGTA	2	10	130268	130277	40 %	40 %	20 %	0 %	345428719
90	NC_015964	TTATA	2	10	132900	132909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015964	TTTAC	2	10	135475	135484	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015964	TTTAG	2	10	138644	138653	20 %	60 %	20 %	0 %	345428724
93	NC_015964	AAAGA	2	10	141209	141218	80 %	0 %	20 %	0 %	345428728
94	NC_015964	GTGAA	2	10	142633	142642	40 %	20 %	40 %	0 %	345428729
95	NC_015964	GCACT	2	10	145134	145143	20 %	20 %	20 %	40 %	345428732
96	NC_015964	AAACC	2	10	145593	145602	60 %	0 %	0 %	40 %	345428732
97	NC_015964	TAAGT	2	10	148036	148045	40 %	40 %	20 %	0 %	345428733
98	NC_015964	TAAAT	2	10	149892	149901	60 %	40 %	0 %	0 %	345428735
99	NC_015964	TTTTA	2	10	150107	150116	20 %	80 %	0 %	0 %	345428735
100	NC_015964	CAAAC	2	10	150690	150699	60 %	0 %	0 %	40 %	345428736
101	NC_015964	TGGAA	2	10	153149	153158	40 %	20 %	40 %	0 %	345428740
102	NC_015964	AAGAT	2	10	155505	155514	60 %	20 %	20 %	0 %	345428742
103	NC_015964	GCACC	2	10	155900	155909	20 %	0 %	20 %	60 %	345428742
104	NC_015964	ACTTT	2	10	156272	156281	20 %	60 %	0 %	20 %	345428743
105	NC_015964	TAACT	2	10	160893	160902	40 %	40 %	0 %	20 %	345428747
106	NC_015964	AATCC	2	10	161075	161084	40 %	20 %	0 %	40 %	345428747
107	NC_015964	ACCTT	2	10	161571	161580	20 %	40 %	0 %	40 %	345428748
108	NC_015964	GTCCA	2	10	163189	163198	20 %	20 %	20 %	40 %	345428750
109	NC_015964	CCACA	2	10	165284	165293	40 %	0 %	0 %	60 %	345428751
110	NC_015964	GTAAA	2	10	166429	166438	60 %	20 %	20 %	0 %	345428752
111	NC_015964	GCTTC	2	10	167200	167209	0 %	40 %	20 %	40 %	345428753
112	NC_015964	AACAA	2	10	167815	167824	80 %	0 %	0 %	20 %	345428753
113	NC_015964	TTTTA	2	10	170322	170331	20 %	80 %	0 %	0 %	345428756
114	NC_015964	GTAAT	2	10	171658	171667	40 %	40 %	20 %	0 %	345428758
115	NC_015964	ACTTT	2	10	171947	171956	20 %	60 %	0 %	20 %	345428759
116	NC_015964	CCATA	2	10	172348	172357	40 %	20 %	0 %	40 %	345428759
117	NC_015964	TTTAC	2	10	173109	173118	20 %	60 %	0 %	20 %	345428760
118	NC_015964	AATAA	2	10	173762	173771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015964	CTTTT	2	10	173836	173845	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015964	CAGAT	2	10	175024	175033	40 %	20 %	20 %	20 %	345428763
121	NC_015964	TTTCA	2	10	176665	176674	20 %	60 %	0 %	20 %	345428766
122	NC_015964	AATTA	2	10	182903	182912	60 %	40 %	0 %	0 %	345428772
123	NC_015964	CAAAA	2	10	186571	186580	80 %	0 %	0 %	20 %	345428774
124	NC_015964	CAAGA	2	10	187992	188001	60 %	0 %	20 %	20 %	345428775
125	NC_015964	TATCG	2	10	188268	188277	20 %	40 %	20 %	20 %	345428775
126	NC_015964	ATTCA	2	10	191353	191362	40 %	40 %	0 %	20 %	345428778
127	NC_015964	ATGAA	2	10	192242	192251	60 %	20 %	20 %	0 %	345428779
128	NC_015964	CCCAT	2	10	192303	192312	20 %	20 %	0 %	60 %	345428779
129	NC_015964	CATCG	2	10	192359	192368	20 %	20 %	20 %	40 %	345428779
130	NC_015964	TACTT	2	10	194177	194186	20 %	60 %	0 %	20 %	345428780
131	NC_015964	CTTTT	2	10	194529	194538	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015964	TTTAT	2	10	199358	199367	20 %	80 %	0 %	0 %	345428784
133	NC_015964	CGTGG	2	10	200323	200332	0 %	20 %	60 %	20 %	345428785
134	NC_015964	TTAAT	2	10	200715	200724	40 %	60 %	0 %	0 %	345428785
135	NC_015964	GTTTT	2	10	204488	204497	0 %	80 %	20 %	0 %	345428789
136	NC_015964	TTATT	2	10	207786	207795	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_015964	ATCAT	2	10	385200	385209	40 %	40 %	0 %	20 %	345428965
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