MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 15490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015955	ATC	2	6	114622	114627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_015955	TAT	2	6	114693	114698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_015955	CTA	2	6	114745	114750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_015955	AAT	2	6	114752	114757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_015955	CCA	2	6	114785	114790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2506	NC_015955	TAT	2	6	114814	114819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_015955	GCAA	2	8	114904	114911	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2508	NC_015955	GA	3	6	114974	114979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_015955	GTG	2	6	115013	115018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_015955	CCA	2	6	115020	115025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2511	NC_015955	AGT	3	9	115106	115114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_015955	CGT	2	6	115320	115325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006922
2513	NC_015955	ACG	2	6	115330	115335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006922
2514	NC_015955	GCAG	2	8	115358	115365	25 %	0 %	50 %	25 %	345006922
2515	NC_015955	GACGGC	2	12	115368	115379	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345006922
2516	NC_015955	CGA	2	6	115425	115430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006922
2517	NC_015955	GTC	2	6	115494	115499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006922
2518	NC_015955	ATTG	2	8	115533	115540	25 %	50 %	25 %	0 %	345006922
2519	NC_015955	CAC	2	6	115571	115576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006922
2520	NC_015955	CTC	2	6	115581	115586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006922
2521	NC_015955	GGC	2	6	115622	115627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006922
2522	NC_015955	TTG	2	6	115654	115659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006922
2523	NC_015955	CTG	2	6	115662	115667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006922
2524	NC_015955	CAT	2	6	115715	115720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006922
2525	NC_015955	CTCG	2	8	115907	115914	0 %	25 %	25 %	50 %	345006923
2526	NC_015955	TC	3	6	115919	115924	0 %	50 %	0 %	50 %	345006923
2527	NC_015955	G	6	6	116012	116017	0 %	0 %	100 %	0 %	345006923
2528	NC_015955	TCG	2	6	116059	116064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006923
2529	NC_015955	GT	4	8	116107	116114	0 %	50 %	50 %	0 %	345006923
2530	NC_015955	GTC	3	9	116121	116129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006923
2531	NC_015955	CGA	2	6	116150	116155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006923
2532	NC_015955	GTC	2	6	116211	116216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006923
2533	NC_015955	CCT	2	6	116225	116230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006923
2534	NC_015955	GAG	2	6	116277	116282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006923
2535	NC_015955	CAG	2	6	116295	116300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006923
2536	NC_015955	CGTT	2	8	116310	116317	0 %	50 %	25 %	25 %	345006923
2537	NC_015955	CCG	2	6	116323	116328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006923
2538	NC_015955	ATACA	2	10	116341	116350	60 %	20 %	0 %	20 %	345006923
2539	NC_015955	GCAT	2	8	116397	116404	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2540	NC_015955	CA	3	6	116470	116475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2541	NC_015955	A	6	6	116509	116514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_015955	AC	3	6	116536	116541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2543	NC_015955	AAGTC	2	10	116766	116775	40 %	20 %	20 %	20 %	345006924
2544	NC_015955	TGT	2	6	116797	116802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006924
2545	NC_015955	GTT	2	6	116868	116873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006925
2546	NC_015955	AGG	2	6	116881	116886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006925
2547	NC_015955	GA	3	6	116969	116974	50 %	0 %	50 %	0 %	345006925
2548	NC_015955	AGG	2	6	117034	117039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006925
2549	NC_015955	TAG	2	6	117061	117066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006925
2550	NC_015955	GA	3	6	117082	117087	50 %	0 %	50 %	0 %	345006925
2551	NC_015955	CGGT	2	8	117169	117176	0 %	25 %	50 %	25 %	345006925
2552	NC_015955	ACG	3	9	117314	117322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006926
2553	NC_015955	GCGA	2	8	117323	117330	25 %	0 %	50 %	25 %	345006926
2554	NC_015955	AG	3	6	117352	117357	50 %	0 %	50 %	0 %	345006926
2555	NC_015955	TCA	2	6	117410	117415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006926
2556	NC_015955	CGA	2	6	117444	117449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006926
2557	NC_015955	CT	3	6	117523	117528	0 %	50 %	0 %	50 %	345006926
2558	NC_015955	TCC	2	6	117554	117559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006926
2559	NC_015955	AGC	2	6	117561	117566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006926
2560	NC_015955	AAG	2	6	117586	117591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006926
2561	NC_015955	GC	3	6	117600	117605	0 %	0 %	50 %	50 %	345006926
2562	NC_015955	TCGAT	2	10	117669	117678	20 %	40 %	20 %	20 %	345006926
2563	NC_015955	CCAT	2	8	117737	117744	25 %	25 %	0 %	50 %	345006926
2564	NC_015955	GGA	2	6	117777	117782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006926
2565	NC_015955	AGA	2	6	117826	117831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006926
2566	NC_015955	TTG	2	6	117871	117876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_015955	ACTGT	2	10	117906	117915	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2568	NC_015955	AGT	2	6	117983	117988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_015955	ACG	2	6	117993	117998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_015955	GTC	2	6	118004	118009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006927
2571	NC_015955	CT	3	6	118020	118025	0 %	50 %	0 %	50 %	345006927
2572	NC_015955	CGACG	2	10	118055	118064	20 %	0 %	40 %	40 %	345006927
2573	NC_015955	CCA	2	6	118155	118160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006927
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2575	NC_015955	ATTCC	2	10	118192	118201	20 %	40 %	0 %	40 %	345006927
2576	NC_015955	TTC	2	6	118208	118213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006927
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2578	NC_015955	CGAG	2	8	118339	118346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2579	NC_015955	ACCA	2	8	118374	118381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2580	NC_015955	ACA	2	6	118388	118393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_015955	AAAGA	2	10	118394	118403	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_015955	CAG	2	6	118443	118448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_015955	CAA	2	6	118511	118516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_015955	ACG	2	6	118603	118608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_015955	AG	3	6	118639	118644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_015955	CGG	2	6	118798	118803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006928
2587	NC_015955	ACG	2	6	118805	118810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006928
2588	NC_015955	GAG	2	6	118822	118827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006928
2589	NC_015955	C	6	6	118886	118891	0 %	0 %	0 %	100 %	345006928
2590	NC_015955	GGA	2	6	119031	119036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006928
2591	NC_015955	TA	3	6	119237	119242	50 %	50 %	0 %	0 %	345006928
2592	NC_015955	GACGC	2	10	119347	119356	20 %	0 %	40 %	40 %	345006928
2593	NC_015955	TGA	2	6	119391	119396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006928
2594	NC_015955	GTTT	2	8	119404	119411	0 %	75 %	25 %	0 %	345006928
2595	NC_015955	CGT	2	6	119412	119417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006928
2596	NC_015955	TCG	2	6	119468	119473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006928
2597	NC_015955	CTG	2	6	119516	119521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_015955	CGA	2	6	119546	119551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_015955	ATT	2	6	119605	119610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_015955	AG	3	6	119616	119621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_015955	AATC	2	8	119714	119721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2602	NC_015955	GTC	2	6	119796	119801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_015955	TG	3	6	119858	119863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_015955	GC	3	6	119876	119881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2605	NC_015955	GCT	2	6	119894	119899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_015955	CGTT	2	8	119918	119925	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2607	NC_015955	CAA	2	6	120118	120123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_015955	TCGT	2	8	120139	120146	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2609	NC_015955	GCG	2	6	120194	120199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_015955	GTC	3	9	120226	120234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_015955	CTG	2	6	120291	120296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_015955	TTCG	2	8	120307	120314	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2613	NC_015955	CGA	2	6	120368	120373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_015955	GA	3	6	120400	120405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_015955	GAA	2	6	120410	120415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_015955	AAG	2	6	120520	120525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_015955	CGT	2	6	120535	120540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_015955	T	6	6	120596	120601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_015955	TCG	2	6	120631	120636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_015955	TA	3	6	120793	120798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_015955	TCG	2	6	120831	120836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006929
2622	NC_015955	GAC	2	6	120837	120842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006929
2623	NC_015955	TTC	2	6	120877	120882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006929
2624	NC_015955	CGA	2	6	120893	120898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006929
2625	NC_015955	CGT	2	6	120899	120904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006929
2626	NC_015955	TTGA	2	8	120948	120955	25 %	50 %	25 %	0 %	345006929
2627	NC_015955	ACG	2	6	120979	120984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006929
2628	NC_015955	CGA	2	6	121073	121078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006929
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2630	NC_015955	GTC	2	6	121152	121157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006929
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2992	NC_015955	CGATG	2	10	138242	138251	20 %	20 %	40 %	20 %	345006941
2993	NC_015955	AAC	2	6	138268	138273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006941
2994	NC_015955	GGA	2	6	138293	138298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006941
2995	NC_015955	CAA	2	6	138302	138307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006941
2996	NC_015955	TGAC	2	8	138344	138351	25 %	25 %	25 %	25 %	345006941
2997	NC_015955	CGT	2	6	138375	138380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006942
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3000	NC_015955	GGCA	2	8	138486	138493	25 %	0 %	50 %	25 %	345006942

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