MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar02

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015959	AT	4	8	78	85	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015959	CG	3	6	322	327	0 %	0 %	50 %	50 %	345133532
3	NC_015959	GA	3	6	338	343	50 %	0 %	50 %	0 %	345133532
4	NC_015959	CG	3	6	535	540	0 %	0 %	50 %	50 %	345133532
5	NC_015959	CG	3	6	788	793	0 %	0 %	50 %	50 %	345133532
6	NC_015959	GT	3	6	1913	1918	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015959	TG	3	6	2192	2197	0 %	50 %	50 %	0 %	345133533
8	NC_015959	GA	3	6	3838	3843	50 %	0 %	50 %	0 %	345133537
9	NC_015959	CG	3	6	4034	4039	0 %	0 %	50 %	50 %	345133538
10	NC_015959	CG	3	6	4247	4252	0 %	0 %	50 %	50 %	345133539
11	NC_015959	GC	3	6	4561	4566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015959	AG	3	6	4670	4675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015959	AC	3	6	5052	5057	50 %	0 %	0 %	50 %	345133540
14	NC_015959	GC	3	6	5193	5198	0 %	0 %	50 %	50 %	345133540
15	NC_015959	GA	3	6	5567	5572	50 %	0 %	50 %	0 %	345133541
16	NC_015959	GA	3	6	5934	5939	50 %	0 %	50 %	0 %	345133542
17	NC_015959	GC	3	6	5963	5968	0 %	0 %	50 %	50 %	345133542
18	NC_015959	GC	3	6	6217	6222	0 %	0 %	50 %	50 %	345133542
19	NC_015959	TC	3	6	6722	6727	0 %	50 %	0 %	50 %	345133542
20	NC_015959	CG	3	6	7534	7539	0 %	0 %	50 %	50 %	345133542
21	NC_015959	AC	3	6	7662	7667	50 %	0 %	0 %	50 %	345133542
22	NC_015959	AC	3	6	7691	7696	50 %	0 %	0 %	50 %	345133542
23	NC_015959	GC	3	6	8369	8374	0 %	0 %	50 %	50 %	345133542
24	NC_015959	GT	3	6	8542	8547	0 %	50 %	50 %	0 %	345133542
25	NC_015959	GC	3	6	8702	8707	0 %	0 %	50 %	50 %	345133542
26	NC_015959	GT	3	6	9685	9690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015959	TC	3	6	9797	9802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015959	GC	4	8	9991	9998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015959	GC	4	8	11428	11435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015959	CG	3	6	11553	11558	0 %	0 %	50 %	50 %	345133544
31	NC_015959	TC	3	6	11687	11692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015959	TC	3	6	11945	11950	0 %	50 %	0 %	50 %	345133545
33	NC_015959	GA	3	6	11983	11988	50 %	0 %	50 %	0 %	345133545
34	NC_015959	AG	3	6	12694	12699	50 %	0 %	50 %	0 %	345133547
35	NC_015959	GT	3	6	13965	13970	0 %	50 %	50 %	0 %	345133548
36	NC_015959	AC	3	6	14584	14589	50 %	0 %	0 %	50 %	345133549
37	NC_015959	CG	4	8	14976	14983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015959	GA	3	6	15155	15160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015959	TG	3	6	15610	15615	0 %	50 %	50 %	0 %	345133550
40	NC_015959	GA	4	8	16848	16855	50 %	0 %	50 %	0 %	345133553
41	NC_015959	CG	4	8	17351	17358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015959	TA	4	8	17779	17786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015959	GA	3	6	18033	18038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015959	CG	3	6	18861	18866	0 %	0 %	50 %	50 %	345133555
45	NC_015959	AC	3	6	19300	19305	50 %	0 %	0 %	50 %	345133555
46	NC_015959	GT	3	6	20316	20321	0 %	50 %	50 %	0 %	345133556
47	NC_015959	TG	4	8	20839	20846	0 %	50 %	50 %	0 %	345133557
48	NC_015959	GC	3	6	21793	21798	0 %	0 %	50 %	50 %	345133559
49	NC_015959	AC	3	6	21852	21857	50 %	0 %	0 %	50 %	345133559
50	NC_015959	GT	3	6	21934	21939	0 %	50 %	50 %	0 %	345133559
51	NC_015959	CG	3	6	22463	22468	0 %	0 %	50 %	50 %	345133560
52	NC_015959	TG	3	6	22579	22584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015959	CG	3	6	22663	22668	0 %	0 %	50 %	50 %	345133561
54	NC_015959	AC	3	6	22886	22891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015959	CG	3	6	23398	23403	0 %	0 %	50 %	50 %	345133562

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.