MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 15490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015955	TGG	2	6	46943	46948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006864
1002	NC_015955	CGA	2	6	47058	47063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006864
1003	NC_015955	GGA	2	6	47082	47087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006864
1004	NC_015955	AAG	2	6	47093	47098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006864
1005	NC_015955	AACG	2	8	47115	47122	50 %	0 %	25 %	25 %	345006864
1006	NC_015955	CGG	2	6	47181	47186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006864
1007	NC_015955	TCG	2	6	47306	47311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1008	NC_015955	ACC	2	6	47350	47355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006865
1009	NC_015955	TTC	2	6	47405	47410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006865
1010	NC_015955	TCGACG	2	12	47490	47501	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1011	NC_015955	GCC	2	6	47504	47509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006865
1012	NC_015955	CCAG	2	8	47518	47525	25 %	0 %	25 %	50 %	345006865
1013	NC_015955	TCG	2	6	47547	47552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1014	NC_015955	GGC	2	6	47568	47573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006865
1015	NC_015955	TCG	2	6	47610	47615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1016	NC_015955	AGCCGA	2	12	47641	47652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1017	NC_015955	CGT	2	6	47656	47661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1018	NC_015955	CGG	2	6	47665	47670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006865
1019	NC_015955	ATC	2	6	47694	47699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006865
1020	NC_015955	GCC	2	6	47734	47739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006865
1021	NC_015955	GAC	2	6	47753	47758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1022	NC_015955	CGG	2	6	47799	47804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006865
1023	NC_015955	CGC	2	6	47841	47846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006865
1024	NC_015955	GGT	2	6	47856	47861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006865
1025	NC_015955	AGA	2	6	47917	47922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006865
1026	NC_015955	CCG	2	6	47943	47948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006865
1027	NC_015955	CGGCG	2	10	47956	47965	0 %	0 %	60 %	40 %	345006865
1028	NC_015955	ACC	2	6	47982	47987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006865
1029	NC_015955	GTC	2	6	48020	48025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1030	NC_015955	TCG	2	6	48078	48083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1031	NC_015955	TTC	2	6	48098	48103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006865
1032	NC_015955	GTC	2	6	48110	48115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1033	NC_015955	GAG	2	6	48134	48139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006865
1034	NC_015955	GAC	2	6	48155	48160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1035	NC_015955	GAA	2	6	48208	48213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006865
1036	NC_015955	GCC	2	6	48245	48250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006865
1037	NC_015955	CGA	2	6	48262	48267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1038	NC_015955	ACG	2	6	48273	48278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1039	NC_015955	CTC	2	6	48302	48307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006865
1040	NC_015955	GAA	2	6	48394	48399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006865
1041	NC_015955	CCT	2	6	48421	48426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006865
1042	NC_015955	GAC	2	6	48439	48444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1043	NC_015955	TCGTCC	2	12	48501	48512	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	345006865
1044	NC_015955	CCT	2	6	48513	48518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006865
1045	NC_015955	CAG	2	6	48563	48568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1046	NC_015955	CAG	2	6	48608	48613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1047	NC_015955	AGG	2	6	48618	48623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006865
1048	NC_015955	CGA	2	6	48646	48651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1049	NC_015955	CCG	2	6	48686	48691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006865
1050	NC_015955	TGG	2	6	48730	48735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006865
1051	NC_015955	CAT	2	6	48751	48756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006865
1052	NC_015955	ACG	2	6	48759	48764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1053	NC_015955	TGG	2	6	48787	48792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006865
1054	NC_015955	CGT	2	6	48796	48801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1055	NC_015955	TCG	2	6	48804	48809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1056	NC_015955	TG	3	6	48828	48833	0 %	50 %	50 %	0 %	345006865
1057	NC_015955	GAC	2	6	48875	48880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1058	NC_015955	CGTTCT	2	12	48915	48926	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	345006865
1059	NC_015955	TCC	2	6	49005	49010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006865
1060	NC_015955	GAT	2	6	49012	49017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006865
1061	NC_015955	TCG	2	6	49047	49052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1062	NC_015955	CGA	2	6	49090	49095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1063	NC_015955	GAC	2	6	49124	49129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
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1065	NC_015955	ACC	2	6	49236	49241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006865
1066	NC_015955	CGG	2	6	49307	49312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006865
1067	NC_015955	ACG	2	6	49338	49343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1068	NC_015955	CCA	2	6	49398	49403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006865
1069	NC_015955	AGCG	2	8	49440	49447	25 %	0 %	50 %	25 %	345006865
1070	NC_015955	TCA	2	6	49536	49541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006865
1071	NC_015955	GAG	2	6	49544	49549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006865
1072	NC_015955	CGA	2	6	49566	49571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1073	NC_015955	AGC	2	6	49584	49589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1074	NC_015955	CGGAAC	2	12	49655	49666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1075	NC_015955	ACG	2	6	49677	49682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
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1078	NC_015955	CCGA	2	8	49772	49779	25 %	0 %	25 %	50 %	345006865
1079	NC_015955	GCG	2	6	49809	49814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006865
1080	NC_015955	CGT	2	6	49839	49844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1081	NC_015955	CCG	3	9	49859	49867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006865
1082	NC_015955	GGA	2	6	50032	50037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006865
1083	NC_015955	GTA	2	6	50049	50054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006865
1084	NC_015955	ACG	2	6	50066	50071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1085	NC_015955	CGAC	2	8	50097	50104	25 %	0 %	25 %	50 %	345006865
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1087	NC_015955	CGA	2	6	50133	50138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1088	NC_015955	GACG	2	8	50236	50243	25 %	0 %	50 %	25 %	345006865
1089	NC_015955	AGC	2	6	50263	50268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1090	NC_015955	AGC	2	6	50303	50308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1091	NC_015955	GAC	2	6	50354	50359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1092	NC_015955	TGA	2	6	50388	50393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006865
1093	NC_015955	GAC	2	6	50402	50407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1094	NC_015955	ACG	2	6	50451	50456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1095	NC_015955	CCT	2	6	50488	50493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006865
1096	NC_015955	TAC	2	6	50522	50527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006865
1097	NC_015955	TCC	2	6	50532	50537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006865
1098	NC_015955	CCT	2	6	50551	50556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006865
1099	NC_015955	GA	3	6	50560	50565	50 %	0 %	50 %	0 %	345006865
1100	NC_015955	CA	3	6	50610	50615	50 %	0 %	0 %	50 %	345006865
1101	NC_015955	CCT	2	6	50629	50634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006865
1102	NC_015955	CAG	2	6	50648	50653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1103	NC_015955	GAC	2	6	50657	50662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1104	NC_015955	TAC	2	6	50681	50686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006865
1105	NC_015955	CGA	2	6	50692	50697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1106	NC_015955	CGA	2	6	50725	50730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1107	NC_015955	TAA	2	6	50773	50778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345006865
1108	NC_015955	CAA	2	6	50845	50850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006865
1109	NC_015955	GATCG	2	10	50894	50903	20 %	20 %	40 %	20 %	345006865
1110	NC_015955	GCGG	3	12	50916	50927	0 %	0 %	75 %	25 %	345006865
1111	NC_015955	TGC	2	6	50971	50976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006865
1112	NC_015955	ACC	2	6	50984	50989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006865
1113	NC_015955	GAG	2	6	51052	51057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006866
1114	NC_015955	CTA	2	6	51066	51071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006866
1115	NC_015955	GAG	2	6	51076	51081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006866
1116	NC_015955	GAC	2	6	51097	51102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006866
1117	NC_015955	TCA	2	6	51113	51118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006866
1118	NC_015955	CGG	2	6	51205	51210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006866
1119	NC_015955	ACG	2	6	51244	51249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006866
1120	NC_015955	CGA	2	6	51258	51263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006866
1121	NC_015955	CGT	2	6	51273	51278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006866
1122	NC_015955	CTA	2	6	51384	51389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006866
1123	NC_015955	CGA	2	6	51489	51494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006866
1124	NC_015955	GAC	2	6	51499	51504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006866
1125	NC_015955	CTC	2	6	51511	51516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006866
1126	NC_015955	CGC	2	6	51537	51542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006866
1127	NC_015955	GAG	2	6	51637	51642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006866
1128	NC_015955	CCT	2	6	51681	51686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006866
1129	NC_015955	ACG	2	6	51710	51715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006866
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1131	NC_015955	CGT	2	6	51777	51782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006866
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1135	NC_015955	CGA	2	6	51903	51908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006866
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1137	NC_015955	CGT	2	6	52025	52030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006867
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1169	NC_015955	CTG	2	6	53489	53494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1181	NC_015955	AGCGCT	2	12	54058	54069	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345006868
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1239	NC_015955	CAGT	2	8	56628	56635	25 %	25 %	25 %	25 %	345006868
1240	NC_015955	CAGAC	2	10	56690	56699	40 %	0 %	20 %	40 %	345006868
1241	NC_015955	AGGA	2	8	56710	56717	50 %	0 %	50 %	0 %	345006868
1242	NC_015955	GGTC	2	8	56760	56767	0 %	25 %	50 %	25 %	345006868
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1248	NC_015955	GCA	2	6	57007	57012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006868
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1252	NC_015955	CGA	2	6	57221	57226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006868
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1373	NC_015955	ATC	2	6	62372	62377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006877
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1380	NC_015955	CGC	2	6	62690	62695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1386	NC_015955	CGC	2	6	62838	62843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1499	NC_015955	TC	3	6	67832	67837	0 %	50 %	0 %	50 %	345006883
1500	NC_015955	GTG	2	6	67864	67869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006883

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