MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 15490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015955	CAC	2	6	479244	479249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007252
10502	NC_015955	TGA	2	6	479259	479264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007252
10503	NC_015955	GAGTAC	2	12	479293	479304	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345007252
10504	NC_015955	GAC	2	6	479320	479325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007252
10505	NC_015955	CTG	2	6	479354	479359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007252
10506	NC_015955	GAC	2	6	479362	479367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007252
10507	NC_015955	GTT	2	6	479371	479376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007252
10508	NC_015955	ACGGG	2	10	479439	479448	20 %	0 %	60 %	20 %	345007252
10509	NC_015955	TCG	2	6	479501	479506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007252
10510	NC_015955	TGA	2	6	479633	479638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_015955	AGC	3	9	479694	479702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_015955	AAC	2	6	479704	479709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_015955	ATC	2	6	479830	479835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10514	NC_015955	CAA	2	6	479850	479855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_015955	GTAT	2	8	479926	479933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_015955	CAAC	2	8	480077	480084	50 %	0 %	0 %	50 %	345007253
10517	NC_015955	TCT	2	6	480284	480289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007254
10518	NC_015955	GTAA	2	8	480316	480323	50 %	25 %	25 %	0 %	345007254
10519	NC_015955	TCCA	2	8	480341	480348	25 %	25 %	0 %	50 %	345007254
10520	NC_015955	CGC	2	6	480373	480378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007254
10521	NC_015955	CCG	2	6	480500	480505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007254
10522	NC_015955	ATA	2	6	480530	480535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345007254
10523	NC_015955	TGA	2	6	480552	480557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007254
10524	NC_015955	TCG	2	6	480584	480589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007254
10525	NC_015955	CT	3	6	480687	480692	0 %	50 %	0 %	50 %	345007254
10526	NC_015955	ATG	2	6	480740	480745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007254
10527	NC_015955	TTG	2	6	480751	480756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007254
10528	NC_015955	TCT	2	6	480780	480785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007254
10529	NC_015955	C	6	6	480839	480844	0 %	0 %	0 %	100 %	345007254
10530	NC_015955	TCA	2	6	480896	480901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007254
10531	NC_015955	TTC	2	6	480955	480960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007254
10532	NC_015955	CAA	2	6	481059	481064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007254
10533	NC_015955	TCT	2	6	481109	481114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007254
10534	NC_015955	ACT	2	6	481129	481134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007254
10535	NC_015955	CGG	2	6	481158	481163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007254
10536	NC_015955	ACG	2	6	481172	481177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007254
10537	NC_015955	AGTAT	2	10	481218	481227	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_015955	AAT	2	6	481230	481235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_015955	ATT	2	6	481277	481282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_015955	TCT	2	6	481298	481303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10541	NC_015955	ATAA	2	8	481304	481311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_015955	TGG	2	6	481315	481320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_015955	GT	3	6	481354	481359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_015955	GCT	2	6	481375	481380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007255
10545	NC_015955	TTC	2	6	481433	481438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007255
10546	NC_015955	ATA	2	6	481480	481485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345007255
10547	NC_015955	CGT	2	6	481644	481649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007255
10548	NC_015955	GCC	2	6	481667	481672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007255
10549	NC_015955	TTCC	2	8	481683	481690	0 %	50 %	0 %	50 %	345007255
10550	NC_015955	TCCA	2	8	481736	481743	25 %	25 %	0 %	50 %	345007255
10551	NC_015955	ACCGGA	2	12	481853	481864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007256
10552	NC_015955	GTT	2	6	481909	481914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007256
10553	NC_015955	CGGCA	2	10	481921	481930	20 %	0 %	40 %	40 %	345007256
10554	NC_015955	GAT	2	6	482042	482047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007256
10555	NC_015955	TCG	2	6	482064	482069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007256
10556	NC_015955	CCAGTC	2	12	482108	482119	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007256
10557	NC_015955	CTCG	2	8	482206	482213	0 %	25 %	25 %	50 %	345007257
10558	NC_015955	CGAA	2	8	482279	482286	50 %	0 %	25 %	25 %	345007257
10559	NC_015955	TGT	2	6	482298	482303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007257
10560	NC_015955	GA	3	6	482336	482341	50 %	0 %	50 %	0 %	345007257
10561	NC_015955	CGA	2	6	482383	482388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007257
10562	NC_015955	GCG	2	6	482496	482501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10563	NC_015955	TATT	2	8	482593	482600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_015955	GT	3	6	482627	482632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_015955	TC	3	6	482749	482754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10566	NC_015955	AAC	2	6	482794	482799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10567	NC_015955	ACC	2	6	482812	482817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10568	NC_015955	ATCT	2	8	482873	482880	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10569	NC_015955	GAA	2	6	482881	482886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_015955	GCA	2	6	482975	482980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007258
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10572	NC_015955	GAGAT	2	10	483053	483062	40 %	20 %	40 %	0 %	345007258
10573	NC_015955	AGA	2	6	483081	483086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007258
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10575	NC_015955	CGG	2	6	483149	483154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007258
10576	NC_015955	TGC	2	6	483197	483202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007258
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10580	NC_015955	CTG	2	6	483394	483399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007258
10581	NC_015955	CGA	2	6	483486	483491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007258
10582	NC_015955	GGA	2	6	483585	483590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007259
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10587	NC_015955	CCG	2	6	483743	483748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007259
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10589	NC_015955	GC	3	6	483786	483791	0 %	0 %	50 %	50 %	345007259
10590	NC_015955	CG	3	6	483793	483798	0 %	0 %	50 %	50 %	345007259
10591	NC_015955	TCG	2	6	483812	483817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007259
10592	NC_015955	GCT	2	6	483849	483854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10593	NC_015955	TTGC	2	8	483902	483909	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10594	NC_015955	GCC	2	6	483925	483930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10595	NC_015955	GTT	2	6	483934	483939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_015955	ATT	2	6	483967	483972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_015955	CTGG	2	8	484062	484069	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10598	NC_015955	TTGTT	2	10	484088	484097	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_015955	AAG	2	6	484117	484122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_015955	TCGT	2	8	484139	484146	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10601	NC_015955	TAG	2	6	484254	484259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10604	NC_015955	TGA	2	6	484477	484482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007260
10605	NC_015955	TCC	2	6	484511	484516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007260
10606	NC_015955	TCA	2	6	484544	484549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007260
10607	NC_015955	TCC	2	6	484586	484591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007260
10608	NC_015955	AGT	2	6	484636	484641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007260
10609	NC_015955	TCA	2	6	484664	484669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007260
10610	NC_015955	TCG	2	6	484685	484690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007260
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10612	NC_015955	GTTT	2	8	484715	484722	0 %	75 %	25 %	0 %	345007260
10613	NC_015955	GTC	2	6	484750	484755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007260
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10617	NC_015955	ATC	2	6	484928	484933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007261
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10619	NC_015955	TTG	2	6	485127	485132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007261
10620	NC_015955	AG	3	6	485204	485209	50 %	0 %	50 %	0 %	345007261
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