MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parainfluenzae T3T1

Total Repeats: 43377

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015964	TGT	2	6	44641	44646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428633
1002	NC_015964	CCA	2	6	44796	44801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428633
1003	NC_015964	GCC	2	6	44807	44812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345428633
1004	NC_015964	CTT	2	6	44826	44831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428633
1005	NC_015964	TGT	2	6	44840	44845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428633
1006	NC_015964	ACC	2	6	44929	44934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428633
1007	NC_015964	TTAA	2	8	44987	44994	50 %	50 %	0 %	0 %	345428633
1008	NC_015964	TAAA	2	8	45030	45037	75 %	25 %	0 %	0 %	345428633
1009	NC_015964	CTT	3	9	45075	45083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428633
1010	NC_015964	TAA	2	6	45112	45117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428633
1011	NC_015964	GTAA	2	8	45135	45142	50 %	25 %	25 %	0 %	345428634
1012	NC_015964	CTTT	2	8	45189	45196	0 %	75 %	0 %	25 %	345428634
1013	NC_015964	TG	3	6	45266	45271	0 %	50 %	50 %	0 %	345428634
1014	NC_015964	GTT	2	6	45303	45308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428634
1015	NC_015964	T	6	6	45320	45325	0 %	100 %	0 %	0 %	345428634
1016	NC_015964	TAT	2	6	45336	45341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428634
1017	NC_015964	GCC	2	6	45377	45382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345428634
1018	NC_015964	ATA	2	6	45444	45449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428634
1019	NC_015964	ATT	2	6	45476	45481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428634
1020	NC_015964	CAC	2	6	45506	45511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428635
1021	NC_015964	CAA	2	6	45512	45517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428635
1022	NC_015964	CTT	2	6	45539	45544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428635
1023	NC_015964	TTA	2	6	45556	45561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428635
1024	NC_015964	CTT	3	9	45599	45607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428635
1025	NC_015964	TAAA	2	8	45629	45636	75 %	25 %	0 %	0 %	345428635
1026	NC_015964	CAT	2	6	45668	45673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428635
1027	NC_015964	AAT	2	6	45699	45704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428635
1028	NC_015964	AAT	2	6	45795	45800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428635
1029	NC_015964	TCT	2	6	45830	45835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_015964	TA	3	6	45844	45849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015964	A	6	6	45849	45854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015964	TGA	2	6	45902	45907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015964	CTT	2	6	45942	45947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428636
1034	NC_015964	ATC	2	6	45952	45957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428636
1035	NC_015964	TAA	2	6	45963	45968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428636
1036	NC_015964	CAACCA	2	12	46116	46127	50 %	0 %	0 %	50 %	345428636
1037	NC_015964	TGGCAA	2	12	46182	46193	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345428636
1038	NC_015964	TAT	2	6	46221	46226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428636
1039	NC_015964	CTG	2	6	46266	46271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428636
1040	NC_015964	TCA	2	6	46382	46387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428636
1041	NC_015964	CAA	2	6	46431	46436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428636
1042	NC_015964	CGC	2	6	46531	46536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345428636
1043	NC_015964	ATT	2	6	46543	46548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428636
1044	NC_015964	AAT	2	6	46557	46562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428636
1045	NC_015964	TCT	2	6	46568	46573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428636
1046	NC_015964	CTG	2	6	46623	46628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428636
1047	NC_015964	TACG	2	8	46683	46690	25 %	25 %	25 %	25 %	345428636
1048	NC_015964	ACGT	2	8	46722	46729	25 %	25 %	25 %	25 %	345428636
1049	NC_015964	ATA	2	6	46751	46756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428636
1050	NC_015964	TAA	3	9	46804	46812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428636
1051	NC_015964	CAC	2	6	46866	46871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428636
1052	NC_015964	CTT	2	6	46962	46967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428636
1053	NC_015964	TG	3	6	46986	46991	0 %	50 %	50 %	0 %	345428636
1054	NC_015964	ATA	2	6	47029	47034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428636
1055	NC_015964	AT	3	6	47096	47101	50 %	50 %	0 %	0 %	345428636
1056	NC_015964	TCGCAT	2	12	47136	47147	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345428636
1057	NC_015964	TCT	3	9	47165	47173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428636
1058	NC_015964	TTTTG	2	10	47180	47189	0 %	80 %	20 %	0 %	345428636
1059	NC_015964	CAA	2	6	47277	47282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428636
1060	NC_015964	AAT	2	6	47378	47383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428636
1061	NC_015964	GTC	2	6	47458	47463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428636
1062	NC_015964	CTT	2	6	47592	47597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428636
1063	NC_015964	TTG	2	6	47644	47649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428636
1064	NC_015964	GCA	2	6	47675	47680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428636
1065	NC_015964	CCA	2	6	47693	47698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428636
1066	NC_015964	CCA	2	6	47717	47722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428636
1067	NC_015964	T	6	6	47790	47795	0 %	100 %	0 %	0 %	345428636
1068	NC_015964	ATT	2	6	47809	47814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015964	A	6	6	47823	47828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015964	A	6	6	47875	47880	100 %	0 %	0 %	0 %	345428637
1071	NC_015964	TAA	2	6	47915	47920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428637
1072	NC_015964	TGCTT	2	10	47942	47951	0 %	60 %	20 %	20 %	345428637
1073	NC_015964	T	6	6	47957	47962	0 %	100 %	0 %	0 %	345428637
1074	NC_015964	A	6	6	47967	47972	100 %	0 %	0 %	0 %	345428637
1075	NC_015964	GTT	2	6	48009	48014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428637
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1078	NC_015964	TCA	2	6	48150	48155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428637
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1080	NC_015964	ATC	2	6	48237	48242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428637
1081	NC_015964	ACA	2	6	48261	48266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428637
1082	NC_015964	ATG	2	6	48282	48287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428637
1083	NC_015964	AGC	2	6	48304	48309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428637
1084	NC_015964	GC	3	6	48342	48347	0 %	0 %	50 %	50 %	345428637
1085	NC_015964	CATC	2	8	48382	48389	25 %	25 %	0 %	50 %	345428637
1086	NC_015964	AGAA	2	8	48455	48462	75 %	0 %	25 %	0 %	345428638
1087	NC_015964	ATC	2	6	48483	48488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428638
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1091	NC_015964	GC	3	6	48639	48644	0 %	0 %	50 %	50 %	345428638
1092	NC_015964	CAA	2	6	48702	48707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428638
1093	NC_015964	GTT	2	6	48748	48753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428638
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1096	NC_015964	AAT	2	6	48906	48911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428638
1097	NC_015964	CACG	2	8	48937	48944	25 %	0 %	25 %	50 %	345428638
1098	NC_015964	AAT	2	6	48999	49004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428638
1099	NC_015964	AATATG	2	12	49023	49034	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	345428638
1100	NC_015964	CG	3	6	49049	49054	0 %	0 %	50 %	50 %	345428638
1101	NC_015964	GCT	2	6	49081	49086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428638
1102	NC_015964	CAC	2	6	49146	49151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428638
1103	NC_015964	TTGA	2	8	49209	49216	25 %	50 %	25 %	0 %	345428638
1104	NC_015964	TTC	2	6	49266	49271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428638
1105	NC_015964	AATC	2	8	49280	49287	50 %	25 %	0 %	25 %	345428638
1106	NC_015964	TTA	2	6	49342	49347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428638
1107	NC_015964	AGC	2	6	49383	49388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428638
1108	NC_015964	A	6	6	49456	49461	100 %	0 %	0 %	0 %	345428638
1109	NC_015964	AAT	2	6	49661	49666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428638
1110	NC_015964	AATACC	2	12	49743	49754	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	345428638
1111	NC_015964	CGA	2	6	49781	49786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428638
1112	NC_015964	TTTC	2	8	49790	49797	0 %	75 %	0 %	25 %	345428638
1113	NC_015964	AATT	2	8	49851	49858	50 %	50 %	0 %	0 %	345428639
1114	NC_015964	GAGC	2	8	49904	49911	25 %	0 %	50 %	25 %	345428639
1115	NC_015964	T	7	7	49918	49924	0 %	100 %	0 %	0 %	345428639
1116	NC_015964	ATTG	2	8	49996	50003	25 %	50 %	25 %	0 %	345428639
1117	NC_015964	TA	3	6	50020	50025	50 %	50 %	0 %	0 %	345428639
1118	NC_015964	TA	3	6	50060	50065	50 %	50 %	0 %	0 %	345428639
1119	NC_015964	TCT	2	6	50070	50075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428639
1120	NC_015964	CAA	2	6	50130	50135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428639
1121	NC_015964	A	8	8	50134	50141	100 %	0 %	0 %	0 %	345428639
1122	NC_015964	ATA	3	9	50151	50159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428639
1123	NC_015964	A	6	6	50188	50193	100 %	0 %	0 %	0 %	345428639
1124	NC_015964	CCTT	2	8	50239	50246	0 %	50 %	0 %	50 %	345428639
1125	NC_015964	A	8	8	50285	50292	100 %	0 %	0 %	0 %	345428639
1126	NC_015964	GAA	2	6	50293	50298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428639
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1128	NC_015964	AT	3	6	50369	50374	50 %	50 %	0 %	0 %	345428639
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1256	NC_015964	AGTG	2	8	56195	56202	25 %	25 %	50 %	0 %	345428646
1257	NC_015964	A	6	6	56245	56250	100 %	0 %	0 %	0 %	345428646
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1260	NC_015964	ATT	2	6	56459	56464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428646
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1262	NC_015964	AAC	2	6	56512	56517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428646
1263	NC_015964	TGA	2	6	56537	56542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428646
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1371	NC_015964	CAA	2	6	62112	62117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428652
1372	NC_015964	AAG	2	6	62184	62189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428652
1373	NC_015964	A	7	7	62329	62335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1374	NC_015964	T	6	6	62338	62343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1375	NC_015964	T	9	9	62414	62422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1376	NC_015964	A	7	7	62466	62472	100 %	0 %	0 %	0 %	345428653
1377	NC_015964	A	6	6	62494	62499	100 %	0 %	0 %	0 %	345428653
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