MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus parainfluenzae T3T1

Total Repeats: 43377

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015964	AAT	2	6	22279	22284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428611
502	NC_015964	CAT	2	6	22291	22296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428611
503	NC_015964	GGCAA	2	10	22343	22352	40 %	0 %	40 %	20 %	345428611
504	NC_015964	CACT	2	8	22377	22384	25 %	25 %	0 %	50 %	345428611
505	NC_015964	TAA	2	6	22450	22455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428611
506	NC_015964	ATA	2	6	22469	22474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428611
507	NC_015964	TTGT	2	8	22531	22538	0 %	75 %	25 %	0 %	345428611
508	NC_015964	CA	3	6	22570	22575	50 %	0 %	0 %	50 %	345428611
509	NC_015964	TAA	4	12	22603	22614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428611
510	NC_015964	CGAA	2	8	22648	22655	50 %	0 %	25 %	25 %	345428611
511	NC_015964	ACC	2	6	22690	22695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428611
512	NC_015964	AT	3	6	22721	22726	50 %	50 %	0 %	0 %	345428611
513	NC_015964	GAAC	2	8	22778	22785	50 %	0 %	25 %	25 %	345428611
514	NC_015964	AGA	2	6	22918	22923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428611
515	NC_015964	ACC	2	6	22944	22949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428611
516	NC_015964	C	7	7	22952	22958	0 %	0 %	0 %	100 %	345428611
517	NC_015964	ATA	2	6	22969	22974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428611
518	NC_015964	CAC	2	6	22979	22984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428611
519	NC_015964	GCC	2	6	23021	23026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345428611
520	NC_015964	ACC	2	6	23043	23048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428611
521	NC_015964	ATG	2	6	23082	23087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428611
522	NC_015964	AAG	2	6	23255	23260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428611
523	NC_015964	TAA	2	6	23268	23273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428611
524	NC_015964	ATA	2	6	23279	23284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428611
525	NC_015964	CTT	2	6	23304	23309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428611
526	NC_015964	TAA	2	6	23356	23361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428611
527	NC_015964	ATA	2	6	23416	23421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428611
528	NC_015964	GCT	2	6	23431	23436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428611
529	NC_015964	AAT	2	6	23492	23497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428611
530	NC_015964	T	6	6	23574	23579	0 %	100 %	0 %	0 %	345428611
531	NC_015964	AAGC	2	8	23631	23638	50 %	0 %	25 %	25 %	345428611
532	NC_015964	ATT	2	6	23663	23668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428611
533	NC_015964	CTT	2	6	23672	23677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428612
534	NC_015964	ACG	2	6	23703	23708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428612
535	NC_015964	T	6	6	23765	23770	0 %	100 %	0 %	0 %	345428612
536	NC_015964	TAA	2	6	23829	23834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428612
537	NC_015964	CGA	2	6	23861	23866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428612
538	NC_015964	GAA	2	6	23894	23899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428612
539	NC_015964	ACC	2	6	24000	24005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428612
540	NC_015964	CTT	2	6	24050	24055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428612
541	NC_015964	ATAAA	2	10	24081	24090	80 %	20 %	0 %	0 %	345428612
542	NC_015964	AG	3	6	24165	24170	50 %	0 %	50 %	0 %	345428612
543	NC_015964	TTTA	2	8	24206	24213	25 %	75 %	0 %	0 %	345428613
544	NC_015964	GTT	2	6	24235	24240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428613
545	NC_015964	CTT	2	6	24253	24258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428613
546	NC_015964	TAAAA	2	10	24406	24415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015964	TCT	2	6	24470	24475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428614
548	NC_015964	ATAAAA	2	12	24519	24530	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	345428614
549	NC_015964	CCA	2	6	24625	24630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428614
550	NC_015964	CAC	2	6	24661	24666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428614
551	NC_015964	CAA	2	6	24669	24674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428614
552	NC_015964	AT	3	6	24746	24751	50 %	50 %	0 %	0 %	345428614
553	NC_015964	AAG	2	6	24752	24757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428614
554	NC_015964	CACC	2	8	24793	24800	25 %	0 %	0 %	75 %	345428614
555	NC_015964	AAT	2	6	24925	24930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428614
556	NC_015964	AC	3	6	24954	24959	50 %	0 %	0 %	50 %	345428614
557	NC_015964	ACAT	2	8	24989	24996	50 %	25 %	0 %	25 %	345428614
558	NC_015964	TAAGC	2	10	25037	25046	40 %	20 %	20 %	20 %	345428614
559	NC_015964	CA	3	6	25049	25054	50 %	0 %	0 %	50 %	345428614
560	NC_015964	AAT	2	6	25067	25072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428614
561	NC_015964	A	6	6	25090	25095	100 %	0 %	0 %	0 %	345428614
562	NC_015964	A	6	6	25182	25187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015964	A	6	6	25189	25194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015964	ATG	2	6	25226	25231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015964	ATTA	2	8	25232	25239	50 %	50 %	0 %	0 %	345428615
566	NC_015964	GCCA	2	8	25293	25300	25 %	0 %	25 %	50 %	345428615
567	NC_015964	CGG	2	6	25349	25354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345428615
568	NC_015964	AAT	2	6	25393	25398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428615
569	NC_015964	CCA	2	6	25518	25523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428615
570	NC_015964	AAC	2	6	25591	25596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428615
571	NC_015964	ATC	2	6	25680	25685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428615
572	NC_015964	AGT	2	6	25762	25767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428615
573	NC_015964	GATT	2	8	25931	25938	25 %	50 %	25 %	0 %	345428616
574	NC_015964	T	7	7	25937	25943	0 %	100 %	0 %	0 %	345428616
575	NC_015964	AAT	2	6	25945	25950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428616
576	NC_015964	CTT	2	6	25961	25966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428616
577	NC_015964	T	6	6	25995	26000	0 %	100 %	0 %	0 %	345428616
578	NC_015964	T	6	6	26040	26045	0 %	100 %	0 %	0 %	345428616
579	NC_015964	CTG	2	6	26132	26137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428616
580	NC_015964	CTG	2	6	26232	26237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428616
581	NC_015964	ATG	2	6	26286	26291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428616
582	NC_015964	TGA	2	6	26308	26313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428616
583	NC_015964	TTC	2	6	26319	26324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428616
584	NC_015964	GTT	2	6	26327	26332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428616
585	NC_015964	TGA	2	6	26530	26535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428616
586	NC_015964	GT	3	6	26660	26665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015964	AAT	2	6	26717	26722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015964	ACT	2	6	26766	26771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_015964	TGT	2	6	26778	26783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015964	A	6	6	26814	26819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015964	ATG	2	6	26864	26869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428617
592	NC_015964	CAC	2	6	26908	26913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428617
593	NC_015964	CAC	2	6	26920	26925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345428617
594	NC_015964	CTG	2	6	26969	26974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428617
595	NC_015964	AAC	2	6	27052	27057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428617
596	NC_015964	A	6	6	27100	27105	100 %	0 %	0 %	0 %	345428617
597	NC_015964	AGC	2	6	27132	27137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428617
598	NC_015964	AGC	3	9	27189	27197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428617
599	NC_015964	TGT	2	6	27252	27257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428617
600	NC_015964	TAC	2	6	27352	27357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428617
601	NC_015964	CGT	2	6	27373	27378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428617
602	NC_015964	GTA	2	6	27406	27411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428617
603	NC_015964	A	6	6	27442	27447	100 %	0 %	0 %	0 %	345428617
604	NC_015964	ATA	2	6	27474	27479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428617
605	NC_015964	AT	3	6	27490	27495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015964	A	6	6	27496	27501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015964	T	7	7	27520	27526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015964	T	6	6	27550	27555	0 %	100 %	0 %	0 %	345428618
609	NC_015964	CTT	2	6	27583	27588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428618
610	NC_015964	TTC	2	6	27601	27606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428618
611	NC_015964	TG	3	6	27623	27628	0 %	50 %	50 %	0 %	345428618
612	NC_015964	T	6	6	27771	27776	0 %	100 %	0 %	0 %	345428618
613	NC_015964	A	6	6	27830	27835	100 %	0 %	0 %	0 %	345428618
614	NC_015964	AGA	2	6	27844	27849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345428618
615	NC_015964	ATG	2	6	27941	27946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345428618
616	NC_015964	GGT	2	6	27947	27952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345428618
617	NC_015964	A	6	6	27993	27998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015964	ATT	2	6	28033	28038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428619
619	NC_015964	GCTT	2	8	28099	28106	0 %	50 %	25 %	25 %	345428619
620	NC_015964	TGC	2	6	28207	28212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428619
621	NC_015964	TTG	2	6	28225	28230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428619
622	NC_015964	TGC	2	6	28255	28260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345428619
623	NC_015964	ATC	2	6	28276	28281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428619
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625	NC_015964	CAA	2	6	28341	28346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345428619
626	NC_015964	TAA	2	6	28363	28368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428619
627	NC_015964	TTG	2	6	28426	28431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428619
628	NC_015964	GCG	2	6	28433	28438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345428619
629	NC_015964	TTTG	2	8	28444	28451	0 %	75 %	25 %	0 %	345428619
630	NC_015964	CAT	2	6	28467	28472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428619
631	NC_015964	CAG	2	6	28476	28481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345428619
632	NC_015964	TGATT	2	10	28491	28500	20 %	60 %	20 %	0 %	345428619
633	NC_015964	AAT	2	6	28564	28569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428619
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702	NC_015964	T	6	6	31632	31637	0 %	100 %	0 %	0 %	345428622
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729	NC_015964	A	6	6	32661	32666	100 %	0 %	0 %	0 %	345428623
730	NC_015964	CTC	2	6	32723	32728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
731	NC_015964	TC	3	6	32727	32732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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735	NC_015964	T	6	6	33041	33046	0 %	100 %	0 %	0 %	345428624
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739	NC_015964	TCA	2	6	33212	33217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428624
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754	NC_015964	T	6	6	33893	33898	0 %	100 %	0 %	0 %	345428624
755	NC_015964	GTT	2	6	33921	33926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428624
756	NC_015964	TTA	2	6	33943	33948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
757	NC_015964	GAT	2	6	33960	33965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
758	NC_015964	CAA	2	6	33982	33987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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892	NC_015964	CAT	2	6	39668	39673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428630
893	NC_015964	AAT	2	6	39690	39695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345428630
894	NC_015964	ATCTC	2	10	39751	39760	20 %	40 %	0 %	40 %	345428630
895	NC_015964	TACGA	2	10	39783	39792	40 %	20 %	20 %	20 %	345428630
896	NC_015964	TTC	2	6	39794	39799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428630
897	NC_015964	TGT	2	6	39843	39848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345428630
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901	NC_015964	CAAC	2	8	40029	40036	50 %	0 %	0 %	50 %	345428630
902	NC_015964	A	7	7	40041	40047	100 %	0 %	0 %	0 %	345428630
903	NC_015964	TCT	2	6	40069	40074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428630
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962	NC_015964	AATA	2	8	42621	42628	75 %	25 %	0 %	0 %	345428631
963	NC_015964	TCA	2	6	42629	42634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428631
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980	NC_015964	AT	3	6	43695	43700	50 %	50 %	0 %	0 %	345428632
981	NC_015964	TTA	2	6	43905	43910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345428632
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997	NC_015964	GCTG	2	8	44453	44460	0 %	25 %	50 %	25 %	345428633
998	NC_015964	AATT	2	8	44521	44528	50 %	50 %	0 %	0 %	345428633
999	NC_015964	CTT	2	6	44562	44567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345428633
1000	NC_015964	TCA	2	6	44576	44581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345428633

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