MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 15490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015955	CAG	2	6	211503	211508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007009
4502	NC_015955	ATG	2	6	211528	211533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007009
4503	NC_015955	CGG	2	6	211556	211561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007009
4504	NC_015955	CCA	2	6	211637	211642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007009
4505	NC_015955	GAA	2	6	211659	211664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007009
4506	NC_015955	TGGA	2	8	211683	211690	25 %	25 %	50 %	0 %	345007009
4507	NC_015955	CGA	2	6	211712	211717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007009
4508	NC_015955	CGG	2	6	211767	211772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007009
4509	NC_015955	GATG	2	8	211799	211806	25 %	25 %	50 %	0 %	345007009
4510	NC_015955	GTT	2	6	211814	211819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007009
4511	NC_015955	TCC	2	6	211864	211869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007009
4512	NC_015955	CTC	2	6	211873	211878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007009
4513	NC_015955	GA	3	6	211926	211931	50 %	0 %	50 %	0 %	345007009
4514	NC_015955	AGT	2	6	211940	211945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007009
4515	NC_015955	TGA	2	6	212068	212073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_015955	CAG	2	6	212081	212086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_015955	GT	4	8	212101	212108	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_015955	CAG	2	6	212110	212115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_015955	TCGT	2	8	212123	212130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4520	NC_015955	ACT	2	6	212172	212177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_015955	ATCGGT	2	12	212299	212310	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345007010
4522	NC_015955	ACA	2	6	212387	212392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007010
4523	NC_015955	GAA	2	6	212461	212466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007010
4524	NC_015955	GCA	2	6	212503	212508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007010
4525	NC_015955	TAT	2	6	212563	212568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_015955	CTG	2	6	212639	212644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007011
4527	NC_015955	CAG	2	6	212754	212759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007011
4528	NC_015955	CTC	2	6	212775	212780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007011
4529	NC_015955	ATT	2	6	212782	212787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345007011
4530	NC_015955	CGC	3	9	212822	212830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007011
4531	NC_015955	GAT	2	6	212837	212842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007011
4532	NC_015955	CTC	2	6	212865	212870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007011
4533	NC_015955	TCGT	2	8	212904	212911	0 %	50 %	25 %	25 %	345007011
4534	NC_015955	GTT	2	6	212951	212956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007011
4535	NC_015955	AGC	2	6	213040	213045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_015955	CTG	2	6	213083	213088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_015955	CAA	2	6	213112	213117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_015955	CTC	2	6	213143	213148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007012
4539	NC_015955	TCT	2	6	213256	213261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007012
4540	NC_015955	GGC	2	6	213262	213267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007012
4541	NC_015955	CGG	2	6	213463	213468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007012
4542	NC_015955	GC	3	6	213473	213478	0 %	0 %	50 %	50 %	345007012
4543	NC_015955	TCC	2	6	213619	213624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007012
4544	NC_015955	GTA	2	6	213723	213728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007012
4545	NC_015955	TCA	2	6	213745	213750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007012
4546	NC_015955	TCGG	2	8	213804	213811	0 %	25 %	50 %	25 %	345007012
4547	NC_015955	CCG	2	6	213826	213831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007012
4548	NC_015955	TTC	2	6	213903	213908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007012
4549	NC_015955	GTC	2	6	213909	213914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007012
4550	NC_015955	CCT	2	6	213968	213973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007012
4551	NC_015955	GTA	2	6	214106	214111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_015955	CAG	2	6	214237	214242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007013
4553	NC_015955	CAA	2	6	214329	214334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007013
4554	NC_015955	AC	3	6	214466	214471	50 %	0 %	0 %	50 %	345007013
4555	NC_015955	GTGAC	2	10	214598	214607	20 %	20 %	40 %	20 %	345007013
4556	NC_015955	GAT	2	6	214641	214646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007013
4557	NC_015955	GAA	2	6	214651	214656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007013
4558	NC_015955	ACA	2	6	214661	214666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007013
4559	NC_015955	ACG	2	6	214673	214678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007013
4560	NC_015955	GCA	2	6	214700	214705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007013
4561	NC_015955	ATC	2	6	214730	214735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007013
4562	NC_015955	ACA	2	6	214754	214759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_015955	TTAG	2	8	214796	214803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_015955	TGCT	2	8	214810	214817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4565	NC_015955	GT	3	6	214822	214827	0 %	50 %	50 %	0 %	345007014
4566	NC_015955	CTT	2	6	214869	214874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007014
4567	NC_015955	CTG	2	6	214939	214944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007014
4568	NC_015955	TCG	2	6	214963	214968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007014
4569	NC_015955	CTA	2	6	215171	215176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007014
4570	NC_015955	GAC	2	6	215187	215192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007014
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4572	NC_015955	GAA	2	6	215270	215275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007014
4573	NC_015955	AGT	2	6	215325	215330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007014
4574	NC_015955	TTC	2	6	215343	215348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007014
4575	NC_015955	GCT	2	6	215426	215431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007014
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4577	NC_015955	GTAC	2	8	215590	215597	25 %	25 %	25 %	25 %	345007014
4578	NC_015955	CGC	2	6	215642	215647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007014
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4580	NC_015955	ACT	2	6	215689	215694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007014
4581	NC_015955	CGACAA	2	12	215746	215757	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345007014
4582	NC_015955	GCT	2	6	215777	215782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007014
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4584	NC_015955	GGCG	2	8	215859	215866	0 %	0 %	75 %	25 %	345007014
4585	NC_015955	TGG	3	9	215874	215882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007014
4586	NC_015955	CGA	2	6	215910	215915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007014
4587	NC_015955	GAC	2	6	215970	215975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007014
4588	NC_015955	ACC	2	6	215990	215995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007014
4589	NC_015955	GAGT	2	8	216013	216020	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_015955	CGG	2	6	216037	216042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_015955	CCG	3	9	216047	216055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_015955	TCCG	2	8	216077	216084	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_015955	TC	3	6	216089	216094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4594	NC_015955	CTT	2	6	216244	216249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_015955	TCT	2	6	216252	216257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_015955	ATTGT	2	10	216281	216290	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_015955	CGA	2	6	216340	216345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_015955	CCA	2	6	216357	216362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4599	NC_015955	CGG	2	6	216519	216524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_015955	GCT	2	6	216531	216536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_015955	AAGCG	2	10	216635	216644	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4602	NC_015955	C	6	6	216826	216831	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4603	NC_015955	AC	3	6	216914	216919	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4604	NC_015955	AAT	2	6	216921	216926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_015955	ACC	2	6	216955	216960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4606	NC_015955	CAG	2	6	217001	217006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_015955	CTCC	2	8	217036	217043	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4608	NC_015955	CAAC	2	8	217105	217112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4609	NC_015955	GAC	2	6	217130	217135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_015955	TGT	2	6	217141	217146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_015955	ACGA	2	8	217226	217233	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_015955	TGA	2	6	217237	217242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_015955	ACA	2	6	217279	217284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_015955	GGT	2	6	217435	217440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_015955	GAG	2	6	217454	217459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_015955	AGG	2	6	217488	217493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_015955	TGA	2	6	217507	217512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_015955	GTG	2	6	217515	217520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_015955	GAT	2	6	217558	217563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_015955	CTT	2	6	217564	217569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_015955	TTCA	2	8	217574	217581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4622	NC_015955	TCT	2	6	217591	217596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_015955	AGA	2	6	217702	217707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_015955	GTT	2	6	217753	217758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_015955	GAA	2	6	217775	217780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_015955	CTG	2	6	217809	217814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4752	NC_015955	CG	3	6	224179	224184	0 %	0 %	50 %	50 %	345007016
4753	NC_015955	TCT	2	6	224204	224209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007016
4754	NC_015955	AAG	2	6	224221	224226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007016
4755	NC_015955	TG	3	6	224367	224372	0 %	50 %	50 %	0 %	345007016
4756	NC_015955	CATC	2	8	224385	224392	25 %	25 %	0 %	50 %	345007016
4757	NC_015955	GCA	2	6	224400	224405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007016
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4759	NC_015955	GCC	2	6	224426	224431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007016
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4761	NC_015955	CCT	2	6	224493	224498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007016
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4765	NC_015955	ATC	2	6	224792	224797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007016
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4771	NC_015955	TCA	2	6	224985	224990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007016
4772	NC_015955	GTC	2	6	225049	225054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007016
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4782	NC_015955	TTG	2	6	225379	225384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007016
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4800	NC_015955	ATG	2	6	226241	226246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4833	NC_015955	TCG	2	6	228377	228382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4872	NC_015955	G	6	6	230000	230005	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4873	NC_015955	GTC	2	6	230023	230028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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