MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 15490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015955	CATG	2	8	502567	502574	25 %	25 %	25 %	25 %	345007270
11002	NC_015955	TCAC	2	8	502609	502616	25 %	25 %	0 %	50 %	345007270
11003	NC_015955	ACG	2	6	502638	502643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007270
11004	NC_015955	CTC	2	6	502694	502699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007270
11005	NC_015955	GTC	3	9	502734	502742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007270
11006	NC_015955	GTC	2	6	502839	502844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007270
11007	NC_015955	CGA	2	6	502895	502900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007270
11008	NC_015955	G	6	6	502932	502937	0 %	0 %	100 %	0 %	345007270
11009	NC_015955	CCT	2	6	502940	502945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007270
11010	NC_015955	TTC	2	6	503023	503028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007270
11011	NC_015955	TCG	2	6	503086	503091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007270
11012	NC_015955	ACC	2	6	503172	503177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007270
11013	NC_015955	ATG	2	6	503293	503298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007270
11014	NC_015955	TCT	2	6	503362	503367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_015955	CAG	2	6	503417	503422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_015955	CAG	2	6	503449	503454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_015955	ACC	2	6	503473	503478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11018	NC_015955	AT	3	6	503500	503505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_015955	TAA	2	6	503507	503512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_015955	TC	3	6	503520	503525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11021	NC_015955	GCAC	2	8	503555	503562	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11022	NC_015955	CT	3	6	503631	503636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11023	NC_015955	CAA	2	6	503663	503668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_015955	TCC	2	6	503699	503704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007271
11025	NC_015955	GTC	2	6	503764	503769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007271
11026	NC_015955	TCG	3	9	503837	503845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007271
11027	NC_015955	TCG	2	6	503870	503875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007271
11028	NC_015955	TCA	2	6	503986	503991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_015955	GACG	2	8	504123	504130	25 %	0 %	50 %	25 %	345007272
11030	NC_015955	CAG	2	6	504241	504246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007272
11031	NC_015955	GGA	2	6	504252	504257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007272
11032	NC_015955	GTC	2	6	504276	504281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007272
11033	NC_015955	TCG	2	6	504320	504325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007272
11034	NC_015955	AGG	2	6	504326	504331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007272
11035	NC_015955	AGC	2	6	504337	504342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007272
11036	NC_015955	TGA	2	6	504510	504515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007272
11037	NC_015955	GTA	2	6	504579	504584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007272
11038	NC_015955	AGA	2	6	504705	504710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007273
11039	NC_015955	GAC	2	6	504738	504743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007273
11040	NC_015955	GAA	2	6	504763	504768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007273
11041	NC_015955	CAT	2	6	504843	504848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007273
11042	NC_015955	GAG	2	6	505045	505050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007273
11043	NC_015955	GGA	2	6	505053	505058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007273
11044	NC_015955	GAG	2	6	505069	505074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007273
11045	NC_015955	CTG	2	6	505094	505099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007273
11046	NC_015955	ATATA	2	10	505139	505148	60 %	40 %	0 %	0 %	345007273
11047	NC_015955	CGT	2	6	505188	505193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007273
11048	NC_015955	TAA	2	6	505281	505286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345007273
11049	NC_015955	GA	3	6	505475	505480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_015955	AGCC	2	8	505503	505510	25 %	0 %	25 %	50 %	345007274
11051	NC_015955	GAT	2	6	505519	505524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007274
11052	NC_015955	GTA	2	6	505588	505593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007274
11053	NC_015955	CTT	2	6	505650	505655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007274
11054	NC_015955	GCT	2	6	505764	505769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007274
11055	NC_015955	TCT	2	6	505808	505813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007274
11056	NC_015955	TCG	2	6	505908	505913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007274
11057	NC_015955	GTC	2	6	505975	505980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007274
11058	NC_015955	CTA	2	6	506030	506035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007274
11059	NC_015955	TTC	2	6	506048	506053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007274
11060	NC_015955	GA	3	6	506081	506086	50 %	0 %	50 %	0 %	345007274
11061	NC_015955	CTG	2	6	506088	506093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007274
11062	NC_015955	ACC	2	6	506114	506119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007274
11063	NC_015955	GAAA	3	12	506122	506133	75 %	0 %	25 %	0 %	345007274
11064	NC_015955	CCA	2	6	506138	506143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007274
11065	NC_015955	AG	3	6	506191	506196	50 %	0 %	50 %	0 %	345007274
11066	NC_015955	AATA	2	8	506274	506281	75 %	25 %	0 %	0 %	345007274
11067	NC_015955	CAG	2	6	506349	506354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007274
11068	NC_015955	CGA	2	6	506370	506375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007274
11069	NC_015955	GAG	2	6	506386	506391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007274
11070	NC_015955	CAATA	2	10	506392	506401	60 %	20 %	0 %	20 %	345007274
11071	NC_015955	CTC	2	6	506431	506436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007274
11072	NC_015955	GAT	2	6	506457	506462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_015955	TCGGT	2	10	506533	506542	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11074	NC_015955	GGT	2	6	506596	506601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_015955	TTG	2	6	506608	506613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_015955	AAGTT	2	10	506637	506646	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_015955	CAC	2	6	506651	506656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11078	NC_015955	CTGA	2	8	506785	506792	25 %	25 %	25 %	25 %	345007275
11079	NC_015955	GTC	2	6	506821	506826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007275
11080	NC_015955	GGC	2	6	506904	506909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007275
11081	NC_015955	TCG	2	6	506942	506947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007275
11082	NC_015955	AAC	2	6	506956	506961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007275
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11088	NC_015955	CGC	2	6	507093	507098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007275
11089	NC_015955	TCG	2	6	507125	507130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007275
11090	NC_015955	ACC	2	6	507145	507150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007275
11091	NC_015955	GAA	2	6	507160	507165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007275
11092	NC_015955	AAG	2	6	507172	507177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007275
11093	NC_015955	CAT	2	6	507270	507275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007275
11094	NC_015955	AGG	2	6	507299	507304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007275
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11097	NC_015955	ACG	2	6	507381	507386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007275
11098	NC_015955	TGT	2	6	507461	507466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007275
11099	NC_015955	CGC	2	6	507479	507484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007275
11100	NC_015955	AGG	2	6	507566	507571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007275
11101	NC_015955	TGA	2	6	507584	507589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007275
11102	NC_015955	CGC	2	6	507592	507597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007275
11103	NC_015955	CGA	2	6	507678	507683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007275
11104	NC_015955	GAG	2	6	507748	507753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007275
11105	NC_015955	CGC	2	6	507759	507764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007275
11106	NC_015955	CAG	2	6	507820	507825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007275
11107	NC_015955	GAA	2	6	507831	507836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007275
11108	NC_015955	AGGC	2	8	507854	507861	25 %	0 %	50 %	25 %	345007275
11109	NC_015955	GAA	2	6	507964	507969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007275
11110	NC_015955	CGG	2	6	507972	507977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007275
11111	NC_015955	CTG	2	6	507989	507994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007275
11112	NC_015955	AGCGCC	2	12	508235	508246	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345007275
11113	NC_015955	CGAC	2	8	508286	508293	25 %	0 %	25 %	50 %	345007275
11114	NC_015955	GGGA	2	8	508301	508308	25 %	0 %	75 %	0 %	345007275
11115	NC_015955	CAT	2	6	508329	508334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007275
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11117	NC_015955	TTC	2	6	508435	508440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007275
11118	NC_015955	CAT	2	6	508458	508463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007275
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11120	NC_015955	CGA	2	6	508488	508493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007275
11121	NC_015955	GAG	2	6	508498	508503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007275
11122	NC_015955	GA	3	6	508589	508594	50 %	0 %	50 %	0 %	345007275
11123	NC_015955	CGT	2	6	508605	508610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007275
11124	NC_015955	CGA	2	6	508611	508616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007275
11125	NC_015955	CGA	2	6	508662	508667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007275
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11144	NC_015955	CGA	2	6	509307	509312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007275
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11231	NC_015955	TCT	2	6	513555	513560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11234	NC_015955	CAA	2	6	513691	513696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11235	NC_015955	GAT	2	6	513712	513717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11237	NC_015955	CTC	2	6	513743	513748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11238	NC_015955	TCG	2	6	513789	513794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11239	NC_015955	ATG	2	6	513813	513818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11240	NC_015955	CCG	2	6	513885	513890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11242	NC_015955	CTT	2	6	514042	514047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11243	NC_015955	TTC	2	6	514052	514057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11244	NC_015955	TCC	2	6	514074	514079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11245	NC_015955	CGT	2	6	514135	514140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11246	NC_015955	TCT	2	6	514204	514209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11247	NC_015955	CGA	2	6	514299	514304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11250	NC_015955	TGCA	2	8	514434	514441	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11251	NC_015955	CGC	2	6	514605	514610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11368	NC_015955	CGA	2	6	519737	519742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007281
11369	NC_015955	TCG	2	6	519778	519783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007281
11370	NC_015955	TCG	2	6	519913	519918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007281
11371	NC_015955	GAT	2	6	520046	520051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11372	NC_015955	CTT	2	6	520136	520141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11373	NC_015955	CTGT	2	8	520202	520209	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11374	NC_015955	CTC	2	6	520247	520252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11375	NC_015955	G	6	6	520324	520329	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11376	NC_015955	TC	3	6	520412	520417	0 %	50 %	0 %	50 %	345007282
11377	NC_015955	TC	3	6	520420	520425	0 %	50 %	0 %	50 %	345007282
11378	NC_015955	AGT	3	9	520433	520441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007282
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11380	NC_015955	CGT	2	6	520490	520495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007282
11381	NC_015955	TCG	2	6	520504	520509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007282
11382	NC_015955	CTG	2	6	520661	520666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007282
11383	NC_015955	CAA	2	6	520713	520718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11384	NC_015955	ATC	2	6	520748	520753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007283
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11386	NC_015955	CGG	2	6	520825	520830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007283
11387	NC_015955	GCC	2	6	520842	520847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007283
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11395	NC_015955	CGA	2	6	521249	521254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007283
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11407	NC_015955	TTG	2	6	521659	521664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11408	NC_015955	GAT	2	6	521709	521714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007284
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11414	NC_015955	CGT	2	6	521885	521890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007284
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11429	NC_015955	CGC	2	6	522664	522669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11430	NC_015955	ACC	2	6	522691	522696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11431	NC_015955	TCG	2	6	522760	522765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007285
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11439	NC_015955	CGG	2	6	523131	523136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007286
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11445	NC_015955	GTC	2	6	523366	523371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007286
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11461	NC_015955	GAA	2	6	524044	524049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11462	NC_015955	GCG	2	6	524072	524077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11465	NC_015955	CAA	2	6	524189	524194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11472	NC_015955	TCG	2	6	524509	524514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11475	NC_015955	GA	3	6	524790	524795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11476	NC_015955	AGC	2	6	524797	524802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11477	NC_015955	ACAG	2	8	524826	524833	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11478	NC_015955	GTA	2	6	524858	524863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11479	NC_015955	TGA	3	9	524962	524970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007289
11480	NC_015955	GAT	2	6	524999	525004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007289
11481	NC_015955	G	7	7	525005	525011	0 %	0 %	100 %	0 %	345007289
11482	NC_015955	TGG	2	6	525015	525020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007289
11483	NC_015955	TCG	2	6	525048	525053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007289
11484	NC_015955	TGT	2	6	525085	525090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007289
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11486	NC_015955	GTT	2	6	525182	525187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007289
11487	NC_015955	GAT	2	6	525200	525205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007289
11488	NC_015955	GAT	2	6	525208	525213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007289
11489	NC_015955	ATCG	2	8	525242	525249	25 %	25 %	25 %	25 %	345007289
11490	NC_015955	GTC	2	6	525343	525348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007289
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