MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 1387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015955	AG	3	6	21	26	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015955	AG	3	6	203	208	50 %	0 %	50 %	0 %	345006828
3	NC_015955	TC	3	6	1005	1010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015955	TA	3	6	1441	1446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015955	AT	3	6	2238	2243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015955	AT	3	6	2678	2683	50 %	50 %	0 %	0 %	345006830
7	NC_015955	AT	3	6	3105	3110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015955	TC	4	8	3666	3673	0 %	50 %	0 %	50 %	345006832
9	NC_015955	CG	3	6	4378	4383	0 %	0 %	50 %	50 %	345006832
10	NC_015955	GA	3	6	4387	4392	50 %	0 %	50 %	0 %	345006832
11	NC_015955	CT	4	8	5121	5128	0 %	50 %	0 %	50 %	345006833
12	NC_015955	GA	3	6	5590	5595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015955	AC	3	6	6134	6139	50 %	0 %	0 %	50 %	345006835
14	NC_015955	AG	4	8	6576	6583	50 %	0 %	50 %	0 %	345006835
15	NC_015955	AC	4	8	6779	6786	50 %	0 %	0 %	50 %	345006835
16	NC_015955	CT	3	6	7737	7742	0 %	50 %	0 %	50 %	345006835
17	NC_015955	TC	3	6	7863	7868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015955	TC	3	6	8462	8467	0 %	50 %	0 %	50 %	345006836
19	NC_015955	CT	3	6	8563	8568	0 %	50 %	0 %	50 %	345006836
20	NC_015955	AG	3	6	8773	8778	50 %	0 %	50 %	0 %	345006836
21	NC_015955	TG	3	6	9153	9158	0 %	50 %	50 %	0 %	345006837
22	NC_015955	AG	3	6	9207	9212	50 %	0 %	50 %	0 %	345006837
23	NC_015955	AC	3	6	9530	9535	50 %	0 %	0 %	50 %	345006837
24	NC_015955	AC	3	6	10529	10534	50 %	0 %	0 %	50 %	345006838
25	NC_015955	GT	3	6	11220	11225	0 %	50 %	50 %	0 %	345006839
26	NC_015955	GA	3	6	11542	11547	50 %	0 %	50 %	0 %	345006839
27	NC_015955	AG	3	6	11769	11774	50 %	0 %	50 %	0 %	345006839
28	NC_015955	CT	3	6	12443	12448	0 %	50 %	0 %	50 %	345006839
29	NC_015955	TG	3	6	12909	12914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015955	CG	3	6	13878	13883	0 %	0 %	50 %	50 %	345006840
31	NC_015955	CA	3	6	13933	13938	50 %	0 %	0 %	50 %	345006840
32	NC_015955	CT	3	6	15081	15086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015955	AT	3	6	15134	15139	50 %	50 %	0 %	0 %	345006841
34	NC_015955	AG	3	6	15373	15378	50 %	0 %	50 %	0 %	345006841
35	NC_015955	AT	3	6	16502	16507	50 %	50 %	0 %	0 %	345006841
36	NC_015955	AC	4	8	17284	17291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015955	AC	3	6	17687	17692	50 %	0 %	0 %	50 %	345006842
38	NC_015955	CT	3	6	17714	17719	0 %	50 %	0 %	50 %	345006842
39	NC_015955	CG	3	6	17770	17775	0 %	0 %	50 %	50 %	345006842
40	NC_015955	AC	3	6	17889	17894	50 %	0 %	0 %	50 %	345006842
41	NC_015955	TC	3	6	18175	18180	0 %	50 %	0 %	50 %	345006842
42	NC_015955	AC	3	6	18498	18503	50 %	0 %	0 %	50 %	345006842
43	NC_015955	GA	3	6	18576	18581	50 %	0 %	50 %	0 %	345006842
44	NC_015955	TA	3	6	19123	19128	50 %	50 %	0 %	0 %	345006842
45	NC_015955	TG	3	6	19181	19186	0 %	50 %	50 %	0 %	345006842
46	NC_015955	AC	3	6	19866	19871	50 %	0 %	0 %	50 %	345006842
47	NC_015955	CT	3	6	19889	19894	0 %	50 %	0 %	50 %	345006842
48	NC_015955	CA	3	6	19989	19994	50 %	0 %	0 %	50 %	345006842
49	NC_015955	AG	3	6	20497	20502	50 %	0 %	50 %	0 %	345006842
50	NC_015955	GA	4	8	21989	21996	50 %	0 %	50 %	0 %	345006844
51	NC_015955	AG	3	6	22792	22797	50 %	0 %	50 %	0 %	345006844
52	NC_015955	AT	3	6	23070	23075	50 %	50 %	0 %	0 %	345006844
53	NC_015955	TC	3	6	23264	23269	0 %	50 %	0 %	50 %	345006844
54	NC_015955	AC	4	8	23297	23304	50 %	0 %	0 %	50 %	345006844
55	NC_015955	AG	3	6	23668	23673	50 %	0 %	50 %	0 %	345006844
56	NC_015955	AG	3	6	23910	23915	50 %	0 %	50 %	0 %	345006844
57	NC_015955	CA	3	6	24178	24183	50 %	0 %	0 %	50 %	345006844
58	NC_015955	GA	4	8	24838	24845	50 %	0 %	50 %	0 %	345006845
59	NC_015955	TC	3	6	25127	25132	0 %	50 %	0 %	50 %	345006845
60	NC_015955	CA	3	6	25396	25401	50 %	0 %	0 %	50 %	345006845
61	NC_015955	TC	3	6	25430	25435	0 %	50 %	0 %	50 %	345006845
62	NC_015955	GT	3	6	26069	26074	0 %	50 %	50 %	0 %	345006845
63	NC_015955	AG	3	6	26256	26261	50 %	0 %	50 %	0 %	345006845
64	NC_015955	TC	3	6	26332	26337	0 %	50 %	0 %	50 %	345006845
65	NC_015955	GA	3	6	26348	26353	50 %	0 %	50 %	0 %	345006845
66	NC_015955	AT	3	6	26728	26733	50 %	50 %	0 %	0 %	345006845
67	NC_015955	AT	3	6	27933	27938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015955	CA	3	6	27991	27996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015955	TA	3	6	28118	28123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015955	TC	4	8	28623	28630	0 %	50 %	0 %	50 %	345006846
71	NC_015955	TC	3	6	29013	29018	0 %	50 %	0 %	50 %	345006846
72	NC_015955	AC	3	6	29124	29129	50 %	0 %	0 %	50 %	345006846
73	NC_015955	AT	3	6	30476	30481	50 %	50 %	0 %	0 %	345006847
74	NC_015955	GA	3	6	30990	30995	50 %	0 %	50 %	0 %	345006847
75	NC_015955	AG	3	6	31745	31750	50 %	0 %	50 %	0 %	345006849
76	NC_015955	GA	3	6	31822	31827	50 %	0 %	50 %	0 %	345006849
77	NC_015955	AT	3	6	32038	32043	50 %	50 %	0 %	0 %	345006850
78	NC_015955	GA	3	6	32189	32194	50 %	0 %	50 %	0 %	345006850
79	NC_015955	GA	4	8	32786	32793	50 %	0 %	50 %	0 %	345006850
80	NC_015955	TC	3	6	33130	33135	0 %	50 %	0 %	50 %	345006851
81	NC_015955	AT	3	6	33156	33161	50 %	50 %	0 %	0 %	345006851
82	NC_015955	CT	3	6	33420	33425	0 %	50 %	0 %	50 %	345006851
83	NC_015955	CG	3	6	33783	33788	0 %	0 %	50 %	50 %	345006851
84	NC_015955	AG	3	6	34040	34045	50 %	0 %	50 %	0 %	345006851
85	NC_015955	TC	4	8	34769	34776	0 %	50 %	0 %	50 %	345006852
86	NC_015955	CG	3	6	35481	35486	0 %	0 %	50 %	50 %	345006852
87	NC_015955	GA	3	6	35490	35495	50 %	0 %	50 %	0 %	345006852
88	NC_015955	GA	3	6	36204	36209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015955	CG	3	6	37032	37037	0 %	0 %	50 %	50 %	345006853
90	NC_015955	AC	3	6	37471	37476	50 %	0 %	0 %	50 %	345006853
91	NC_015955	TA	3	6	37791	37796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015955	AC	3	6	37856	37861	50 %	0 %	0 %	50 %	345006855
93	NC_015955	GA	3	6	38112	38117	50 %	0 %	50 %	0 %	345006856
94	NC_015955	AC	3	6	38808	38813	50 %	0 %	0 %	50 %	345006856
95	NC_015955	GT	3	6	40191	40196	0 %	50 %	50 %	0 %	345006859
96	NC_015955	GC	3	6	41825	41830	0 %	0 %	50 %	50 %	345006860
97	NC_015955	AC	3	6	43067	43072	50 %	0 %	0 %	50 %	345006862
98	NC_015955	CT	3	6	43425	43430	0 %	50 %	0 %	50 %	345006862
99	NC_015955	GC	3	6	44312	44317	0 %	0 %	50 %	50 %	345006863
100	NC_015955	GA	3	6	44566	44571	50 %	0 %	50 %	0 %	345006863
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103	NC_015955	TC	3	6	45363	45368	0 %	50 %	0 %	50 %	345006864
104	NC_015955	GC	3	6	45525	45530	0 %	0 %	50 %	50 %	345006864
105	NC_015955	GC	3	6	45656	45661	0 %	0 %	50 %	50 %	345006864
106	NC_015955	AC	3	6	46306	46311	50 %	0 %	0 %	50 %	345006864
107	NC_015955	TC	3	6	46731	46736	0 %	50 %	0 %	50 %	345006864
108	NC_015955	TG	3	6	48828	48833	0 %	50 %	50 %	0 %	345006865
109	NC_015955	GA	3	6	50560	50565	50 %	0 %	50 %	0 %	345006865
110	NC_015955	CA	3	6	50610	50615	50 %	0 %	0 %	50 %	345006865
111	NC_015955	TG	3	6	52182	52187	0 %	50 %	50 %	0 %	345006867
112	NC_015955	CT	3	6	52301	52306	0 %	50 %	0 %	50 %	345006867
113	NC_015955	GA	3	6	53834	53839	50 %	0 %	50 %	0 %	345006868
114	NC_015955	GA	3	6	54035	54040	50 %	0 %	50 %	0 %	345006868
115	NC_015955	AT	3	6	54141	54146	50 %	50 %	0 %	0 %	345006868
116	NC_015955	AG	3	6	54766	54771	50 %	0 %	50 %	0 %	345006868
117	NC_015955	CT	3	6	56001	56006	0 %	50 %	0 %	50 %	345006868
118	NC_015955	AG	3	6	56062	56067	50 %	0 %	50 %	0 %	345006868
119	NC_015955	TG	4	8	56357	56364	0 %	50 %	50 %	0 %	345006868
120	NC_015955	AG	3	6	56487	56492	50 %	0 %	50 %	0 %	345006868
121	NC_015955	TA	3	6	56863	56868	50 %	50 %	0 %	0 %	345006868
122	NC_015955	GA	3	6	57734	57739	50 %	0 %	50 %	0 %	345006868
123	NC_015955	AT	3	6	57919	57924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015955	GA	3	6	58092	58097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015955	CT	3	6	58337	58342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015955	AC	3	6	59244	59249	50 %	0 %	0 %	50 %	345006870
127	NC_015955	GC	3	6	59692	59697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015955	CG	3	6	60305	60310	0 %	0 %	50 %	50 %	345006872
129	NC_015955	GC	4	8	60665	60672	0 %	0 %	50 %	50 %	345006873
130	NC_015955	TG	3	6	60976	60981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015955	GC	3	6	61619	61624	0 %	0 %	50 %	50 %	345006875
132	NC_015955	CG	3	6	61639	61644	0 %	0 %	50 %	50 %	345006875
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134	NC_015955	CG	3	6	62642	62647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015955	GC	3	6	62697	62702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015955	GT	3	6	62812	62817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_015955	TA	3	6	64976	64981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_015955	CG	3	6	68669	68674	0 %	0 %	50 %	50 %	345006884
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145	NC_015955	TG	3	6	69223	69228	0 %	50 %	50 %	0 %	345006884
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