MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 15490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_015955	CGA	2	6	684027	684032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007434
15002	NC_015955	TCG	2	6	684058	684063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007434
15003	NC_015955	GAG	2	6	684105	684110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007434
15004	NC_015955	CG	3	6	684137	684142	0 %	0 %	50 %	50 %	345007434
15005	NC_015955	TC	3	6	684146	684151	0 %	50 %	0 %	50 %	345007434
15006	NC_015955	ACT	2	6	684184	684189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007434
15007	NC_015955	TGGG	2	8	684212	684219	0 %	25 %	75 %	0 %	345007434
15008	NC_015955	GCG	2	6	684257	684262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007434
15009	NC_015955	GCG	2	6	684304	684309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007434
15010	NC_015955	AGC	2	6	684310	684315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007434
15011	NC_015955	CAG	2	6	684325	684330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007434
15012	NC_015955	AAC	2	6	684340	684345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007434
15013	NC_015955	TC	3	6	684347	684352	0 %	50 %	0 %	50 %	345007434
15014	NC_015955	CGA	2	6	684359	684364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007434
15015	NC_015955	GAC	2	6	684384	684389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007434
15016	NC_015955	CGAC	2	8	684394	684401	25 %	0 %	25 %	50 %	345007434
15017	NC_015955	CGCGG	2	10	684468	684477	0 %	0 %	60 %	40 %	345007434
15018	NC_015955	CGA	2	6	684488	684493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007434
15019	NC_015955	CGG	2	6	684504	684509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007434
15020	NC_015955	GAA	2	6	684572	684577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007434
15021	NC_015955	GAC	2	6	684588	684593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007434
15022	NC_015955	CCG	2	6	684610	684615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007434
15023	NC_015955	GAC	2	6	684660	684665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007434
15024	NC_015955	CA	3	6	684713	684718	50 %	0 %	0 %	50 %	345007434
15025	NC_015955	ACG	2	6	684820	684825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007434
15026	NC_015955	CGC	2	6	684829	684834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007434
15027	NC_015955	CGA	2	6	684902	684907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007434
15028	NC_015955	CGGCG	2	10	684939	684948	0 %	0 %	60 %	40 %	345007434
15029	NC_015955	GGC	2	6	684986	684991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007434
15030	NC_015955	GC	3	6	684990	684995	0 %	0 %	50 %	50 %	345007434
15031	NC_015955	GAG	2	6	685011	685016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007434
15032	NC_015955	ACT	2	6	685030	685035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007434
15033	NC_015955	GC	3	6	685064	685069	0 %	0 %	50 %	50 %	345007434
15034	NC_015955	ACC	2	6	685099	685104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007434
15035	NC_015955	ACT	2	6	685116	685121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007434
15036	NC_015955	GAC	2	6	685122	685127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007434
15037	NC_015955	CGA	2	6	685275	685280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007435
15038	NC_015955	CGA	2	6	685299	685304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007435
15039	NC_015955	CGA	2	6	685347	685352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007435
15040	NC_015955	TCC	3	9	685376	685384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007435
15041	NC_015955	AGC	2	6	685415	685420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007435
15042	NC_015955	TCGG	2	8	685429	685436	0 %	25 %	50 %	25 %	345007435
15043	NC_015955	GTCT	2	8	685534	685541	0 %	50 %	25 %	25 %	345007435
15044	NC_015955	CT	3	6	685544	685549	0 %	50 %	0 %	50 %	345007435
15045	NC_015955	CGA	2	6	685602	685607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007435
15046	NC_015955	CTT	2	6	685653	685658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007435
15047	NC_015955	GTC	3	9	685669	685677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007435
15048	NC_015955	CTT	2	6	685699	685704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007435
15049	NC_015955	TCA	2	6	685713	685718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007435
15050	NC_015955	ACC	2	6	685723	685728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007436
15051	NC_015955	CT	3	6	685755	685760	0 %	50 %	0 %	50 %	345007436
15052	NC_015955	GGT	2	6	685762	685767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007436
15053	NC_015955	GTC	2	6	685844	685849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007436
15054	NC_015955	CTT	2	6	685877	685882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007436
15055	NC_015955	CGA	2	6	685883	685888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007436
15056	NC_015955	CATC	2	8	685922	685929	25 %	25 %	0 %	50 %	345007436
15057	NC_015955	CGC	2	6	685953	685958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007436
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15059	NC_015955	TCG	2	6	686006	686011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007436
15060	NC_015955	CG	3	6	686188	686193	0 %	0 %	50 %	50 %	345007436
15061	NC_015955	GAT	2	6	686202	686207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007436
15062	NC_015955	GAC	2	6	686208	686213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007436
15063	NC_015955	GTC	2	6	686220	686225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007436
15064	NC_015955	TTC	2	6	686236	686241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007436
15065	NC_015955	GCT	2	6	686261	686266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007436
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15070	NC_015955	ATC	2	6	686454	686459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007436
15071	NC_015955	AGGT	2	8	686482	686489	25 %	25 %	50 %	0 %	345007436
15072	NC_015955	TGG	2	6	686503	686508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007436
15073	NC_015955	CGT	2	6	686574	686579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007436
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15075	NC_015955	TTCC	2	8	686770	686777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15076	NC_015955	ATC	2	6	686846	686851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15079	NC_015955	ATC	2	6	686919	686924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007437
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15082	NC_015955	CGG	2	6	687023	687028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007438
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15086	NC_015955	GAACT	2	10	687217	687226	40 %	20 %	20 %	20 %	345007438
15087	NC_015955	GCCG	2	8	687281	687288	0 %	0 %	50 %	50 %	345007438
15088	NC_015955	TCA	2	6	687328	687333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007438
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15104	NC_015955	GTC	2	6	687959	687964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15105	NC_015955	CGAG	2	8	688029	688036	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15106	NC_015955	CGA	2	6	688126	688131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007439
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15110	NC_015955	CGA	2	6	688195	688200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007439
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15120	NC_015955	GAA	2	6	688672	688677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007439
15121	NC_015955	TGG	2	6	688695	688700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007439
15122	NC_015955	CTT	2	6	688808	688813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007439
15123	NC_015955	TCC	2	6	688853	688858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007439
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15131	NC_015955	TCA	2	6	689067	689072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15132	NC_015955	CGA	2	6	689110	689115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15159	NC_015955	CT	3	6	690953	690958	0 %	50 %	0 %	50 %	345007442
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15180	NC_015955	GAAG	2	8	691827	691834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15181	NC_015955	AGT	2	6	691850	691855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15182	NC_015955	CTG	2	6	691856	691861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15183	NC_015955	CGA	2	6	691977	691982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15185	NC_015955	ACGG	2	8	691990	691997	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15186	NC_015955	GCTGTC	2	12	692009	692020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15188	NC_015955	GCC	2	6	692032	692037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15189	NC_015955	CACT	2	8	692054	692061	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15190	NC_015955	TCGG	2	8	692074	692081	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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15215	NC_015955	AGCA	2	8	693258	693265	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15216	NC_015955	CTAA	2	8	693272	693279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15217	NC_015955	ACG	2	6	693304	693309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15222	NC_015955	AG	3	6	693441	693446	50 %	0 %	50 %	0 %	345007445
15223	NC_015955	CGGG	2	8	693566	693573	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15224	NC_015955	TA	3	6	693599	693604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15225	NC_015955	TGC	2	6	693640	693645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15228	NC_015955	AAGA	3	12	693674	693685	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15229	NC_015955	GA	3	6	693684	693689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15230	NC_015955	AAGA	2	8	693690	693697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15231	NC_015955	ACG	2	6	693703	693708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15235	NC_015955	CAT	2	6	694043	694048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007446
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15239	NC_015955	TCT	2	6	694328	694333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007446
15240	NC_015955	TG	3	6	694462	694467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15242	NC_015955	AGA	2	6	694569	694574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15490	NC_015955	ATC	2	6	705786	705791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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